; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc11G06200 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc11G06200
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionTPRXL protein
Genome locationClcChr11:6073928..6074623
RNA-Seq ExpressionClc11G06200
SyntenyClc11G06200
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8646577.1 hypothetical protein Csa_005771 [Cucumis sativus]5.6e-9789.08Show/hide
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XP_011656432.1 putative protein TPRXL [Cucumis sativus]1.0e-9888.84Show/hide
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XP_016901982.1 PREDICTED: putative uncharacterized protein DDB_G0277255 [Cucumis melo]2.7e-9989.32Show/hide
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XP_022134140.1 putative protein TPRXL [Momordica charantia]7.9e-7574.36Show/hide
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XP_038885974.1 putative protein TPRXL [Benincasa hispida]5.1e-9889.7Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K7T8 Uncharacterized protein4.9e-9988.84Show/hide
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A0A1S4E178 Uncharacterized protein1.3e-9989.32Show/hide
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A0A5A7UC51 Putative serine-rich protein1.3e-9989.32Show/hide
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A0A6J1BX95 Uncharacterized protein3.8e-7574.36Show/hide
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        SSIFPRL PR+SR SP   SS  S+S SSS +SW SSRSSSSSSP    +  FFKRRR  SD+PSLPFE+SFDD  DGDE   GS NSPTSTLCFGG+SS
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        SRAS F GCYQLV+VKNA LS+VGHGSA RGT+N
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A0A6J1K022 uncharacterized serine-rich protein C215.13-like1.2e-6879.1Show/hide
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        KE NS  NSSFRVYYGGATGAIPFRWESRPGTPKHT+S+TSIPPLTPPPSYYS+ HS SK S KPT  +SIF     RKSRT+ SFS SS SSSSSSS  
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Query:  SWPSSRSSSSSSPSAFVRPKFFKRRRHFSDSPSLPFEHSFDDNNDGDEVVAGSPNSPTSTLCFGGSSSS-RASLFGGCYQLVNVKNALLSIVGHGSASRG
        SW SSR    SSPSAFVRPKFFK RR FS+SPSLPFE SFDD N+GDE V GSP+SPTSTLCFGG SSS RASLF GCYQLV+VKNALLSIVGHGSASRG
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Query:  T
        T
Subjt:  T

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06930.1 unknown protein3.7e-0641.96Show/hide
Query:  YYGGATGAIPFRWESRPGTPK-----------HTFSETSIP---PLTPPPSYYSTLHSASKASSKPTLLSSIFPRLTPRKSRTSPSFSSSSGSSSSSSSL
        YYGG++ A+PF+WES+PGTP+           ++ S+ + P   PLTPPPSY+    S++K  S P   +++F  L   K+R+ PS S +S SSSSSSS+
Subjt:  YYGGATGAIPFRWESRPGTPK-----------HTFSETSIP---PLTPPPSYYSTLHSASKASSKPTLLSSIFPRLTPRKSRTSPSFSSSSGSSSSSSSL

Query:  ASWPSSRSSSSS
         S P   S  S+
Subjt:  ASWPSSRSSSSS

AT2G40475.1 unknown protein1.2e-1741.71Show/hide
Query:  NSTINSSFRVYYGGATGAIPFRWESRPGTPKHT-FSET-SIPPLTPPPSYYSTLHSA-SKASSKPTLLSSIFPRLTPRKSRTSPSFSSSSGSSSSSSSLA
        +S +NSS R+YY G   ++PF WE+RPGTPKH  FSE+  +PPLTPPPSYYS+  S+ +K S   T+  + F +    +  + PSFS SS SSSSSSS  
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Query:  SWPSSRSSSSSSPSAFVRPKFFKRRRHFSDSPSLPFEHSFDDNNDGDEVVAGSPNSPTSTLCF-GGSSSSRASLFGGCYQLVNVKNALLSIVGHGSASR
                SSSSP + V     + R+ +S S       S+   +D +E+V+   +SPTSTLC+  G SSS  S+          K AL S++ HGS+ +
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AT3G56260.2 unknown protein6.1e-0942.44Show/hide
Query:  YYGGATGAIPFRWESRPGTPK-HTFSETSIP-PLTPPPSYY-----STLHSASKASSKPTLLSSIFPRLTPRKSRTSPSFSSSSGSSSSSSSLASWPSSR
        YYGGA  +IPF WESRPGTPK H  S++S+P PLTPPPSYY     ST  + SK  SK +   S         S  S    S+ GS  ++SS  SW S+ 
Subjt:  YYGGATGAIPFRWESRPGTPK-HTFSETSIP-PLTPPPSYY-----STLHSASKASSKPTLLSSIFPRLTPRKSRTSPSFSSSSGSSSSSSSLASWPSSR

Query:  SSSSSSPSAFVRPKFFKRRRHFSDSPSLPFEHSFDDNNDGDEVVAGSPNSPTSTLCFG-----GSSSSRASL
        SSSS S S     K  KR  H   SP L   +  D+            +SPTSTLC       G SSS  S+
Subjt:  SSSSSSPSAFVRPKFFKRRRHFSDSPSLPFEHSFDDNNDGDEVVAGSPNSPTSTLCFG-----GSSSSRASL

AT5G01790.1 unknown protein5.0e-1156.25Show/hide
Query:  SFRV-YYGGATGAIPFRWESRPGTPKHTFSE-TSIPPLTPPPSYYS----TLHSASKASSKPTL
        SFR+ YY GA GA+PF WES PGTPKH  SE  ++PPLTPPPS++S     +   SK S+K  L
Subjt:  SFRV-YYGGATGAIPFRWESRPGTPKHTFSE-TSIPPLTPPPSYYS----TLHSASKASSKPTL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAACTCCAAACTATGACCAAATCTCTCAAAAATCCTTCCAAACCAAACATGAAGATAGATTATTCACTAGGGCTCTATCCAAAGAGCTCAATTCCACCATCAACTC
CTCTTTTAGAGTCTATTACGGCGGAGCCACCGGTGCAATTCCGTTCCGATGGGAGTCCCGACCAGGAACTCCAAAGCATACTTTTTCAGAAACTTCAATCCCTCCTCTTA
CTCCTCCTCCTTCTTACTATTCCACTTTGCATTCTGCTTCCAAGGCCTCTTCCAAACCAACCCTTTTGAGCTCCATTTTTCCTCGGCTCACGCCAAGGAAATCTCGAACC
TCCCCGTCTTTCTCCTCTTCCTCGGGCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCTTTAGCATCGTGGCCATCTTCTCGCTCATCGTCCTCCTCGTCTCCCTCGGCTTTCGTTAGACC
TAAATTCTTCAAACGTCGTCGTCATTTCTCAGATTCTCCAAGCTTACCATTCGAGCATAGCTTCGACGATAACAACGACGGAGACGAGGTGGTGGCTGGGAGTCCCAATT
CTCCTACATCAACTTTGTGCTTTGGTGGTTCTTCTTCAAGTAGAGCTTCATTGTTTGGAGGTTGTTACCAGTTAGTGAATGTGAAGAATGCTTTGTTGTCCATTGTTGGC
CATGGATCTGCAAGCAGAGGTACTCTTAATAATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAAACTCCAAACTATGACCAAATCTCTCAAAAATCCTTCCAAACCAAACATGAAGATAGATTATTCACTAGGGCTCTATCCAAAGAGCTCAATTCCACCATCAACTC
CTCTTTTAGAGTCTATTACGGCGGAGCCACCGGTGCAATTCCGTTCCGATGGGAGTCCCGACCAGGAACTCCAAAGCATACTTTTTCAGAAACTTCAATCCCTCCTCTTA
CTCCTCCTCCTTCTTACTATTCCACTTTGCATTCTGCTTCCAAGGCCTCTTCCAAACCAACCCTTTTGAGCTCCATTTTTCCTCGGCTCACGCCAAGGAAATCTCGAACC
TCCCCGTCTTTCTCCTCTTCCTCGGGCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCTTTAGCATCGTGGCCATCTTCTCGCTCATCGTCCTCCTCGTCTCCCTCGGCTTTCGTTAGACC
TAAATTCTTCAAACGTCGTCGTCATTTCTCAGATTCTCCAAGCTTACCATTCGAGCATAGCTTCGACGATAACAACGACGGAGACGAGGTGGTGGCTGGGAGTCCCAATT
CTCCTACATCAACTTTGTGCTTTGGTGGTTCTTCTTCAAGTAGAGCTTCATTGTTTGGAGGTTGTTACCAGTTAGTGAATGTGAAGAATGCTTTGTTGTCCATTGTTGGC
CATGGATCTGCAAGCAGAGGTACTCTTAATAATTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SPSFSSSSGSSSSSSSLASWPSSRSSSSSSPSAFVRPKFFKRRRHFSDSPSLPFEHSFDDNNDGDEVVAGSPNSPTSTLCFGGSSSSRASLFGGCYQLVNVKNALLSIVG
HGSASRGTLNN