; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc11G02230 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc11G02230
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionSuppressor protein SRP40-like
Genome locationClcChr11:2141631..2142686
RNA-Seq ExpressionClc11G02230
SyntenyClc11G02230
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0061522.1 suppressor protein SRP40-like [Cucumis melo var. makuwa]2.9e-5577.44Show/hide
Query:  MEDKEK-IEAFEAMEFRELSWVIMKTRENEVFEA-STSTIDSSLENSINSIESSSSELLEDASSSSLTSNV-SSLSLSPSVSSS-EGPLYELSELMAHLP
        ME KE+ IE FEAME REL+WVIM++RE+EV EA STSTIDSS   S+NSIESS+SELLEDASSSSLTSN  SSLSLSPS+SSS +GPLYELSELMA+LP
Subjt:  MEDKEK-IEAFEAMEFRELSWVIMKTRENEVFEA-STSTIDSSLENSINSIESSSSELLEDASSSSLTSNV-SSLSLSPSVSSS-EGPLYELSELMAHLP

Query:  IKRGLSKFYNGKSQSFTSLASAKSLEDLAKRVNNIS------QRKRMKSCKSYGGGFDAQKSS--YSPKPLIAKRVSKGSSLLSPV-SKRNNRLF
        IKRGLSKFYNGKSQSFTSLAS KSLEDLAKRVN  +      QRK+MK CKSYGG  DAQKSS  +SPKPLIAK+VSK SSLLS V SKRNNR F
Subjt:  IKRGLSKFYNGKSQSFTSLASAKSLEDLAKRVNNIS------QRKRMKSCKSYGGGFDAQKSS--YSPKPLIAKRVSKGSSLLSPV-SKRNNRLF

XP_004141029.1 uncharacterized protein LOC101219805 [Cucumis sativus]1.0e-5273.1Show/hide
Query:  MEDKEKI-EAFEAM-EFRELSWVIMKTRENEVFE--ASTSTIDSSLENSINSIESSSSELLEDASSSSLTSN-VSSLSLSPSVSSSEGPLYELSELMAHL
        ME KEKI E FEAM +FR+L+WVIM+TRE+EV E  +++STIDSS   S+NSIESS+SELLEDASSSSLTSN  SSLSLSP   S +GPLYELSELMA+L
Subjt:  MEDKEKI-EAFEAM-EFRELSWVIMKTRENEVFE--ASTSTIDSSLENSINSIESSSSELLEDASSSSLTSN-VSSLSLSPSVSSSEGPLYELSELMAHL

Query:  PIKRGLSKFYNGKSQSFTSLASAKSLEDLAKRVNN----ISQRKRMKSCKSYGGGFDAQKSS--YSPKPLIAKRVSKGSSLLSPV-SKRNNRLFDSH
        PIKRGLSKFYNGKSQSFTSLAS KSLEDLAKR+N+     SQRK++K CKSYGG  ++QKSS  YSPKPLIAK+VS+ SSLLS V +KR+NRLFD+H
Subjt:  PIKRGLSKFYNGKSQSFTSLASAKSLEDLAKRVNN----ISQRKRMKSCKSYGGGFDAQKSS--YSPKPLIAKRVSKGSSLLSPV-SKRNNRLFDSH

XP_008458957.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103498213 [Cucumis melo]2.9e-5577.44Show/hide
Query:  MEDKEK-IEAFEAMEFRELSWVIMKTRENEVFEA-STSTIDSSLENSINSIESSSSELLEDASSSSLTSNV-SSLSLSPSVSSS-EGPLYELSELMAHLP
        ME KE+ IE FEAME REL+WVIM++RE+EV EA STSTIDSS   S+NS+ESS+SELLEDASSSSLTSN  SSLSLSPS+SSS +GPLYELSELMA+LP
Subjt:  MEDKEK-IEAFEAMEFRELSWVIMKTRENEVFEA-STSTIDSSLENSINSIESSSSELLEDASSSSLTSNV-SSLSLSPSVSSS-EGPLYELSELMAHLP

Query:  IKRGLSKFYNGKSQSFTSLASAKSLEDLAKRVN------NISQRKRMKSCKSYGGGFDAQKSS--YSPKPLIAKRVSKGSSLLSPV-SKRNNRLF
        IKRGLSKFYNGKSQSFTSLAS KSLEDLAKRVN        SQRK+MK CKSYGG  DAQKSS  +SPKPLIAK+VSK SSLLS V SKRNNR F
Subjt:  IKRGLSKFYNGKSQSFTSLASAKSLEDLAKRVN------NISQRKRMKSCKSYGGGFDAQKSS--YSPKPLIAKRVSKGSSLLSPV-SKRNNRLF

XP_022154740.1 uncharacterized protein LOC111021921 [Momordica charantia]5.9e-5675.79Show/hide
Query:  IDMEDKEKIEAFEAMEFRELSWVIMKTRENEVFEASTSTIDSSLENSINSIESSSSELLEDASSSSLTSNVSSLSLSPSVSSSEGPLYELSELMAHLPIK
        +D+  KEK+EAFEAME RELSWVIMK+ E+EV EAS ST+DSS ENSI+SIES SSEL EDASSSS TSN S  S SP +SSS GPLYELSELMA+LPIK
Subjt:  IDMEDKEKIEAFEAMEFRELSWVIMKTRENEVFEASTSTIDSSLENSINSIESSSSELLEDASSSSLTSNVSSLSLSPSVSSSEGPLYELSELMAHLPIK

Query:  RGLSKFYNGKSQSFTSLASAKSLEDLAKRVNN---ISQRKRMKSCKSYGGGFDAQKSSYSPKPLIAKRVSKGSSLLSPVSKRNNRLFDSH
        RGLSKFYNGKSQSFTSLASAKSLEDLAKRVNN   I QRK+MK CKSYGGG DAQ+ SYSPK  IAK+ SK       V KRNNRLFDSH
Subjt:  RGLSKFYNGKSQSFTSLASAKSLEDLAKRVNN---ISQRKRMKSCKSYGGGFDAQKSSYSPKPLIAKRVSKGSSLLSPVSKRNNRLFDSH

XP_038890684.1 uncharacterized protein LOC120080185 [Benincasa hispida]3.0e-6885.41Show/hide
Query:  MEDKEKIEAFEAMEFRELSWVIMKTRENEVFEASTSTIDSSLENSINSIESSSSELLEDASSSSLTSNVSSLSLSPSVSSSEGPLYELSELMAHLPIKRG
        M  KEK+EAFEAME  EL+WVIM+TRE+EVFEASTSTI SS ENSINSIES SSELLEDASSSS  SN+SSLSLSPS+SSS+GPLYELSELMA+LPIKRG
Subjt:  MEDKEKIEAFEAMEFRELSWVIMKTRENEVFEASTSTIDSSLENSINSIESSSSELLEDASSSSLTSNVSSLSLSPSVSSSEGPLYELSELMAHLPIKRG

Query:  LSKFYNGKSQSFTSLASAKSLEDLAKRV-NNISQRKRMKSCKSYGGGFDAQKSSYSPKPLIAKRVSKGSSLLSPVSKRNN-RLFD
        LSKFYNGKSQSFTSLAS KSLEDLAKRV NNISQRK+MKSCKSYGGG DAQK  YSPKPLI+KRVSKG SLLSP+SKRNN RLFD
Subjt:  LSKFYNGKSQSFTSLASAKSLEDLAKRV-NNISQRKRMKSCKSYGGGFDAQKSSYSPKPLIAKRVSKGSSLLSPVSKRNN-RLFD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LKQ7 Uncharacterized protein5.0e-5373.1Show/hide
Query:  MEDKEKI-EAFEAM-EFRELSWVIMKTRENEVFE--ASTSTIDSSLENSINSIESSSSELLEDASSSSLTSN-VSSLSLSPSVSSSEGPLYELSELMAHL
        ME KEKI E FEAM +FR+L+WVIM+TRE+EV E  +++STIDSS   S+NSIESS+SELLEDASSSSLTSN  SSLSLSP   S +GPLYELSELMA+L
Subjt:  MEDKEKI-EAFEAM-EFRELSWVIMKTRENEVFE--ASTSTIDSSLENSINSIESSSSELLEDASSSSLTSN-VSSLSLSPSVSSSEGPLYELSELMAHL

Query:  PIKRGLSKFYNGKSQSFTSLASAKSLEDLAKRVNN----ISQRKRMKSCKSYGGGFDAQKSS--YSPKPLIAKRVSKGSSLLSPV-SKRNNRLFDSH
        PIKRGLSKFYNGKSQSFTSLAS KSLEDLAKR+N+     SQRK++K CKSYGG  ++QKSS  YSPKPLIAK+VS+ SSLLS V +KR+NRLFD+H
Subjt:  PIKRGLSKFYNGKSQSFTSLASAKSLEDLAKRVNN----ISQRKRMKSCKSYGGGFDAQKSS--YSPKPLIAKRVSKGSSLLSPV-SKRNNRLFDSH

A0A1S3C929 uncharacterized protein LOC1034982131.4e-5577.44Show/hide
Query:  MEDKEK-IEAFEAMEFRELSWVIMKTRENEVFEA-STSTIDSSLENSINSIESSSSELLEDASSSSLTSNV-SSLSLSPSVSSS-EGPLYELSELMAHLP
        ME KE+ IE FEAME REL+WVIM++RE+EV EA STSTIDSS   S+NS+ESS+SELLEDASSSSLTSN  SSLSLSPS+SSS +GPLYELSELMA+LP
Subjt:  MEDKEK-IEAFEAMEFRELSWVIMKTRENEVFEA-STSTIDSSLENSINSIESSSSELLEDASSSSLTSNV-SSLSLSPSVSSS-EGPLYELSELMAHLP

Query:  IKRGLSKFYNGKSQSFTSLASAKSLEDLAKRVN------NISQRKRMKSCKSYGGGFDAQKSS--YSPKPLIAKRVSKGSSLLSPV-SKRNNRLF
        IKRGLSKFYNGKSQSFTSLAS KSLEDLAKRVN        SQRK+MK CKSYGG  DAQKSS  +SPKPLIAK+VSK SSLLS V SKRNNR F
Subjt:  IKRGLSKFYNGKSQSFTSLASAKSLEDLAKRVN------NISQRKRMKSCKSYGGGFDAQKSS--YSPKPLIAKRVSKGSSLLSPV-SKRNNRLF

A0A5A7V023 Suppressor protein SRP40-like1.4e-5577.44Show/hide
Query:  MEDKEK-IEAFEAMEFRELSWVIMKTRENEVFEA-STSTIDSSLENSINSIESSSSELLEDASSSSLTSNV-SSLSLSPSVSSS-EGPLYELSELMAHLP
        ME KE+ IE FEAME REL+WVIM++RE+EV EA STSTIDSS   S+NSIESS+SELLEDASSSSLTSN  SSLSLSPS+SSS +GPLYELSELMA+LP
Subjt:  MEDKEK-IEAFEAMEFRELSWVIMKTRENEVFEA-STSTIDSSLENSINSIESSSSELLEDASSSSLTSNV-SSLSLSPSVSSS-EGPLYELSELMAHLP

Query:  IKRGLSKFYNGKSQSFTSLASAKSLEDLAKRVNNIS------QRKRMKSCKSYGGGFDAQKSS--YSPKPLIAKRVSKGSSLLSPV-SKRNNRLF
        IKRGLSKFYNGKSQSFTSLAS KSLEDLAKRVN  +      QRK+MK CKSYGG  DAQKSS  +SPKPLIAK+VSK SSLLS V SKRNNR F
Subjt:  IKRGLSKFYNGKSQSFTSLASAKSLEDLAKRVNNIS------QRKRMKSCKSYGGGFDAQKSS--YSPKPLIAKRVSKGSSLLSPV-SKRNNRLF

A0A6J1DKH4 uncharacterized protein LOC1110219212.8e-5675.79Show/hide
Query:  IDMEDKEKIEAFEAMEFRELSWVIMKTRENEVFEASTSTIDSSLENSINSIESSSSELLEDASSSSLTSNVSSLSLSPSVSSSEGPLYELSELMAHLPIK
        +D+  KEK+EAFEAME RELSWVIMK+ E+EV EAS ST+DSS ENSI+SIES SSEL EDASSSS TSN S  S SP +SSS GPLYELSELMA+LPIK
Subjt:  IDMEDKEKIEAFEAMEFRELSWVIMKTRENEVFEASTSTIDSSLENSINSIESSSSELLEDASSSSLTSNVSSLSLSPSVSSSEGPLYELSELMAHLPIK

Query:  RGLSKFYNGKSQSFTSLASAKSLEDLAKRVNN---ISQRKRMKSCKSYGGGFDAQKSSYSPKPLIAKRVSKGSSLLSPVSKRNNRLFDSH
        RGLSKFYNGKSQSFTSLASAKSLEDLAKRVNN   I QRK+MK CKSYGGG DAQ+ SYSPK  IAK+ SK       V KRNNRLFDSH
Subjt:  RGLSKFYNGKSQSFTSLASAKSLEDLAKRVNN---ISQRKRMKSCKSYGGGFDAQKSSYSPKPLIAKRVSKGSSLLSPVSKRNNRLFDSH

