; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmUC11G220940 (gene) of Watermelon (USVL531) v1 genome

Gene IDCmUC11G220940
OrganismCitrullus mucosospermus (Watermelon (USVL531) v1)
DescriptionTGA transcription factor
Genome locationCmU531Chr11:29216153..29217142
RNA-Seq ExpressionCmUC11G220940
SyntenyCmUC11G220940
Gene Ontology termsGO:0006351 - transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR025422 - Transcription factor TGA like domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6591766.1 Protein DOG1-like 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.7e-10785.04Show/hide
Query:  MSGGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLI
        MSGGFNFT FYATWFDHL  LI QLSST TA K N ++++ DL  LV TVMSHY+DYY VKS+AAERDPLS+F+APWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLI
Subjt:  MSGGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLI

Query:  YSESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELLT
        YSESSILFESR+VDIL GLRTGDLGDLSPSQF  VSELQCQTVEEENAIT+ELSEWQD+VSELIGTRTE+TG+VEGLVSIIKKADDLRLRT+QKVVELLT
Subjt:  YSESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELLT

Query:  TKQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDRQRANHPD
         KQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDR+R+N+ D
Subjt:  TKQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDRQRANHPD

KAG7024648.1 Protein DOG1-like 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.1e-10785.04Show/hide
Query:  MSGGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLI
        MS GFNFT FYATWFDHL  LI QLSST TA K N ++++ DL  LV TVMSHY+DYY VKS+AAERDPLS+F+APWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLI
Subjt:  MSGGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLI

Query:  YSESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELLT
        YSESSILFESR+VDIL GLRTGDLGDLSPSQF RVSELQCQTVEEENAIT+ELSEWQD+VSELIGTRTE+TG+VEGLVSIIKKADDLRLRT+QKVVELLT
Subjt:  YSESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELLT

Query:  TKQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDRQRANHPD
         KQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDR+R+N+ D
Subjt:  TKQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDRQRANHPD

XP_022935985.1 protein DOG1-like 4 [Cucurbita moschata]2.7e-10785.47Show/hide
Query:  MSGGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLI
        MS GFNFT FYATWFDHL  LI QLSST TA K N ++++ DL  LV TVMSHYSDYY VKS+AAERDPLS+FSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLI
Subjt:  MSGGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLI

Query:  YSESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELLT
        YSESSILFESR+VDIL GLRTGDLGDLSPSQF RVSELQCQTVEEENAIT+ELSEWQD+VS+LIGTRTE+TG+VEGLVSIIKKADDLRLRT+QKVVELLT
Subjt:  YSESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELLT

Query:  TKQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDRQRANHPD
         KQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDR+R+N+ D
Subjt:  TKQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDRQRANHPD

XP_022976023.1 protein DOG1-like 4 [Cucurbita maxima]2.3e-10685.04Show/hide
Query:  MSGGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLI
        MS GFNFT FYATWFDHL  LI QLSST TA K N ++++ DL  LV TVMSHYSDYY VKS+AAERDPLS+FSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLI
Subjt:  MSGGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLI

Query:  YSESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELLT
        Y+ESSILFESR+VDIL GLRTGDLGDLSPSQF RVSELQCQTVEEENAIT+ELSEWQD+VSELIGTRTE+T +VEGLVSIIKKADDLRLRT+QKVVELLT
Subjt:  YSESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELLT

Query:  TKQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDRQRANHPD
         KQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDR+R+N+ D
Subjt:  TKQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDRQRANHPD

XP_038896732.1 protein DOG1-like 4 [Benincasa hispida]1.8e-10686.27Show/hide
Query:  SGGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLIY
        S GF+F SFYATWFDHLHRLIDQLS+T T    ++  S+AD  RLVETVMSHYSDYYRVKS+AAERDPLS+FSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLIY
Subjt:  SGGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLIY

Query:  SESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELLTT
        SESSILFESR+VDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIG R E+TGRVEGLVSIIKKADDLRLRT+QKVVE LT 
Subjt:  SESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELLTT

Query:  KQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDRQRANHPD
        KQA+EFLIAA ELQFGVRGWGL+QDR+R + PD
Subjt:  KQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDRQRANHPD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L389 DOG1 domain-containing protein2.5e-10687.93Show/hide
Query:  MSG-GFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHL
        MSG GFNFTSFYATWFDHLHRL+DQLSSTA   K NHN+SSA    LV+TVMSHYSDYYRVKS+AAERDPLS+FSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHL
Subjt:  MSG-GFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHL

Query:  IYSESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELL
        IY+ESSILFESR+ DILRGL TGDLGDLSPSQ RRVSELQC+TVEEENAITEELSEWQDDVSEL+GTRTEVTGRVEGLV+IIKKAD LRLRT+QKVVELL
Subjt:  IYSESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELL

Query:  TTKQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDRQRAN
        T KQAVEF IAAAELQFGVRGWGL+QDRQR N
Subjt:  TTKQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDRQRAN

A0A1S3CLK4 transcription factor HBP-1b(C1)2.5e-10686.81Show/hide
Query:  SGGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSA--DLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHL
        S GFNFTSFYATWFD LHRL+DQLSSTA   K NHN+SSA   LARLV+TVMSHY DYYRVKS+AAERDPLS+FSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHL
Subjt:  SGGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSA--DLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHL

Query:  IYSESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELL
        IYSESSILFESR+VDILRGL TGDLGDLSPSQ RRVSELQC+TVEEENAITEELSEWQDDVSEL+GTRTEVTGR E LV+IIKKAD LRLRT+QKVVELL
Subjt:  IYSESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELL

Query:  TTKQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDRQRANHPD
        T KQAVEF IAAAELQFGVRGWGL+QDRQR N  D
Subjt:  TTKQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDRQRANHPD

A0A5A7VNB0 Transcription factor HBP-1b(C1)2.5e-10686.81Show/hide
Query:  SGGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSA--DLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHL
        S GFNFTSFYATWFD LHRL+DQLSSTA   K NHN+SSA   LARLV+TVMSHY DYYRVKS+AAERDPLS+FSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHL
Subjt:  SGGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSA--DLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHL

Query:  IYSESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELL
        IYSESSILFESR+VDILRGL TGDLGDLSPSQ RRVSELQC+TVEEENAITEELSEWQDDVSEL+GTRTEVTGR E LV+IIKKAD LRLRT+QKVVELL
Subjt:  IYSESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELL

Query:  TTKQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDRQRANHPD
        T KQAVEF IAAAELQFGVRGWGL+QDRQR N  D
Subjt:  TTKQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDRQRANHPD

A0A6J1FCB7 protein DOG1-like 41.3e-10785.47Show/hide
Query:  MSGGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLI
        MS GFNFT FYATWFDHL  LI QLSST TA K N ++++ DL  LV TVMSHYSDYY VKS+AAERDPLS+FSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLI
Subjt:  MSGGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLI

Query:  YSESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELLT
        YSESSILFESR+VDIL GLRTGDLGDLSPSQF RVSELQCQTVEEENAIT+ELSEWQD+VS+LIGTRTE+TG+VEGLVSIIKKADDLRLRT+QKVVELLT
Subjt:  YSESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELLT

Query:  TKQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDRQRANHPD
         KQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDR+R+N+ D
Subjt:  TKQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDRQRANHPD

A0A6J1IKW4 protein DOG1-like 41.1e-10685.04Show/hide
Query:  MSGGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLI
        MS GFNFT FYATWFDHL  LI QLSST TA K N ++++ DL  LV TVMSHYSDYY VKS+AAERDPLS+FSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLI
Subjt:  MSGGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLI

Query:  YSESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELLT
        Y+ESSILFESR+VDIL GLRTGDLGDLSPSQF RVSELQCQTVEEENAIT+ELSEWQD+VSELIGTRTE+T +VEGLVSIIKKADDLRLRT+QKVVELLT
Subjt:  YSESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELLT

Query:  TKQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDRQRANHPD
         KQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDR+R+N+ D
Subjt:  TKQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDRQRANHPD

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0SVK0 Protein DELAY OF GERMINATION 15.1e-1624.39Show/hide
Query:  YATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSAD--LARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLIYSESSILF
        Y  W     + I +L     A + +H     D  L +L   ++  + +Y   ++  A R   + ++  W + LE +L W+ G RP++ F L+Y+      
Subjt:  YATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSAD--LARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLIYSESSILF

Query:  ESRMVDILR---------GLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSEL-----------IGTRTEVTGRV-----EGLVSIIKK
        E R+   LR         G     L DLS  Q  +++ L  + ++EE  +T+++S  Q+D +++           +G    V  +      E +  ++ +
Subjt:  ESRMVDILR---------GLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSEL-----------IGTRTEVTGRV-----EGLVSIIKK

Query:  ADDLRLRTMQKVVELLTTKQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDRQR
        AD+LR+ T+ K++ +L+  Q  +FL+A  +L   +  WG  +DR+R
Subjt:  ADDLRLRTMQKVVELLTTKQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDRQR

P43273 Transcription factor TGA21.3e-1426.32Show/hide
Query:  SGGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLIY
        +G   F + ++ W +  ++ +++L S       N +   ++L  +V+ VM+HY + +R+KS AA+ D   L S  W T  ER   W+ G+R +    L+ 
Subjt:  SGGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLIY

Query:  SESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELLTT
        ++   + E +++ I    +T    + + SQ   +  LQ Q++ +  +     S    +V+  +G      G++  L   I++AD+LRL+T+Q+++ +LTT
Subjt:  SESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELLTT

Query:  KQAVEFLIA
        +Q+   L+A
Subjt:  KQAVEFLIA

Q39140 Transcription factor TGA64.3e-1527.27Show/hide
Query:  SGGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLIY
        +G   F + ++ W +  +R +++L S       N +    +L  +V+ VM+HY + +R+KS AA+ D   L S  W T  ER   W+ G+R +    L+ 
Subjt:  SGGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLIY

Query:  SESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELLTT
        ++   + E +++ I    +T    + + SQ   +  LQ Q++ +  +     S   D+V+  +G      G++  L   I++AD+LRL+T+Q+++ +LTT
Subjt:  SESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELLTT

Query:  KQAVEFLIA
        +Q+   L+A
Subjt:  KQAVEFLIA

Q39163 Transcription factor TGA55.7e-1530.77Show/hide
Query:  GGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLIYS
        G   F   Y  W +  +R + +LSS       +H T S +L  +V+ V++HY + YR+K  AA+ D   L S  W T  ER   W+ G+R +    LI S
Subjt:  GGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLIYS

Query:  ESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELLTTK
        +   L E + +DI    ++    + + SQ   +  LQ Q++ +  +     S    +V+  +G      G++  L   I++AD+LRL+T Q++V LLTT+
Subjt:  ESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELLTTK

Query:  QAVEFLIA
        Q+   L+A
Subjt:  QAVEFLIA

Q41558 Transcription factor HBP-1b(c1) (Fragment)2.0e-1525.94Show/hide
Query:  SGGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLIY
        +G   F   YA W +  ++ I++L + A     N +    DL ++V+++MS Y +++R+K VAA+ D   + S  W T  ER   W+ G+R +    L+ 
Subjt:  SGGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLIY

Query:  SESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELLTT
         +   L E ++  I    ++    + + SQ   +  LQ    E   + +   +    +V+  +G      G++  L + +++AD+LRL+T+Q++  +LTT
Subjt:  SESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELLTT

Query:  KQAVEFLIAAAE
        +Q+   L+A ++
Subjt:  KQAVEFLIAAAE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G12250.1 TGACG motif-binding factor 63.1e-1627.27Show/hide
Query:  SGGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLIY
        +G   F + ++ W +  +R +++L S       N +    +L  +V+ VM+HY + +R+KS AA+ D   L S  W T  ER   W+ G+R +    L+ 
Subjt:  SGGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLIY

Query:  SESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELLTT
        ++   + E +++ I    +T    + + SQ   +  LQ Q++ +  +     S   D+V+  +G      G++  L   I++AD+LRL+T+Q+++ +LTT
Subjt:  SESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELLTT

Query:  KQAVEFLIA
        +Q+   L+A
Subjt:  KQAVEFLIA

AT3G12250.2 TGACG motif-binding factor 63.1e-1627.27Show/hide
Query:  SGGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLIY
        +G   F + ++ W +  +R +++L S       N +    +L  +V+ VM+HY + +R+KS AA+ D   L S  W T  ER   W+ G+R +    L+ 
Subjt:  SGGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLIY

Query:  SESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELLTT
        ++   + E +++ I    +T    + + SQ   +  LQ Q++ +  +     S   D+V+  +G      G++  L   I++AD+LRL+T+Q+++ +LTT
Subjt:  SESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELLTT

Query:  KQAVEFLIA
        +Q+   L+A
Subjt:  KQAVEFLIA

AT3G14880.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: transcription factor-related (TAIR:AT4G18650.1)4.0e-6452.74Show/hide
Query:  NFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARL---VETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLIYS
        +F  F  +W + L   ++ L S   A   + N+++ D  RL   V+ VM H+ +Y+R K  A ++D + + ++PWA++LERSL W+ GWRPTT FHL+Y+
Subjt:  NFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARL---VETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLIYS

Query:  ESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQF-------RRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELI-GTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQK
        ESSILFESR+VDILRG RTGDL DLSPSQF       R VSELQC+TV+EENAITEELSEWQDD S+L+ GT ++   R+  L  I+ + DDLRLRT+ +
Subjt:  ESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQF-------RRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELI-GTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQK

Query:  VVELLTTKQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDRQRAN
        VVE+L+  Q  EFL+AAAEL+ GV GWG + DR+R++
Subjt:  VVELLTTKQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDRQRAN

AT3G14880.2 FUNCTIONS IN: molecular_function unknown3.3e-6654.35Show/hide
Query:  NFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARL---VETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLIYS
        +F  F  +W + L   ++ L S   A   + N+++ D  RL   V+ VM H+ +Y+R K  A ++D + + ++PWA++LERSL W+ GWRPTT FHL+Y+
Subjt:  NFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARL---VETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLIYS

Query:  ESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELI-GTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELLTT
        ESSILFESR+VDILRG RTGDL DLSPSQFR VSELQC+TV+EENAITEELSEWQDD S+L+ GT ++   R+  L  I+ + DDLRLRT+ +VVE+L+ 
Subjt:  ESSILFESRMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELI-GTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELLTT

Query:  KQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDRQRAN
         Q  EFL+AAAEL+ GV GWG + DR+R++
Subjt:  KQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDRQRAN

AT5G45830.1 delay of germination 13.6e-1724.39Show/hide
Query:  YATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSAD--LARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLIYSESSILF
        Y  W     + I +L     A + +H     D  L +L   ++  + +Y   ++  A R   + ++  W + LE +L W+ G RP++ F L+Y+      
Subjt:  YATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSAD--LARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLIYSESSILF

Query:  ESRMVDILR---------GLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSEL-----------IGTRTEVTGRV-----EGLVSIIKK
        E R+   LR         G     L DLS  Q  +++ L  + ++EE  +T+++S  Q+D +++           +G    V  +      E +  ++ +
Subjt:  ESRMVDILR---------GLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSEL-----------IGTRTEVTGRV-----EGLVSIIKK

Query:  ADDLRLRTMQKVVELLTTKQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDRQR
        AD+LR+ T+ K++ +L+  Q  +FL+A  +L   +  WG  +DR+R
Subjt:  ADDLRLRTMQKVVELLTTKQAVEFLIAAAELQFGVRGWGLNQDRQR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGCGGCGGATTCAACTTCACGAGCTTCTACGCCACCTGGTTCGACCACCTCCACCGCCTCATCGACCAGCTCTCCTCCACCGCCACCGCCGTCAAGTCCAACCACAA
CACTTCCTCTGCCGATCTCGCCCGCCTCGTCGAAACCGTCATGTCTCACTACTCCGATTACTACCGCGTGAAGTCCGTGGCCGCCGAGCGCGACCCACTGTCTTTGTTCT
CGGCGCCATGGGCCACCTCTCTTGAACGATCCCTCCATTGGATCGCTGGGTGGCGTCCCACTACTACTTTTCATCTCATTTATTCTGAGTCCTCCATTCTCTTTGAATCA
CGCATGGTCGATATTCTTCGCGGTCTTCGCACTGGCGACCTCGGCGACCTCTCCCCGTCGCAGTTTCGCCGCGTTAGCGAGCTCCAATGTCAAACGGTGGAGGAGGAGAA
TGCGATAACGGAGGAGCTGTCGGAGTGGCAGGACGATGTGAGCGAACTGATCGGAACGAGGACGGAGGTGACGGGGAGGGTTGAAGGTCTGGTTAGCATTATAAAGAAAG
CTGACGATCTCCGCCTGAGGACAATGCAAAAAGTGGTGGAGCTTCTCACCACCAAGCAGGCCGTCGAGTTCCTCATCGCTGCCGCCGAGCTCCAGTTCGGTGTTCGGGGT
TGGGGACTGAATCAGGACCGTCAACGTGCCAATCATCCAGACACTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTTACTCTACTCTTCCAATTAACGCTCTTTCAGCGTCAGGGAAAACCGGTACCCAAATGAGCGGCGGATTCAACTTCACGAGCTTCTACGCCACCTGGTTCGACCACCT
CCACCGCCTCATCGACCAGCTCTCCTCCACCGCCACCGCCGTCAAGTCCAACCACAACACTTCCTCTGCCGATCTCGCCCGCCTCGTCGAAACCGTCATGTCTCACTACT
CCGATTACTACCGCGTGAAGTCCGTGGCCGCCGAGCGCGACCCACTGTCTTTGTTCTCGGCGCCATGGGCCACCTCTCTTGAACGATCCCTCCATTGGATCGCTGGGTGG
CGTCCCACTACTACTTTTCATCTCATTTATTCTGAGTCCTCCATTCTCTTTGAATCACGCATGGTCGATATTCTTCGCGGTCTTCGCACTGGCGACCTCGGCGACCTCTC
CCCGTCGCAGTTTCGCCGCGTTAGCGAGCTCCAATGTCAAACGGTGGAGGAGGAGAATGCGATAACGGAGGAGCTGTCGGAGTGGCAGGACGATGTGAGCGAACTGATCG
GAACGAGGACGGAGGTGACGGGGAGGGTTGAAGGTCTGGTTAGCATTATAAAGAAAGCTGACGATCTCCGCCTGAGGACAATGCAAAAAGTGGTGGAGCTTCTCACCACC
AAGCAGGCCGTCGAGTTCCTCATCGCTGCCGCCGAGCTCCAGTTCGGTGTTCGGGGTTGGGGACTGAATCAGGACCGTCAACGTGCCAATCATCCAGACACTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSGGFNFTSFYATWFDHLHRLIDQLSSTATAVKSNHNTSSADLARLVETVMSHYSDYYRVKSVAAERDPLSLFSAPWATSLERSLHWIAGWRPTTTFHLIYSESSILFES
RMVDILRGLRTGDLGDLSPSQFRRVSELQCQTVEEENAITEELSEWQDDVSELIGTRTEVTGRVEGLVSIIKKADDLRLRTMQKVVELLTTKQAVEFLIAAAELQFGVRG
WGLNQDRQRANHPDT