; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmUC02G041000 (gene) of Watermelon (USVL531) v1 genome

Gene IDCmUC02G041000
OrganismCitrullus mucosospermus (Watermelon (USVL531) v1)
DescriptionRapid ALkalinization Factor
Genome locationCmU531Chr02:28780229..28780836
RNA-Seq ExpressionCmUC02G041000
SyntenyCmUC02G041000
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6586247.1 Protein RALF-like 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.2e-4793.88Show/hide
Query:  CSSTAVQAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        CSSTAV  GLGI HSL WIPNQSTCKG+IAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  CSSTAVQAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS

XP_022150733.1 protein RALF-like 33 [Momordica charantia]9.4e-4792.86Show/hide
Query:  CSSTAVQAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        CSSTAV  GLGIHHSLAWIP+QS+CKGSIAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGAL+RNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPY RGCSAITRCRS
Subjt:  CSSTAVQAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS

XP_022937540.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita moschata]7.2e-4793.88Show/hide
Query:  CSSTAVQAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        CSSTAV  GLGI HSL WIPNQSTCKG+IAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  CSSTAVQAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS

XP_022966015.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita maxima]8.5e-4894.9Show/hide
Query:  CSSTAVQAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        CSSTAV  GLGIHHSL WIPNQSTCKG+IAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  CSSTAVQAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS

XP_038889183.1 protein RALF-like 33 [Benincasa hispida]1.2e-4998.98Show/hide
Query:  CSSTAVQAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        CSSTAV AGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  CSSTAVQAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LFW9 Uncharacterized protein1.2e-4794.9Show/hide
Query:  CSSTAVQAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        CSST V AGLGI HSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRN VPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGC+AITRCRS
Subjt:  CSSTAVQAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS

A0A5A7TYI2 Rapid ALkalinization Factor4.6e-4793.88Show/hide
Query:  CSSTAVQAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        CSSTAV AG+GI +SLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRN VPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGC+AITRCRS
Subjt:  CSSTAVQAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS

A0A6J1DA82 protein RALF-like 334.6e-4792.86Show/hide
Query:  CSSTAVQAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        CSSTAV  GLGIHHSLAWIP+QS+CKGSIAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGAL+RNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPY RGCSAITRCRS
Subjt:  CSSTAVQAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS

A0A6J1FH12 protein RALF-like 333.5e-4793.88Show/hide
Query:  CSSTAVQAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        CSSTAV  GLGI HSL WIPNQSTCKG+IAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  CSSTAVQAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS

A0A6J1HQE4 protein RALF-like 334.1e-4894.9Show/hide
Query:  CSSTAVQAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        CSSTAV  GLGIHHSL WIPNQSTCKG+IAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  CSSTAVQAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 334.4e-3178.31Show/hide
Query:  WIPNQSTCKGSIAEC---FGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        ++P +S C G+IAEC      EEFE DSEINRRILAT++YISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGCSAITRCR
Subjt:  WIPNQSTCKGSIAEC---FGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR

Q945T0 Rapid alkalinization factor1.1e-2982.67Show/hide
Query:  CKGSIAECFG-GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        CKGSI EC    EEFE DSE NRRILAT +YISYGAL++N+VPCSRRGASYYNC+PGAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  CKGSIAECFG-GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS

Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 232.4e-2968.42Show/hide
Query:  PNQSTCKGSIAEC-------------FG----GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        P ++ C+G+IAEC             +G    GEEFE DSEINRRILAT +YISYGALRRNT+PCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGCSAITRCR
Subjt:  PNQSTCKGSIAEC-------------FG----GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR

Q9MA62 Protein RALF-like 227.8e-2878.95Show/hide
Query:  STCKGSIAECFG-GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        S C GSIAEC    EE EFDS+I+RRILA  +YISYGA+RRN+VPCSRRGASYYNCQ GAQANPYSRGCS ITRCR
Subjt:  STCKGSIAECFG-GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR

Q9SRY3 Protein RALF-like 19.9e-3169.31Show/hide
Query:  SSTAVQAGLGIH-HSLAWI---PNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        SS  VQAG       +AW     N S C GSIAEC G EE E DSEINRRILAT++YISY +L+RN+VPCSRRGASYYNCQ GAQANPYSRGCS I RCR
Subjt:  SSTAVQAGLGIH-HSLAWI---PNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR

Query:  S
        S
Subjt:  S

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 17.0e-3269.31Show/hide
Query:  SSTAVQAGLGIH-HSLAWI---PNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        SS  VQAG       +AW     N S C GSIAEC G EE E DSEINRRILAT++YISY +L+RN+VPCSRRGASYYNCQ GAQANPYSRGCS I RCR
Subjt:  SSTAVQAGLGIH-HSLAWI---PNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR

Query:  S
        S
Subjt:  S

AT2G33775.1 ralf-like 191.4e-1655.42Show/hide
Query:  WIPNQSTCKGSIAECFG--GE-EFEFDSEINRRILATSQ-YISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRC
        W   +S   G    C G  GE ++  DSE NRR LA  + YISYGALR+N VPCSRRG SYY+C+   +ANPY RGCS IT C
Subjt:  WIPNQSTCKGSIAECFG--GE-EFEFDSEINRRILATSQ-YISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRC

AT3G05490.1 ralf-like 225.6e-2978.95Show/hide
Query:  STCKGSIAECFG-GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        S C GSIAEC    EE EFDS+I+RRILA  +YISYGA+RRN+VPCSRRGASYYNCQ GAQANPYSRGCS ITRCR
Subjt:  STCKGSIAECFG-GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR

AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 231.7e-3068.42Show/hide
Query:  PNQSTCKGSIAEC-------------FG----GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        P ++ C+G+IAEC             +G    GEEFE DSEINRRILAT +YISYGALRRNT+PCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGCSAITRCR
Subjt:  PNQSTCKGSIAEC-------------FG----GEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR

AT4G15800.1 ralf-like 333.1e-3278.31Show/hide
Query:  WIPNQSTCKGSIAEC---FGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        ++P +S C G+IAEC      EEFE DSEINRRILAT++YISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGCSAITRCR
Subjt:  WIPNQSTCKGSIAEC---FGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCATATTCGGAACTCCAAAACGAAGAAGAAGCACAACCCACCGACGATTCGCCGGAGCCACTGCCGGAGCTGAGGAAACCGTCAATTCCGAGTAGAAGACAGACAAA
GAGACGAAGACTGAGACACTGCTCCTCAACCGCCGTCCAGGCCGGCCTCGGGATCCACCACAGTCTTGCATGGATTCCTAACCAATCCACCTGTAAGGGCTCCATAGCGG
AGTGTTTCGGTGGAGAGGAGTTCGAATTTGATTCAGAAATCAACCGCCGTATTTTGGCCACTAGCCAGTACATCAGCTACGGCGCTCTGCGGAGGAACACGGTGCCGTGC
TCGAGACGCGGTGCATCCTATTACAATTGCCAGCCCGGAGCTCAGGCCAATCCCTATAGCCGTGGATGCAGCGCCATTACGAGGTGCAGGAGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCATATTCGGAACTCCAAAACGAAGAAGAAGCACAACCCACCGACGATTCGCCGGAGCCACTGCCGGAGCTGAGGAAACCGTCAATTCCGAGTAGAAGACAGACAAA
GAGACGAAGACTGAGACACTGCTCCTCAACCGCCGTCCAGGCCGGCCTCGGGATCCACCACAGTCTTGCATGGATTCCTAACCAATCCACCTGTAAGGGCTCCATAGCGG
AGTGTTTCGGTGGAGAGGAGTTCGAATTTGATTCAGAAATCAACCGCCGTATTTTGGCCACTAGCCAGTACATCAGCTACGGCGCTCTGCGGAGGAACACGGTGCCGTGC
TCGAGACGCGGTGCATCCTATTACAATTGCCAGCCCGGAGCTCAGGCCAATCCCTATAGCCGTGGATGCAGCGCCATTACGAGGTGCAGGAGTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAYSELQNEEEAQPTDDSPEPLPELRKPSIPSRRQTKRRRLRHCSSTAVQAGLGIHHSLAWIPNQSTCKGSIAECFGGEEFEFDSEINRRILATSQYISYGALRRNTVPC
SRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS