; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc11G04460 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc11G04460
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionRING-type domain-containing protein
Genome locationClcChr11:4245816..4250616
RNA-Seq ExpressionClc11G04460
SyntenyClc11G04460
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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AT4G39140.1 RING/U-box superfamily protein1.1e-9949.78Show/hide
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AT4G39140.2 RING/U-box superfamily protein1.1e-9949.78Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
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AGGAATATATCGACAGATGTGAGTTTAGAACAGGTGAAGGAGGCTATAGAATCTCCCACAGCTTCATATAAGTCTCCTGCAAAATTGTCACTTTCATTGCCTTCAACTTC
ATCTTTGTCAACATCTCCTTTGTCATCTCAGAGTTATCTGCCTCCAACCAATTCATCCCTAACAAGATGTTCCCACCGATCTCCAGGACATCAGTTGTTGCGTCAAGTGT
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TCATTGCCTTCAACTTCATCTTTGTCAACATCTCCTTTGTCATCTCAGAGTTATCTGCCTCCAACCAATTCATCCCTAACAAGATGTTCCCACCGATCTCCAGGACATCA
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AATGGTGAGAAAATTGCCAGATCTAGTAGTCAGATTTCAACTTCCTCAGTTGACTTGCAAACTTGCGGAGTTTGCTCGAAGCTGTTGACCGAGAAATCCTCGTGGAGTAG
CCAAAGGATTATTGCTAACAATGAACTTTCCGTTGCTGCTGTACTAACCTGTGGACATGTTTATCATGCCGATTGTTTGGAGAGTATGACACCTGAGATTTACAAGTACG
ACCCCGCTTGTCCTGTTTGTACCTTTGGGGAGAAGCATACTCAAAAGTTGTCCGAAAAGGCACTTAAAGCTGAAATGGACTGGAAGAGTCTATATAAGAGACCCAAAAAC
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AGTCTAGCAAAGTATGATAGATTCCAACGGCCCCTTCACGTTGCTTCGGGAAGTTGTGTTTCGTGAAACAAGGGAACCGTTGACTTCTGTGCCTCGTCAATGGAAACATG
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TATAC
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