; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh01G006830 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh01G006830
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionPyruvate decarboxylase
Genome locationCma_Chr01:3571907..3572347
RNA-Seq ExpressionCmaCh01G006830
SyntenyCmaCh01G006830
Gene Ontology termsGO:0080182 - histone H3-K4 trimethylation (biological process)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0048188 - Set1C/COMPASS complex (cellular component)
GO:0000287 - magnesium ion binding (molecular function)
GO:0003682 - chromatin binding (molecular function)
GO:0004737 - pyruvate decarboxylase activity (molecular function)
GO:0030976 - thiamine pyrophosphate binding (molecular function)
InterPro domainsIPR012110 - Thiamine pyrophosphate (TPP)-dependent enzyme
IPR029061 - Thiamin diphosphate-binding fold


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
GFQ07287.1 pyruvate decarboxylase 1 [Phtheirospermum japonicum]5.5e-4490.53Show/hide
Query:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ
        GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALV+AIHNGEG CWTTKVR EEELIEAI+ ATG K DSLCFIEVIVHKDDT KELLEWGSRVC+ANSRPPNPQ
Subjt:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ

KAG6607324.1 Pyruvate decarboxylase 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.9e-4694.74Show/hide
Query:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ
        GYTIEVEIHDGPYN+IKNWNYTALVDAIHNGEG+CWTTKVRTEEELIEAIKKATG KSDSLCFIEVIVHKDDT KELLEWGSRVCSANSRPPN Q
Subjt:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ

KAG7037001.1 Pyruvate decarboxylase 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.9e-4694.74Show/hide
Query:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ
        GYTIEVEIHDGPYN+IKNWNYTALVDAIHNGEG+CWTTKVRTEEELIEAIKKATG KSDSLCFIEVIVHKDDT KELLEWGSRVCSANSRPPN Q
Subjt:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ

XP_022949063.1 pyruvate decarboxylase 2-like [Cucurbita moschata]3.1e-4796.84Show/hide
Query:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ
        GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEG+CWTTKVRTEEELIEAIKKATG KSDSLCFIEVIVHKDDT KELLEWGSRVCSANSRPPNPQ
Subjt:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ

XP_023524562.1 pyruvate decarboxylase 2-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.1e-4796.84Show/hide
Query:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ
        GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEG+CWTTKVRTEEELIEAIKKATG KSDSLCFIEVIVHKDDT KELLEWGSRVCSANSRPPNPQ
Subjt:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1U8BCX6 Pyruvate decarboxylase1.3e-4388.42Show/hide
Query:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ
        GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYT LVDAIHNGEG+CWT KVRTE+EL EAI  ATG K DSLCFIEV+VHKDDT KELLEWGSRVCSANSRPPNPQ
Subjt:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ

A0A2C9V9T5 Pyruvate decarboxylase1.0e-4386.32Show/hide
Query:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ
        GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTAL+DAIHNGEG CWTTKV+ EE+L+EAIK ATG K D LCFIEV+VHKDDT KELLEWGSRVC+ANSRPPNPQ
Subjt:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ

A0A3Q7H1V5 Pyruvate decarboxylase1.7e-4389.47Show/hide
Query:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ
        GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYT LVDAIHNGEG CWT KVRTEEELIEAI  ATG K D LCFIEVIVHKDDT KELLEWGSRVCSAN RPPNPQ
Subjt:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ

A0A6J1GB08 Pyruvate decarboxylase1.5e-4796.84Show/hide
Query:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ
        GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEG+CWTTKVRTEEELIEAIKKATG KSDSLCFIEVIVHKDDT KELLEWGSRVCSANSRPPNPQ
Subjt:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ

A0A6P3ZAD1 Pyruvate decarboxylase3.5e-4489.47Show/hide
Query:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ
        GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEG+CWT+KVRTEEELIEAI+ ATG K D LCFIEVIVH+DDT KELLEWGSRVCSAN RPPNPQ
Subjt:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2Y5L9 Pyruvate decarboxylase 13.7e-4383.16Show/hide
Query:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ
        GYTIEVEIHDGPYNVIKNW+YT L+DAIHN +G CWT KVRTEEELIEAI  ATG K D LCFIE+IVHKDDT KELLEWGSRV +ANSRPPNPQ
Subjt:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ

P51846 Pyruvate decarboxylase 21.8e-4588.42Show/hide
Query:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ
        GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYT LVDAIHNGEG CWT KVRTEEEL EAI  ATG K D LCFIEVIVHKDDT KELLEWGSRVCSAN RPPNPQ
Subjt:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ

P51851 Pyruvate decarboxylase 2 (Fragment)3.0e-4588.42Show/hide
Query:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ
        GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYT LVDAIHNGEG+CWTTKV  EEEL+EAI KATG K DSLCFIEVIVHKDDT KELLEWGSRV +ANSRPPNPQ
Subjt:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ

Q9M039 Pyruvate decarboxylase 35.7e-4486.32Show/hide
Query:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ
        GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYT LVDAIHNGEG+CWTTKVR EEEL+EAI  AT  K DSLCFIEVIVHKDDT KELLEWGSRV +AN RPPNPQ
Subjt:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ

Q9M040 Pyruvate decarboxylase 48.9e-4587.37Show/hide
Query:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ
        GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYT LVDAIHNGEG+CWTTKVR EEEL+EAIK AT  K DSLCFIEVIVHKDDT KELLEWGSRV +AN RPPNPQ
Subjt:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G33070.1 Thiamine pyrophosphate dependent pyruvate decarboxylase family protein4.5e-4484.21Show/hide
Query:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ
        GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYT LVDAIHNGEG CWT KVR EEEL+EAI  AT  K D LCFIEVI+HKDDT KELLEWGSRV +ANSRPPNPQ
Subjt:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ

AT5G01320.1 Thiamine pyrophosphate dependent pyruvate decarboxylase family protein6.3e-4687.37Show/hide
Query:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ
        GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYT LVDAIHNGEG+CWTTKVR EEEL+EAIK AT  K DSLCFIEVIVHKDDT KELLEWGSRV +AN RPPNPQ
Subjt:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ

AT5G01330.1 pyruvate decarboxylase-34.1e-4586.32Show/hide
Query:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ
        GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYT LVDAIHNGEG+CWTTKVR EEEL+EAI  AT  K DSLCFIEVIVHKDDT KELLEWGSRV +AN RPPNPQ
Subjt:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ

AT5G54960.1 pyruvate decarboxylase-22.9e-4381.05Show/hide
Query:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ
        GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTA V+AIHNGEG+CWT KVR EEEL++AI  AT  + +S CFIEVIVHKDDT KELLEWGSRV +ANSRPPNPQ
Subjt:  GYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAACGATCACAGGTGACACACATAGGTTATACAATTGAAGTCGAAATCCACGACGGACCGTACAATGTAATCAAGAATTGGAACTACACGGCCCTCGTAGACGCAAT
CCACAACGGTGAAGGACAATGTTGGACGACAAAGGTGCGTACTGAGGAGGAGCTGATTGAGGCGATCAAGAAGGCGACAGGATACAAGAGTGATTCATTGTGTTTTATTG
AAGTGATTGTTCATAAAGATGATACGTGCAAGGAGCTGCTTGAGTGGGGCTCAAGGGTTTGTTCTGCCAATAGTCGCCCTCCAAATCCTCAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAACGATCACAGGTGACACACATAGGTTATACAATTGAAGTCGAAATCCACGACGGACCGTACAATGTAATCAAGAATTGGAACTACACGGCCCTCGTAGACGCAAT
CCACAACGGTGAAGGACAATGTTGGACGACAAAGGTGCGTACTGAGGAGGAGCTGATTGAGGCGATCAAGAAGGCGACAGGATACAAGAGTGATTCATTGTGTTTTATTG
AAGTGATTGTTCATAAAGATGATACGTGCAAGGAGCTGCTTGAGTGGGGCTCAAGGGTTTGTTCTGCCAATAGTCGCCCTCCAAATCCTCAGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKRSQVTHIGYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTALVDAIHNGEGQCWTTKVRTEEELIEAIKKATGYKSDSLCFIEVIVHKDDTCKELLEWGSRVCSANSRPPNPQ