; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc11G07510 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc11G07510
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Descriptionzinc finger protein 511
Genome locationClcChr11:7665613..7667798
RNA-Seq ExpressionClc11G07510
SyntenyClc11G07510
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type
IPR039258 - Zinc finger protein 511


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0056568.1 zinc finger protein 511 [Cucumis melo var. makuwa]2.0e-12586.94Show/hide
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KAG6602683.1 Zinc finger protein 511, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.5e-12590.36Show/hide
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XP_008441334.1 PREDICTED: zinc finger protein 511 [Cucumis melo]6.6e-12993.57Show/hide
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XP_038885473.1 zinc finger protein 511 [Benincasa hispida]3.6e-12792.37Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LMY3 Uncharacterized protein7.9e-12893.17Show/hide
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A0A1S3B3Y4 zinc finger protein 5113.2e-12993.57Show/hide
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A0A5D3DLV5 Zinc finger protein 5119.6e-12686.94Show/hide
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A0A6J1BVX1 zinc finger protein 5115.8e-12389.16Show/hide
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A0A6J1E4J7 zinc finger protein 5113.1e-12490.36Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6P0X2 Zinc finger protein 5111.9e-2232.95Show/hide
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        P A    P     +  E P+ + P   RF  D  FF  G+V+R +  + +   ++E  +  +         E  C + GC     +++D++ HY+  H  
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        +CS C R +P+  LL +H+ E HDS FQ  +A+  DMY+CLVE C  KFK+ + R+ H+V  H + A F F K
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Q7ZZ00 Zinc finger protein 5111.4e-2532.35Show/hide
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        E ++  P+ ++P + RF  +  +F  G++ R +  + +     +D++           SE  C I GC     +L+ +E HYN+ H   CS C R +P++
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Query:  RLLSLHVSEAHDSFFQAKVARGYDMYECLVEGCGLKFKSYKSRQQHLVDKHKFSASFEFFKKAHPSKKQRQKLHRKQ-------ALQGWEETSE-----M
        RLL +H+ E HDS FQ  +A    MYECLVEGCGLKFK+ K R+ HL+  H + A F F K     +   +K  +K+       A    +E+SE     +
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Query:  EVENETIDGLISGVSKLTTSDLTPSSISFGRRHTRGLQ
          E    + + +   K   S   PSSI FG+   RG +
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Q8NB15 Zinc finger protein 5119.5e-2232.87Show/hide
Query:  RFDPDSPFFASGNVEREILAKQVALDLTE-DEKVQLHNMAVDASSEIFCPIVGCGAHLKSLDDFEDHYNSRHTASCSVCPRVYPTSRLLSLHVSEAHDSF
        RF  +  FF  G+V+R +  + V + + +  EK ++   A        C + GC     +LDD+E HY++ H   CS C R +P+  LL  H+ E HDS 
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Query:  FQAKVARGYDMYECLVEGCGLKFKSYKSRQQHLVDKHKFSASFEFFKKAHPSKKQRQKLHRKQALQGWE--ETSEMEVENETI--DGLISGVSKLTTSDL
        FQ  ++   DMY+CLVEGC  KFK+ + R+ H+V  H + A F F K     KK R     +      E  E   ME+ +E +      +G  ++    +
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Query:  TPSSISFGRRHTRGLQ
         PS+I FG+   RG +
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Q9V574 Protein lethal(2)k102013.4e-1133.63Show/hide
Query:  DHYNSRHTASCSVCPRVYPTSRLLSLHVSEAHDSFFQAKVARG-YDMYECLVEGCGLKFKSYKSRQQHLVDKHKFSASFEFFKKAHPSKKQRQKLHRKQA
        D+ +   + SC  C ++ PT+ LL LH++E HD +F A V RG   M+ C +E C +KF + + R+ H +  HK  A++ F            K   KQ 
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Query:  LQGWEETSEMEVE
         QG  + + MEV+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G14140.1 zinc ion binding;nucleic acid binding;zinc ion binding1.7e-9065.35Show/hide
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        A++   +  FPYW P +RRF PDSPFFASGNVERE+LAKQV LD TEDE   LH      +  I CPIVGC   LKSLD FEDHYN+RHTASCSVC RVY
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Query:  PTSRLLSLHVSEAHDSFFQAKVARGYDMYECLVEGCGLKFKSYKSRQQHLVDKHKFSASFEFFKKAHPSKKQRQKLHRKQALQ-GWEETSE------MEV
        PTSRLLS+H+SEAHDSFFQAKV+RGYDMYECLVEGCGLKFK+YK+R +HL+DKHKF  +FEFFKK   SKK+R+KL R+   +   EE  E      MEV
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Query:  ENE-TIDGLISGVSKLTTSDLTPSSISFGRRHTRGLQFLPRAVQREKVSDSSTA
        E++ ++DGL+S +S LTTSD TPS++SFGRRH RGL F+PR+V REK ++SS+A
Subjt:  ENE-TIDGLISGVSKLTTSDLTPSSISFGRRHTRGLQFLPRAVQREKVSDSSTA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACTCAATTGCCGTTCAAAGTTCAAACCAAAATTGAAAATAATCTTCCGTCTGCAACGGTCCATTGCCCTGCCATGGAACTTGAATCACAATCAGAGTTCCCGTACTG
GAAGCCTTTCCAACGGAGGTTCGATCCTGATTCTCCCTTCTTTGCCTCTGGAAATGTCGAGCGTGAAATCTTAGCCAAACAGGTTGCCTTGGATTTAACCGAAGATGAAA
AGGTACAGCTGCATAACATGGCAGTTGATGCTAGCAGTGAAATCTTTTGCCCAATTGTTGGTTGCGGTGCACACTTGAAATCTCTGGATGACTTTGAAGATCATTACAAT
TCGCGGCATACTGCCTCTTGTTCTGTTTGCCCAAGAGTTTACCCGACATCACGGCTACTTAGTTTACATGTGTCTGAGGCGCATGACTCGTTCTTTCAAGCAAAAGTTGC
TCGTGGCTATGACATGTATGAATGCCTGGTGGAAGGTTGTGGTTTGAAGTTCAAAAGCTACAAAAGCAGACAGCAGCATCTAGTGGACAAGCATAAATTTTCTGCTTCAT
TTGAATTCTTTAAGAAAGCTCATCCATCTAAGAAACAAAGACAGAAATTACATCGTAAACAAGCCCTTCAAGGGTGGGAAGAAACCTCGGAAATGGAAGTTGAGAATGAA
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AGCAGTTCAGCGAGAAAAAGTGTCAGACTCCTCAACAGCTGGAACAAAGAGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGACTCAATTGCCGTTCAAAGTTCAAACCAAAATTGAAAATAATCTTCCGTCTGCAACGGTCCATTGCCCTGCCATGGAACTTGAATCACAATCAGAGTTCCCGTACTG
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TTTTGCTGCATAGTTTCTATTGTTGGTCCTTCTCAAGGATATCTGGTTTTGCGGCATCTCGGAGTTGGTTTTATTTTCCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTQLPFKVQTKIENNLPSATVHCPAMELESQSEFPYWKPFQRRFDPDSPFFASGNVEREILAKQVALDLTEDEKVQLHNMAVDASSEIFCPIVGCGAHLKSLDDFEDHYN
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