; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh02G003640 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh02G003640
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionGATA transcription factor
Genome locationCma_Chr02:1797272..1798853
RNA-Seq ExpressionCmaCh02G003640
SyntenyCmaCh02G003640
Gene Ontology termsGO:0030154 - cell differentiation (biological process)
GO:0045893 - positive regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000679 - Zinc finger, GATA-type
IPR013088 - Zinc finger, NHR/GATA-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6605045.1 GATA transcription factor 5, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.8e-17898.19Show/hide
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A0A0A0LLB3 GATA transcription factor1.6e-13979.64Show/hide
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A0A5A7TQJ0 GATA transcription factor2.1e-14280.24Show/hide
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A0A6J1L063 GATA transcription factor6.6e-181100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O49741 GATA transcription factor 22.1e-3035.94Show/hide
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O49743 GATA transcription factor 41.2e-3037.13Show/hide
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        DD  +F  D + S SS    S    AA  E+          S +LL     +L +P D  A LEW+S FVDDS   F +  +  +   PE +  G     
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O65515 GATA transcription factor 71.4e-3140.35Show/hide
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Q9FH57 GATA transcription factor 59.2e-4742.03Show/hide
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        +E  ALKSS   E+A+++     + EE   +  A N  + ++F VD+  + SN D         EE D   + E   VS S + N  G+        +G 
Subjt:  LEAKALKSSFHWELAMESAQQDALVEEIWCLNGA-NLVAGEEFEVDEFFNFSNGDFEHGSALRVEENDDYQEFEKDLVSVSSDSNQSGEI-----PAAGE

Query:  EDSKSLLAVELAIPGDALAELEWVSHFVDDSRLGFSSAAVAFSRSEPEKNLAGG---------VISCLPTFVPVKPRTKRSRQSRQTKSTGSSLNQSSSS
        +D  SL   EL++P D LA LEW+SHFV+DS   +S   +  + +E    L G            +C  + VP K R+KR+R   +  S GSS +   SS
Subjt:  EDSKSLLAVELAIPGDALAELEWVSHFVDDSRLGFSSAAVAFSRSEPEKNLAGG---------VISCLPTFVPVKPRTKRSRQSRQTKSTGSSLNQSSSS

Query:  SSSSTSSGVSSASQWFIFSDAGENVDSSNAAGEPPKKQRKKSITSSPTALQSGGLTGQIP-RRCSHCLVQKTPQWRTGPHGAKTLCNACGVRYKSGRLFP
        S S++SS    +S WF  ++  E V +S      PKK +K+S  S    + SG L    P R+CSHC VQKTPQWR GP GAKTLCNACGVRYKSGRL P
Subjt:  SSSSTSSGVSSASQWFIFSDAGENVDSSNAAGEPPKKQRKKSITSSPTALQSGGLTGQIP-RRCSHCLVQKTPQWRTGPHGAKTLCNACGVRYKSGRLFP

Query:  EYRPALSPTFCSNVHSNSHRKVLEMRKMKE-VSQPATELTPMVRS
        EYRPA SPTF S +HSN HRKV+EMR+ KE  S   T L  +V+S
Subjt:  EYRPALSPTFCSNVHSNSHRKVLEMRKMKE-VSQPATELTPMVRS

Q9SD38 GATA transcription factor 63.3e-3642.76Show/hide
Query:  GEEFEVDEFFNFSNGDFEHGSALRVEENDDYQEFEKDLVSVSSDSNQSGEIPAAGEEDSKSLLAVELAIPGDALAELEWVSHFVDDSRLGFSSAAV--AF
        G++F VD+  +FS    E    + VE+  + +   K  VS  +  ++S +   A    S       L++P D +AELEW+S+FVDDS     SA      
Subjt:  GEEFEVDEFFNFSNGDFEHGSALRVEENDDYQEFEKDLVSVSSDSNQSGEIPAAGEEDSKSLLAVELAIPGDALAELEWVSHFVDDSRLGFSSAAV--AF

