CuGenDBv2

Gene ID	CmaCh02G002380
Organism	Cucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
Description	Taste receptor type 1 member 1 like
Genome location	Cma_Chr02:1064478..1067517
RNA-Seq Expression	CmaCh02G002380
Synteny	CmaCh02G002380
Gene Ontology terms	GO:0010228 - vegetative to reproductive phase transition of meristem (biological process) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG6604922.1 hypothetical protein SDJN03_02239, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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TrEMBL top hits

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A0A6J1FXH1 uncharacterized protein LOC111448482

3.3e-137

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A0A6J1G724 uncharacterized protein LOC111451366 isoform X1

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A0A6J1G752 uncharacterized protein LOC111451366 isoform X2

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A0A6J1I5Q6 uncharacterized protein LOC111469843 isoform X1

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A0A6J1I7H8 uncharacterized protein LOC111469843 isoform X2

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

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AT2G04360.1 unknown protein

5.0e-93

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Show/hide

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        EGRDW++SILLF+ W  L++Y FNLAP++TP+ D+Y LKKLLNLK DDGF+MN++LV LWYIMGLWPLVY MLLLP+G    S  P WPF+VLSFF G Y
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         LLPYF L  PP PPV E EL++WPLN LESK T+G+T  AGLGI+ Y+ +     W  FYQYFRES+FIH  S+DF LLS+FAPFWVYND T RKW+DK
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Query:  GSWLVPFSVVPFLGPALYLILRPLPTTMTTTVPPNAAASEP
        GSWL+P SV+PFLGP+LYL+LR  P    T  P + A+S+P
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

ATGGGTTTGCTTCAAAAATGGCGGAGAGCATCGGGAAATCAAACGGCAGGAGACCCAGTTGGGGAAAAAGCGAGACCAATAGAATACGAGCGCGGCGGTAGCGGC
GACGGCGACGGCGGCAGATATGGTGGGGAGGGAAGAGACTGGACGACCTCGATTCTACTGTTTTCTTTCTGGGCTGGTCTAATGTTTTATGTCTTCAATCTCGCT
CCGAATCGGACTCCGTCAATGGACATATATCTCTTGAAGAAGCTTTTGAACTTGAAAAGTGACGATGGCTTCAAAATGAATGAAGTGCTTGTGTCTCTTTGGTAT
ATTATGGGCTTGTGGCCACTGGTTTATGGCATGCTGCTGCTTCCTTCTGGCAGAAGCTCAAATAGCAATGTTCCTGTCTGGCCTTTCCTAGTACTGTCGTTCTTC
TTGGGTGCCTACGGTCTTCTTCCATATTTTGTACTTCGGAAGCCACCGCCACCTCCTGTTGAGGAAGATGAACTCAAGAGATGGCCTTTGAATTTCCTCGAGTCC
AAATTCACTTCTGGGATAACATTTGCTGCAGGACTCGGTATACTATTTTATGCTGGATTAGCTGGTGAGAGTGCGTGGAAGGCATTTTACCAGTACTTCAGAGAG
AGCAGATTTATCCATGCCATGAGCATCGACTTCATGCTACTATCTTCATTTGCTCCATTTTGGGTTTACAATGACAAGACTGCTCGAAAATGGTACGACAAAGGA
TCTTGGCTCGTTCCGTTTTCGGTCGTGCCATTTTTAGGTCCTGCCTTGTATCTCATCCTGCGGCCGTTGCCTACTACAATGACGACTACCGTTCCACCCAACGCA
GCTGCATCTGAACCAAAATAGTCATGTTTCTAAAGTGAACCAGAACAAGGAAGCTTAGCTGCAATTGTGAGAAAAAACAGGCTTTAAGGTACAGGGAGAAGTTTT
GTGTCTCAAAACATAGTAGATTAGGATAAAGTGACAGTCAAATGATGTTTGTCTTGTTCTTATGTTATTATGTTTCTTTAATAGAAAAAGGGTAATGTGATATTG
AGCTTCTTTCAGTAGAAGGGACAGTTGAAGCTCGTTGCGTATCATTTTCAGTCTCACTATTTAAAATTATCTGCTAGGGAGAGATTTTTATACCATTATAAAGAA
TGTTTAGTTCCCCTCTACAATCAGTGTGGGATGTTATAGCATCCTTGTTGGCACACCATTCTAGCTCTGATACTATTTGTAACAACCCCATCTCTCAGTATCTGA
CTCTTCATCATTTATTACCATGTCAGCCTACTGCTAACAGATATTGTCAGTCCCACATTCAGTGTCGGACTCTTCTGATACCATTTGTAACCGTTCAAACCTATT
GGTAGTAGATATTGTCAGCTCCACGTCTGGCTCTTCTTATACTATTTGTAACAATCCAAATCTCATATTAACAGATATTGTCAACCCCACCGACTAGTGTCGGGC
TCTTCTGATACCATTTGTAATGGTCCAAATATACTATTAATAGATATTGTTAGCCTCACATTCTCCACCGTCCAATGTCTAGCTCTTCTA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MGLLQKWRRASGNQTAGDPVGEKARPIEYERGGSGDGDGGRYGGEGRDWTTSILLFSFWAGLMFYVFNLAPNRTPSMDIYLLKKLLNLKSDDGFKMNEVLVSLWY
IMGLWPLVYGMLLLPSGRSSNSNVPVWPFLVLSFFLGAYGLLPYFVLRKPPPPPVEEDELKRWPLNFLESKFTSGITFAAGLGILFYAGLAGESAWKAFYQYFRE
SRFIHAMSIDFMLLSSFAPFWVYNDKTARKWYDKGSWLVPFSVVPFLGPALYLILRPLPTTMTTTVPPNAAASEPK

CmaCh02G002380 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome