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| Q15287 RNA-binding protein with serine-rich domain 1 | 4.7e-20 | 42.64 | Show/hide |
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+R RRS SGS SS+RSRS S S S SS+ + S S S S S S SRS SSS+S S S SS S SP P R+ + RR+R+ S P KR ++ SP
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| Q28E41 RNA-binding protein with serine-rich domain 1 | 4.2e-21 | 43.8 | Show/hide |
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+R RRS SGS SSSRSRS S S S S S S S S S S S S SRS SSSSS S S SS S SP P R+ + RR+R+ S KR ++ SP
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P + P M R+ P RR+ SPRRRSPV RR SP R+ R S
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| Q3KPW1 RNA-binding protein with serine-rich domain 1-B | 3.6e-20 | 43.02 | Show/hide |
Query: SRGRRSPPSGSGSSSRSRSFSGSDSRSSSRSRSRSASVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRASSPPAKRSSPPPRKPSPVR
++ RRS SGS SSSRSR S S S SSS S S S+S S S + SRS SSSSS S S SS S SP P R+ + RR+R+ S KR ++ SP
Subjt: SRGRRSPPSGSGSSSRSRSFSGSDSRSSSRSRSRSASVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRASSPPAKRSSPPPRKPSPVR
Query: ESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFGNFGEVVNVELAMDR-TVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTVATVPKR
+HI L+RNV + H+ EIF +G++ +++ +DR +L KGY YVEF+ +AEKA +MDG QIDG I A L P P R +P+R
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Query: DGPKPENVGPDADKDDMKRQRDPSPRRKPLSPRRRSPVGRRGGSPRRQPDSPRRRPES
P + P M R+ P RR+ SPRRRSPV RR SP R+ R S
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| Q4R5N1 RNA-binding protein with serine-rich domain 1 | 4.7e-20 | 42.64 | Show/hide |
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+R RRS SGS SS+RSRS S S S SS+ + S S S S S S SRS SSS+S S S SS S SP P R+ + RR+R+ S P KR ++ SP
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Query: ESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFGNFGEVVNVELAMDRT-VNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTVATVPKR
+ +HI L+RNV + H+ EIF +G++ +++ ++R +L KGY YVEF+ +AEKA +MDG QIDG I A L P PP + P+R
Subjt: ESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFGNFGEVVNVELAMDRT-VNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTVATVPKR
Query: DGPKPENVGPDADKDDMKRQRDPSPRRKPLSPRRRSPVGRRGGSPRRQPDSPRRRPES
P P M R+ P RR+ SPRRRSPV RR SP R+ R S
Subjt: DGPKPENVGPDADKDDMKRQRDPSPRRKPLSPRRRSPVGRRGGSPRRQPDSPRRRPES
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| Q9SEE9 Serine/arginine-rich splicing factor SR45 | 1.9e-109 | 67.13 | Show/hide |
Query: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSRSRSFSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRASSPPAKRSSPPP
MAKPSRGRRSP S SGS SRSSSRSRS S+ S+SRSRSRSRS+SSSSS SRS SS SRSPP + KSP ARR R+ PP + + P
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Query: RKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFGNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
K + V+ESLVLH+D+LSRNV+E HL+EIFGNFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK+ +PP+ V
Subjt: RKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFGNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
Query: ATVPKRDGPKPENVGPDADKD-DMKRQRDPSPRRKP-LSPRRRSPVGRRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPRRRPASPMRGGRSPSP
+ PKRD PK +N DA+KD +R R+ SP+RK LSPRRRSP+ RRG SPRR+ PDSP RRRP SP RR R D+PPRRRPASP RG SP
Subjt: ATVPKRDGPKPENVGPDADKD-DMKRQRDPSPRRKP-LSPRRRSPVGRRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPRRRPASPMRGGRSPSP
Query: LARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPAAAGRRGRSSSYSGSPSPRKVARRV
RR+RSPPR SPRRIRGSPVRRRSP P RRR+ PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRP RSRS S SPR+GR AGRRGRSSSYS SPSPR++ R++
Subjt: LARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPAAAGRRGRSSSYSGSPSPRKVARRV
Query: --SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
SRSP+RPLRG RSSS SSSSSSPP P
Subjt: --SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
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| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G16610.1 arginine/serine-rich 45 | 1.3e-110 | 67.13 | Show/hide |
Query: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSRSRSFSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRASSPPAKRSSPPP
MAKPSRGRRSP S SGS SRSSSRSRS S+ S+SRSRSRSRS+SSSSS SRS SS SRSPP + KSP ARR R+ PP + + P
Subjt: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSRSRSFSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRASSPPAKRSSPPP
Query: RKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFGNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
K + V+ESLVLH+D+LSRNV+E HL+EIFGNFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK+ +PP+ V
Subjt: RKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFGNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
Query: ATVPKRDGPKPENVGPDADKD-DMKRQRDPSPRRKP-LSPRRRSPVGRRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPRRRPASPMRGGRSPSP
+ PKRD PK +N DA+KD +R R+ SP+RK LSPRRRSP+ RRG SPRR+ PDSP RRRP SP RR R D+PPRRRPASP RG SP
Subjt: ATVPKRDGPKPENVGPDADKD-DMKRQRDPSPRRKP-LSPRRRSPVGRRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPRRRPASPMRGGRSPSP
Query: LARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPAAAGRRGRSSSYSGSPSPRKVARRV
RR+RSPPR SPRRIRGSPVRRRSP P RRR+ PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRP RSRS S SPR+GR AGRRGRSSSYS SPSPR++ R++
Subjt: LARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPAAAGRRGRSSSYSGSPSPRKVARRV
Query: --SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
SRSP+RPLRG RSSS SSSSSSPP P
Subjt: --SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
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| AT1G16610.2 arginine/serine-rich 45 | 7.2e-109 | 66.51 | Show/hide |
Query: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSRSRSFSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRASSPPAKRSSPPP
MAKPSRGRRSP S SGS SRSSSRSRS S+ S+SRSRSRSRS+SSSSS SRS SS SRSPP + KSP ARR R+ PP + + P
Subjt: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSRSRSFSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRASSPPAKRSSPPP
Query: RKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFGNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
K + V+ESLVLH+D+LSRNV+E HL+EIFGNFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK+ +PP+ V
Subjt: RKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFGNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
Query: ATVPKRDGPKPENVGPDADKDDMKRQRDPSPRRKPLSPRRRSPVGRRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPRRRPASPMRGGRSPSPLA
+ PKRD PK +N DA+KD P R+ LSPRRRSP+ RRG SPRR+ PDSP RRRP SP RR R D+PPRRRPASP RG SP
Subjt: ATVPKRDGPKPENVGPDADKDDMKRQRDPSPRRKPLSPRRRSPVGRRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPRRRPASPMRGGRSPSPLA
Query: RRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPAAAGRRGRSSSYSGSPSPRKVARRV--
RR+RSPPR SPRRIRGSPVRRRSP P RRR+ PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRP RSRS S SPR+GR AGRRGRSSSYS SPSPR++ R++
Subjt: RRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPAAAGRRGRSSSYSGSPSPRKVARRV--
Query: SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
SRSP+RPLRG RSSS SSSSSSPP P
Subjt: SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
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| AT1G16610.3 arginine/serine-rich 45 | 2.1e-108 | 65.38 | Show/hide |
Query: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSRSRSFSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRASSPPAKRSSPPP
MAKPSRGRRSP S SGS SRSSSRSRS S+ S+SRSRSRSRS+SSSSS SRS SS SRSPP + KSP ARR R+ PP + + P
Subjt: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSRSRSFSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRASSPPAKRSSPPP
Query: RKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFGNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
K + V+ESLVLH+D+LSRNV+E HL+EIFGNFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK+ +PP+ V
Subjt: RKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFGNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
Query: ATVPKRDGPKPENVGPDADKD-DMKRQRDPSPRRKP-LSPRRRSPVGRRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPRRRPASPMRGGRSPSP
+ PKRD PK +N DA+KD +R R+ SP+RK LSPRRRSP+ RRG SPRR+ PDSP RRRP SP RR R D+PPRRRPASP RG SP
Subjt: ATVPKRDGPKPENVGPDADKD-DMKRQRDPSPRRKP-LSPRRRSPVGRRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPRRRPASPMRGGRSPSP
Query: LARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRR----------GRPAAAGRRGRSSSYSGS
RR+RSPPR SPRRIRGSPVRRRSP P RRR+ PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRP RSRS S SPR+ G AGRRGRSSSYS S
Subjt: LARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRR----------GRPAAAGRRGRSSSYSGS
Query: PSPRKVARRV--SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
PSPR++ R++ SRSP+RPLRG RSSS SSSSSSPP P
Subjt: PSPRKVARRV--SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
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