CuGenDBv2

Gene ID	Clc11G09460
Organism	Citrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Description	Trinucleotide repeat-containing gene 18 protein-like protein
Genome location	ClcChr11:12067865..12069219
RNA-Seq Expression	Clc11G09460
Synteny	Clc11G09460
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG7015908.1 hypothetical protein SDJN02_21012, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

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XP_008441227.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103485423 [Cucumis melo]

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XP_011649907.1 uncharacterized protein LOC105434677 [Cucumis sativus]

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XP_023549797.1 putative protein TPRXL [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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XP_038885392.1 uncharacterized protein LOC120075791 [Benincasa hispida]

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TrEMBL top hits

e value

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A0A1S3B2H5 uncharacterized protein LOC103485423

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A0A5D3C8I6 Trinucleotide repeat-containing gene 18 protein-like protein

4.9e-92

91.79

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A0A6J1DE38 uncharacterized protein LOC111020211

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A0A6J1GNZ5 uncharacterized protein LOC111456137

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A0A6J1JTM6 uncharacterized protein LOC111487739

4.6e-74

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G22680.1 unknown protein

4.2e-19

42.19

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        +RR++S   SS+ ++S+  S SSSS  S  F  +SP    ATP+      IPFSWE LPG PK+ S  R     +  LS+LLPLPP+      + R    
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          +K+    + RDPF  A +ECSK    A  D +  TG  + K + +S S   G LNLYSSC+R C VSESIVYLP++  +S+D L+  T G
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AT1G71970.1 unknown protein

8.2e-23

44.02

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        SSRR    S SSS+S SS S+ SSS  S  FP DSP ++ ATP+R     +PFSWE LPG PK  S     R ++   + LLPLPP  N   P + K+  
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Query:  FQDWRKSNRQNS----QRDPFFDAFLECSK-EPTAAAVDSDL---------WTGASNG--KAITR-SLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTPR-
              S+++NS     +DPF  A LECSK E T +  D D+         + G S G  K +++ S+ DRFG +NLY SC+RTC V+ESIVYLPR  + 
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        +S+D L  R
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGTTTCAATCTTCTCGCCGGACTCATTCTTTCTCTTCTTCTTCTTCTAATTCCCTCTCCTCCTCCTCCGCCTCCTCCTCCTCCCGCGGCTCTTACTATTTTCCCGATGA
CTCTCCCTTCTCCGCCGCCGCCACTCCGATCCGATCATTCTCCGGCAGCATTCCCTTCTCCTGGGAGCATTTGCCAGGAATCCCTAAAAAACAGTCTCCGGCCAGGCTCC
GGCGAGGTTCTTCATCTCCTCTCTCCTCTCTCCTCCCCTTACCACCCAATTCCATCACTCCACCGTCTTCGAAACGCTTCGGGTTTCAAGATTGGAGGAAATCGAACCGC
CAAAATTCGCAGCGGGATCCTTTCTTCGACGCCTTCCTCGAGTGCTCTAAGGAACCTACCGCCGCCGCCGTAGACTCTGACCTCTGGACCGGCGCCAGCAATGGTAAGGC
GATTACAAGAAGCTTGAGCGATCGATTCGGATTCTTGAATCTGTACTCTTCTTGTAAACGGACCTGCGGCGTTTCGGAATCCATCGTTTACCTGCCGAGAACGCCGAGGA
GTTCGTTCGATCTGCTTAACCAGCGTACCGGCGGCTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

TAGGATGCATTATATTTTGATACCTCTTTCAATGACATCAAATACATGGAGATCCCAAAGCAATTCCTATTTTTACTTGGAATACAATTTTATTCAAATTCAGGAAGTTT
TAATCAATAATCTAAGTCAAATTCATATTTAGCACTTTTATATAATCTCTAACACCTACTACTTTCTAAACCTCAAATCTAATATACAAAACTTTCGCTAACTTTATATG
GGATTTATATGAATTATATCTTATTCTATTTTTAATTAGATGGAGTGAGTTTGAATCTATAACAAGAAATATTGAGGCAGATAAACTAAATTAAGGTCCATTTATATGTA
ACTTAAAACATAAACCAGCGTTGACAAAACAAGATAGAGATGGAAAAGAAAAGAGATTAGAATGAAAATGAAGAGAAAGAAAGCTTATTTTAGAAGGAAAAAAAAAAACC
CGCAAAACTCAATCACGTTGCTGACCAAAAAAAAAAAAAGATCCTTTTCTTATTAAATGAGAACTTTATCTCTCCACTTCTCATGGTTTCCCTTTTACAAATAATAATGT
CACAAACCCAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATTCATATATATATATATATAACAAATTTCTTAGAAACTTGAAGTGGGTTTTTGTGTGTGCAAAAAGCCAAA
TCCCAATTCCCAAATTTTTCCTAATTTCTCAAAAAGAGAATGTGAAGAATCGGAGAGAAATTCAGAGAATAATGTTTCAATCTTCTCGCCGGACTCATTCTTTCTCTTCT
TCTTCTTCTAATTCCCTCTCCTCCTCCTCCGCCTCCTCCTCCTCCCGCGGCTCTTACTATTTTCCCGATGACTCTCCCTTCTCCGCCGCCGCCACTCCGATCCGATCATT
CTCCGGCAGCATTCCCTTCTCCTGGGAGCATTTGCCAGGAATCCCTAAAAAACAGTCTCCGGCCAGGCTCCGGCGAGGTTCTTCATCTCCTCTCTCCTCTCTCCTCCCCT
TACCACCCAATTCCATCACTCCACCGTCTTCGAAACGCTTCGGGTTTCAAGATTGGAGGAAATCGAACCGCCAAAATTCGCAGCGGGATCCTTTCTTCGACGCCTTCCTC
GAGTGCTCTAAGGAACCTACCGCCGCCGCCGTAGACTCTGACCTCTGGACCGGCGCCAGCAATGGTAAGGCGATTACAAGAAGCTTGAGCGATCGATTCGGATTCTTGAA
TCTGTACTCTTCTTGTAAACGGACCTGCGGCGTTTCGGAATCCATCGTTTACCTGCCGAGAACGCCGAGGAGTTCGTTCGATCTGCTTAACCAGCGTACCGGCGGCTGAA
TCGAGGCCGTTGTTGAAGAAGTGAAGAACACACAC

Protein sequence

Show/hide protein sequence

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QNSQRDPFFDAFLECSKEPTAAAVDSDLWTGASNGKAITRSLSDRFGFLNLYSSCKRTCGVSESIVYLPRTPRSSFDLLNQRTGG

Clc11G09460 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome