; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmUC10G190730 (gene) of Watermelon (USVL531) v1 genome

Gene IDCmUC10G190730
OrganismCitrullus mucosospermus (Watermelon (USVL531) v1)
DescriptionCCHC-type domain-containing protein
Genome locationCmU531Chr10:18856675..18860043
RNA-Seq ExpressionCmUC10G190730
SyntenyCmUC10G190730
Gene Ontology termsGO:0005488 - binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
AQY61301.1 Gag [Vitis vinifera]6.3e-7860.15Show/hide
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        L  +LDAE+HLDAMNL  TIK+GN  S++++AKA+IFL  HLH+GLK +YLT+KDP  LW NLK++YDHQKTVILPKARY+WMHLRLQDFK+VS+YNS L
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        FKISS+L LC EKIT+ DMLEKTF+TFHASN+LLQQQ +++ F +YSELI  LL+ EQ NELLM+NH+SRPTG+ PFPEVNA++  +RGRGR+RGRGR +
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               + G +SN         H      T      GK  QDK  K+ E+ C+RC M  H
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WP_217833168.1 hypothetical protein, partial [Synechococcus sp. PCC 7002]2.3e-9683.86Show/hide
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        FKISSKLLLC EKITDA MLE TFSTFHASNML+QQQ ++KGFKQYSELI  LL+ EQ NELLMKNHESRPTGTTPFPEVNAVNFN+      RGRGRDR
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        GRGRN Y+FRG HSNHPNFKRTT
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XP_022144017.1 uncharacterized protein LOC111013806 [Momordica charantia]6.7e-8877.13Show/hide
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        FKISSKL LC EKITD+DMLEKT+STFH SN+LLQQQ ++KGFK+YSELI  LL+ +Q NELLMKNHESRPTG TPFPE NAVNFN+      RGRGRDR
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        GRGRN + FRGG  N PNFKRTT
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XP_028767563.1 uncharacterized protein LOC114725246 [Prosopis alba]6.3e-7863.89Show/hide
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        F+ISS+L LC EKITD DMLEKTFSTFHASN+LLQQQ ++KGFK+YSELI  LL+ EQ NELLM+NHESRPTG+TPFPEVN V   S     RGRGR RG
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        RGR +   RGG  +H   ++   ND+H  K     N+   E+ C+RC    H
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XP_028787995.1 uncharacterized protein LOC114743980 [Prosopis alba]4.8e-7864.29Show/hide
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        L  +LDAEIHL+A  L +TIKEGN  S ++KAKAMIFL  HLH+GLK++YLTIKDP +LW NLK++YDHQKTVILPKARY+WMHLRLQDFKSV +YNS +
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        F+ISS+L LC EKITD DMLEKTFSTFHASN+LLQQQ ++KGFK+YSELI  LL+ EQ NELLM+NHESRPTG+TPFPEVN V   S     RGRGR RG
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        RGR +   RGG  +H   ++   ND+H  K     N+   E+ C+RC    H
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A286QJ35 Gag3.0e-7860.15Show/hide
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        FKISS+L LC EKIT+ DMLEKTF+TFHASN+LLQQQ +++ F +YSELI  LL+ EQ NELLM+NH+SRPTG+ PFPEVNA++  +RGRGR+RGRGR +
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               + G +SN         H      T      GK  QDK  K+ E+ C+RC M  H
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A0A438ID00 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-941.2e-7760.23Show/hide
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             + G +SN+        + ++   N+     GK  QDK  K+ E+ C+RC M  H
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A0A6J1CSH6 uncharacterized protein LOC1110138063.2e-8877.13Show/hide
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        L  VLDAEIHLDAMNL ETIKE N T+ +E AKAMIFL  HLH+GLKM+YLTIKD   LW+NLK++YDHQKTVILPKARYEWMHLRLQDFKSVSDYNS L
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        FKISSKL LC EKITD+DMLEKT+STFH SN+LLQQQ ++KGFK+YSELI  LL+ +Q NELLMKNHESRPTG TPFPE NAVNFN+      RGRGRDR
Subjt:  FKISSKLLLCREKITDADMLEKTFSTFHASNMLLQQQCQKKGFKQYSELILYLLMVEQTNELLMKNHESRPTGTTPFPEVNAVNFNS------RGRGRDR

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        GRGRN + FRGG  N PNFKRTT
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A5AJ43 Uncharacterized protein1.2e-7760.23Show/hide
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A5B4M9 Uncharacterized protein1.2e-7760.23Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATGCACCAGTTCTTAATGGGGATATGGCCTATTGGAGCCATTGTTCATGATTCCAATGGCGATGTTGTGTTCGCCATGGAGGACCACTTTCTTTTGTCCAGTTCCAT
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AATTGCTATTATGCAGAGAGAAAATTACTGATGCAGATATGTTGGAGAAGACATTTTCTACATTTCATGCCTCGAATATGCTCCTGCAGCAGCAATGTCAAAAGAAAGGT
TTTAAACAATATTCTGAATTAATTTTATATCTTCTCATGGTTGAACAAACTAATGAGCTATTGATGAAAAACCATGAATCTCGACCAACTGGAACAACACCATTCCCTGA
AGTGAATGCTGTAAATTTTAATAGTCGTGGTCGTGGTCGTGACCGTGGCAGAGGAAGAAATAAATATTTTTTTCGTGGTGGTCATTCTAATCATCCAAATTTCAAAAGAA
CCACCCGAAATGATGATCATAAAGGAAAAGCTCCACAAGATAAAAATTCAAAAGATGATGAGCATAAATGCTTCCGATGCGAGATGACTAGTCACTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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KAMIFLCRHLHKGLKMKYLTIKDPCILWKNLKKKYDHQKTVILPKARYEWMHLRLQDFKSVSDYNSTLFKISSKLLLCREKITDADMLEKTFSTFHASNMLLQQQCQKKG
FKQYSELILYLLMVEQTNELLMKNHESRPTGTTPFPEVNAVNFNSRGRGRDRGRGRNKYFFRGGHSNHPNFKRTTRNDDHKGKAPQDKNSKDDEHKCFRCEMTSH