| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AHM88912.1 RNA polymerase beta [Lagenaria siceraria] | 2.6e-137 | 98.39 | Show/hide |
Query: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
Subjt: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
Query: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
IEGKEGRFRETLLGKRVDY GRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIR+KEPIVWEILQEVMQG+P+LLNRAPTLH
Subjt: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
Query: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
Subjt: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
|
|
| AHM88970.1 RNA polymerase beta [Lagenaria siceraria] | 2.6e-137 | 98.39 | Show/hide |
Query: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
Subjt: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
Query: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
IEGKEGRFRETLLGKRVDY GRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIR+KEPIVWEILQEVMQG+P+LLNRAPTLH
Subjt: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
Query: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
Subjt: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
|
|
| AHM91152.1 RNA polymerase beta, partial [Lagenaria siceraria] | 2.6e-137 | 98.39 | Show/hide |
Query: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
Subjt: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
Query: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
IEGKEGRFRETLLGKRVDY GRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIR+KEPIVWEILQEVMQG+P+LLNRAPTLH
Subjt: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
Query: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
Subjt: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
|
|
| ASY96794.1 RNA polymerase beta' subunit [Cucumis melo var. momordica] | 2.6e-137 | 98.39 | Show/hide |
Query: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
Subjt: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
Query: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
IEGKEGRFRETLLGKRVDY GRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIR+KEPIVWEILQEVMQG+P+LLNRAPTLH
Subjt: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
Query: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
Subjt: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
|
|
| YP_009560826.1 RpoC1 [Trichosanthes kirilowii] | 2.6e-137 | 98.39 | Show/hide |
Query: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
Subjt: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
Query: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
IEGKEGRFRETLLGKRVDY GRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIR+KEPIVWEILQEVMQG+P+LLNRAPTLH
Subjt: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
Query: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
Subjt: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1P8LE65 DNA-directed RNA polymerase subunit gamma | 1.3e-137 | 98.39 | Show/hide |
Query: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
Subjt: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
Query: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
IEGKEGRFRETLLGKRVDY GRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIR+KEPIVWEILQEVMQG+P+LLNRAPTLH
Subjt: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
Query: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
Subjt: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
|
|
| A0A1X9Q1T5 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' | 1.3e-137 | 98.39 | Show/hide |
Query: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
Subjt: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
Query: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
IEGKEGRFRETLLGKRVDY GRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIR+KEPIVWEILQEVMQG+P+LLNRAPTLH
Subjt: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
Query: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
Subjt: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
|
|
| A0A218KG20 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' | 1.3e-137 | 98.39 | Show/hide |
Query: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
Subjt: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
Query: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
IEGKEGRFRETLLGKRVDY GRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIR+KEPIVWEILQEVMQG+P+LLNRAPTLH
Subjt: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
Query: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
Subjt: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
|
|
| A0A249RZJ2 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' | 1.3e-137 | 98.39 | Show/hide |
Query: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
Subjt: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
Query: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
IEGKEGRFRETLLGKRVDY GRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIR+KEPIVWEILQEVMQG+P+LLNRAPTLH
Subjt: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
Query: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
Subjt: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
|
|
| A0A6M3S6B8 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' | 1.3e-137 | 98.39 | Show/hide |
Query: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
Subjt: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
Query: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
IEGKEGRFRETLLGKRVDY GRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIR+KEPIVWEILQEVMQG+P+LLNRAPTLH
Subjt: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
Query: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
Subjt: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| Q09X26 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' | 3.2e-138 | 95.98 | Show/hide |
Query: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTL DNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSD+
Subjt: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
Query: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
IEGKEGRFRETLLGKRVDY GRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTF+IRGLIRQHFASNIGVAKSKIR+KEP+VWEILQ+VMQG+P+LLNRAPTLH
Subjt: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
Query: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
RLGIQAFQPILVEG AICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
Subjt: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
|
|
| Q4VZP2 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' | 3.4e-140 | 98.39 | Show/hide |
Query: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
Subjt: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
Query: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
IEGKEGRFRETLLGKRVDY GRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIR+KEPIVWEILQEVMQG+P+LLNRAPTLH
Subjt: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
Query: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
Subjt: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
|
|
| Q8HVY4 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' | 1.7e-139 | 97.19 | Show/hide |
Query: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSD+
Subjt: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
Query: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
IEGKEGRFRETLLGKRVDY GRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIR+HFASNIG+AKSKIR+KEPIVWEILQEVMQG+P+LLNRAPTLH
Subjt: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
Query: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
Subjt: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
|
|
| Q8S8Y0 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' | 5.4e-138 | 96.39 | Show/hide |
Query: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTL DLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
Subjt: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
Query: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
IEGKEGRFRETLLGKRVDY GRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTF+IRGLIRQH ASNIGVAKSKIR+KEPIVWEILQEVMQG+P+LLNRAPTLH
Subjt: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
Query: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
RLGIQAFQP+LVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQ E
Subjt: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
|
|
| Q9BBS8 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' | 4.1e-138 | 96.39 | Show/hide |
Query: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPM+DGHNKVYKSFSD+
Subjt: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
Query: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
IEGKEGRFRETLLGKRVDY GRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIR LIR+HFASNIGVAKSKIR+KEPIVWEILQEVM+G+PILLNRAPTLH
Subjt: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
Query: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMA+HVPLSLEAQAE
Subjt: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G63020.1 nuclear RNA polymerase D1A | 2.7e-15 | 25.47 | Show/hide |
Query: LCLLPVLPPELRP---IIQIDGGKLMSSDINELYRRVI-YRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQE--KLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
L PV P R + Q +G +L+ + +Y++++ + NTL ++ C + +L E V + D+ Y+ SD
Subjt: LCLLPVLPPELRP---IIQIDGGKLMSSDINELYRRVI-YRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQE--KLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
Query: IEGKEGRF-RETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASN-----IGVAKSKIRKKEPIVW----------EILQE
+ RF ++ LLGKR D+ R+V+V PSL L+ G+P IA L + + ++ ++ + + +R+ + +V +I +
Subjt: IEGKEGRF-RETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASN-----IGVAKSKIRKKEPIVW----------EILQE
Query: VMQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQ-PILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEL
+M G +L+NR P++H+ + A IL + L+P+ C F DFDGD + +VP S++A+ EL
Subjt: VMQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQ-PILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAEL
|
|
| AT4G35800.1 RNA polymerase II large subunit | 4.7e-28 | 27.74 | Show/hide |
Query: KLHRREGNSPDHQLRPLN-------DR--SVIKKV--------GVQRQPGEPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDL
K+ R++ + PD P DR SV+K++ G + P+WM+L +LP+ PP +RP + +D D+ +I N L
Subjt: KLHRREGNSPDHQLRPLN-------DR--SVIKKV--------GVQRQPGEPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDL
Query: LTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQP-MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIEL---
P ++ +L+Q + T DN + GQP + KS ++ KEGR R L+GKRVD+ R+VI P++++ G+P IA+ L
Subjt: LTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQP-MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIEL---
Query: -----FQTFLIRGLI--RQHFASNIGVAKSKIR-----------KKE-----PIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLV
+ ++ L+ H AK IR KK + +++ + + G +L NR P+LH++ I + ++ L+ V
Subjt: -----FQTFLIRGLI--RQHFASNIGVAKSKIR-----------KKE-----PIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLV
Query: CKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAELL
+NADFDGD+M +HVP S E +AE+L
Subjt: CKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAELL
|
|
| AT5G60040.1 nuclear RNA polymerase C1 | 2.0e-23 | 27.64 | Show/hide |
Query: PEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRG-QPMRDGHNKVYKSFSDV
PE +++ + V P +RP + I G + +D+ +++I N +L +L+ S+P + + VQ V +++ +RG Q + H
Subjt: PEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRG-QPMRDGHNKVYKSFSDV
Query: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIA-------------IELFQTFLIRGLIRQHFASN-----------IGVAKSKIRKKEP
++GK GRFR L GKRV++ GR+VI P+L + G+P +A IE + + G + A N +G + +I +
Subjt: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIA-------------IELFQTFLIRGLIRQHFASN-----------IGVAKSKIRKKEP
Query: IVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAELL
I + + + +G +L NR P+LHR+ I + ++ R + + VC +NADFDGD+M +HVP + EA+ E +
Subjt: IVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAELL
|
|
| AT5G60040.2 nuclear RNA polymerase C1 | 2.0e-23 | 27.64 | Show/hide |
Query: PEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRG-QPMRDGHNKVYKSFSDV
PE +++ + V P +RP + I G + +D+ +++I N +L +L+ S+P + + VQ V +++ +RG Q + H
Subjt: PEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRG-QPMRDGHNKVYKSFSDV
Query: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIA-------------IELFQTFLIRGLIRQHFASN-----------IGVAKSKIRKKEP
++GK GRFR L GKRV++ GR+VI P+L + G+P +A IE + + G + A N +G + +I +
Subjt: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIA-------------IELFQTFLIRGLIRQHFASN-----------IGVAKSKIRKKEP
Query: IVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAELL
I + + + +G +L NR P+LHR+ I + ++ R + + VC +NADFDGD+M +HVP + EA+ E +
Subjt: IVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAELL
|
|
| ATCG00180.1 DNA-directed RNA polymerase family protein | 1.6e-137 | 95.18 | Show/hide |
Query: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQI+GGKLMSSDINELYRRVIYRNNTL DLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
Subjt: EPEWMVLCLLPVLPPELRPIIQIDGGKLMSSDINELYRRVIYRNNTLIDLLTTSRSTPGELVMCQEKLVQEAVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDV
Query: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
IEGKEGRFRETLLGKRVDY GRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTF+IRGLIRQH ASNIGVAKS+IR+K+PIVWEILQEVMQG+P+LLNRAPTLH
Subjt: IEGKEGRFRETLLGKRVDYLGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLH
Query: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
RLGIQ+FQPILVEGR ICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
Subjt: RLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFDGDQMAVHVPLSLEAQAE
|
|
