CuGenDBv2

Gene ID	CmaCh02G003660
Organism	Cucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
Description	Squalene synthase
Genome location	Cma_Chr02:1813921..1819736
RNA-Seq Expression	CmaCh02G003660
Synteny	CmaCh02G003660
Gene Ontology terms	GO:0008610 - lipid biosynthetic process (biological process) GO:0045338 - farnesyl diphosphate metabolic process (biological process) GO:0005789 - endoplasmic reticulum membrane (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0004310 - farnesyl-diphosphate farnesyltransferase activity (molecular function) GO:0051996 - squalene synthase activity (molecular function)
InterPro domains	IPR002060 - Squalene/phytoene synthase IPR006449 - Squalene synthase-like IPR008949 - Isoprenoid synthase domain superfamily IPR019845 - Squalene/phytoene synthase, conserved site IPR033904 - Trans-isoprenyl diphosphate synthases, head-to-head IPR044844 - Trans-isoprenyl diphosphate synthases, eukaryotic-type

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

ARE29886.1 squalene synthase [Cucurbita moschata]

2.4e-239

98.8

Show/hide

Query:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH
        MGSL AILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH
Subjt:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH

Query:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS
        IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS
Subjt:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS

Query:  MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC
        MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCL YM NLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC
Subjt:  MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC

Query:  YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC
        YNNVEVFRGVVK+RRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPM+NPAVIVILFSLIC
Subjt:  YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC

Query:  IILAYLSARQLPANQPI
        IILAYLSARQLPANQPI
Subjt:  IILAYLSARQLPANQPI

KAG6605048.1 Squalene synthase 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

7.4e-233

99.26

Show/hide

Query:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH
        MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH
Subjt:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH

Query:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS
        IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS
Subjt:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS

Query:  MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC
        MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCL YMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC
Subjt:  MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC

Query:  YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC
        YNNVEVFRGVVK+RRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPM+NPAVIVILFSLIC
Subjt:  YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC

Query:  IILA
        IILA
Subjt:  IILA

XP_022947243.1 squalene synthase-like [Cucurbita moschata]

9.7e-241

99.28

Show/hide

Query:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH
        MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH
Subjt:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH

Query:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS
        IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS
Subjt:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS

Query:  MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC
        MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCL YMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC
Subjt:  MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC

Query:  YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC
        YNNVEVFRGVVK+RRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPM+NPAVIVILFSLIC
Subjt:  YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC

Query:  IILAYLSARQLPANQPI
        IILAYLSARQLPANQPI
Subjt:  IILAYLSARQLPANQPI

XP_023007304.1 squalene synthase-like [Cucurbita maxima]

3.9e-242

100

Show/hide

Query:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH
        MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH
Subjt:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH

Query:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS
        IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS
Subjt:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS

Query:  MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC
        MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC
Subjt:  MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC

Query:  YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC
        YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC
Subjt:  YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC

Query:  IILAYLSARQLPANQPI
        IILAYLSARQLPANQPI
Subjt:  IILAYLSARQLPANQPI

XP_023534141.1 squalene synthase-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]

5.3e-239

98.8

Show/hide

Query:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH
        MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAF RH
Subjt:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH

Query:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS
        IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS
Subjt:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS

Query:  MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC
        MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCL YMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC
Subjt:  MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC

Query:  YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC
        YNNVEVFRGVVK+RRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKR+LYVVRSEPM+NPAVIVILFSLIC
Subjt:  YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC

Query:  IILAYLSARQLPANQPI
        IILAYLSARQLPANQPI
Subjt:  IILAYLSARQLPANQPI

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A2R2WEV4 Squalene synthase

2.9e-230

95.2

Show/hide

Query:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH
        MGSL AIL HPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIP EPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSI+TDIKVPIL AFH H
Subjt:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH

Query:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS
        IYN DWHFSCGTK YKVLMDEFHHVSTAFLEL KGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLA DSLSNS
Subjt:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS

Query:  MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC
        MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIW+KYADKLEDFKYE+NSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCL YMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC
Subjt:  MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC

Query:  YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC
        YNNVEVFRGVVK+RRGLTAKIIDRTKT+ADVYG+FFDFSVMLKAKVN+N PNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKR LYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC
Subjt:  YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC

Query:  IILAYLSARQLPANQPI
        IILAYLSA+QLPANQPI
Subjt:  IILAYLSARQLPANQPI

A0A2R2WEW6 Squalene synthase

1.1e-229

94.48

Show/hide

Query:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH
        MGSL AIL HPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCY+MLHKVSRSFALVIQQL PELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSI+TDIKVPILNAFH H
Subjt:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH

Query:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS
        IYN DWHFSCGTK YKVLMDEFHHVSTAFLEL KGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLA DSLSNS
Subjt:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS

Query:  MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC
        MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIW+KYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCL YMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC
Subjt:  MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC

Query:  YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC
        YNNV+VFRGVVK+RRGLTAK+IDRTKT+ADVYGAFFDFSVMLKAKVNN+DPNA+KTLSRIEAIQKTCK+SGLLNKR LYVV SEPMYNPAVIVILFSLIC
Subjt:  YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC

Query:  IILAYLSARQLPANQPI
        IILAYLSA++LPANQPI
Subjt:  IILAYLSARQLPANQPI

A0A2R2WG76 Squalene synthase

1.2e-239

98.8

Show/hide

Query:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH
        MGSL AILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH
Subjt:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH

Query:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS
        IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS
Subjt:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS

Query:  MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC
        MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCL YM NLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC
Subjt:  MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC

Query:  YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC
        YNNVEVFRGVVK+RRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPM+NPAVIVILFSLIC
Subjt:  YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC

Query:  IILAYLSARQLPANQPI
        IILAYLSARQLPANQPI
Subjt:  IILAYLSARQLPANQPI

A0A6J1G684 Squalene synthase

4.7e-241

99.28

Show/hide

Query:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH
        MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH
Subjt:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH

Query:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS
        IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS
Subjt:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS

Query:  MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC
        MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCL YMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC
Subjt:  MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC

Query:  YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC
        YNNVEVFRGVVK+RRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPM+NPAVIVILFSLIC
Subjt:  YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC

Query:  IILAYLSARQLPANQPI
        IILAYLSARQLPANQPI
Subjt:  IILAYLSARQLPANQPI

A0A6J1L4K6 Squalene synthase

1.9e-242

100

Show/hide

Query:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH
        MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH
Subjt:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH

Query:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS
        IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS
Subjt:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS

Query:  MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC
        MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC
Subjt:  MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC

Query:  YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC
        YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC
Subjt:  YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC

Query:  IILAYLSARQLPANQPI
        IILAYLSARQLPANQPI
Subjt:  IILAYLSARQLPANQPI

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1P7Y0A8 Squalene synthase 12

9.5e-199

Show/hide

Query:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH
        MGSL AIL HPDDFYPLLKLK+AARHAEKQIP EPHW FCYSMLHKVSRSF LVIQQL P+LR+AVCIFYLVLRALDTVEDDTSI T++KVPI+ AFH H
Subjt:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH

Query:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS
        IY+ DWHFSCGTK YKVLMDEFHHVS AFL+L   Y+EAIEDIT RMGAGMAKFICKEVET+DDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHAS  EDLA+DSLSNS
Subjt:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS

Query:  MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC
        MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPR+IW+KY DKLED KYE+NS KAVQCLND+VT+AL H EDCL YMS+LR  +IFRFCAIPQIMAIGTLALC
Subjt:  MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC

Query:  YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC
        +NN +VFRGVVK+RRGLTAK+ID+TKT++DVYGAFFDFS +LK+KV+NNDPNA KTLSR+EAIQKTCKESG L+KR  Y++ SE  +N A+I I+F ++ 
Subjt:  YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC

Query:  IILAYLSARQLPANQ
        I+ AYLS+  LP  Q
Subjt:  IILAYLSARQLPANQ

C9E894 Squalene synthase 2

7.3e-199

81.91

Show/hide

Query:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH
        MGSL AIL HPDDFYPLLKLK+AARHAEKQIP EPHW FCYSMLHKVSRSF LVIQQL P+LR+AVCIFYLVLRALDTVEDDTSI T++KVPIL AFHRH
Subjt:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH

Query:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS
        IY+ DWHFSCGTK YKVLMDEFHHVS AFL+L  GY+EAIEDIT RMGAGMAKFICKEVET+DDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHAS  EDLA+DSLSNS
Subjt:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS

Query:  MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC
        MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPR+IW+KY DKLED KYE+NS KAVQCLND+VTNAL HVEDCL YMS+LRD +IFRFCAIPQIM+IGTLALC
Subjt:  MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC

Query:  YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESG-LLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLI
        YNN++VFRGVVK+RRGLTAK+IDRT T++DVYGAFFDFS MLK+KV+NNDPNA KTLSR+EAIQK CK SG L  KR  Y++ +E  YN  +IVILF ++
Subjt:  YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESG-LLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLI

Query:  CIILAYLSA
         I+ AYLS+
Subjt:  CIILAYLSA

D0VFU8 Squalene synthase

1.1e-199

81.28

Show/hide

Query:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH
        MG+LRAIL +PDD YPL+KLK+AARHAEKQIPPEPHWGFCY ML KVSRSFALVIQQL  ELR+AVCIFYLVLRALDTVEDDTSI TD+KVPIL +FH+H
Subjt:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH

Query:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS
        +Y+ +WHF+CGTK YKVLMD+FHHVSTAFLEL K YQ+AIEDIT RMGAGMAKFICKEVET DDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHAS  EDLASDSLSNS
Subjt:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS

Query:  MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC
        MGLFLQKTNIIRDYLEDINE+PK RMFWPREIW+KY +KLED KYE+NSVKAVQCLND+VTNAL+HVEDCLTYM NL D +IFRFCAIPQ+MAIGTLA+C
Subjt:  MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC

Query:  YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC
        Y+N+EVFRGVVK+RRGLTAK+IDRTKT+ADVYGAFFDFS MLK+KVNNNDPNA KTL R++AI KTC++SG LNKR  Y++R+EP Y+P +IV++F ++ 
Subjt:  YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC

Query:  IILAYL
        IILA L
Subjt:  IILAYL

O48666 Squalene synthase 1

6.6e-200

81.27

Show/hide

Query:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH
        MGSL AIL HP+DFYPLLKLK AARHAEKQIPPEPHW FCYSMLHKVSRSF LVIQQL P+LR+AVCIFYLVLRALDTVEDDTSI T++KVPIL AFHRH
Subjt:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH

Query:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS
        IY+ DWHFSCGTK YKVLMDEFHHVS AFLEL  GYQEAIEDIT RMGAGMAKFICKEVET++DYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHAS  EDLA+DSLSNS
Subjt:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS

Query:  MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC
        MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPR+IW+KY DKLED KYE+NS KAVQCLND+VT+AL H EDCL YMS+LR  +IFRFCAIPQIMAIGTLALC
Subjt:  MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC

Query:  YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC
        +NN +VFRGVVK+RRGLTAK+ID+TKT++DVYGAFFDFS +LK+KV+NNDPNA KTLSR+EAIQKTCKESG L+KR  Y++ SE  +N A+I I+F ++ 
Subjt:  YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC

Query:  IILAYLSARQL
        I+ AYLS+  L
Subjt:  IILAYLSARQL

P53800 Squalene synthase

1.3e-200

80.98

Show/hide

Query:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH
        MGSLRAIL +P+D YPL+KLK+AARHAEKQIPP P+WGFCYSMLHKVSRSFALVIQQL  ELR+AVCIFYLVLRALDTVEDDTSI TD+KVPIL +FH+H
Subjt:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH

Query:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS
        +Y+ +WHFSCGTK YKVLMD+FHHVSTAFLEL K YQ+AIEDIT RMGAGMAKFICKEVET DDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHAS+ EDLASDSLSNS
Subjt:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNS

Query:  MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC
        MGLFLQKTNIIRDYLEDINE+PK RMFWPREIW+KY +KLE+ KYE NS KAVQCLND+VTNAL HVEDCLTYMS LRD SIFRFCAIPQ+MAIGTLA+C
Subjt:  MGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALC

Query:  YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC
        Y+N+EVFRGVVK+RRGLTAK+IDRT+T+ADVYGAFFDFS MLK+KVNNNDPNA KTL R+E I KTC++SG LNKR  Y++RSEP Y+P +IV++F ++ 
Subjt:  YNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLIC

Query:  IILAYLSARQ
        IILA LS  +
Subjt:  IILAYLSARQ

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT4G34640.1 squalene synthase 1

1.6e-185

76.59

Show/hide

Query:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH
        MGSL  +L +PDD YPLLK+K A   AEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSF+LVIQQL  ELRNAVC+FYLVLRALDTVEDDTSI TD KVPIL AFHRH
Subjt:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH

Query:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASD--SLS
        IY+ DWH+SCGTK YK+LMD+FHHVS AFLEL KGYQEAIE+IT+RMGAGMAKFIC+EVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLF A+  E L  D  ++S
Subjt:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASD--SLS

Query:  NSMGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLA
        NSMGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIW KYADKLED KYE+N+ K+VQCLN++VTNAL H+EDCL YM +LRD SIFRFCAIPQIMAIGTLA
Subjt:  NSMGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLA

Query:  LCYNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSL
        LCYNN +VFRGVVKLRRGLTAK+IDRTKT+ADVYGAF+DFS MLK KV+ NDPNA+KTL+R+EA+QK C+++G+L  R  Y V  +   N   I+++  L
Subjt:  LCYNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSL

Query:  ICIILAYLSA
        + I+ AYL A
Subjt:  ICIILAYLSA

AT4G34650.1 squalene synthase 2

2.8e-177

73.12

Show/hide

Query:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH
        MGSL  IL HPD+ YPLLKLK+A   A+KQIP EPH  FCYS+LHKVS+SF+LVIQQL  ELRNAVC+FYL+LRALDTVEDDTS+  +IKVPIL AFHRH
Subjt:  MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRH

Query:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASD--SLS
        IY+ DWHFSCGTK YK+LMD+FHHVS AFL+L KGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVET+DDYDEYCHY AGLVGLGLSK+F AS+LE L  D   +S
Subjt:  IYNPDWHFSCGTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASD--SLS

Query:  NSMGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLA
        NS GLFLQKTNII+DYLEDINE PKSRMFWPREIW KY DKLEDFK E+ + KAVQCLN++VTNALNHVEDCL  +++LRD +IF+ CAIPQI+AIGTLA
Subjt:  NSMGLFLQKTNIIRDYLEDINEIPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLA

Query:  LCYNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILF-S
        LCYNNV+VFRGVV+LRRGL AK+IDRTKT+ DVYGAF+DFS ML+ KV+NNDPNA KTL+R+E I+K CKE+G L+KR  YV  ++   + A+ V++F  
Subjt:  LCYNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVADVYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILF-S