Query:  SRSEPEKNLAGGV--ISCLPTFVP-VKPRTKRSRQSRQTKSTGS-SLNQSSSSSSSSTSSGVSSASQWFIFSDAGENVDSSNAAGEP-PKKQRKKSITSS
          +   ++L   V   +C  +  P VK R KR+R   +  S GS SL  SSSSS++S+SS    +S  ++ S  G+ +D      EP  K Q+KK +  +
Subjt:  SRSEPEKNLAGGV--ISCLPTFVP-VKPRTKRSRQSRQTKSTGS-SLNQSSSSSSSSTSSGVSSASQWFIFSDAGENVDSSNAAGEP-PKKQRKKSITSS

Query:  PTALQSGGLTGQIPRRCSHCLVQKTPQWRTGPHGAKTLCNACGVRYKSGRLFPEYRPALSPTFCSNVHSNSHRKVLEMRKMKEVSQPATE
          A Q+   T    R+C HC VQKTPQWR GP GAKTLCNACGVRYKSGRL PEYRPA SPTF S +HSN H KV+EMR+ KE S  A E
Subjt:  PTALQSGGLTGQIPRRCSHCLVQKTPQWRTGPHGAKTLCNACGVRYKSGRLFPEYRPALSPTFCSNVHSNSHRKVLEMRKMKEVSQPATE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G51080.1 GATA transcription factor 62.3e-3742.76Show/hide
Query:  GEEFEVDEFFNFSNGDFEHGSALRVEENDDYQEFEKDLVSVSSDSNQSGEIPAAGEEDSKSLLAVELAIPGDALAELEWVSHFVDDSRLGFSSAAV--AF
        G++F VD+  +FS    E    + VE+  + +   K  VS  +  ++S +   A    S       L++P D +AELEW+S+FVDDS     SA      
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Query:  SRSEPEKNLAGGV--ISCLPTFVP-VKPRTKRSRQSRQTKSTGS-SLNQSSSSSSSSTSSGVSSASQWFIFSDAGENVDSSNAAGEP-PKKQRKKSITSS
          +   ++L   V   +C  +  P VK R KR+R   +  S GS SL  SSSSS++S+SS    +S  ++ S  G+ +D      EP  K Q+KK +  +
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Query:  PTALQSGGLTGQIPRRCSHCLVQKTPQWRTGPHGAKTLCNACGVRYKSGRLFPEYRPALSPTFCSNVHSNSHRKVLEMRKMKEVSQPATE
          A Q+   T    R+C HC VQKTPQWR GP GAKTLCNACGVRYKSGRL PEYRPA SPTF S +HSN H KV+EMR+ KE S  A E
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AT3G60530.1 GATA transcription factor 48.6e-3237.13Show/hide
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        DD  +F  D + S SS    S    AA  E+          S +LL     +L +P D  A LEW+S FVDDS   F +  +  +   PE +  G     
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Query:  LPTFVPVKPRTKRSRQSRQTKSTGSSLNQSSSSSSSSTSSGVSSASQWFIFSDAGENVDSSNAAGEPPKKQRKKSITSSPTALQSGGLTGQIPRRCSHCL
               KPR++RSR                       +   S A  W   S++   +  S A  +P K    +S+T+               RRC+HC 
Subjt:  LPTFVPVKPRTKRSRQSRQTKSTGSSLNQSSSSSSSSTSSGVSSASQWFIFSDAGENVDSSNAAGEPPKKQRKKSITSSPTALQSGGLTGQIPRRCSHCL

Query:  VQKTPQWRTGPHGAKTLCNACGVRYKSGRLFPEYRPALSPTFCSNVHSNSHRKVLEMRKMKEVSQPATELTP
         +KTPQWRTGP G KTLCNACGVRYKSGRL PEYRPA SPTF    HSNSHRKV+E+R+ KE  +    + P
Subjt:  VQKTPQWRTGPHGAKTLCNACGVRYKSGRLFPEYRPALSPTFCSNVHSNSHRKVLEMRKMKEVSQPATELTP