A0A6J1FBB9 uncharacterized protein LOC111443888 isoform X11.1e-4467.01Show/hide
Query:  IDMEDKEKIEAFE---AMEFRELSWVIMKTRENEVFEASTSTIDSSLENSINSIESSSSELLEDASSSSLTSNVSSLSLSPSVSSSEGPLYELSELMAHL
        +DM  K+ IEAFE   AME +ELS V+++TRE++V EAS ST     ENSI+S ES SSELLEDASS+S TSN+S  SLS S SS  GPLYELSELM +L
Subjt:  IDMEDKEKIEAFE---AMEFRELSWVIMKTRENEVFEASTSTIDSSLENSINSIESSSSELLEDASSSSLTSNVSSLSLSPSVSSSEGPLYELSELMAHL

Query:  PIKRGLSKFYNGKSQSFTSLASAKSLEDLAKRVNN----ISQRKRMKSCKSYGGGFDAQKSSYSPKPLIAKRVSKGSSLLSPVSKRNNRLFDSH
        PIKRGLSKFYNGKSQSFTSLASAKSLEDLAK+VNN     SQ+K+MK CKSYGGG DAQ+ SYSPKPLIAK+           SKR +RLF SH
Subjt:  PIKRGLSKFYNGKSQSFTSLASAKSLEDLAKRVNN----ISQRKRMKSCKSYGGGFDAQKSSYSPKPLIAKRVSKGSSLLSPVSKRNNRLFDSH

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G43850.1 unknown protein1.6e-0651.67Show/hide
Query:  SSSEGPLYELSELMAHLPIKRGLSKFYNGKSQSFTSLASAKSL--EDLAKRVNNISQRKR
        SS  GPL  +  L   LPIKR +SKFY GKS+SF SL+   SL  +DL K  N  S+R+R
Subjt:  SSSEGPLYELSELMAHLPIKRGLSKFYNGKSQSFTSLASAKSL--EDLAKRVNNISQRKR

AT4G26288.1 FUNCTIONS IN: molecular_function unknown8.0e-1140.37Show/hide
Query:  MEFRELSWVIMKTRENEVFEASTSTIDSSLENSINSIESSSSELLEDASSSSLTSNVSSLSLSPSVSSSEGPLYELSELMAHLPI----KRGLSKFYNGK
        M  R+ + +     E  V   S S   S+  +S +SI   SS+L EDASSSS          S S SSS GP  +LS+L++ LPI    K GLSK+Y GK
Subjt:  MEFRELSWVIMKTRENEVFEASTSTIDSSLENSINSIESSSSELLEDASSSSLTSNVSSLSLSPSVSSSEGPLYELSELMAHLPI----KRGLSKFYNGK

Query:  SQSFTSLASAKSLEDLAKRVNNISQRKRMKSCKSYGGGFDAQKSSYSPKPLIAKRVSKGSS
        SQSFTSLA+  SL+DL KR        R KSC         +   Y PK  I+ + ++ SS
Subjt:  SQSFTSLASAKSLEDLAKRVNNISQRKRMKSCKSYGGGFDAQKSSYSPKPLIAKRVSKGSS

AT5G21940.1 unknown protein7.2e-0435.59Show/hide
Query:  FEASTSTIDSSLENSINSIESSSSELLEDASSSSLTSNVSSLSLSPSVSSSEGPLYELSELMAHLPIKRGLSKFYNGKSQSFT--------SLASAKSLE
        F  S S  DSS  +S +S  SSS     D    S          +   S  +GPL  +  L   LP+++G+SK+Y+GKS+SFT        +L S+ S++
Subjt:  FEASTSTIDSSLENSINSIESSSSELLEDASSSSLTSNVSSLSLSPSVSSSEGPLYELSELMAHLPIKRGLSKFYNGKSQSFT--------SLASAKSLE

Query:  DLAKRVNNISQRKRMKSC
        DLAK  N  S+R+R   C
Subjt:  DLAKRVNNISQRKRMKSC

AT5G56550.1 oxidative stress 31.7e-1640.8Show/hide
Query:  FRELSWVIMKTRENEVFEASTSTIDSSLENSINSIESSSSELLEDASSSSLTSNVSSLSLSP------SVSSSEGPLYELSELMAHLPIKRGLSKFYNGK
        F+E++ + +K   N ++E  T   +   E+ +  + ++ S+  +++SS SL+S++ S           S SSS GPL +LS+LM+HLPIKRGLSKFY GK
Subjt:  FRELSWVIMKTRENEVFEASTSTIDSSLENSINSIESSSSELLEDASSSSLTSNVSSLSLSP------SVSSSEGPLYELSELMAHLPIKRGLSKFYNGK