Query:  LICIILAYLSARQ
        L+ I++ YL A Q
Subjt:  LICIILAYLSARQ

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGGGAGTTTGAGGGCGATTTTGAGTCATCCGGATGACTTTTATCCGCTTTTGAAACTGAAAATGGCTGCTAGACATGCGGAGAAGCAGATCCCGCCGGAGCCTCATTG
GGGATTTTGCTATTCCATGCTGCATAAGGTTTCTCGAAGCTTTGCTCTCGTTATTCAGCAGCTTACGCCCGAGCTTCGAAATGCTGTATGCATATTTTATCTTGTTTTGC
GAGCCCTCGACACTGTTGAGGATGATACAAGCATAGAAACAGATATCAAAGTGCCCATTCTGAACGCTTTTCACCGTCACATATATAACCCTGATTGGCACTTTTCATGT
GGCACAAAGCACTATAAAGTTCTTATGGATGAGTTTCATCACGTTTCAACTGCGTTTCTTGAACTTGCAAAAGGGTACCAGGAAGCGATTGAGGATATCACGAAACGAAT
GGGTGCCGGAATGGCTAAATTCATTTGCAAAGAGGTAGAGACAGTTGACGATTATGATGAATATTGCCACTACGTAGCTGGACTTGTCGGACTTGGTTTGTCAAAGTTGT
TCCACGCATCGAAGTTGGAGGATTTGGCATCTGATTCTCTTTCAAATTCTATGGGATTGTTTCTTCAGAAAACAAACATTATTCGAGATTACTTGGAGGACATCAATGAG
ATACCGAAATCTCGAATGTTTTGGCCTCGCGAGATTTGGAACAAATATGCTGATAAATTAGAGGATTTTAAATATGAGAAGAATTCGGTCAAGGCTGTGCAATGCCTCAA
TGATTTGGTCACTAATGCTTTGAACCATGTGGAGGATTGTCTGACATACATGTCTAACTTAAGAGATCTTTCCATATTTCGATTTTGTGCAATCCCTCAGATTATGGCGA
TTGGAACCTTAGCATTATGCTACAACAATGTCGAAGTCTTCAGGGGGGTCGTCAAATTGCGTCGGGGTCTTACTGCAAAGATCATTGATCGAACGAAAACAGTTGCAGAC
GTCTATGGAGCTTTCTTTGATTTCTCTGTTATGCTGAAGGCTAAGGTCAACAACAATGATCCTAATGCTGCTAAAACCCTGAGCAGGATTGAGGCAATACAGAAAACATG
CAAGGAGTCGGGTCTCTTGAACAAACGGAACTTGTATGTGGTAAGAAGTGAGCCAATGTACAATCCAGCTGTGATTGTCATCCTTTTCAGCCTAATATGCATCATTCTCG
CGTATCTCTCCGCCAGACAGTTACCAGCTAACCAACCCATATGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

AAGAAGAACAAGACTGAAGATTGATTGCCATTTGAATTTGGGGCCGTAAAAAGCTTTGGTCTCTGCCAATTTGTATTGTACTCAGTGCACACGCATTCACCAGAACGCCC
ACTTTAGTCTTCAAATTCCCTCCACTGATCTTCCATTTCTGCAAATTCTTGAAACCACGTATTTCACGTTGTTTTCTTTGATTACAGCATCTCAACAAACAATCTGCACA
GCTATATAAGCAGATTCCATGGATTTCTCTTCTTTAAATATCTGAAAACCATCATCCTTCATTAGATTGTCCATCATTTGGGGATTTGGGCTTCAATCATTCTGTTTTCT
TCGCTATTTTGTTCGAATTTGTCATTGTCGATTGAATTAGAGGAACGCCATTTGAGGAATTGGGTGTTTGCGCTGAGGTTTGACCGGCGTGGGATCTGAAACTTGTGGAG
TTTGGGTGTTTGAAATCGGATTGAGAGCTAGAAATGGGGAGTTTGAGGGCGATTTTGAGTCATCCGGATGACTTTTATCCGCTTTTGAAACTGAAAATGGCTGCTAGACA
TGCGGAGAAGCAGATCCCGCCGGAGCCTCATTGGGGATTTTGCTATTCCATGCTGCATAAGGTTTCTCGAAGCTTTGCTCTCGTTATTCAGCAGCTTACGCCCGAGCTTC
GAAATGCTGTATGCATATTTTATCTTGTTTTGCGAGCCCTCGACACTGTTGAGGATGATACAAGCATAGAAACAGATATCAAAGTGCCCATTCTGAACGCTTTTCACCGT
CACATATATAACCCTGATTGGCACTTTTCATGTGGCACAAAGCACTATAAAGTTCTTATGGATGAGTTTCATCACGTTTCAACTGCGTTTCTTGAACTTGCAAAAGGGTA
CCAGGAAGCGATTGAGGATATCACGAAACGAATGGGTGCCGGAATGGCTAAATTCATTTGCAAAGAGGTAGAGACAGTTGACGATTATGATGAATATTGCCACTACGTAG
CTGGACTTGTCGGACTTGGTTTGTCAAAGTTGTTCCACGCATCGAAGTTGGAGGATTTGGCATCTGATTCTCTTTCAAATTCTATGGGATTGTTTCTTCAGAAAACAAAC
ATTATTCGAGATTACTTGGAGGACATCAATGAGATACCGAAATCTCGAATGTTTTGGCCTCGCGAGATTTGGAACAAATATGCTGATAAATTAGAGGATTTTAAATATGA
GAAGAATTCGGTCAAGGCTGTGCAATGCCTCAATGATTTGGTCACTAATGCTTTGAACCATGTGGAGGATTGTCTGACATACATGTCTAACTTAAGAGATCTTTCCATAT
TTCGATTTTGTGCAATCCCTCAGATTATGGCGATTGGAACCTTAGCATTATGCTACAACAATGTCGAAGTCTTCAGGGGGGTCGTCAAATTGCGTCGGGGTCTTACTGCA
AAGATCATTGATCGAACGAAAACAGTTGCAGACGTCTATGGAGCTTTCTTTGATTTCTCTGTTATGCTGAAGGCTAAGGTCAACAACAATGATCCTAATGCTGCTAAAAC
CCTGAGCAGGATTGAGGCAATACAGAAAACATGCAAGGAGTCGGGTCTCTTGAACAAACGGAACTTGTATGTGGTAAGAAGTGAGCCAATGTACAATCCAGCTGTGATTG
TCATCCTTTTCAGCCTAATATGCATCATTCTCGCGTATCTCTCCGCCAGACAGTTACCAGCTAACCAACCCATATGAGCATCGAACTCCGGACAGGAGTTTGAACCGAAC
ATGCCATGAACTTGGACGGTATGATTTAGTTTTTGGCTCCATAATCTTCCTCAGAGCTTTGTTTAAATGTTACAAAGGGTGTAAGTTAGTGTGTTGTTAAGTACAGACCA
GGAAACGAGTGAGATCTTGTAGCATTCTAATGGGGATGTGTAGTGTAATGGTTGACATGGAAGTAAGCTTTGTTCTTGTTTTTTCAATATTCTATTAAGGGATTAAGTTT
TGGAATTAAAAGTATCTTCCATAACAAA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MGSLRAILSHPDDFYPLLKLKMAARHAEKQIPPEPHWGFCYSMLHKVSRSFALVIQQLTPELRNAVCIFYLVLRALDTVEDDTSIETDIKVPILNAFHRHIYNPDWHFSC
GTKHYKVLMDEFHHVSTAFLELAKGYQEAIEDITKRMGAGMAKFICKEVETVDDYDEYCHYVAGLVGLGLSKLFHASKLEDLASDSLSNSMGLFLQKTNIIRDYLEDINE
IPKSRMFWPREIWNKYADKLEDFKYEKNSVKAVQCLNDLVTNALNHVEDCLTYMSNLRDLSIFRFCAIPQIMAIGTLALCYNNVEVFRGVVKLRRGLTAKIIDRTKTVAD
VYGAFFDFSVMLKAKVNNNDPNAAKTLSRIEAIQKTCKESGLLNKRNLYVVRSEPMYNPAVIVILFSLICIILAYLSARQLPANQPI

CmaCh02G003660 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome