; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmUC01G003280 (gene) of Watermelon (USVL531) v1 genome

Gene IDCmUC01G003280
OrganismCitrullus mucosospermus (Watermelon (USVL531) v1)
Descriptionagamous-like MADS-box protein AGL19
Genome locationCmU531Chr01:3173583..3179429
RNA-Seq ExpressionCmUC01G003280
SyntenyCmUC01G003280
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002100 - Transcription factor, MADS-box
IPR002487 - Transcription factor, K-box
IPR033896 - MADS MEF2-like
IPR036879 - Transcription factor, MADS-box superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7016937.1 Agamous-like MADS-box protein AGL19, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.7e-8786.18Show/hide
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XP_022156217.1 agamous-like MADS-box protein AGL19 [Momordica charantia]5.3e-8986.64Show/hide
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XP_038906882.1 agamous-like MADS-box protein AGL19 [Benincasa hispida]3.4e-10495.87Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3AT26 agamous-like MADS-box protein AGL195.5e-10093.93Show/hide
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A0A6J1DRG2 agamous-like MADS-box protein AGL192.5e-8986.64Show/hide
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A0A6J1E382 agamous-like MADS-box protein AGL19 isoform X25.0e-8584.79Show/hide
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A0A6J1E6F6 agamous-like MADS-box protein AGL19 isoform X13.1e-8785.71Show/hide
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A0A6J1I258 agamous-like MADS-box protein AGL19 isoform X14.1e-8785.71Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O64645 MADS-box protein SOC12.2e-5358.57Show/hide
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O82743 Agamous-like MADS-box protein AGL192.9e-5861.03Show/hide
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Q38838 Agamous-like MADS-box protein AGL142.3e-5559.15Show/hide
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Q9FIS1 MADS-box protein AGL428.0e-4853.37Show/hide
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Q9XJ60 MADS-box transcription factor 502.9e-5056.07Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G45660.1 AGAMOUS-like 201.5e-5458.57Show/hide
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AT4G11880.1 AGAMOUS-like 141.6e-5659.15Show/hide
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AT4G22950.1 AGAMOUS-like 192.1e-5961.03Show/hide
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