; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc11G15500 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc11G15500
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Descriptionblue copper protein-like
Genome locationClcChr11:26401980..26403278
RNA-Seq ExpressionClc11G15500
SyntenyClc11G15500
Gene Ontology termsGO:0022900 - electron transport chain (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0046658 - anchored component of plasma membrane (cellular component)
GO:0009055 - electron transfer activity (molecular function)
InterPro domainsIPR003245 - Phytocyanin domain
IPR008972 - Cupredoxin
IPR039391 - Phytocyanin


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004136269.1 blue copper protein isoform X1 [Cucumis sativus]4.8e-8185.43Show/hide
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XP_008466191.1 PREDICTED: blue copper protein-like [Cucumis melo]1.6e-8487.44Show/hide
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XP_022940502.1 blue copper protein-like [Cucurbita moschata]1.3e-7883.16Show/hide
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XP_022980897.1 blue copper protein-like [Cucurbita maxima]9.0e-8084.21Show/hide
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XP_038897888.1 blue copper protein-like [Benincasa hispida]1.5e-9090.91Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LHL0 Phytocyanin domain-containing protein2.3e-8185.43Show/hide
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A0A1S3CQN2 blue copper protein-like7.6e-8587.44Show/hide
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A0A5A7T903 Blue copper protein-like7.6e-8587.44Show/hide
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A0A6J1FJS8 blue copper protein-like6.3e-7983.16Show/hide
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A0A6J1ISI5 blue copper protein-like4.3e-8084.21Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80517 Uclacyanin-29.8e-2145.12Show/hide
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        T  W+ GVDY  WA+GKTF VGD L F Y   HTVD V  + Y  C A +S  + S G T I LK  G +YFICS+ GHC  + GMKL+V V AG  GP 
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         TP+    +  TPT+P S  PS    TP T TP   +T  P     SG S     Y+ V   +V
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O82081 Uclacyanin 11.0e-1434.39Show/hide
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        L+ + V    ++    AT +T+G  +GW++G    TWA+G+TF+VGD L F+Y A  H V EVT  ++ +C A   + + ++G++ + L  PG  YFIC 
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Query:  SMGHCDSGMKLSVTV--------AAGGPSTTPS--SGGGSSTTPTSPASDTPSATGTTPATTTPTTKLPAGSSNSGPSVFPNFYMAVSA
          GHC  GMKL V V         A  P+T PS  +   SS  P  P          +P+++TP   LP+ S    P + P    A +A
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Q07488 Blue copper protein4.0e-1439.27Show/hide
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        +LVF   +V   FA  Y VGD   W+  +D   Y TWA+GKTF VGD+L F++A G H V  V+ + ++ C     I+  +     I L   G  YFIC+
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Query:  SMGHCDSGMKLSVTVAAGGPSTTPSSGGGSSTTPTSPASDTPSATGTTP----ATTTPT----TKLPAG---SSNSGPSVFPNFYMAVSAI
           HC  G KLS+TV A G +   + G G++  P S    TPS  GTTP     TTTP+    T  PAG   SS  G +    F  AV A+
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Q41001 Blue copper protein1.1e-3553.11Show/hide
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        MA  +A ++C L+    M  P+ ATVYTVGDT+GW +G DY TWAS KTF+VGD L FNY AG HTVDEV  SDYK+C++GNSI++DS+G+TTI LK  G
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Query:  THYFICSSMGHCDSGMKLSVTV-AAGGPSTTPSSGGGSSTTPTSPASDTPSATGTTPATTTPTTKLPAGSSNSGPSV
         HYFIC   GH   GMKLS+ V A+ G S  PS+   SS   +  + DTP+AT T   TTTPT +  + +++  P V
Subjt:  THYFICSSMGHCDSGMKLSVTV-AAGGPSTTPSSGGGSSTTPTSPASDTPSATGTTPATTTPTTKLPAGSSNSGPSV

Q96316 Uclacyanin-32.0e-1841.25Show/hide
Query:  LLVFGFCMVQPNFATVYTVGDTAGWSLGVDYGTWASGKTFSVGDKLAFNYAGGHTVDEVTASDYKACSAGNSITSDSSGSTTITLKNPGTHYFICSSMGH
        LL+F    V   FA  + VGD +GW+  +DY  W +GKTF VGD L F Y   H+V  V  + Y  C +  +  + + G T I L   GT +F+C + GH
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Query:  CDSGMKLSVTVAAGGPS-TTPSSGGGSSTTPTSPASDTPSATGTTPA-TTTPTTKLPAGS
        C +GMKL+V V A  PS +TPSS   + +TP+SP S TPS   + P+  + P+  LP  S
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G22480.1 Cupredoxin superfamily protein4.5e-2952.45Show/hide
Query:  LVCLLVFGFCMVQPNFATVYTVGDTAGWSLGVDYGTWASGKTFSVGDKLAFNYAGGHTVDEVTASDYKACSAGNSITSDSSGSTTITLKNPGTHYFICSS
        L CL++    + Q + A++     T  WSLG DY    +GKTFSVGD + FNY  GHTVDEV+ +DYK+C+ GNSITSDSSG+TTI L   G  YFIC  
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Query:  MGHCDSGMKLSVTVA-------AGGPST-TPSSGGGSSTTPTS
         GHC +GMKL+VTVA       AGG +T TP +GGG    PT+
Subjt:  MGHCDSGMKLSVTVA-------AGGPST-TPSSGGGSSTTPTS

AT1G72230.1 Cupredoxin superfamily protein3.8e-2849.3Show/hide
Query:  VCLLVFGFCMVQPN-FATVYTVGDTAGWSLGVDYGTWASGKTFSVGDKLAFNYAGGHTVDEVTASDYKACSAGNSITSDSSGSTTITLKNPGTHYFICSS
        +C LV    ++  N FA   +      WSLG DY + A+GK+F+VGD + FNY  GHTVDEV+ SDYK+C+ GN+I+SDSSG+T+I LK PG HYFIC  
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Query:  MGHCDSGMKLSVTVAAGGPSTTPSSGGGSSTTPTSPASDTPS
         GHC  GMKLSV V A     +   G     TP      TPS
Subjt:  MGHCDSGMKLSVTVAAGGPSTTPSSGGGSSTTPTSPASDTPS

AT2G44790.1 uclacyanin 27.0e-2245.12Show/hide
Query:  TAGWSLGVDYGTWASGKTFSVGDKLAFNYAGGHTVDEVTASDYKACSAGNSITSDSSGSTTITLKNPGTHYFICSSMGHC--DSGMKLSVTVAAG--GPS
        T  W+ GVDY  WA+GKTF VGD L F Y   HTVD V  + Y  C A +S  + S G T I LK  G +YFICS+ GHC  + GMKL+V V AG  GP 
Subjt:  TAGWSLGVDYGTWASGKTFSVGDKLAFNYAGGHTVDEVTASDYKACSAGNSITSDSSGSTTITLKNPGTHYFICSSMGHC--DSGMKLSVTVAAG--GPS

Query:  TTPSSGGGSSTTPTSPASDTPSATGTTPATTTP---TTKLPAGSSNSGPSVFPNFYMAVSAILV
         TP+    +  TPT+P S  PS    TP T TP   +T  P     SG S     Y+ V   +V
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AT3G60280.1 uclacyanin 31.5e-1941.25Show/hide
Query:  LLVFGFCMVQPNFATVYTVGDTAGWSLGVDYGTWASGKTFSVGDKLAFNYAGGHTVDEVTASDYKACSAGNSITSDSSGSTTITLKNPGTHYFICSSMGH
        LL+F    V   FA  + VGD +GW+  +DY  W +GKTF VGD L F Y   H+V  V  + Y  C +  +  + + G T I L   GT +F+C + GH
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Query:  CDSGMKLSVTVAAGGPS-TTPSSGGGSSTTPTSPASDTPSATGTTPA-TTTPTTKLPAGS
        C +GMKL+V V A  PS +TPSS   + +TP+SP S TPS   + P+  + P+  LP  S
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AT5G07475.1 Cupredoxin superfamily protein1.9e-1939.04Show/hide
Query:  LVFGFCMVQPNFATVYTVGDTAGWSLGVDYGTWASGKTFSVGDKLAFNYAGGHTVDEVTASDYKACSAGNSITSDSSGSTTITLKNPGTHYFICSSMGHC
        ++FG  +++   AT Y VGD++GW +  D  +W SGK FS GD L F Y+  H+V EV   +Y+ C+  ++I + ++G+TT+ L  PG  +F+C +  HC
Subjt:  LVFGFCMVQPNFATVYTVGDTAGWSLGVDYGTWASGKTFSVGDKLAFNYAGGHTVDEVTASDYKACSAGNSITSDSSGSTTITLKNPGTHYFICSSMGHC

Query:  DSGMKLSVTVAAGGPSTTPSSGGGSSTTPTSPASDTPSATGTTPAT
         +GM+L V V   GPS  P    GS    TS     PS+    PAT
Subjt:  DSGMKLSVTVAAGGPSTTPSSGGGSSTTPTSPASDTPSATGTTPAT


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGAGCTTCCATGCCGGACTTGTTTGCCTCCTGGTATTTGGATTCTGCATGGTACAGCCAAATTTCGCTACGGTTTATACTGTCGGAGACACTGCTGGTTGGTCTCT
CGGTGTTGATTATGGCACGTGGGCTTCCGGGAAGACCTTCAGCGTCGGCGATAAACTTGCGTTCAACTATGCAGGAGGCCACACAGTAGACGAAGTTACTGCCAGTGACT
ACAAAGCATGCTCGGCCGGAAACTCCATAACTTCCGACAGTTCAGGCTCCACCACCATCACCTTAAAAAACCCCGGAACTCACTACTTCATTTGCAGTTCCATGGGGCAT
TGCGATAGCGGCATGAAACTCTCCGTCACAGTCGCCGCCGGTGGACCGTCCACTACTCCATCTTCAGGGGGCGGCAGCTCCACCACTCCAACATCGCCAGCGAGTGACAC
CCCTTCGGCTACCGGAACGACGCCGGCGACGACGACGCCGACAACGAAGCTTCCAGCCGGTTCGTCGAATTCAGGGCCGTCTGTTTTCCCCAATTTTTACATGGCCGTTT
CGGCGATTTTGGTAGGTTCATTGGCGGGTTATTATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGAGCTTCCATGCCGGACTTGTTTGCCTCCTGGTATTTGGATTCTGCATGGTACAGCCAAATTTCGCTACGGTTTATACTGTCGGAGACACTGCTGGTTGGTCTCT
CGGTGTTGATTATGGCACGTGGGCTTCCGGGAAGACCTTCAGCGTCGGCGATAAACTTGCGTTCAACTATGCAGGAGGCCACACAGTAGACGAAGTTACTGCCAGTGACT
ACAAAGCATGCTCGGCCGGAAACTCCATAACTTCCGACAGTTCAGGCTCCACCACCATCACCTTAAAAAACCCCGGAACTCACTACTTCATTTGCAGTTCCATGGGGCAT
TGCGATAGCGGCATGAAACTCTCCGTCACAGTCGCCGCCGGTGGACCGTCCACTACTCCATCTTCAGGGGGCGGCAGCTCCACCACTCCAACATCGCCAGCGAGTGACAC
CCCTTCGGCTACCGGAACGACGCCGGCGACGACGACGCCGACAACGAAGCTTCCAGCCGGTTCGTCGAATTCAGGGCCGTCTGTTTTCCCCAATTTTTACATGGCCGTTT
CGGCGATTTTGGTAGGTTCATTGGCGGGTTATTATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASFHAGLVCLLVFGFCMVQPNFATVYTVGDTAGWSLGVDYGTWASGKTFSVGDKLAFNYAGGHTVDEVTASDYKACSAGNSITSDSSGSTTITLKNPGTHYFICSSMGH
CDSGMKLSVTVAAGGPSTTPSSGGGSSTTPTSPASDTPSATGTTPATTTPTTKLPAGSSNSGPSVFPNFYMAVSAILVGSLAGYY