; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc11G08050 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc11G08050
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
Genome locationClcChr11:7835673..7838094
RNA-Seq ExpressionClc11G08050
SyntenyClc11G08050
Gene Ontology termsGO:0009507 - chloroplast (cellular component)
InterPro domainsIPR022546 - Uncharacterised protein family Ycf68


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
AGZ19190.1 hypothetical chloroplast RF68 [Camellia sinensis]3.3e-1568.18Show/hide
Query:  AGEGLKPQWENKTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFFFMLFPEGV-SGSINRDQSFIP
        +  GLKP   NK EHLTT+LHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFFF  FP G+   +INR    +P
Subjt:  AGEGLKPQWENKTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFFFMLFPEGV-SGSINRDQSFIP

ANP25546.1 Ycf68 [Eucommia ulmoides]1.4e-1669.35Show/hide
Query:  LKPQWENKTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFFFMLFPEGV-SGSINRDQSFIP
        ++PQWEN+ EHLTT+LHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPF F  FP G+   +INR    +P
Subjt:  LKPQWENKTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFFFMLFPEGV-SGSINRDQSFIP

KAF4348549.1 hypothetical protein F8388_000228 [Cannabis sativa]3.3e-1592.86Show/hide
Query:  GLKPQWENKTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFF
        G++PQWENKTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEP F
Subjt:  GLKPQWENKTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFF

TYH79861.1 hypothetical protein ES332_D03G093200v1 [Gossypium tomentosum]3.0e-1657.65Show/hide
Query:  GKRQPGGAHT---LIVLYLAGEGLKPQWENKTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFFFMLFPEG-VSGSINRDQSFIP
        G  + GG  T     +++ +   ++PQWENK EHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFF   FP G    +INR    +P
Subjt:  GKRQPGGAHT---LIVLYLAGEGLKPQWENKTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFFFMLFPEG-VSGSINRDQSFIP

YP_009493632.1 Ycf68 [Eucommia ulmoides]1.4e-1669.35Show/hide
Query:  LKPQWENKTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFFFMLFPEGV-SGSINRDQSFIP
        ++PQWEN+ EHLTT+LHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPF F  FP G+   +INR    +P
Subjt:  LKPQWENKTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFFFMLFPEGV-SGSINRDQSFIP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1B0ZD71 Uncharacterized protein ycf686.5e-1769.35Show/hide
Query:  LKPQWENKTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFFFMLFPEGV-SGSINRDQSFIP
        ++PQWEN+ EHLTT+LHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPF F  FP G+   +INR    +P
Subjt:  LKPQWENKTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFFFMLFPEGV-SGSINRDQSFIP

A0A2U8XDR1 Uncharacterized protein ycf686.5e-1769.35Show/hide
Query:  LKPQWENKTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFFFMLFPEGV-SGSINRDQSFIP
        ++PQWEN+ EHLTT+LHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPF F  FP G+   +INR    +P
Subjt:  LKPQWENKTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFFFMLFPEGV-SGSINRDQSFIP

A0A5D2LK82 Uncharacterized protein ycf681.5e-1657.65Show/hide
Query:  GKRQPGGAHT---LIVLYLAGEGLKPQWENKTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFFFMLFPEG-VSGSINRDQSFIP
        G  + GG  T     +++ +   ++PQWENK EHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFF   FP G    +INR    +P
Subjt:  GKRQPGGAHT---LIVLYLAGEGLKPQWENKTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFFFMLFPEG-VSGSINRDQSFIP

A0A7J6DSE9 Uncharacterized protein ycf681.6e-1592.86Show/hide
Query:  GLKPQWENKTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFF
        G++PQWENKTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEP F
Subjt:  GLKPQWENKTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFF

U5U7J0 Uncharacterized protein ycf681.6e-1568.18Show/hide
Query:  AGEGLKPQWENKTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFFFMLFPEGV-SGSINRDQSFIP
        +  GLKP   NK EHLTT+LHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFFF  FP G+   +INR    +P
Subjt:  AGEGLKPQWENKTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFFFMLFPEGV-SGSINRDQSFIP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P03938 Uncharacterized protein ycf682.9e-1470.91Show/hide
Query:  KTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFFFMLFPEGVSGS-INRDQSFIP
        K EHLTT+LHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFF   FP G+  + INR    +P
Subjt:  KTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFFFMLFPEGVSGS-INRDQSFIP

P0C304 Uncharacterized protein ycf683.8e-0645.16Show/hide
Query:  LKPQWENKTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFFFMLFPEGV-SGSINRDQSFIP
        ++PQWEN   +  +   + +     LSFWGDGGIVPFEPFF   FP G+   +INR    +P
Subjt:  LKPQWENKTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFFFMLFPEGV-SGSINRDQSFIP

Q6ENB7 Uncharacterized protein ycf683.8e-0645.16Show/hide
Query:  LKPQWENKTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFFFMLFPEGV-SGSINRDQSFIP
        ++PQWEN   +  +   + +     LSFWGDGGIVPFEPFF   FP G+   +INR    +P
Subjt:  LKPQWENKTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFFFMLFPEGV-SGSINRDQSFIP

Q6ENQ5 Uncharacterized protein ycf682.9e-1470.91Show/hide
Query:  KTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFFFMLFPEGVSGS-INRDQSFIP
        K EHLTT+LHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFF   FP G+  + INR    +P
Subjt:  KTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFFFMLFPEGVSGS-INRDQSFIP

Q6L3C9 Uncharacterized protein ycf682.9e-1470.91Show/hide
Query:  KTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFFFMLFPEGVSGS-INRDQSFIP
        K EHLTT+LHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFF   FP G+  + INR    +P
Subjt:  KTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFFFMLFPEGVSGS-INRDQSFIP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTTCGGGGAGTTGAAAATAAGCGTAGATCCGGAGATTCCCGAATAGGTCAACCTTTCAAACTGCTGTTGAATCCATGGGCAGGCAAGAGACAACCTGGCGGGGCCCA
CACCTTAATTGTTCTATACCTTGCAGGAGAAGGGTTAAAGCCTCAATGGGAAAATAAAACGGAGCACCTAACAACGTATCTTCACAGACCAAGAACTACGAGATCGCCCC
TTTCATTCTGGGGTGACGGAGGGATCGTACCATTCGAGCCTTTTTTTTTCATGCTTTTCCCGGAGGGCGTTAGCGGGTCTATTAATCGAGATCAATCGTTTATTCCCGGA
TGCGTTGGTATTCCCATTTTTTTCATTCTAGTTATTGATTTGCGCGTCGTTCCAACAACCGGCGGGGAGCACCTCAGTATACGATCGTGCGCAGTAACTGAGAGTCCTAT
TACACCTAAGGCCAACTTCAATTCACCAAACCAAGGCTACCCTTCTCCGAAAGCTCCGCGGGACCACCTACCACTAGTCTTCGGCCGGAGGGGTTTATTGCACAAAAACG
CCGGGACGCAGGCCCCCGAAGAGGGAAGCCCAACGAATACGAGAGTGAGGTACAACAAGGCCATTTCTGTCCACCGCCCTTCTCACAGAGCCGGCTCATGGCTTTCGAAG
GATCGTATTGACCCTCTTCAGAGCCTATGGGAGAAGACCCACTACTCCCAAGTGGGGTTCATCGGCACTCCCACTCTGGGACTAGGGAGATCCCCGTCACATCCTGTTTC
CGTGCCTCTCCTCCTTCCCCCCCCTAAACAGATTAGAAAAGAAAAAAGCATATCTTCCAATTCCTTCCCGATACCTCCCAAGGAAAATTCCGAATTGGATCCAAAATTGA