Query:  SQSFTSLASAKSLEDLAKR-VNNISQRKRMKSCKSYGGGFD-AQKSSYSPKPLIAKRVSK-GSSLLSPVSKRNN
        SQSFTSL + KSLEDL KR   + +   + KS +S GG  D + K  +SPK  I+K+ ++  SS+LS +++R +
Subjt:  SQSFTSLASAKSLEDLAKR-VNNISQRKRMKSCKSYGGGFD-AQKSSYSPKPLIAKRVSK-GSSLLSPVSKRNN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCTATTTTTAAACTCCTTCCCTTATTCCTTTTCTTCTTCAAATTCTACCAAATTTTCTTACAATTTTATTTCTTGGACATAGACATGGAAGACAAAGAGAAGAT
TGAAGCTTTTGAAGCTATGGAGTTTAGGGAACTCAGTTGGGTGATTATGAAAACTAGAGAAAATGAAGTTTTCGAAGCTTCTACTTCTACTATTGATTCTTCTTTAGAGA
ATTCTATAAACTCAATTGAATCCTCTTCGTCAGAATTGTTAGAAGATGCATCGTCGTCTTCTTTAACGTCTAACGTTTCGTCATTGTCATTGTCGCCATCAGTATCATCA
TCGGAGGGACCTCTCTATGAACTCTCAGAGCTCATGGCCCATCTCCCCATCAAGAGAGGGTTATCAAAGTTCTACAATGGAAAATCACAATCTTTTACATCTCTAGCAAG
TGCAAAGAGCTTAGAAGATCTTGCAAAGAGAGTGAATAATATTTCTCAAAGGAAAAGGATGAAGTCTTGCAAAAGCTATGGAGGAGGTTTTGATGCTCAAAAATCTTCTT
ATTCTCCAAAGCCTTTGATTGCTAAAAGAGTTTCAAAGGGTTCTTCTTTGCTATCTCCTGTTTCTAAGAGAAATAATAGGCTATTTGATAGCCATTCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGCAAATCAATTTGCAACCATAAATACTATACACTATCAACCAAAATTCTTATCATCATTTAAATAATATAAACATTTATATATATGTCTATGGTGATCCTACTCACCCT
ATTTATTATAATAATTCAAACCCACCTAAAAGAAACATTTTTTGGTCAATACCCCTACATTTATGGCTTCTATTTTTAAACTCCTTCCCTTATTCCTTTTCTTCTTCAAA
TTCTACCAAATTTTCTTACAATTTTATTTCTTGGACATAGACATGGAAGACAAAGAGAAGATTGAAGCTTTTGAAGCTATGGAGTTTAGGGAACTCAGTTGGGTGATTAT
GAAAACTAGAGAAAATGAAGTTTTCGAAGCTTCTACTTCTACTATTGATTCTTCTTTAGAGAATTCTATAAACTCAATTGAATCCTCTTCGTCAGAATTGTTAGAAGATG
CATCGTCGTCTTCTTTAACGTCTAACGTTTCGTCATTGTCATTGTCGCCATCAGTATCATCATCGGAGGGACCTCTCTATGAACTCTCAGAGCTCATGGCCCATCTCCCC
ATCAAGAGAGGGTTATCAAAGTTCTACAATGGAAAATCACAATCTTTTACATCTCTAGCAAGTGCAAAGAGCTTAGAAGATCTTGCAAAGAGAGTGAATAATATTTCTCA
AAGGAAAAGGATGAAGTCTTGCAAAAGCTATGGAGGAGGTTTTGATGCTCAAAAATCTTCTTATTCTCCAAAGCCTTTGATTGCTAAAAGAGTTTCAAAGGGTTCTTCTT
TGCTATCTCCTGTTTCTAAGAGAAATAATAGGCTATTTGATAGCCATTCTTGATGCTTATTTAGAGGGATAGGCCTTTTTCTTTTTCTTTCTCAATGATTTGAGGTTAAA
GTGTTATTTTTGTGGAAGAGTGTTTGAAATAATGGTTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASIFKLLPLFLFFFKFYQIFLQFYFLDIDMEDKEKIEAFEAMEFRELSWVIMKTRENEVFEASTSTIDSSLENSINSIESSSSELLEDASSSSLTSNVSSLSLSPSVSS
SEGPLYELSELMAHLPIKRGLSKFYNGKSQSFTSLASAKSLEDLAKRVNNISQRKRMKSCKSYGGGFDAQKSSYSPKPLIAKRVSKGSSLLSPVSKRNNRLFDSHS