; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmUC10G192130 (gene) of Watermelon (USVL531) v1 genome

Gene IDCmUC10G192130
OrganismCitrullus mucosospermus (Watermelon (USVL531) v1)
DescriptionProtein RALF-like 33
Genome locationCmU531Chr10:22202543..22202923
RNA-Seq ExpressionCmUC10G192130
SyntenyCmUC10G192130
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044366.1 protein RALF-like 33 [Cucumis melo var. makuwa]3.9e-5290Show/hide
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XP_022934551.1 protein RALF-like 1 [Cucurbita moschata]2.5e-5188.43Show/hide
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XP_022983404.1 protein RALF-like 1 [Cucurbita maxima]4.3e-5188.43Show/hide
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XP_023529110.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.1e-5289.26Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KWI2 Uncharacterized protein7.2e-5289.34Show/hide
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A0A5A7TQI0 Protein RALF-like 331.9e-5290Show/hide
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A0A6J1F244 protein RALF-like 11.2e-5188.43Show/hide
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A0A6J1J798 protein RALF-like 12.1e-5188.43Show/hide
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A0A6J5XM33 Uncharacterized protein1.7e-2957.26Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 338.5e-2652.07Show/hide
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Q945T0 Rapid alkalinization factor6.8e-2351.69Show/hide
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Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 232.0e-2246.67Show/hide
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Q9MA62 Protein RALF-like 224.1e-2064Show/hide
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Q9SRY3 Protein RALF-like 19.4e-2554.05Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 16.7e-2654.05Show/hide
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AT2G33775.1 ralf-like 198.2e-1643.62Show/hide
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AT3G05490.1 ralf-like 222.9e-2164Show/hide
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AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 231.4e-2346.67Show/hide
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AT4G15800.1 ralf-like 336.1e-2752.07Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGCTAAAGGCAACTATGGGTAACTCTTCTTCTCCACCTACCTTATGTATGCTCATTTTCACCATAGCCTTCTTCGTCTCCTCGTCCTCTATAATGGTCACGGCAAT
GAGTAGCGACCATAGTCTTAGTTGGCTCTCGACCGAAACTCGATGCCATGGACGTTCGATAAGTGAATGCATGATGAACATTGAGTTTGAAATGGATTCTGAGATCAATC
GTCGCATCTTAGCCACTTCAAGTTACATAAGTTACAAGTCGTTGAGGGCCAACAACATTCCATGCTCTCGGAGAGGTTCGTCCTACTACAATTGCCAACCTGGGGCCGAA
GCTAACCCGTATCAGCGAGGTTGTACTGCCATTACTCGTTGTAGAAGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAGCTAAAGGCAACTATGGGTAACTCTTCTTCTCCACCTACCTTATGTATGCTCATTTTCACCATAGCCTTCTTCGTCTCCTCGTCCTCTATAATGGTCACGGCAAT
GAGTAGCGACCATAGTCTTAGTTGGCTCTCGACCGAAACTCGATGCCATGGACGTTCGATAAGTGAATGCATGATGAACATTGAGTTTGAAATGGATTCTGAGATCAATC
GTCGCATCTTAGCCACTTCAAGTTACATAAGTTACAAGTCGTTGAGGGCCAACAACATTCCATGCTCTCGGAGAGGTTCGTCCTACTACAATTGCCAACCTGGGGCCGAA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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