; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc11G15880 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc11G15880
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionMADS-box transcription factor 23-like
Genome locationClcChr11:26826202..26832362
RNA-Seq ExpressionClc11G15880
SyntenyClc11G15880
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002100 - Transcription factor, MADS-box
IPR033896 - MADS MEF2-like
IPR036879 - Transcription factor, MADS-box superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_011652593.1 MADS-box transcription factor 23 isoform X3 [Cucumis sativus]1.2e-22100Show/hide
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XP_011652594.1 MADS-box transcription factor 23 isoform X4 [Cucumis sativus]1.2e-22100Show/hide
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XP_016903556.1 PREDICTED: MADS-box transcription factor 23-like isoform X5 [Cucumis melo]1.2e-22100Show/hide
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XP_022981047.1 MADS-box transcription factor 23-like isoform X3 [Cucurbita maxima]1.2e-22100Show/hide
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XP_023525011.1 MADS-box transcription factor 23-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.2e-22100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4E6G1 MADS-box transcription factor 23-like isoform X15.9e-23100Show/hide
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A0A6J1ISW7 MADS-box transcription factor 23-like isoform X35.9e-23100Show/hide
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A0A6J1IVD9 MADS-box transcription factor 23-like isoform X25.9e-23100Show/hide
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A0A6J1IYC5 MADS-box transcription factor 23-like isoform X15.9e-23100Show/hide
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A0A6J1J0X9 MADS-box transcription factor 23-like isoform X45.9e-23100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2RVQ5 Agamous-like MADS-box protein AGL163.1e-2183.61Show/hide
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Q6EP49 MADS-box transcription factor 271.6e-2286.89Show/hide
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Q6Z6W2 MADS-box transcription factor 573.7e-2283.61Show/hide
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Q9SI38 MADS-box transcription factor ANR15.6e-2390.16Show/hide
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Q9SZJ6 Agamous-like MADS-box protein AGL216.9e-2181.97Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G14210.1 AGAMOUS-like 444.0e-2490.16Show/hide
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AT2G22630.1 AGAMOUS-like 172.7e-2077.05Show/hide
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AT3G57230.1 AGAMOUS-like 162.2e-2283.61Show/hide
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AT3G57230.2 AGAMOUS-like 162.2e-2283.61Show/hide
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AT4G37940.1 AGAMOUS-like 214.9e-2281.97Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLINRDLIGPRVLQRKNRVADLSMGRGKIVIRRIDNSTSRQVTFSKRRSGLLKKAKELAILCDADVGVIIFSSTSKLYEYSSTSDYYKAPHNRTATELEWLVGKC