; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh01G013090 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh01G013090
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionAlpha/beta-Hydrolases superfamily protein
Genome locationCma_Chr01:9356465..9362967
RNA-Seq ExpressionCmaCh01G013090
SyntenyCmaCh01G013090
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6607977.1 hypothetical protein SDJN03_01319, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.4e-8193.96Show/hide
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KAG7037491.1 hypothetical protein SDJN02_01118 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]8.5e-8295Show/hide
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XP_022940302.1 uncharacterized protein LOC111445962 [Cucurbita moschata]1.2e-8891.37Show/hide
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XP_022981115.1 uncharacterized protein LOC111480359 [Cucurbita maxima]6.1e-88100Show/hide
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XP_023523373.1 uncharacterized protein LOC111787590 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.4e-8497.18Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L2V6 Uncharacterized protein9.1e-7487.08Show/hide
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A0A1S3CNU3 uncharacterized protein LOC103503051 isoform X11.0e-7287.08Show/hide
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A0A5D3CDY1 Uncharacterized protein1.0e-7287.08Show/hide
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A0A6J1FJ79 uncharacterized protein LOC1114459625.9e-8991.37Show/hide
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A0A6J1IYJ7 uncharacterized protein LOC1114803592.9e-88100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G42975.1 unknown protein3.8e-4060.77Show/hide
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        MA NF  T+ H   P S+ SS S  +Q+  LLL+  S    R  S   +  V++       D      S S +SSS RTQLDLLEQL+S S   DGY SD
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Query:  GNYQK-TTIRDQLAQLFRDRDDDFSIPLGKNLKKVSAKFLTISQKRNIKRQEYLNEVSQRNDSVFFATVGAFVILPPIVIL
        G   +  TIRDQLA L  DRDDDFSIPLGKNLKKVS KFLTISQKRNIKRQ YLNEVSQRNDSVFFAT+GAFVILPP+VIL
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCTCCAATTTCATTACTGCGTTTCATTGCCCGAATCCACACTCTTCTTCTTCTTCTTATTCAAATCTGCAGCAGAATACAGTGCTCCTTTTGAAGTTCCATTCTCG
TTGTTCATCTTCTTCGAGAAAATTCGCTGTTTCGGAGGGCGCTGAGGGTAGAGTTCAAGATGAAGAGCTTTTCATTTCGTCTTCTTCTGGAGCATCTTCTTCTGCACGCA
CACAGCTTGATCTCTTGGAGCAACTCTCTTCCGGTAGCCAATTAGTTGATGGTTATGAGAGTGATGGCAATTACCAGAAAACTACGATCCGTGATCAGCTTGCACAATTG
TTCAGAGACAGAGACGACGATTTTAGCATTCCATTGGGTAAGAACTTGAAGAAGGTTAGTGCCAAGTTTTTGACAATTTCTCAGAAGAGGAACATCAAAAGACAAGAATA
CTTGAATGAAGTATCTCAAAGGAATGATTCAGTTTTCTTTGCTACAGTTGGAGCATTTGTAATTCTGCCACCTATTGTAATATTAGGCACCAAGAACAATGCAGAAGCCA
AGCCACTCTTGGAAGCTGCTTATTTGGCTGCTATGGATTTCACAAGTGATCTTCAAAGCTTTTGTAGCAATGAGGTAAAAGGAAAAAGCTGGACAATGTCAGAGGAGAGG
AGCAATAAAGGGTTGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAATCAATTGTAGCCGCAAATTTATGGGGAAATTGTTCAAGCTCCGCTTCCAGTCCCAGTAATGGAGACCAGAAGCCATAGATTTTTCACTTGAAAACAACAAAATCATG
GCCTCCAATTTCATTACTGCGTTTCATTGCCCGAATCCACACTCTTCTTCTTCTTCTTATTCAAATCTGCAGCAGAATACAGTGCTCCTTTTGAAGTTCCATTCTCGTTG
TTCATCTTCTTCGAGAAAATTCGCTGTTTCGGAGGGCGCTGAGGGTAGAGTTCAAGATGAAGAGCTTTTCATTTCGTCTTCTTCTGGAGCATCTTCTTCTGCACGCACAC
AGCTTGATCTCTTGGAGCAACTCTCTTCCGGTAGCCAATTAGTTGATGGTTATGAGAGTGATGGCAATTACCAGAAAACTACGATCCGTGATCAGCTTGCACAATTGTTC
AGAGACAGAGACGACGATTTTAGCATTCCATTGGGTAAGAACTTGAAGAAGGTTAGTGCCAAGTTTTTGACAATTTCTCAGAAGAGGAACATCAAAAGACAAGAATACTT
GAATGAAGTATCTCAAAGGAATGATTCAGTTTTCTTTGCTACAGTTGGAGCATTTGTAATTCTGCCACCTATTGTAATATTAGGCACCAAGAACAATGCAGAAGCCAAGC
CACTCTTGGAAGCTGCTTATTTGGCTGCTATGGATTTCACAAGTGATCTTCAAAGCTTTTGTAGCAATGAGGTAAAAGGAAAAAGCTGGACAATGTCAGAGGAGAGGAGC
AATAAAGGGTTGTGATCAATTATGCCTTAAGAGGACGCTCAACTAAGGTACTTGATTTTTCTCTAGAAATACATCTGCCTTGTGTTGGATGTTGATCTAAAAATATGTCG
GTTACTTTTACCATTTCTGTCTCACATATCATCTGTCTGTGCAAAATTATCGAGATTACTGGTGTGCTGAGTAGATATTGTACTCTTTGTGCTTTCTCTTTCGAGCTTTC
CCTCAAGGTTTTTGAAATGTGTCTACTAGGGAGAGGTTTCCACACCCTTATAAAGAATAAAGAATGTTTCGTTCTTCTCCCCAACTGATGTGGGATCTCACAATCCTCCC
TCCTTCGAGGCCCAACCTCTTCATTAGCATATCGCCTGGTGTCTGGCTCTGATACCATTTGTAACGGCCCAAACTCACTGCCAATAGATATTGTCCTCTTTGGACTATCT
CTTTCGGGTTTTCCTTCAAGGTTTTTAAAACATATATGCAAGGGAGAGGTTTCTACACCCTTATAAAGAATATTTCATTCTTATCTCCAACCGATGGGATCTCACAATCC
ACTCATTTTCGGGGCCCAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SNKGL