AT4G36240.1 GATA transcription factor 71.0e-3240.35Show/hide
Query:  EFEVDEFFNFSNGD--FEHGSALRVEENDDYQEFEKDLVSVSSDSNQSGEIPAAGEEDSKSLLAVELAIPGDA----LAELEWVSHFVDDSRLGFSSAAV
        +F VD+  + SN D   E  S+ R E+  + ++F+       S S+QS  +  +  ED        L+ PGDA    L +LEW+S+FV+DS   FS + +
Subjt:  EFEVDEFFNFSNGD--FEHGSALRVEENDDYQEFEKDLVSVSSDSNQSGEIPAAGEEDSKSLLAVELAIPGDA----LAELEWVSHFVDDSRLGFSSAAV

Query:  AFSRSEPEKNLAGGVISCLPTFVPVKPRTKRSRQSRQTKSTGSSLNQSSSSSSSSTSSGVSSASQWFIFSDAGENVDSSNAAGEPPKKQRKKSITSSPTA
          S   P   +A   +      VPVKPR+KR R      + G   +  S S   ST                        A     K+ R+K   S    
Subjt:  AFSRSEPEKNLAGGVISCLPTFVPVKPRTKRSRQSRQTKSTGSSLNQSSSSSSSSTSSGVSSASQWFIFSDAGENVDSSNAAGEPPKKQRKKSITSSPTA

Query:  LQSGGLTGQIPRRCSHCLVQKTPQWRTGPHGAKTLCNACGVRYKSGRLFPEYRPALSPTFCSNVHSNSHRKVLEMRKMKEVSQPA
        +Q      Q+ R CSHC VQKTPQWR GP GAKTLCNACGVR+KSGRL PEYRPA SPTF + +HSNSHRKVLE+R MK V+ PA
Subjt:  LQSGGLTGQIPRRCSHCLVQKTPQWRTGPHGAKTLCNACGVRYKSGRLFPEYRPALSPTFCSNVHSNSHRKVLEMRKMKEVSQPA

AT5G66320.1 GATA transcription factor 56.5e-4842.03Show/hide
Query:  LEAKALKSSFHWELAMESAQQDALVEEIWCLNGA-NLVAGEEFEVDEFFNFSNGDFEHGSALRVEENDDYQEFEKDLVSVSSDSNQSGEI-----PAAGE
        +E  ALKSS   E+A+++     + EE   +  A N  + ++F VD+  + SN D         EE D   + E   VS S + N  G+        +G 
Subjt:  LEAKALKSSFHWELAMESAQQDALVEEIWCLNGA-NLVAGEEFEVDEFFNFSNGDFEHGSALRVEENDDYQEFEKDLVSVSSDSNQSGEI-----PAAGE

Query:  EDSKSLLAVELAIPGDALAELEWVSHFVDDSRLGFSSAAVAFSRSEPEKNLAGG---------VISCLPTFVPVKPRTKRSRQSRQTKSTGSSLNQSSSS
        +D  SL   EL++P D LA LEW+SHFV+DS   +S   +  + +E    L G            +C  + VP K R+KR+R   +  S GSS +   SS
Subjt:  EDSKSLLAVELAIPGDALAELEWVSHFVDDSRLGFSSAAVAFSRSEPEKNLAGG---------VISCLPTFVPVKPRTKRSRQSRQTKSTGSSLNQSSSS

Query:  SSSSTSSGVSSASQWFIFSDAGENVDSSNAAGEPPKKQRKKSITSSPTALQSGGLTGQIP-RRCSHCLVQKTPQWRTGPHGAKTLCNACGVRYKSGRLFP
        S S++SS    +S WF  ++  E V +S      PKK +K+S  S    + SG L    P R+CSHC VQKTPQWR GP GAKTLCNACGVRYKSGRL P
Subjt:  SSSSTSSGVSSASQWFIFSDAGENVDSSNAAGEPPKKQRKKSITSSPTALQSGGLTGQIP-RRCSHCLVQKTPQWRTGPHGAKTLCNACGVRYKSGRLFP

Query:  EYRPALSPTFCSNVHSNSHRKVLEMRKMKE-VSQPATELTPMVRS
        EYRPA SPTF S +HSN HRKV+EMR+ KE  S   T L  +V+S
Subjt:  EYRPALSPTFCSNVHSNSHRKVLEMRKMKE-VSQPATELTPMVRS

