; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmUC10G194660 (gene) of Watermelon (USVL531) v1 genome

Gene IDCmUC10G194660
OrganismCitrullus mucosospermus (Watermelon (USVL531) v1)
DescriptionTryptophan synthase
Genome locationCmU531Chr10:26039741..26044521
RNA-Seq ExpressionCmUC10G194660
SyntenyCmUC10G194660
Gene Ontology termsGO:0000162 - tryptophan biosynthetic process (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0004834 - tryptophan synthase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002028 - Tryptophan synthase, alpha chain
IPR011060 - Ribulose-phosphate binding barrel
IPR013785 - Aldolase-type TIM barrel
IPR018204 - Tryptophan synthase, alpha chain, active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004141207.1 tryptophan synthase alpha chain [Cucumis sativus]8.0e-15592.95Show/hide
Query:  MDIAFKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIAFKSSR LPLNKIP+T  FS RPCKISVSQSKRFAPMAALAA P VGLSETF  LREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELS PISLFTYYNPILKRG+ENFMMIIKD GVRGLVVPDVPLEETE+LRKEAVK+NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPK+RMKNI EASEGFVYLVSS+GVTGTRTSVS RVQTLLEEVKEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA+WGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTISLKSALS
        ENFT SLKSALS
Subjt:  ENFTISLKSALS

XP_008465320.1 PREDICTED: tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Cucumis melo]1.5e-15693.27Show/hide
Query:  MDIAFKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIAFK SR LPLNKIP+T  FS RPCKISVSQ+KRFAPMAALAA P VGLSETF KLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRG+ENFMMIIKD GVRGLVVPDVPLEETE+LRKEAVK+NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPK+RMK I EASEGFVYLVSS+GVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA+WGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTISLKSALS
        ENFT SLKSALS
Subjt:  ENFTISLKSALS

XP_022932801.1 tryptophan synthase alpha chain-like [Cucurbita moschata]3.3e-15390.71Show/hide
Query:  MDIAFKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIAFKSSRFLPLNKIP+T   S RPC ISV QSKRFAP+AAL ASPA GLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATR+LARETNFNAIISMLKGVIPELSCP+SLF+YYNPILKRGIENFMM I+DAGVRGLVVPDVPLEET +LR+EAVKYNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPKDRMKNI EASEGFVYLVSSVGVTG RTSVSGRVQ+LLEE+KEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+I+GSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTISLKSALS
        E FT SL+SALS
Subjt:  ENFTISLKSALS

XP_023528646.1 tryptophan synthase alpha chain-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.4e-15390.71Show/hide
Query:  MDIAFKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIAFKSSRFLPLNKIP+T   S RPC ISV QSKRFAP+AAL ASPA GLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATR+L RETNFNAIISMLKGVIPELSCP+SLF+YYNPILKRGIENFMM I+DAGVRGLVVPDVPLEET +LR+EAVKYNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPKDRMKNI EASEGFVYLVSSVGVTG RTSVSGRVQ+LLEE+KEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+I+GSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTISLKSALS
        E FT SLKSALS
Subjt:  ENFTISLKSALS

XP_038906368.1 tryptophan synthase alpha chain-like [Benincasa hispida]1.0e-15795.19Show/hide
Query:  MDIAFKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        M IAFKSS F PLNKIPS+P FS RPCKISV +SKRFAPMA LAASP VGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYN ILKRGIENF+MIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPKDRMK+IAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVT KPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTISLKSALS
        ENFT SLKSALS
Subjt:  ENFTISLKSALS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LD81 Tryptophan synthase3.9e-15592.95Show/hide
Query:  MDIAFKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIAFKSSR LPLNKIP+T  FS RPCKISVSQSKRFAPMAALAA P VGLSETF  LREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELS PISLFTYYNPILKRG+ENFMMIIKD GVRGLVVPDVPLEETE+LRKEAVK+NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPK+RMKNI EASEGFVYLVSS+GVTGTRTSVS RVQTLLEEVKEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA+WGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTISLKSALS
        ENFT SLKSALS
Subjt:  ENFTISLKSALS

A0A1S3CNL8 Tryptophan synthase7.0e-15793.27Show/hide
Query:  MDIAFKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIAFK SR LPLNKIP+T  FS RPCKISVSQ+KRFAPMAALAA P VGLSETF KLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRG+ENFMMIIKD GVRGLVVPDVPLEETE+LRKEAVK+NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPK+RMK I EASEGFVYLVSS+GVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA+WGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTISLKSALS
        ENFT SLKSALS
Subjt:  ENFTISLKSALS

A0A1S4E560 Tryptophan synthase2.1e-15392.31Show/hide
Query:  MDIAFKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIAFK SR LPLNKIP+T  FS RPCKISVSQ+KRFAPMAALAA P VGLSETF KLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRG+ENFMMIIKD    GLVVPDVPLEETE+LRKEAVK+NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPK+RMK I EASEGFVYLVSS+GVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA+WGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTISLKSALS
        ENFT SLKSALS
Subjt:  ENFTISLKSALS

A0A5D3E2H9 Tryptophan synthase7.0e-15793.27Show/hide
Query:  MDIAFKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIAFK SR LPLNKIP+T  FS RPCKISVSQ+KRFAPMAALAA P VGLSETF KLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRG+ENFMMIIKD GVRGLVVPDVPLEETE+LRKEAVK+NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPK+RMK I EASEGFVYLVSS+GVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA+WGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTISLKSALS
        ENFT SLKSALS
Subjt:  ENFTISLKSALS

A0A6J1EXE2 Tryptophan synthase1.6e-15390.71Show/hide
Query:  MDIAFKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIAFKSSRFLPLNKIP+T   S RPC ISV QSKRFAP+AAL ASPA GLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATR+LARETNFNAIISMLKGVIPELSCP+SLF+YYNPILKRGIENFMM I+DAGVRGLVVPDVPLEET +LR+EAVKYNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPKDRMKNI EASEGFVYLVSSVGVTG RTSVSGRVQ+LLEE+KEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+I+GSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ENFTISLKSALS
        E FT SL+SALS
Subjt:  ENFTISLKSALS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B0C6F8 Tryptophan synthase alpha chain1.9e-7956.7Show/hide
Query:  LSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYN
        +S+ F +LR++G+ ALIP++TAGDPDL+TTA AL+ L   G+D+IELGVPYSDPLADGPVIQAAATR+L R T  + ++ M+  + PE+  PI LFTYYN
Subjt:  LSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYN

Query:  PILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVT
        PI  RG+  F+  I  AGVRGLVVPD+PLEE+E L ++A    IE+ LL  PT+ K+R++ IA  S+GF+YLVS+ GVTG RT V  RVQ L+ ++++VT
Subjt:  PILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVT

Query:  KKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTISLKSAL
         KP+ VGFGIS+ EH +QV DWGAD  I+GSA V  L E  SP +GL  +  F  SLKS+L
Subjt:  KKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTISLKSAL

B8HPH2 Tryptophan synthase alpha chain8.7e-8056.44Show/hide
Query:  VGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTY
        V +S  F+ LR++ + ALIP+ITAGDP L  TA+AL+VL   G+D+IELGVPYSDPLADGP IQAAATR+L + T  +A++ M+  V P L  P+ LFTY
Subjt:  VGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTY

Query:  YNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKE
        YNPI  RG+E F+  +  AGV+GLVVPD+PLEE + +  +A    IEL LL  PTTP+ R+  IAE S+GF+YLVS+ GVTG R+ V GRV  LL E+++
Subjt:  YNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKE

Query:  VTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTISLKSALS
        VT KP+ VGFGIS+PEH +QV +WGAD  I+GSA VK L E  +PE+GL  + +F  SLK+AL+
Subjt:  VTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTISLKSALS

O22765 Tryptophan synthase alpha chain2.4e-11779.32Show/hide
Query:  SPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISL
        S  VGLSETF +L+ QGKVALIPYITAGDPDLSTTA+ALKVL +CGSDIIELGVPYSDPLADGP IQAAA RSL + TNFN+IISMLK VIP+LSCPI+L
Subjt:  SPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISL

Query:  FTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEE
        FTYYNPIL+RG+EN+M +IK+AGV GL+VPDVPLEETE LR EA K+ IELVLLTTPTTPK+RM  I EASEGF+YLVSSVGVTGTR SV+ +VQ+LL++
Subjt:  FTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEE

Query:  VKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTISLKSAL
        +KE T KPVAVGFGISKPEHVKQVA+WGADG+I+GSAMVK+LGE++SPE+GLKELE FT SLKSAL
Subjt:  VKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTISLKSAL

P42390 Indole-3-glycerol phosphate lyase, chloroplastic1.1e-8555.41Show/hide
Query:  IPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAA
        +P+ P  +  P  +   Q+      AA A   +  +S+T   L  +GK A IPYITAGDPDL+TTAEAL++L  CG+D+IELGVP SDP  DGP+IQA+ 
Subjt:  IPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAA

Query:  TRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKNIAEA
         R+LA  T  +A++ ML+ V PELSCP+ L +YY PI+ R +      +K+AGV GL+VPD+P      L  EA   N+ELVLLTTP  P+DRMK I +A
Subjt:  TRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKNIAEA

Query:  SEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTISLKSAL
        SEGFVYLVS  GVTG R +V+ RV++L++EVK+VT KPVAVGFGISKPEHVKQ+A WGADG+IIGSAMV+ LGEA SP++GL+ LE +   +K+AL
Subjt:  SEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTISLKSAL

Q42529 Tryptophan synthase alpha chain, chloroplastic5.2e-11770.83Show/hide
Query:  MDIAFKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALA-ASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGV
        M IAFKS  F  L    S   F       S    KRF PMA+L+ +SP +GL++TF +L++QGKVA IPYITAGDPDLSTTAEALKVL  CGSDIIELGV
Subjt:  MDIAFKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALA-ASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSL R TN ++I+ ML  V+P++SCPISLFTYYNPILKRG+  FM  I+  GV+GLVVPDVPLEETE+LRKEA+  +IELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKE
        TTPTTP +RMK I +ASEGF+YLVSS+GVTG R+SVSG+VQ+LL+++KE T KPVAVGFGISKPEHVKQ+A WGADG+I+GSAMVKLLG+A+SP EGLKE
Subjt:  TTPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKE

Query:  LENFTISLKSAL
        LE  T SLKSAL
Subjt:  LENFTISLKSAL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G54640.1 tryptophan synthase alpha chain3.7e-11870.83Show/hide
Query:  MDIAFKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALA-ASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGV
        M IAFKS  F  L    S   F       S    KRF PMA+L+ +SP +GL++TF +L++QGKVA IPYITAGDPDLSTTAEALKVL  CGSDIIELGV
Subjt:  MDIAFKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALA-ASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSL R TN ++I+ ML  V+P++SCPISLFTYYNPILKRG+  FM  I+  GV+GLVVPDVPLEETE+LRKEA+  +IELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKE
        TTPTTP +RMK I +ASEGF+YLVSS+GVTG R+SVSG+VQ+LL+++KE T KPVAVGFGISKPEHVKQ+A WGADG+I+GSAMVKLLG+A+SP EGLKE
Subjt:  TTPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKE

Query:  LENFTISLKSAL
        LE  T SLKSAL
Subjt:  LENFTISLKSAL

AT4G02610.1 Aldolase-type TIM barrel family protein1.7e-11879.32Show/hide
Query:  SPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISL
        S  VGLSETF +L+ QGKVALIPYITAGDPDLSTTA+ALKVL +CGSDIIELGVPYSDPLADGP IQAAA RSL + TNFN+IISMLK VIP+LSCPI+L
Subjt:  SPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISL

Query:  FTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEE
        FTYYNPIL+RG+EN+M +IK+AGV GL+VPDVPLEETE LR EA K+ IELVLLTTPTTPK+RM  I EASEGF+YLVSSVGVTGTR SV+ +VQ+LL++
Subjt:  FTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKNIAEASEGFVYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEE

Query:  VKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTISLKSAL
        +KE T KPVAVGFGISKPEHVKQVA+WGADG+I+GSAMVK+LGE++SPE+GLKELE FT SLKSAL
Subjt:  VKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTISLKSAL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACATTGCATTCAAATCTTCGAGGTTTCTTCCGCTCAACAAGATACCCAGTACGCCTGCCTTTTCTTCACGTCCTTGTAAGATTTCAGTCTCCCAATCCAAGCGGTT
TGCTCCAATGGCTGCTCTTGCAGCTTCCCCTGCTGTTGGACTGTCCGAAACCTTCAACAAATTGAGAGAACAAGGGAAGGTCGCATTGATCCCCTACATCACTGCTGGTG
ATCCTGATCTTTCCACCACGGCTGAGGCATTGAAGGTGCTTTCGACTTGTGGATCAGATATAATTGAACTTGGTGTTCCCTATTCGGATCCCTTGGCAGATGGTCCTGTT
ATACAGGCTGCAGCCACTCGGTCCTTGGCTAGGGAGACAAACTTTAATGCAATCATTTCTATGCTGAAGGGGGTGATTCCTGAACTATCTTGTCCAATTTCCCTTTTTAC
ATATTATAACCCAATTCTTAAACGTGGCATTGAGAACTTTATGATGATAATAAAAGATGCTGGTGTGCGAGGGCTTGTTGTTCCAGATGTTCCTCTTGAGGAGACTGAAA
TTTTAAGAAAGGAAGCTGTAAAGTACAATATTGAACTGGTACTCTTAACTACACCAACCACGCCAAAAGATAGGATGAAAAACATCGCTGAAGCTTCAGAGGGATTTGTT
TATCTTGTGAGCTCCGTTGGAGTTACCGGTACCCGCACATCAGTTAGTGGTAGAGTTCAAACTCTCCTTGAGGAAGTTAAAGAGGTTACGAAAAAACCAGTAGCAGTTGG
TTTTGGTATATCAAAACCCGAGCATGTGAAACAGGTGGCTGACTGGGGGGCAGATGGTATTATTATTGGTAGTGCTATGGTGAAGCTGTTGGGTGAAGCCCAATCCCCTG
AGGAAGGATTGAAGGAGCTTGAAAACTTCACCATATCCTTGAAATCTGCACTCTCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGACATTGCATTCAAATCTTCGAGGTTTCTTCCGCTCAACAAGATACCCAGTACGCCTGCCTTTTCTTCACGTCCTTGTAAGATTTCAGTCTCCCAATCCAAGCGGTT
TGCTCCAATGGCTGCTCTTGCAGCTTCCCCTGCTGTTGGACTGTCCGAAACCTTCAACAAATTGAGAGAACAAGGGAAGGTCGCATTGATCCCCTACATCACTGCTGGTG
ATCCTGATCTTTCCACCACGGCTGAGGCATTGAAGGTGCTTTCGACTTGTGGATCAGATATAATTGAACTTGGTGTTCCCTATTCGGATCCCTTGGCAGATGGTCCTGTT
ATACAGGCTGCAGCCACTCGGTCCTTGGCTAGGGAGACAAACTTTAATGCAATCATTTCTATGCTGAAGGGGGTGATTCCTGAACTATCTTGTCCAATTTCCCTTTTTAC
ATATTATAACCCAATTCTTAAACGTGGCATTGAGAACTTTATGATGATAATAAAAGATGCTGGTGTGCGAGGGCTTGTTGTTCCAGATGTTCCTCTTGAGGAGACTGAAA
TTTTAAGAAAGGAAGCTGTAAAGTACAATATTGAACTGGTACTCTTAACTACACCAACCACGCCAAAAGATAGGATGAAAAACATCGCTGAAGCTTCAGAGGGATTTGTT
TATCTTGTGAGCTCCGTTGGAGTTACCGGTACCCGCACATCAGTTAGTGGTAGAGTTCAAACTCTCCTTGAGGAAGTTAAAGAGGTTACGAAAAAACCAGTAGCAGTTGG
TTTTGGTATATCAAAACCCGAGCATGTGAAACAGGTGGCTGACTGGGGGGCAGATGGTATTATTATTGGTAGTGCTATGGTGAAGCTGTTGGGTGAAGCCCAATCCCCTG
AGGAAGGATTGAAGGAGCTTGAAAACTTCACCATATCCTTGAAATCTGCACTCTCTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDIAFKSSRFLPLNKIPSTPAFSSRPCKISVSQSKRFAPMAALAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPV
IQAAATRSLARETNFNAIISMLKGVIPELSCPISLFTYYNPILKRGIENFMMIIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKNIAEASEGFV
YLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEVKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVADWGADGIIIGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTISLKSALS