; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh01G005200 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh01G005200
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionTransmembrane protein
Genome locationCma_Chr01:2687377..2690217
RNA-Seq ExpressionCmaCh01G005200
SyntenyCmaCh01G005200
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022948420.1 uncharacterized protein LOC111452109 [Cucurbita moschata]2.0e-8096.95Show/hide
Query:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKPINHGLRLFDSNPISADLKLQGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGL
        MELTLPTPLFASSSKIIRDPK INHGLRL D+NPISADLKLQGGRRTL IASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEA+EIPLRPCEDCGGSGL
Subjt:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKPINHGLRLFDSNPISADLKLQGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGL

Query:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
        CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
Subjt:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS

XP_022998903.1 uncharacterized protein LOC111493423 [Cucurbita maxima]8.6e-84100Show/hide
Query:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKPINHGLRLFDSNPISADLKLQGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGL
        MELTLPTPLFASSSKIIRDPKPINHGLRLFDSNPISADLKLQGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGL
Subjt:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKPINHGLRLFDSNPISADLKLQGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGL

Query:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
        CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
Subjt:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS

XP_023522036.1 uncharacterized protein LOC111785907, partial [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.1e-7398.65Show/hide
Query:  IRDPKPINHGLRLFDSNPISADLKLQGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGLCSECKGEGFVLKKLSD
        IRDPKPINHGLRLFDSNPISADLKLQGGRRTL IASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEA+EIPLRPCEDCGGSGLCSECKGEGFVLKKLSD
Subjt:  IRDPKPINHGLRLFDSNPISADLKLQGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGLCSECKGEGFVLKKLSD

Query:  ENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
        ENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
Subjt:  ENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS

XP_023522425.1 uncharacterized protein LOC111786358, partial [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.6e-7497.33Show/hide
Query:  KIIRDPKPINHGLRLFDSNPISADLKLQGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGLCSECKGEGFVLKKL
        ++IRDPKPINHGLRLFDSNPISADLKLQGGRRTL IASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEA+EIPLRPCEDCGGSGLCSECKGEGFVLKKL
Subjt:  KIIRDPKPINHGLRLFDSNPISADLKLQGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGLCSECKGEGFVLKKL

Query:  SDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
        SDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
Subjt:  SDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS

XP_023525360.1 uncharacterized protein LOC111788983 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.2e-8298.78Show/hide
Query:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKPINHGLRLFDSNPISADLKLQGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGL
        MELTLPTPLFASSSKIIRDPKPINHGLRLFDSNPISADLKLQGGRRTL IASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEA+EIPLRPCEDCGGSGL
Subjt:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKPINHGLRLFDSNPISADLKLQGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGL

Query:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
        CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
Subjt:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LVE3 Uncharacterized protein2.1e-7288.41Show/hide
Query:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKPINHGLRLFDSNPISADLKLQGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGL
        MELTLPTPLF S  KI+R+ KP N+GL L DSNP+SAD+KLQGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNK+SEA E+PL  CEDCGGSGL
Subjt:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKPINHGLRLFDSNPISADLKLQGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGL

Query:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
        CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGG+GT NS
Subjt:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS

A0A1S3CIP4 uncharacterized protein LOC103501412 isoform X21.4e-7187.8Show/hide
Query:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKPINHGLRLFDSNPISADLKLQGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGL
        MELTLPTPLF S  KI+R  KP NHGL L +S P+SAD+KLQGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEA E+PL  CEDCGGSGL
Subjt:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKPINHGLRLFDSNPISADLKLQGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGL

Query:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
        CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGG+GT +S
Subjt:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS

A0A6J1DHB6 uncharacterized protein LOC1110204499.0e-7187.2Show/hide
Query:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKPINHGLRLFDSNPISADLKLQGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGL
        MELTLPTP   S  KIIR PKPIN GL   DSNP+ AD+KLQGG+RTLT+ASSLPETAASVAIAATVVGAAAT LSRRNK SEAEEIPLR CEDCGGSGL
Subjt:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKPINHGLRLFDSNPISADLKLQGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGL

Query:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
        CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSC+TCGG+GT NS
Subjt:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS

A0A6J1G9T1 uncharacterized protein LOC1114521099.6e-8196.95Show/hide
Query:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKPINHGLRLFDSNPISADLKLQGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGL
        MELTLPTPLFASSSKIIRDPK INHGLRL D+NPISADLKLQGGRRTL IASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEA+EIPLRPCEDCGGSGL
Subjt:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKPINHGLRLFDSNPISADLKLQGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGL

Query:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
        CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
Subjt:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS

A0A6J1KI37 uncharacterized protein LOC1114934234.2e-84100Show/hide
Query:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKPINHGLRLFDSNPISADLKLQGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGL
        MELTLPTPLFASSSKIIRDPKPINHGLRLFDSNPISADLKLQGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGL
Subjt:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKPINHGLRLFDSNPISADLKLQGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGL

Query:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
        CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
Subjt:  CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G45050.1 unknown protein3.5e-2764.42Show/hide
Query:  ISADLKL--QGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRR-NKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMAT
        ++ DLK   Q  +R+ T+  +L ETA S+AIAATVVG AAT L RR NK SE  E  ++ CE C GSG+C ECKGEGFVLKKLSD NAE+ARLAAKNMAT
Subjt:  ISADLKL--QGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRR-NKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMAT

Query:  RFTA
        R+TA
Subjt:  RFTA

AT3G45050.2 unknown protein1.1e-3966.67Show/hide
Query:  ISADLKL--QGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRR-NKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMAT
        ++ DLK   Q  +R+ T+  +L ETA S+AIAATVVG AAT L RR NK SE  E  ++ CE C GSG+C ECKGEGFVLKKLSD NAE+ARLAAKNMAT
Subjt:  ISADLKL--QGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRR-NKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMAT

Query:  RFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTG
        R+TA LPKKWSYC+KCSS RSC  CGG+G
Subjt:  RFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTG

AT3G45050.3 unknown protein1.1e-3966.67Show/hide
Query:  ISADLKL--QGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRR-NKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMAT
        ++ DLK   Q  +R+ T+  +L ETA S+AIAATVVG AAT L RR NK SE  E  ++ CE C GSG+C ECKGEGFVLKKLSD NAE+ARLAAKNMAT
Subjt:  ISADLKL--QGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRR-NKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMAT

Query:  RFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTG
        R+TA LPKKWSYC+KCSS RSC  CGG+G
Subjt:  RFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTG

AT3G45050.4 unknown protein1.1e-3966.67Show/hide
Query:  ISADLKL--QGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRR-NKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMAT
        ++ DLK   Q  +R+ T+  +L ETA S+AIAATVVG AAT L RR NK SE  E  ++ CE C GSG+C ECKGEGFVLKKLSD NAE+ARLAAKNMAT
Subjt:  ISADLKL--QGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRR-NKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMAT

Query:  RFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTG
        R+TA LPKKWSYC+KCSS RSC  CGG+G
Subjt:  RFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGCTGACTCTGCCTACACCCTTGTTTGCCTCCTCCTCCAAGATAATTAGGGATCCTAAGCCCATCAACCATGGACTTCGGTTGTTCGACTCCAATCCTATTTCAGC
TGATTTGAAGCTTCAAGGAGGGAGAAGAACACTGACTATAGCTTCTTCCCTACCTGAAACAGCTGCTTCTGTGGCCATTGCTGCTACAGTTGTAGGTGCAGCAGCCACCT
TCCTTTCCAGAAGAAACAAAGATTCTGAAGCGGAGGAGATTCCTTTGAGACCATGTGAAGACTGCGGTGGTTCAGGCCTATGTTCTGAATGCAAAGGTGAAGGGTTTGTG
CTGAAGAAACTGTCGGATGAAAATGCAGAGCGTGCACGGTTGGCTGCGAAGAACATGGCCACTCGGTTCACCGCAGCGCTTCCTAAAAAATGGAGCTACTGTTCCAAGTG
TTCTTCTGCTCGTTCTTGTAGTACTTGTGGTGGCACTGGGACGTTCAACTCTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GATAAGGGACCCAAGAATAGCGGAACAAGAAGCAGGTAGAGAAATTTCTTTGTTCTGCGCGAAAGAACTTACAATTCCTTCTCAATGGAGCTGACTCTGCCTACACCCTT
GTTTGCCTCCTCCTCCAAGATAATTAGGGATCCTAAGCCCATCAACCATGGACTTCGGTTGTTCGACTCCAATCCTATTTCAGCTGATTTGAAGCTTCAAGGAGGGAGAA
GAACACTGACTATAGCTTCTTCCCTACCTGAAACAGCTGCTTCTGTGGCCATTGCTGCTACAGTTGTAGGTGCAGCAGCCACCTTCCTTTCCAGAAGAAACAAAGATTCT
GAAGCGGAGGAGATTCCTTTGAGACCATGTGAAGACTGCGGTGGTTCAGGCCTATGTTCTGAATGCAAAGGTGAAGGGTTTGTGCTGAAGAAACTGTCGGATGAAAATGC
AGAGCGTGCACGGTTGGCTGCGAAGAACATGGCCACTCGGTTCACCGCAGCGCTTCCTAAAAAATGGAGCTACTGTTCCAAGTGTTCTTCTGCTCGTTCTTGTAGTACTT
GTGGTGGCACTGGGACGTTCAACTCTTAGTCTTACAACCCGACAAACTCCTTATATCTCCGTATATCATCCTATCTTGTAAATTTCTCTCATCAGGAGTGTTCAAAGAAT
TCGATGACTTCAAAAATTTAATCAATTCAATCTAATTTGTACAACTTAGATTGGATTGAGTTCTAATAAATAAAATTGATTAAGTTAGTTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MELTLPTPLFASSSKIIRDPKPINHGLRLFDSNPISADLKLQGGRRTLTIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAEEIPLRPCEDCGGSGLCSECKGEGFV
LKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS