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CmUC11G210910 (gene) of Watermelon (USVL531) v1 genome

Gene IDCmUC11G210910
OrganismCitrullus mucosospermus (Watermelon (USVL531) v1)
DescriptionATP synthase subunit beta, chloroplastic
Genome locationCmU531Chr11:7642280..7643341
RNA-Seq ExpressionCmUC11G210910
SyntenyCmUC11G210910
Gene Ontology termsGO:0015986 - ATP synthesis coupled proton transport (biological process)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0045261 - proton-transporting ATP synthase complex, catalytic core F(1) (cellular component)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0046933 - proton-transporting ATP synthase activity, rotational mechanism (molecular function)
GO:0046961 - proton-transporting ATPase activity, rotational mechanism (molecular function)
InterPro domainsIPR000194 - ATPase, F1/V1/A1 complex, alpha/beta subunit, nucleotide-binding domain
IPR003593 - AAA+ ATPase domain
IPR004100 - ATPase, F1/V1/A1 complex, alpha/beta subunit, N-terminal domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase
IPR036121 - ATPase, F1/V1/A1 complex, alpha/beta subunit, N-terminal domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
QIT04057.1 CF1 subunit beta [Luffa aegyptiaca]1.3e-15698.62Show/hide
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A0A343A8B7 ATP synthase subunit beta, chloroplastic9.4e-15899.31Show/hide
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A0A6H0ETN9 ATP synthase subunit beta, chloroplastic1.2e-15798.97Show/hide
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A6MM43 ATP synthase subunit beta, chloroplastic8.5e-15695.52Show/hide
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Q9MRR1 ATP synthase subunit beta, chloroplastic9.4e-15595.17Show/hide
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Q9MU41 ATP synthase subunit beta, chloroplastic5.5e-15595.52Show/hide
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Query:  PVGGATLGRIFNVLGEPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAFIQLDTKLSIFETGIKVVDLLAPYRRGGKIGLFGGVGVGKTVLIMELINNIAKAHGGVSVFG
        PVGGATLGRIFNVLGEP+DNLGPVDTRTTSPIHRSAPAFIQLDTKLSIFETGIKVVDLLAPYRRGGKIGLFGG GVGKTVLIMELINNIAKAHGGVSVFG
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Query:  GVGERTREGNDLYMEMKESGVINEENIAESKVALVYGQMNEPPGARMRVGLTALTMAEYFRDVNEQDVLLFIDNIFRFVQAGSEVSALLG
        GVGERTREGNDLYMEMKESGVINE+NIAESKVALVYGQMNEPPGARMRVGLTALTMAEYFRDVNEQDVLLFIDNIFRFVQAGSEVSALLG
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G08670.1 ATP synthase alpha/beta family protein3.0e-9265.58Show/hide
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        K   GR+ Q+IG ++DV F   + +P I  +L V+   T      +  EV   LG N VR +AM  T+GL+RG +V++T AP++VPVG ATLGRI NVLG
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Query:  EPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAFIQLDTKLSIFETGIKVVDLLAPYRRGGKIGLFGGVGVGKTVLIMELINNIAKAHGGVSVFGGVGERTREGNDLYME
        EPID  G + T    PIHR APA + L T   I  TGIKVVDLLAPY+RGGKIGLFGG GVGKTVLIMELINN+AKAHGG SVF GVGERTREGNDLY E
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Query:  MKESGVIN-EENIAESKVALVYGQMNEPPGARMRVGLTALTMAEYFRDVNEQDVLLFIDNIFRFVQAGSEVSALLG
        M ESGVI   E  +ESK ALVYGQMNEPPGAR RVGLT LT+AEYFRD   QDVLLFIDNIFRF QA SEVSALLG
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AT5G08680.1 ATP synthase alpha/beta family protein3.0e-9265.58Show/hide
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        K   GR+ Q+IG ++DV F   + +P I  +L V+   T      +  EV   LG N VR +AM  T+GL+RG +V++T AP++VPVG ATLGRI NVLG
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        EPID  G + T    PIHR APA + L T   I  TGIKVVDLLAPY+RGGKIGLFGG GVGKTVLIMELINN+AKAHGG SVF GVGERTREGNDLY E
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        M ESGVI   E  +ESK ALVYGQMNEPPGAR RVGLT LT+AEYFRD   QDVLLFIDNIFRF QA SEVSALLG
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AT5G08690.1 ATP synthase alpha/beta family protein3.0e-9265.58Show/hide
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        K   GR+ Q+IG ++DV F   + +P I  +L V+   T      +  EV   LG N VR +AM  T+GL+RG +V++T AP++VPVG ATLGRI NVLG
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Query:  EPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAFIQLDTKLSIFETGIKVVDLLAPYRRGGKIGLFGGVGVGKTVLIMELINNIAKAHGGVSVFGGVGERTREGNDLYME
        EPID  G + T    PIHR APA + L T   I  TGIKVVDLLAPY+RGGKIGLFGG GVGKTVLIMELINN+AKAHGG SVF GVGERTREGNDLY E
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Query:  MKESGVIN-EENIAESKVALVYGQMNEPPGARMRVGLTALTMAEYFRDVNEQDVLLFIDNIFRFVQAGSEVSALLG
        M ESGVI   E  +ESK ALVYGQMNEPPGAR RVGLT LT+AEYFRD   QDVLLFIDNIFRF QA SEVSALLG
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ATCG00480.1 ATP synthase subunit beta3.8e-15192.41Show/hide
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        MR NPTTS PEVS  EK N GRIAQIIGPVLDVAFPP KMPNIYNAL+VKG+DT GQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSAT+GL RGM+VVD   PLSV
Subjt:  MRINPTTSGPEVSTLEKNNSGRIAQIIGPVLDVAFPPSKMPNIYNALIVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGMEVVDTRAPLSV

Query:  PVGGATLGRIFNVLGEPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAFIQLDTKLSIFETGIKVVDLLAPYRRGGKIGLFGGVGVGKTVLIMELINNIAKAHGGVSVFG
        PVGGATLGRIFNVLGEP+DNLGPVDTRTTSPIH+SAPAFI+LDTKLSIFETGIKVVDLLAPYRRGGKIGLFGG GVGKTVLIMELINNIAKAHGGVSVFG
Subjt:  PVGGATLGRIFNVLGEPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAFIQLDTKLSIFETGIKVVDLLAPYRRGGKIGLFGGVGVGKTVLIMELINNIAKAHGGVSVFG

Query:  GVGERTREGNDLYMEMKESGVINEENIAESKVALVYGQMNEPPGARMRVGLTALTMAEYFRDVNEQDVLLFIDNIFRFVQAGSEVSALLG
        GVGERTREGNDLYMEMKESGVINE+N+AESKVALVYGQMNEPPGARMRVGLTALTMAEYFRDVNEQDVLLFIDNIFRFVQAGSEVSALLG
Subjt:  GVGERTREGNDLYMEMKESGVINEENIAESKVALVYGQMNEPPGARMRVGLTALTMAEYFRDVNEQDVLLFIDNIFRFVQAGSEVSALLG

ATCG01010.1 NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 protein1.9e-2279.69Show/hide
Query:  VSALLGFWSKDEILNDSWLYSPIFAIIACSTAGLTAFYMFRIYLLTFDGHLNLYCKNYSGKTYG
        +  L  FWSKDEILNDS L+SPIFAIIACSTAGLTAFYMFRIYLLTF+GHLN Y  NYSGK  G
Subjt:  VSALLGFWSKDEILNDSWLYSPIFAIIACSTAGLTAFYMFRIYLLTFDGHLNLYCKNYSGKTYG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGAATAAATCCTACGACGTCTGGTCCTGAAGTTTCCACGCTTGAAAAAAACAACTCGGGACGTATCGCTCAAATCATTGGTCCGGTACTAGATGTAGCTTTTCCCCC
GAGCAAAATGCCTAATATTTACAATGCTTTGATAGTTAAAGGTCAAGATACTGCCGGTCAAGAAATTAATGTGACTTGTGAAGTACAGCAATTATTAGGAAATAATCGAG
TTAGAGCTGTAGCTATGAGTGCTACAGATGGTCTAATGAGAGGAATGGAAGTGGTTGACACGAGAGCTCCTCTAAGTGTTCCAGTCGGCGGAGCGACTCTCGGCCGAATT
TTCAACGTGCTTGGAGAGCCTATTGATAATTTGGGTCCTGTAGATACTCGCACAACATCTCCTATTCATAGATCCGCCCCGGCTTTTATACAGTTAGATACAAAATTATC
TATTTTTGAAACAGGAATTAAAGTAGTGGATCTTTTAGCCCCTTATCGACGTGGAGGAAAAATAGGACTATTCGGAGGGGTTGGAGTGGGTAAAACAGTACTCATTATGG
AATTGATCAACAACATTGCCAAAGCTCATGGAGGTGTATCCGTATTTGGAGGAGTAGGTGAACGTACTCGTGAAGGAAATGATCTTTACATGGAAATGAAAGAATCCGGA
GTAATTAATGAAGAAAATATTGCAGAGTCAAAAGTGGCTCTAGTCTACGGTCAGATGAATGAACCGCCGGGAGCTCGTATGAGAGTTGGTTTAACTGCCCTAACTATGGC
GGAATATTTTCGAGATGTTAATGAACAAGACGTGCTTCTATTTATTGACAATATCTTCCGTTTCGTTCAAGCGGGATCCGAAGTATCCGCGTTACTGGGCTTTTGGTCCA
AAGATGAAATTCTTAATGATAGTTGGTTGTATTCACCGATTTTCGCAATAATAGCCTGTTCCACAGCTGGATTAACAGCATTTTATATGTTTCGCATCTACTTACTTACT
TTTGATGGACATTTAAACCTTTATTGTAAAAACTACAGTGGAAAAACCTACGGTAGAGCGGTTTATGTATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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TTTGATGGACATTTAAACCTTTATTGTAAAAACTACAGTGGAAAAACCTACGGTAGAGCGGTTTATGTATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRINPTTSGPEVSTLEKNNSGRIAQIIGPVLDVAFPPSKMPNIYNALIVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGMEVVDTRAPLSVPVGGATLGRI
FNVLGEPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAFIQLDTKLSIFETGIKVVDLLAPYRRGGKIGLFGGVGVGKTVLIMELINNIAKAHGGVSVFGGVGERTREGNDLYMEMKESG
VINEENIAESKVALVYGQMNEPPGARMRVGLTALTMAEYFRDVNEQDVLLFIDNIFRFVQAGSEVSALLGFWSKDEILNDSWLYSPIFAIIACSTAGLTAFYMFRIYLLT
FDGHLNLYCKNYSGKTYGRAVYV