; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc11G18580 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc11G18580
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Description50S ribosomal protein L2, chloroplastic
Genome locationClcChr11:29105913..29106650
RNA-Seq ExpressionClc11G18580
SyntenyClc11G18580
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0015934 - large ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0016740 - transferase activity (molecular function)
GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002171 - Ribosomal protein L2
IPR005880 - Ribosomal protein L2, bacterial/organellar-type
IPR008991 - Translation protein SH3-like domain superfamily
IPR014722 - Ribosomal protein L2, domain 2
IPR014726 - Ribosomal protein L2, domain 3
IPR022669 - Ribosomal protein L2, C-terminal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6382273.1 hypothetical protein SASPL_158091 [Salvia splendens]5.9e-8992.06Show/hide
Query:  MSPTLPVICGSIDISSSTSRNLYALEEACTVWEGILIDQKEESTSTDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKN
        MSPTLP+ICGSIDI SSTSR  YALEEACTVWEG+LIDQKEESTSTDMPLGT IHNIEITLGKGGQL RAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKN
Subjt:  MSPTLPVICGSIDISSSTSRNLYALEEACTVWEGILIDQKEESTSTDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKN

Query:  CSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPHGGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK
        CSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR   RGV MNPVDHPHGGGEGRA IGRKKP TPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLI+RR SK
Subjt:  CSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPHGGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK

KAG6383879.1 hypothetical protein SASPL_156292 [Salvia splendens]4.2e-8791.01Show/hide
Query:  MSPTLPVICGSIDISSSTSRNLYALEEACTVWEGILIDQKEESTSTDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKN
        MSPTLP+ICGSIDI SSTSR  YALEEACTVWEG+LIDQKEESTSTDMPLGT IHNIEITLGKGGQL RAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKN
Subjt:  MSPTLPVICGSIDISSSTSRNLYALEEACTVWEGILIDQKEESTSTDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKN

Query:  CSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPHGGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK
        CSATVGQVGNVG NQKSLGRAGSK WLGKR   RGV MNPVDHPHGGGEGRA IGRKKP TPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLI+RR SK
Subjt:  CSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPHGGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK

RVW36222.1 50S ribosomal protein L2, chloroplastic [Vitis vinifera]7.5e-8493.75Show/hide
Query:  ISSSTSRNLYALEEACTVWEGILIDQKEESTSTDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGV
        ISSSTSR  YALEEACTVWEG+LIDQKEESTSTDMPLGT IHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGV
Subjt:  ISSSTSRNLYALEEACTVWEGILIDQKEESTSTDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGV

Query:  NQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPHGGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK
        NQKSLGRAGSKCWLGKR   RGV MNPVDHPHGGGEGRA IGRKKP TPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRR SK
Subjt:  NQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPHGGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK

YP_009715437.1 ribosomal protein L2 [Colvillea racemosa]7.5e-8489.42Show/hide
Query:  MSPTLPVICGSIDISSSTSRNLYALEEACTVWEGILIDQKEESTSTDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKN
        M   LP+   S  ISSSTSR  YALEEACTVWEG+LIDQKEESTSTDMPLGT IHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKN
Subjt:  MSPTLPVICGSIDISSSTSRNLYALEEACTVWEGILIDQKEESTSTDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKN

Query:  CSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPHGGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK
        CSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR   RGV MNPVDHPHGGGEGRA IGRKKP TPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRR SK
Subjt:  CSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPHGGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK

YP_009758282.1 ribosomal protein L2 [Rubus amabilis]4.4e-8488.89Show/hide
Query:  MSPTLPVICGSIDISSSTSRNLYALEEACTVWEGILIDQKEESTSTDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKN
        M   LP+   S +ISSSTSR  YALEEACTVWEG+LIDQKEESTSTDMPLGT IHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKN
Subjt:  MSPTLPVICGSIDISSSTSRNLYALEEACTVWEGILIDQKEESTSTDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKN

Query:  CSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPHGGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK
        CSATVGQVGNVGVNQKSLG+AGSKCWLGKR   RGV MNPVDHPHGGGEGRA IGRKKP TPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRR SK
Subjt:  CSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPHGGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A438GGK8 50S ribosomal protein L2, chloroplastic3.6e-8493.75Show/hide
Query:  ISSSTSRNLYALEEACTVWEGILIDQKEESTSTDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGV
        ISSSTSR  YALEEACTVWEG+LIDQKEESTSTDMPLGT IHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGV
Subjt:  ISSSTSRNLYALEEACTVWEGILIDQKEESTSTDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGV

Query:  NQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPHGGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK
        NQKSLGRAGSKCWLGKR   RGV MNPVDHPHGGGEGRA IGRKKP TPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRR SK
Subjt:  NQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPHGGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK

A0A649X4M7 50S ribosomal protein L2, chloroplastic3.6e-8489.42Show/hide
Query:  MSPTLPVICGSIDISSSTSRNLYALEEACTVWEGILIDQKEESTSTDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKN
        M   LP+   S  ISSSTSR  YALEEACTVWEG+LIDQKEESTSTDMPLGT IHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKN
Subjt:  MSPTLPVICGSIDISSSTSRNLYALEEACTVWEGILIDQKEESTSTDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKN

Query:  CSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPHGGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK
        CSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR   RGV MNPVDHPHGGGEGRA IGRKKP TPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRR SK
Subjt:  CSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPHGGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK

A0A6G8QRU1 50S ribosomal protein L2, chloroplastic2.1e-8488.89Show/hide
Query:  MSPTLPVICGSIDISSSTSRNLYALEEACTVWEGILIDQKEESTSTDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKN
        M   LP+   S +ISSSTSR  YALEEACTVWEG+LIDQKEESTSTDMPLGT IHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKN
Subjt:  MSPTLPVICGSIDISSSTSRNLYALEEACTVWEGILIDQKEESTSTDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKN

Query:  CSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPHGGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK
        CSATVGQVGNVGVNQKSLG+AGSKCWLGKR   RGV MNPVDHPHGGGEGRA IGRKKP TPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRR SK
Subjt:  CSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPHGGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK

A0A7T7D7D8 Ribosomal protein L23.6e-8489.42Show/hide
Query:  MSPTLPVICGSIDISSSTSRNLYALEEACTVWEGILIDQKEESTSTDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKN
        M   LP+   S  ISSSTSR  YALEEACTVWEG+LIDQKEESTSTDMPLGT IHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKN
Subjt:  MSPTLPVICGSIDISSSTSRNLYALEEACTVWEGILIDQKEESTSTDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKN

Query:  CSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPHGGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK
        CSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR   RGV MNPVDHPHGGGEGRA IGRKKP TPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRR SK
Subjt:  CSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPHGGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK

A0A7T7IE65 Ribosomal protein L22.1e-8488.89Show/hide
Query:  MSPTLPVICGSIDISSSTSRNLYALEEACTVWEGILIDQKEESTSTDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKN
        M   LP+   S +ISSSTSR  YALEEACTVWEG+LIDQKEESTSTDMPLGT IHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKN
Subjt:  MSPTLPVICGSIDISSSTSRNLYALEEACTVWEGILIDQKEESTSTDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKN

Query:  CSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPHGGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK
        CSATVGQVGNVGVNQKSLG+AGSKCWLGKR   RGV MNPVDHPHGGGEGRA IGRKKP TPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRR SK
Subjt:  CSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPHGGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B1A976 50S ribosomal protein L2, chloroplastic1.1e-6994.44Show/hide
Query:  TDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPH
        TDMPLGT IHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR   RGV MNPVDHPH
Subjt:  TDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPH

Query:  GGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK
        GGGEGRA IGRKKP TPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRR SK
Subjt:  GGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK

Q0ZIX7 50S ribosomal protein L2, chloroplastic1.1e-6994.44Show/hide
Query:  TDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPH
        TDMPLGT IHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR   RGV MNPVDHPH
Subjt:  TDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPH

Query:  GGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK
        GGGEGRA IGRKKP TPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRR SK
Subjt:  GGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK

Q14F95 50S ribosomal protein L2-A, chloroplastic2.4e-6993.1Show/hide
Query:  STDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHP
        STDMPLGT IHNIEITLG+GGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKNCSATVGQVGN GVNQKSLGRAGSKCWLGKR   RGV MNPVDHP
Subjt:  STDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHP

Query:  HGGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK
        HGGGEGRA IGRKKP TPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRR SK
Subjt:  HGGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK

Q2L944 50S ribosomal protein L2, chloroplastic2.4e-6993.75Show/hide
Query:  TDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPH
        TDMPLGT IHNIEITLG+GGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR   RGV MNPVDHPH
Subjt:  TDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPH

Query:  GGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK
        GGGEGRA IGRKKP TPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRR SK
Subjt:  GGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK

Q4VZK5 50S ribosomal protein L2, chloroplastic3.2e-6993.75Show/hide
Query:  TDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPH
        TDMPLGT IHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKNCSATVGQVGN GVNQKSLGRAGSKCWLGKR   RGV MNPVDHPH
Subjt:  TDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPH

Query:  GGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK
        GGGEGRA IGRKKP TPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRR SK
Subjt:  GGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G44065.1 Ribosomal protein L2 family2.1e-2347.62Show/hide
Query:  MPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATL-KLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLG---KRRGVAMNPVDHPHG
        M +GT IHNIE+  G+G ++ RAAG  AK++ +  K   L KLPSG+ + I+  C AT+G V N     K L +AG   WLG   K RGVAMNP DHPHG
Subjt:  MPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATL-KLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLG---KRRGVAMNPVDHPHG

Query:  GGEGRALIGRKKPPT---PWGYPALG
        GGEG++     +  T   PWG P  G
Subjt:  GGEGRALIGRKKPPT---PWGYPALG

AT2G44065.2 Ribosomal protein L2 family2.1e-2347.62Show/hide
Query:  MPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATL-KLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLG---KRRGVAMNPVDHPHG
        M +GT IHNIE+  G+G ++ RAAG  AK++ +  K   L KLPSG+ + I+  C AT+G V N     K L +AG   WLG   K RGVAMNP DHPHG
Subjt:  MPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATL-KLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLG---KRRGVAMNPVDHPHG

Query:  GGEGRALIGRKKPPT---PWGYPALG
        GGEG++     +  T   PWG P  G
Subjt:  GGEGRALIGRKKPPT---PWGYPALG

AT3G51190.1 Ribosomal protein L2 family2.3e-1444.04Show/hide
Query:  MPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSAT--LKLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGS---------KCWLGKRRGVAMN
        +P G  I N+E+ +G  G LARA+G  A +IA   +S T  +KLPSG  +++   C A +GQV   G  +K L +AG+          CW    RGVAMN
Subjt:  MPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSAT--LKLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGS---------KCWLGKRRGVAMN

Query:  PVDHPHGGG
        PV+HPHGGG
Subjt:  PVDHPHGGG

ATCG00830.1 ribosomal protein L23.6e-6890.97Show/hide
Query:  TDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPH
        TDMPLGT IHNIEITLG+GGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR   RGV MNPVDHPH
Subjt:  TDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPH

Query:  GGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK
        GGGEGRA IGRKKP TPWGYPALGRR+RKR KYS+ LILRR SK
Subjt:  GGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK

ATCG01310.1 ribosomal protein L23.6e-6890.97Show/hide
Query:  TDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPH
        TDMPLGT IHNIEITLG+GGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR   RGV MNPVDHPH
Subjt:  TDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKNCSATVGQVGNVGVNQKSLGRAGSKCWLGKR---RGVAMNPVDHPH

Query:  GGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK
        GGGEGRA IGRKKP TPWGYPALGRR+RKR KYS+ LILRR SK
Subjt:  GGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTCCTACGTTACCCGTAATATGTGGAAGTATCGATATATCATCATCTACATCCAGAAACCTGTATGCTTTGGAAGAAGCTTGTACTGTTTGGGAAGGGATTTTGAT
TGATCAAAAAGAAGAATCTACTTCAACTGATATGCCCTTAGGCACGACCATACATAACATAGAAATCACACTTGGGAAGGGGGGACAATTAGCTAGAGCAGCAGGTGCTG
TAGCGAAATTGATTGCAAAAGAGGGGAAATCGGCCACATTAAAATTACCTTCTGGGGAGGTTCGTTTGATATCCAAAAATTGCTCAGCAACAGTCGGACAAGTGGGGAAT
GTTGGGGTAAACCAGAAAAGTTTGGGTAGAGCCGGATCTAAATGTTGGCTAGGTAAGCGTCGAGGAGTAGCTATGAACCCTGTAGACCATCCCCATGGGGGTGGTGAAGG
GAGGGCCCTAATTGGTAGAAAAAAACCCCCAACCCCTTGGGGTTATCCTGCACTTGGAAGAAGAAGTCGAAAAAGGAATAAATATAGTGATAATTTGATTCTTCGTCGCC
ATAGTAAATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCTCCTACGTTACCCGTAATATGTGGAAGTATCGATATATCATCATCTACATCCAGAAACCTGTATGCTTTGGAAGAAGCTTGTACTGTTTGGGAAGGGATTTTGAT
TGATCAAAAAGAAGAATCTACTTCAACTGATATGCCCTTAGGCACGACCATACATAACATAGAAATCACACTTGGGAAGGGGGGACAATTAGCTAGAGCAGCAGGTGCTG
TAGCGAAATTGATTGCAAAAGAGGGGAAATCGGCCACATTAAAATTACCTTCTGGGGAGGTTCGTTTGATATCCAAAAATTGCTCAGCAACAGTCGGACAAGTGGGGAAT
GTTGGGGTAAACCAGAAAAGTTTGGGTAGAGCCGGATCTAAATGTTGGCTAGGTAAGCGTCGAGGAGTAGCTATGAACCCTGTAGACCATCCCCATGGGGGTGGTGAAGG
GAGGGCCCTAATTGGTAGAAAAAAACCCCCAACCCCTTGGGGTTATCCTGCACTTGGAAGAAGAAGTCGAAAAAGGAATAAATATAGTGATAATTTGATTCTTCGTCGCC
ATAGTAAATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSPTLPVICGSIDISSSTSRNLYALEEACTVWEGILIDQKEESTSTDMPLGTTIHNIEITLGKGGQLARAAGAVAKLIAKEGKSATLKLPSGEVRLISKNCSATVGQVGN
VGVNQKSLGRAGSKCWLGKRRGVAMNPVDHPHGGGEGRALIGRKKPPTPWGYPALGRRSRKRNKYSDNLILRRHSK