AT5G66320.2 GATA transcription factor 56.5e-4842.03Show/hide
Query:  LEAKALKSSFHWELAMESAQQDALVEEIWCLNGA-NLVAGEEFEVDEFFNFSNGDFEHGSALRVEENDDYQEFEKDLVSVSSDSNQSGEI-----PAAGE
        +E  ALKSS   E+A+++     + EE   +  A N  + ++F VD+  + SN D         EE D   + E   VS S + N  G+        +G 
Subjt:  LEAKALKSSFHWELAMESAQQDALVEEIWCLNGA-NLVAGEEFEVDEFFNFSNGDFEHGSALRVEENDDYQEFEKDLVSVSSDSNQSGEI-----PAAGE

Query:  EDSKSLLAVELAIPGDALAELEWVSHFVDDSRLGFSSAAVAFSRSEPEKNLAGG---------VISCLPTFVPVKPRTKRSRQSRQTKSTGSSLNQSSSS
        +D  SL   EL++P D LA LEW+SHFV+DS   +S   +  + +E    L G            +C  + VP K R+KR+R   +  S GSS +   SS
Subjt:  EDSKSLLAVELAIPGDALAELEWVSHFVDDSRLGFSSAAVAFSRSEPEKNLAGG---------VISCLPTFVPVKPRTKRSRQSRQTKSTGSSLNQSSSS

Query:  SSSSTSSGVSSASQWFIFSDAGENVDSSNAAGEPPKKQRKKSITSSPTALQSGGLTGQIP-RRCSHCLVQKTPQWRTGPHGAKTLCNACGVRYKSGRLFP
        S S++SS    +S WF  ++  E V +S      PKK +K+S  S    + SG L    P R+CSHC VQKTPQWR GP GAKTLCNACGVRYKSGRL P
Subjt:  SSSSTSSGVSSASQWFIFSDAGENVDSSNAAGEPPKKQRKKSITSSPTALQSGGLTGQIP-RRCSHCLVQKTPQWRTGPHGAKTLCNACGVRYKSGRLFP

Query:  EYRPALSPTFCSNVHSNSHRKVLEMRKMKE-VSQPATELTPMVRS
        EYRPA SPTF S +HSN HRKV+EMR+ KE  S   T L  +V+S
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TCCTTTCCTGCCTGCAATTATTCCCCACCCTCTCAGACAGAAAAAAATGGAGTGTTTGGAAGCTAAGGCTTTGAAATCGAGTTTCCACTGGGAATTAGCCATGGAATCTG
CTCAACAAGACGCTTTGGTGGAGGAAATTTGGTGTTTGAACGGAGCTAATCTCGTCGCCGGCGAGGAGTTTGAAGTCGACGAGTTTTTTAACTTCTCTAATGGAGATTTT
GAACATGGGTCTGCTTTGAGAGTTGAGGAAAATGACGATTATCAAGAGTTTGAGAAAGATTTGGTCTCTGTTTCGTCGGATTCGAACCAGTCCGGCGAGATTCCGGCTGC
CGGAGAGGAGGACTCGAAGTCGCTTCTTGCCGTTGAGCTTGCTATTCCGGGCGATGCTCTGGCGGAGCTTGAATGGGTTTCTCATTTCGTCGACGATTCTCGGCTGGGAT
TTTCCAGCGCCGCCGTGGCTTTCAGCCGCTCCGAGCCGGAAAAGAACCTCGCCGGAGGTGTAATTTCGTGTTTGCCGACGTTTGTTCCGGTCAAACCAAGGACGAAAAGG
TCGAGACAAAGTCGGCAAACGAAATCCACCGGTTCTTCTCTGAACCAATCGTCGTCGTCATCCTCCTCCTCGACGTCCTCCGGCGTTTCCTCCGCCTCACAGTGGTTCAT
CTTCTCCGACGCCGGCGAGAACGTGGACTCTTCAAACGCCGCCGGCGAGCCTCCGAAGAAGCAAAGGAAAAAGTCAATAACATCGTCGCCGACAGCTCTTCAATCCGGTG
GTTTGACCGGTCAGATTCCGCGGCGGTGTAGTCATTGTCTGGTTCAGAAGACCCCACAATGGCGAACCGGTCCACACGGGGCCAAAACACTCTGCAACGCTTGTGGGGTC
CGGTATAAATCCGGTCGGCTTTTTCCAGAGTATAGACCGGCGTTGAGCCCCACTTTTTGCAGCAATGTTCACTCAAACAGCCATCGAAAAGTGCTCGAAATGAGGAAGAT
GAAGGAGGTCTCCCAACCGGCAACCGAGTTGACTCCAATGGTCCGGAGTTACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATCAAACCATGTGTCCACAAAAGTAAACCAAAAAAAAAAATAATAATAATTAATTTATATTTATTTATATATTTTGGAATCTGCAACTGCCGCTCTGACCCGTCTTT
TCCTTTCCTGCCTGCAATTATTCCCCACCCTCTCAGACAGAAAAAAATGGAGTGTTTGGAAGCTAAGGCTTTGAAATCGAGTTTCCACTGGGAATTAGCCATGGAATCTG
CTCAACAAGACGCTTTGGTGGAGGAAATTTGGTGTTTGAACGGAGCTAATCTCGTCGCCGGCGAGGAGTTTGAAGTCGACGAGTTTTTTAACTTCTCTAATGGAGATTTT
GAACATGGGTCTGCTTTGAGAGTTGAGGAAAATGACGATTATCAAGAGTTTGAGAAAGATTTGGTCTCTGTTTCGTCGGATTCGAACCAGTCCGGCGAGATTCCGGCTGC
CGGAGAGGAGGACTCGAAGTCGCTTCTTGCCGTTGAGCTTGCTATTCCGGGCGATGCTCTGGCGGAGCTTGAATGGGTTTCTCATTTCGTCGACGATTCTCGGCTGGGAT
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TCGAGACAAAGTCGGCAAACGAAATCCACCGGTTCTTCTCTGAACCAATCGTCGTCGTCATCCTCCTCCTCGACGTCCTCCGGCGTTTCCTCCGCCTCACAGTGGTTCAT
CTTCTCCGACGCCGGCGAGAACGTGGACTCTTCAAACGCCGCCGGCGAGCCTCCGAAGAAGCAAAGGAAAAAGTCAATAACATCGTCGCCGACAGCTCTTCAATCCGGTG
GTTTGACCGGTCAGATTCCGCGGCGGTGTAGTCATTGTCTGGTTCAGAAGACCCCACAATGGCGAACCGGTCCACACGGGGCCAAAACACTCTGCAACGCTTGTGGGGTC
CGGTATAAATCCGGTCGGCTTTTTCCAGAGTATAGACCGGCGTTGAGCCCCACTTTTTGCAGCAATGTTCACTCAAACAGCCATCGAAAAGTGCTCGAAATGAGGAAGAT
GAAGGAGGTCTCCCAACCGGCAACCGAGTTGACTCCAATGGTCCGGAGTTACTAAAACCGACCAACCGGCTGAACCGGTTGGATTTTGTTGTAGGGCTAAAAAGGGAATC
CAATTTATAGTTGTAGGTTAGGGGAGAAATTAGGCAGAGCATTAATTTTATTATAGTATTTTTGTGAAATTAATTTGATTAATTAGATTAGGTAGGAAAAAAAAAAAAAA
ATAGAGATTTTTCTATTTTTGTATTAATTTAGATAATTTCGAATATAAATATTCATACTTTCTCTACAGAGTTGCCTTCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MIKPCVHKSKPKKKIIIINLYLFIYFGICNCRSDPSFPFLPAIIPHPLRQKKMECLEAKALKSSFHWELAMESAQQDALVEEIWCLNGANLVAGEEFEVDEFFNFSNGDF
EHGSALRVEENDDYQEFEKDLVSVSSDSNQSGEIPAAGEEDSKSLLAVELAIPGDALAELEWVSHFVDDSRLGFSSAAVAFSRSEPEKNLAGGVISCLPTFVPVKPRTKR
SRQSRQTKSTGSSLNQSSSSSSSSTSSGVSSASQWFIFSDAGENVDSSNAAGEPPKKQRKKSITSSPTALQSGGLTGQIPRRCSHCLVQKTPQWRTGPHGAKTLCNACGV
RYKSGRLFPEYRPALSPTFCSNVHSNSHRKVLEMRKMKEVSQPATELTPMVRSY