CGGATCGCTTCTTCCAAAGCACGCCCTGTTCGTTCCGCTCGCAACAATCCAATGAGTTCTCCAGAATTGCCTCAACCAAAATTGATGGAATTGGACCTAAAAAAGCCATT
CAGGCGGAAGCTGAAAAGAGATTTGAACAGCAGTCTGAAAAGACTAATGCTGCGCAAAAGAATATGTTTCTAAAAAAGAATAAGCACAAAGTGAGTGCAGAAGGACCTGA
AAAACATACCGTTCCGACTTCCAAAGGCGATCCTAAGGGAAGAAGAATGAAAGGGATAAGGCTGCAAGAAGAACCTAGAGAGGAAGCTCCACCGAAAGAAGAAGAGGAAA
TAAGACTCGAGTTTCTGGAAATCTTTCAAGAGGGAGTTCCATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCTTCGGGGAGTTGAAAATAAGCGTAGATCCGGAGATTCCCGAATAGGTCAACCTTTCAAACTGCTGTTGAATCCATGGGCAGGCAAGAGACAACCTGGCGGGGCCCA
CACCTTAATTGTTCTATACCTTGCAGGAGAAGGGTTAAAGCCTCAATGGGAAAATAAAACGGAGCACCTAACAACGTATCTTCACAGACCAAGAACTACGAGATCGCCCC
TTTCATTCTGGGGTGACGGAGGGATCGTACCATTCGAGCCTTTTTTTTTCATGCTTTTCCCGGAGGGCGTTAGCGGGTCTATTAATCGAGATCAATCGTTTATTCCCGGA
TGCGTTGGTATTCCCATTTTTTTCATTCTAGTTATTGATTTGCGCGTCGTTCCAACAACCGGCGGGGAGCACCTCAGTATACGATCGTGCGCAGTAACTGAGAGTCCTAT
TACACCTAAGGCCAACTTCAATTCACCAAACCAAGGCTACCCTTCTCCGAAAGCTCCGCGGGACCACCTACCACTAGTCTTCGGCCGGAGGGGTTTATTGCACAAAAACG
CCGGGACGCAGGCCCCCGAAGAGGGAAGCCCAACGAATACGAGAGTGAGGTACAACAAGGCCATTTCTGTCCACCGCCCTTCTCACAGAGCCGGCTCATGGCTTTCGAAG
GATCGTATTGACCCTCTTCAGAGCCTATGGGAGAAGACCCACTACTCCCAAGTGGGGTTCATCGGCACTCCCACTCTGGGACTAGGGAGATCCCCGTCACATCCTGTTTC
CGTGCCTCTCCTCCTTCCCCCCCCTAAACAGATTAGAAAAGAAAAAAGCATATCTTCCAATTCCTTCCCGATACCTCCCAAGGAAAATTCCGAATTGGATCCAAAATTGA
CGGATCGCTTCTTCCAAAGCACGCCCTGTTCGTTCCGCTCGCAACAATCCAATGAGTTCTCCAGAATTGCCTCAACCAAAATTGATGGAATTGGACCTAAAAAAGCCATT
CAGGCGGAAGCTGAAAAGAGATTTGAACAGCAGTCTGAAAAGACTAATGCTGCGCAAAAGAATATGTTTCTAAAAAAGAATAAGCACAAAGTGAGTGCAGAAGGACCTGA
AAAACATACCGTTCCGACTTCCAAAGGCGATCCTAAGGGAAGAAGAATGAAAGGGATAAGGCTGCAAGAAGAACCTAGAGAGGAAGCTCCACCGAAAGAAGAAGAGGAAA
TAAGACTCGAGTTTCTGGAAATCTTTCAAGAGGGAGTTCCATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLRGVENKRRSGDSRIGQPFKLLLNPWAGKRQPGGAHTLIVLYLAGEGLKPQWENKTEHLTTYLHRPRTTRSPLSFWGDGGIVPFEPFFFMLFPEGVSGSINRDQSFIPG
CVGIPIFFILVIDLRVVPTTGGEHLSIRSCAVTESPITPKANFNSPNQGYPSPKAPRDHLPLVFGRRGLLHKNAGTQAPEEGSPTNTRVRYNKAISVHRPSHRAGSWLSK
DRIDPLQSLWEKTHYSQVGFIGTPTLGLGRSPSHPVSVPLLLPPPKQIRKEKSISSNSFPIPPKENSELDPKLTDRFFQSTPCSFRSQQSNEFSRIASTKIDGIGPKKAI
QAEAEKRFEQQSEKTNAAQKNMFLKKNKHKVSAEGPEKHTVPTSKGDPKGRRMKGIRLQEEPREEAPPKEEEEIRLEFLEIFQEGVP