; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc11G19180 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc11G19180
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Description26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5
Genome locationClcChr11:29654057..29663941
RNA-Seq ExpressionClc11G19180
SyntenyClc11G19180
Gene Ontology termsGO:0043248 - proteasome assembly (biological process)
InterPro domainsIPR011989 - Armadillo-like helical
IPR016024 - Armadillo-type fold
IPR019538 - 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7037420.1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.6e-25986.68Show/hide
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XP_008463698.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501781 isoform X1 [Cucumis melo]8.1e-25687.01Show/hide
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XP_038898234.1 uncharacterized protein LOC120085959 isoform X1 [Benincasa hispida]1.2e-26489.98Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L246 Uncharacterized protein7.1e-25887.76Show/hide
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A0A1S3CKC0 uncharacterized protein LOC103501781 isoform X13.9e-25687.01Show/hide
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A0A5D3DVV9 Armadillo-like helical6.9e-25386.46Show/hide
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A0A6J1FJQ7 uncharacterized protein LOC1114463603.0e-25687.01Show/hide
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        MEEF++DDP+QLLEAAA+FANYPGVRTDASVKEF  RFPLPV+INALQ KAEIPGLENTLVACL RIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGL+ADSQ VRSLAC
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Query:  KTVTRLLQESDETALLAIQLIIDYGLYPLLLECLLNGNEEVANSSMDTIKTLAAFPQGMAIIFPTNKTEATHLETVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSS
        KTVTRLL+E+D T  LA QLI+DY +YPLL+ECLLNGNE+VANSSMD IK LAAFP+GM IIFPTNKTEATHL TVASTCSSLGRVRVMAL+VKLFSVSS
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Query:  SVASAVYNANLLSLLESEISNSNDTLVTLSVLELLYEVYCLFLPDLLFMNMLVEVEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESIVRSRAMVISGRLLSKEN
        SVASAVYN+NLL+LLESEISNSNDTLVTLSVLELLYE              LVE+EHGT FLPRTSFLQLLSSIISN SAESI+RSRAMVISGRLLSKEN
Subjt:  SVASAVYNANLLSLLESEISNSNDTLVTLSVLELLYEVYCLFLPDLLFMNMLVEVEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESIVRSRAMVISGRLLSKEN

Query:  ICSLVDESCVRNLISAIDGILGSSEGQDVNECEAAFEALGQIGSSKWGATLLLSSFPTCVELVIYAAFDRHEHSKQLAAMHALGNIFGETRSENDIVLND
        I SLVDESCVR LISAID ILGSSEGQDVN CE+AFEALGQIGSSKWGATLLLSS+PTCV+ VI AAFDRHEH KQLAAMHALGNIFGETRSENDI+LND
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Query:  NAEENLRDLIYQIASKSPKMMPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQDIINIVTDASTETTKIGMEARYKCCLAFHKAFMSSTRLT
        NAEENLRDLIYQ AS+SPKM PSGL LAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQDIINIV+DASTETTKIGMEARY CCLA HKAFMSSTRLT
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Query:  GDPALAGIASKLQEAFRNGPYLNRRNLETQPAIMTAERF
        GDPALAGIASKLQEA +NGPYL+RR LETQPAIMTAERF
Subjt:  GDPALAGIASKLQEAFRNGPYLNRRNLETQPAIMTAERF

A0A6J1IVZ7 uncharacterized protein LOC1114804338.2e-25486.09Show/hide
Query:  MEEFSLDDPSQLLEAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPVIINALQTKAEIPGLENTLVACLHRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLRADSQTVRSLAC
        MEEF++DDP+QLLEAAA+FANYPGVRTD SVKEF  RFPLPV+INALQ KAEIPGLENTLVACL RIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGL+ADSQ VRSLAC
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Query:  KTVTRLLQESDETALLAIQLIIDYGLYPLLLECLLNGNEEVANSSMDTIKTLAAFPQGMAIIFPTNKTEATHLETVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSS
        KTVTRLL+E+D T  LA QLI+DY +YPLL+ECLLNGNE+VANSSMD +K LAAFP+GM IIFPTNKTEATHL TVASTCSSLGRVRVMAL+VKLFSVSS
Subjt:  KTVTRLLQESDETALLAIQLIIDYGLYPLLLECLLNGNEEVANSSMDTIKTLAAFPQGMAIIFPTNKTEATHLETVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSS

Query:  SVASAVYNANLLSLLESEISNSNDTLVTLSVLELLYEVYCLFLPDLLFMNMLVEVEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESIVRSRAMVISGRLLSKEN
        SVASAVYN+NLL+LLESEISNSNDTLVTLSVLELLYE              LVE+EHGT FLPRTSFLQLLSSIISN SAESI+RSRAMVISGRLLSKEN
Subjt:  SVASAVYNANLLSLLESEISNSNDTLVTLSVLELLYEVYCLFLPDLLFMNMLVEVEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESIVRSRAMVISGRLLSKEN

Query:  ICSLVDESCVRNLISAIDGILGSSEGQDVNECEAAFEALGQIGSSKWGATLLLSSFPTCVELVIYAAFDRHEHSKQLAAMHALGNIFGETRSENDIVLND
        I SLVDESCVR LIS+ID ILGSSEGQDVN CE+AFEALGQIGSSKWGATLLLSS+PTCV+ VI AAFDRHEH KQLAAMHALGNIFGETRSENDI+LND
Subjt:  ICSLVDESCVRNLISAIDGILGSSEGQDVNECEAAFEALGQIGSSKWGATLLLSSFPTCVELVIYAAFDRHEHSKQLAAMHALGNIFGETRSENDIVLND

Query:  NAEENLRDLIYQIASKSPKMMPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQDIINIVTDASTETTKIGMEARYKCCLAFHKAFMSSTRLT
        NAEENL DLIYQ AS+SPK+ PSGL LAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQDIINIV+DASTETTKIGMEARY CCLA HKAFMSSTRLT
Subjt:  NAEENLRDLIYQIASKSPKMMPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQDIINIVTDASTETTKIGMEARYKCCLAFHKAFMSSTRLT

Query:  GDPALAGIASKLQEAFRNGPYLNRRNLETQPAIMTAERF
        GDPALAGIASKLQEA +NGPYL+RR LETQPAIMTAERF
Subjt:  GDPALAGIASKLQEAFRNGPYLNRRNLETQPAIMTAERF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G15180.1 ARM repeat superfamily protein1.6e-16155.81Show/hide
Query:  LDDPSQLLEAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPVIINALQTKAEIPGLENTLVACLHRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLRADSQTVRSLACKTVTR
        ++D +QL +AA  FA+YPG + + SVKEFLDRFPLPVI NALQT  +IPG ENTLV CL R+FKTKYGASLIP YMP +QVGL+ADS  V+SLACKTV  
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Query:  LLQESDETALLAIQLIIDYGLYPLLLECLLNGNEEVANSSMDTIKTLAAFPQGMAIIFPTNKTEATHLETVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASA
        LL++ D   + ++QL+++ G+YPLLL+ ++N ++EVAN++ +TIK+LA FP  M++IFP+   + THL  +A+ CSSL RVRV++L+VKLFS+S  VAS 
Subjt:  LLQESDETALLAIQLIIDYGLYPLLLECLLNGNEEVANSSMDTIKTLAAFPQGMAIIFPTNKTEATHLETVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASA

Query:  VYNANLLSLLESEISNSNDTLVTLSVLELLYEVYCLFLPDLLFMNMLVEVEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESIVRSRAMVISGRLLSKENICSLV
        V  + LL LLE+E+  + DTLV L+VLEL YE              L+EVEH ++F+P+TS +QLL SIIS +S     + RAM+ISGRLLSKENI  +V
Subjt:  VYNANLLSLLESEISNSNDTLVTLSVLELLYEVYCLFLPDLLFMNMLVEVEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESIVRSRAMVISGRLLSKENICSLV

Query:  DESCVRNLISAIDGILGSSEGQDVNECEAAFEALGQIGSSKWGATLLLSSFPTCVELVIYAAFDRHEHSKQLAAMHALGNIFGETRSENDIVLNDNAEEN
        +E+ V+ LISAIDG L S E  D +  EAA +ALGQ+GS+  GA L+LS+ P     V+ +AFDR+ H KQLAA+HAL NI GETR +++ +++  AEE+
Subjt:  DESCVRNLISAIDGILGSSEGQDVNECEAAFEALGQIGSSKWGATLLLSSFPTCVELVIYAAFDRHEHSKQLAAMHALGNIFGETRSENDIVLNDNAEEN

Query:  LRDLIYQIASKSPKMMPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQDIINIVTDASTETTKIGMEARYKCCLAFHKAFMSSTRLTGDPAL
        LR LIY  A++S K+ PSGLFL+VLQQ SEIRLA YR +T LVARPWCL+EI +K++IINIVTDA+TET KI MEARY CC A H+AF+ S     DP  
Subjt:  LRDLIYQIASKSPKMMPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQDIINIVTDASTETTKIGMEARYKCCLAFHKAFMSSTRLTGDPAL

Query:  AGIASKLQEAFRNGPYLNRRNLETQPAIMTAERF
             KLQEA R+GPY+++++   +P +MT E F
Subjt:  AGIASKLQEAFRNGPYLNRRNLETQPAIMTAERF

AT3G15180.2 ARM repeat superfamily protein1.1e-15752.83Show/hide
Query:  LDDPSQLLEAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPVIINALQTKAEIPGLENTLVACLHRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLRADSQTVRSLACKTVTR
        ++D +QL +AA  FA+YPG + + SVKEFLDRFPLPVI NALQT  +IPG ENTLV CL R+FKTKYGASLIP YMP +QVGL+ADS  V+SLACKTV  
Subjt:  LDDPSQLLEAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPVIINALQTKAEIPGLENTLVACLHRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLRADSQTVRSLACKTVTR

Query:  LLQESDETALLAIQLIIDYGLYPLLLECLLNGNEEVANSSMDTIKTLAAFPQGMAIIFPTNKTEATHLETVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASA
        LL++ D   + ++QL+++ G+YPLLL+ ++N ++EVAN++ +TIK+LA FP  M++IFP+   + THL  +A+ CSSL RVRV++L+VKLFS+S  VAS 
Subjt:  LLQESDETALLAIQLIIDYGLYPLLLECLLNGNEEVANSSMDTIKTLAAFPQGMAIIFPTNKTEATHLETVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASA

Query:  VYNANLLSLLESEISNSNDTLVTLSVLELLYEVYCLFLPDLLFMNMLVEVEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESIVRSRAMVISGRLLSKENICSLV
        V  + LL LLE+E+  + DTLV L+VLEL YE              L+EVEH ++F+P+TS +QLL SIIS +S     + RAM+ISGRLLSKENI  +V
Subjt:  VYNANLLSLLESEISNSNDTLVTLSVLELLYEVYCLFLPDLLFMNMLVEVEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESIVRSRAMVISGRLLSKENICSLV

Query:  DES--------------------------------CVRNLISAIDGILGSSEGQDVNECEAAFEALGQIGSSKWGATLLLSSFPTCVELVIYAAFDRHEH
        +E+                                CV+ LISAIDG L S E  D +  EAA +ALGQ+GS+  GA L+LS+ P     V+ +AFDR+ H
Subjt:  DES--------------------------------CVRNLISAIDGILGSSEGQDVNECEAAFEALGQIGSSKWGATLLLSSFPTCVELVIYAAFDRHEH

Query:  SKQLAAMHALGNIFGETRSENDIVLNDNAEENLRDLIYQIASKSPKMMPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQDIINIVTDASTE
         KQLAA+HAL NI GETR +++ +++  AEE+LR LIY  A++S K+ PSGLFL+VLQQ SEIRLA YR +T LVARPWCL+EI +K++IINIVTDA+TE
Subjt:  SKQLAAMHALGNIFGETRSENDIVLNDNAEENLRDLIYQIASKSPKMMPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQDIINIVTDASTE

Query:  TTKIGMEARYKCCLAFHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQEAFRNGPYLNRRNLETQPAIMTAERF
        T KI MEARY CC A H+AF+ S     DP       KLQEA R+GPY+++++   +P +MT E F
Subjt:  TTKIGMEARYKCCLAFHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQEAFRNGPYLNRRNLETQPAIMTAERF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGAATTTTCTTTGGATGATCCGTCTCAGCTACTCGAAGCAGCTGCAAACTTCGCAAATTATCCCGGTGTTCGGACTGATGCGTCGGTTAAGGAATTTCTCGACCG
CTTCCCCCTTCCCGTCATCATCAATGCTTTACAAACAAAAGCAGAAATTCCTGGTCTAGAGAACACTCTGGTTGCATGTCTTCACAGGATATTCAAAACCAAGTATGGTG
CTTCTCTCATACCTCATTATATGCCTTTTGTACAGGTTGGACTACGGGCAGATTCTCAAACAGTTAGAAGCTTAGCTTGTAAAACGGTCACTCGCCTTTTACAGGAGTCT
GATGAAACTGCTCTTTTGGCTATACAACTAATTATTGACTACGGCCTCTATCCACTTTTGCTCGAGTGCCTTCTCAATGGTAATGAAGAAGTTGCTAACTCATCAATGGA
TACAATTAAGACATTGGCTGCATTTCCACAGGGGATGGCGATCATCTTCCCAACAAATAAAACAGAAGCAACCCACCTAGAAACTGTAGCTTCAACATGTTCATCTCTGG
GCAGAGTTCGAGTCATGGCTTTGGTAGTGAAACTATTTTCAGTTTCTAGCTCTGTGGCATCGGCAGTATACAATGCAAATTTACTAAGCCTACTGGAAAGTGAAATCAGC
AATTCAAATGATACACTTGTAACTTTAAGTGTGTTGGAACTCTTGTATGAGGTTTATTGTCTCTTTCTCCCTGACCTCTTGTTTATGAACATGCTAGTGGAGGTTGAACA
TGGTACAAAGTTCTTGCCAAGGACCAGCTTTCTCCAACTTCTAAGCTCTATAATCAGCAACTCATCAGCAGAGTCTATTGTACGATCAAGAGCCATGGTCATTAGTGGAA
GACTTTTGTCTAAAGAGAACATTTGCTCACTTGTAGATGAATCATGTGTACGGAATTTGATATCTGCTATAGATGGAATTCTTGGGTCATCTGAAGGACAAGATGTAAAC
GAATGCGAAGCTGCATTTGAAGCACTGGGTCAAATTGGGTCAAGCAAATGGGGAGCCACTTTACTGCTGTCAAGTTTTCCAACTTGTGTGGAGCTTGTAATTTATGCAGC
TTTTGATCGGCATGAGCACAGCAAACAGTTGGCAGCCATGCATGCTCTTGGTAATATCTTTGGAGAAACTCGATCTGAGAATGATATTGTACTAAATGATAATGCCGAAG
AAAATTTGCGGGATTTGATATATCAAATTGCATCCAAAAGTCCAAAAATGATGCCCTCGGGTCTTTTTCTAGCTGTCCTCCAACAGGACTCTGAGATTCGCTTGGCGAGT
TACAGAATGATAACTGGGTTGGTCGCTCGACCTTGGTGCCTAATGGAAATCTGCTCAAAACAAGACATAATAAATATAGTTACTGATGCAAGTACTGAGACTACTAAAAT
AGGAATGGAAGCTAGATATAAGTGTTGTTTGGCTTTCCATAAGGCCTTCATGTCTTCAACTAGGCTTACTGGCGATCCTGCTCTTGCTGGAATAGCTTCAAAGCTGCAGG
AAGCTTTTAGAAATGGTCCATATCTTAATAGAAGGAATCTTGAAACTCAACCAGCAATAATGACAGCTGAGAGATTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAAATTTAAGCTCATTCGTGATTATCTTACAAAACACCTCTTTAGGCGGTGCTCTTCGTCTTCCATAGAATGTGACAAACAAGAAAAGTTGAAACCGACTGAAAATAC
TCTCACACTCCCACTCTCCGATTCTCTCCTTCTTTTCCCATTTTCACACTCATATCAAAAACTCTGGGAGCGAAGAAATGGAGGAATTTTCTTTGGATGATCCGTCTCAG
CTACTCGAAGCAGCTGCAAACTTCGCAAATTATCCCGGTGTTCGGACTGATGCGTCGGTTAAGGAATTTCTCGACCGCTTCCCCCTTCCCGTCATCATCAATGCTTTACA
AACAAAAGCAGAAATTCCTGGTCTAGAGAACACTCTGGTTGCATGTCTTCACAGGATATTCAAAACCAAGTATGGTGCTTCTCTCATACCTCATTATATGCCTTTTGTAC
AGGTTGGACTACGGGCAGATTCTCAAACAGTTAGAAGCTTAGCTTGTAAAACGGTCACTCGCCTTTTACAGGAGTCTGATGAAACTGCTCTTTTGGCTATACAACTAATT
ATTGACTACGGCCTCTATCCACTTTTGCTCGAGTGCCTTCTCAATGGTAATGAAGAAGTTGCTAACTCATCAATGGATACAATTAAGACATTGGCTGCATTTCCACAGGG
GATGGCGATCATCTTCCCAACAAATAAAACAGAAGCAACCCACCTAGAAACTGTAGCTTCAACATGTTCATCTCTGGGCAGAGTTCGAGTCATGGCTTTGGTAGTGAAAC
TATTTTCAGTTTCTAGCTCTGTGGCATCGGCAGTATACAATGCAAATTTACTAAGCCTACTGGAAAGTGAAATCAGCAATTCAAATGATACACTTGTAACTTTAAGTGTG
TTGGAACTCTTGTATGAGGTTTATTGTCTCTTTCTCCCTGACCTCTTGTTTATGAACATGCTAGTGGAGGTTGAACATGGTACAAAGTTCTTGCCAAGGACCAGCTTTCT
CCAACTTCTAAGCTCTATAATCAGCAACTCATCAGCAGAGTCTATTGTACGATCAAGAGCCATGGTCATTAGTGGAAGACTTTTGTCTAAAGAGAACATTTGCTCACTTG
TAGATGAATCATGTGTACGGAATTTGATATCTGCTATAGATGGAATTCTTGGGTCATCTGAAGGACAAGATGTAAACGAATGCGAAGCTGCATTTGAAGCACTGGGTCAA
ATTGGGTCAAGCAAATGGGGAGCCACTTTACTGCTGTCAAGTTTTCCAACTTGTGTGGAGCTTGTAATTTATGCAGCTTTTGATCGGCATGAGCACAGCAAACAGTTGGC
AGCCATGCATGCTCTTGGTAATATCTTTGGAGAAACTCGATCTGAGAATGATATTGTACTAAATGATAATGCCGAAGAAAATTTGCGGGATTTGATATATCAAATTGCAT
CCAAAAGTCCAAAAATGATGCCCTCGGGTCTTTTTCTAGCTGTCCTCCAACAGGACTCTGAGATTCGCTTGGCGAGTTACAGAATGATAACTGGGTTGGTCGCTCGACCT
TGGTGCCTAATGGAAATCTGCTCAAAACAAGACATAATAAATATAGTTACTGATGCAAGTACTGAGACTACTAAAATAGGAATGGAAGCTAGATATAAGTGTTGTTTGGC
TTTCCATAAGGCCTTCATGTCTTCAACTAGGCTTACTGGCGATCCTGCTCTTGCTGGAATAGCTTCAAAGCTGCAGGAAGCTTTTAGAAATGGTCCATATCTTAATAGAA
GGAATCTTGAAACTCAACCAGCAATAATGACAGCTGAGAGATTTTAAGAGTACACTATGGTTCAAAAGGCAAGCCTTATATACAGTGGTTTGTAGGTTGTTACATCTTTT
GTTTCTAACTTTCTAGTTGAAAATCATCACTTGGGGAGTTCACAGTAATATTTGAAAATAGATTTTTTAGTATTTTCCATGGATTGTGTGTAGTAATATTTCTCTATCTC
TTTGGATATATGTTTGTGAATGGATTGATGTGTTTATTAAATTTGCTCGGGACAGCGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEEFSLDDPSQLLEAAANFANYPGVRTDASVKEFLDRFPLPVIINALQTKAEIPGLENTLVACLHRIFKTKYGASLIPHYMPFVQVGLRADSQTVRSLACKTVTRLLQES
DETALLAIQLIIDYGLYPLLLECLLNGNEEVANSSMDTIKTLAAFPQGMAIIFPTNKTEATHLETVASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSSSVASAVYNANLLSLLESEIS
NSNDTLVTLSVLELLYEVYCLFLPDLLFMNMLVEVEHGTKFLPRTSFLQLLSSIISNSSAESIVRSRAMVISGRLLSKENICSLVDESCVRNLISAIDGILGSSEGQDVN
ECEAAFEALGQIGSSKWGATLLLSSFPTCVELVIYAAFDRHEHSKQLAAMHALGNIFGETRSENDIVLNDNAEENLRDLIYQIASKSPKMMPSGLFLAVLQQDSEIRLAS
YRMITGLVARPWCLMEICSKQDIINIVTDASTETTKIGMEARYKCCLAFHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQEAFRNGPYLNRRNLETQPAIMTAERF