CuGenDBv2

Gene ID	CmaCh02G002660
Organism	Cucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
Description	DUF1279 domain-containing protein
Genome location	Cma_Chr02:1201977..1202435
RNA-Seq Expression	CmaCh02G002660
Synteny	CmaCh02G002660
Gene Ontology terms	GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
InterPro domains	IPR009688 - Protein FAM210A/B-like domain

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG6604946.1 hypothetical protein SDJN03_02263, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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XP_022947464.1 uncharacterized protein LOC111451320 [Cucurbita moschata]

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XP_022971121.1 uncharacterized protein LOC111469888 [Cucurbita maxima]

3.4e-74

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XP_023533856.1 uncharacterized protein LOC111795580 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

1.6e-71

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A0A6J1CXM4 uncharacterized protein LOC111015379

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A0A6J1FU56 uncharacterized protein LOC111448454

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A0A6J1G6W3 uncharacterized protein LOC111451320

4.0e-73

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A0A6J1I2F7 uncharacterized protein LOC111469888

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A0A6J1JD52 uncharacterized protein LOC111483951

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

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Alignment

AT2G20940.1 Protein of unknown function (DUF1279)

1.4e-33

56.25

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        R +E+++KYGKVA+GVHFSVS  SI+G Y+AIKNNVDVESLL+K  +  FSSK+ P        PS+D    +EE      Q +V  +    N+T +LA 
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        S GGALALAVLCNKAL PIR+PIT+ALTPPIAR L +R I+++G
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCTTTCTTCACCGGTGGTGGCCGATTCCGCGAGCTTCTCAGGAAGTACGGGAAGGTCGCAATCGGAGTTCATTTCTCAGTGTCGGCGGCTTCAATCACTGGC
CTCTATGTCGCCATCAAGAACAATGTCGATGTAGAATCGCTACTCGATAAGCTACACATGGACGGATTCTCTTCCAAAGATACGCCACAGACAAGTCCCTCTGAA
ATCACACCGTCTGTAGATGATGGATTTGTGATCGAAGAAAGACCTACATCGGGAATTCAATCAACCGTAGTGGAAGAGCCGAGGAAAAGGAATCGTACAGCCGAG
CTCGCAGCGTCGACTGGCGGCGCGTTGGCTTTGGCCGTGCTTTGTAACAAGGCATTGTTGCCGATTCGGATCCCGATCACGATTGCGCTCACACCGCCGATCGCG
AGGCTGCTGGCGAGGCGAGGAATTATGAGAAGTGGTTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

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LAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITIALTPPIARLLARRGIMRSG

CmaCh02G002660 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome