; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc10G21110 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc10G21110
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionEncodes a protein involved in salt tolerance, names SIS (Salt Induced Serine rich).
Genome locationClcChr10:34427727..34429405
RNA-Seq ExpressionClc10G21110
SyntenyClc10G21110
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_016899678.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103486348 isoform X3 [Cucumis melo]9.2e-5885.42Show/hide
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XP_038905456.1 uncharacterized protein LOC120091479 isoform X1 [Benincasa hispida]3.3e-6389.51Show/hide
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XP_038905457.1 uncharacterized protein LOC120091479 isoform X2 [Benincasa hispida]2.0e-6089.21Show/hide
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XP_038905460.1 uncharacterized protein LOC120091479 isoform X3 [Benincasa hispida]2.3e-6188.81Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LD07 Uncharacterized protein7.6e-5886.9Show/hide
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        YYGGQDV TQNP TGFNS LKRD GGEDDSGGASRGNWWQGSLYY
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A0A1S3B5B7 uncharacterized protein LOC103486348 isoform X11.8e-5987.07Show/hide
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        SIYYGGQD+ T QNPGTGFNSSLKRDGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY
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A0A1S3B5T7 uncharacterized protein LOC103486348 isoform X21.3e-5786.39Show/hide
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        SIYYGGQD+ T QNPGTGFNSSLKRDGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY
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A0A1S4DUN5 uncharacterized protein LOC103486348 isoform X34.5e-5885.42Show/hide
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A0A5D3DN19 Uncharacterized protein1.8e-5987.07Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39855.2 unknown protein3.7e-1237.58Show/hide
Query:  MSEKKASDGSSFSFTTDLFGTRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKASQHSEVGGKSQAFSCSPKTEGNSKYKEG--------------RSQSTSSREMGSFYQ
        M +KK+  GSS S           SS S +HIFGP  S S+ +S       KS     S  T+GN   + G              R + + ++E  S+  
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Query:  EQRTDPCHLSSSIYYGGQDVCTQNPGTGFNSSLKRDGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY
        E+   PC+LSSSIYYGGQD    +  T    + K+DG E DS  ASRGNWW+GS  Y
Subjt:  EQRTDPCHLSSSIYYGGQDVCTQNPGTGFNSSLKRDGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY

AT3G55646.1 unknown protein5.1e-1438.57Show/hide
Query:  ASDGSSFSFTTDLFGTRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKASQHSEVGGKSQAFSCSPKTEGNSKYK--EGRSQSTSSREMGSFYQEQRTDPCHLSSSIYYGG
        +S  SS S    +FG R +SS SS+     +F S F      ++G +    S      G+ KY+    + + ++ +E  S+Y E+   PCHLSSS+YYGG
Subjt:  ASDGSSFSFTTDLFGTRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKASQHSEVGGKSQAFSCSPKTEGNSKYK--EGRSQSTSSREMGSFYQEQRTDPCHLSSSIYYGG

Query:  QDVCTQNPGTGFNSSLKRDGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY
        Q+  +    T  + + K+DG E DS  ASRGNWW+GSLYY
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AT5G02020.1 Encodes a protein involved in salt tolerance, names SIS (Salt Induced Serine rich).1.5e-2144.83Show/hide
Query:  EKKASDG---SSFSFTTDLFGTRDT-SSLSSNHIFGPVFSSSFKASQHSEVGGKSQAFSCSPKTEGNSKYKEGRSQSTSSREMGSFYQEQRTDPCHLSSS
        +KKAS     SS S T++LFG+R+  SS SS+ I G +F    K      V  ++    C  +    +     R++         + Q+QR  PCHLSSS
Subjt:  EKKASDG---SSFSFTTDLFGTRDT-SSLSSNHIFGPVFSSSFKASQHSEVGGKSQAFSCSPKTEGNSKYKEGRSQSTSSREMGSFYQEQRTDPCHLSSS

Query:  IYYGGQDVCTQNPGTGFNSSLKRDGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY
        IYYGG DV  Q   +  NS+ K+DGGEDDSG ASRGNWWQGSLYY
Subjt:  IYYGGQDVCTQNPGTGFNSSLKRDGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY

AT5G02020.2 Encodes a protein involved in salt tolerance, names SIS (Salt Induced Serine rich).9.3e-0835.54Show/hide
Query:  EKKASDG---SSFSFTTDLFGTRDT-SSLSSNHIFGPVFSSSFKASQHSEVGGKSQAFSCSPKTEGNSKYKEGRSQSTSSREMGSFYQEQRTDPCHLSSS
        +KKAS     SS S T++LFG+R+  SS SS+ I G +F    K      V  ++    C  +    +     R++         + Q+QR  PCHLSSS
Subjt:  EKKASDG---SSFSFTTDLFGTRDT-SSLSSNHIFGPVFSSSFKASQHSEVGGKSQAFSCSPKTEGNSKYKEGRSQSTSSREMGSFYQEQRTDPCHLSSS

Query:  IYYGGQDVCTQNPGTGFNSSL
        IYYGG DV  Q   +  NS++
Subjt:  IYYGGQDVCTQNPGTGFNSSL

AT5G59080.1 unknown protein8.7e-1440.41Show/hide
Query:  ASDGSSFSFTTDLFGTRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKASQHSEVGGKSQAFSCSPKTEGNSKYKEGRSQSTSSREMGSFYQEQRTDPCHLSSSIYYGGQD
        +S  +S SFT +LFG++D S  SS+     +FS+ F    H   G        S +   NSK+      S + R      QE R +PCHLSSS+YYGGQD
Subjt:  ASDGSSFSFTTDLFGTRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKASQHSEVGGKSQAFSCSPKTEGNSKYKEGRSQSTSSREMGSFYQEQRTDPCHLSSSIYYGGQD

Query:  VCTQNPGTGFNSSLKRD---GGEDDSGG-----ASRGNWWQGSLYY
        V  ++        +K D    GEDD+ G      SRGNWWQGSLYY
Subjt:  VCTQNPGTGFNSSLKRD---GGEDDSGG-----ASRGNWWQGSLYY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGGAGAAGAAAGCTTCCGATGGGTCATCTTTTTCCTTCACTACTGATCTCTTTGGGACCAGAGACACTTCTTCACTCTCTTCTAATCACATTTTTGGCCCTGTATT
CTCATCTTCTTTCAAGGCCTCCCAGCACTCCGAAGTCGGTGGCAAATCACAAGCTTTTTCATGCTCCCCCAAAACTGAAGGCAATTCCAAATATAAGGAAGGCAGGAGTC
AGAGCACATCAAGCAGAGAAATGGGTTCGTTTTATCAGGAACAGAGAACAGACCCATGTCATCTAAGTTCTTCAATTTATTATGGTGGTCAGGATGTCTGTACCCAAAAT
CCTGGAACTGGATTCAACTCCTCTTTAAAGAGAGATGGGGGAGAAGATGATTCTGGTGGTGCTTCCAGAGGAAATTGGTGGCAAGGGTCTCTGTACTACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ACCCAAAAATTCAAGTGGAGTACAAACGAATTTAATATTATATCAACCTAACAATATGATGCGAAAAAGTTTTGCATATTAGGTCGGTGGGTCGCTACGATTTGTTTCTA
TAAATAGGTGGGTATGCGATACAATGGCTTTCAGTAATCCTTCCATCTCTCTTCCCTGTTTTCTTTGTTCTCCTTCTTCATCTAACTTCCGGCGACGGCAAGTGATTCAA
GTTCTAAAAAAATGTCGGAGAAGAAAGCTTCCGATGGGTCATCTTTTTCCTTCACTACTGATCTCTTTGGGACCAGAGACACTTCTTCACTCTCTTCTAATCACATTTTT
GGCCCTGTATTCTCATCTTCTTTCAAGGCCTCCCAGCACTCCGAAGTCGGTGGCAAATCACAAGCTTTTTCATGCTCCCCCAAAACTGAAGGCAATTCCAAATATAAGGA
AGGCAGGAGTCAGAGCACATCAAGCAGAGAAATGGGTTCGTTTTATCAGGAACAGAGAACAGACCCATGTCATCTAAGTTCTTCAATTTATTATGGTGGTCAGGATGTCT
GTACCCAAAATCCTGGAACTGGATTCAACTCCTCTTTAAAGAGAGATGGGGGAGAAGATGATTCTGGTGGTGCTTCCAGAGGAAATTGGTGGCAAGGGTCTCTGTACTAC
TGAGAATCTCACCTCGCCATCAAGGTGCATGATACATACTATTACTATAAATATAGTATATGGAGATCAATGATGTAGGATCATTTTACCTGCCAAGATGAGAATAACTC
ATAGTTGTTGACATGTAATTATAAGTTAGAGGGCCGAATCTTCACACCTCACATTCCTTGTACTTAACGAAAGAATATTGCATTATGCTGCTAATATGAAGGCATGTTAT
TGTTTATTATTACATCATCCAACAAATAACTAGTGATGGTTATCAAGTAATGTCTGAAGTATGTATTATATAATATATATTGGTAAGAAATGGATATGAAGACAAGGGAA
TCTGGAACTGTTTGCGCAAAGGATATAGTCTTATCCTTATCTTCATTTACTGCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSEKKASDGSSFSFTTDLFGTRDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKASQHSEVGGKSQAFSCSPKTEGNSKYKEGRSQSTSSREMGSFYQEQRTDPCHLSSSIYYGGQDVCTQN
PGTGFNSSLKRDGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY