; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh02G006460 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh02G006460
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCma_Chr02:3903058..3903498
RNA-Seq ExpressionCmaCh02G006460
SyntenyCmaCh02G006460
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6605337.1 hypothetical protein SDJN03_02654, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.2e-6693.15Show/hide
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KAG7035293.1 hypothetical protein SDJN02_02088, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.5e-6693.15Show/hide
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XP_022947828.1 uncharacterized protein LOC111451588 [Cucurbita moschata]7.7e-6895.21Show/hide
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XP_023533092.1 uncharacterized protein LOC111795084 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.6e-6593.15Show/hide
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         NESPQSDAGCQA KED NQRQSNSSSN S  SRESEKPLAITM S
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XP_038900833.1 uncharacterized protein LOC120087896 [Benincasa hispida]2.7e-4468.87Show/hide
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        MSLV+PS GR  IWIVT  LF S++SGGGCLLMY+ LPETE TAWLPVAGLSLVCLPWFFW LTF YR+ISRACGFRVS+G+ V+   D A  NN N +N
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        N   ESP+ D G +  +ED   G+QR+SNSSSNNS  SRESE PLAITMGS
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LJX6 Uncharacterized protein3.9e-4166Show/hide
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        MSLV+PS GR  IWIVT  LF S+LSGGGCLLMY+ LPETE TAWLP+ GLSLVCLPWFFW LTF YR++SRACGFRVSLG+   V+ + A  NN N +N
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         +  ES Q D G +  +++ N  QR SNSSSNNS VSRESE PLAITM S
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A0A1S3CDW9 Uncharacterized protein4.3e-4064.05Show/hide
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        MSLV+PS GR  IWIVT  LF S++SGGGCLLMY+ LPE+E+T WLP+ GLSLVCLPWFFW LTF YR+ISRACG+RVSLG    ED    N N+N +NN
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          N    ESP+ D G +  +++ N  QR+SNSSSNNS VSRESE PLAITM S
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A0A5A7TCV0 Uncharacterized protein1.2e-3962.91Show/hide
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        MSLV+PS GR  IWIVT  LF S++SGGGCLLMY+ LPE+E+T WLP+ GLSLVCLPWFFW LTF YR+ISRACG+RVSLG    V   +    NN N +
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Query:  NNTPNESPQSDAGCQAYKEDGN--QRQSNSSSNNSRVSRESEKPLAITMGS
        N +  ESP+ D G +  +++ N  QR+SNSSSNNS VSRESE PLAITM S
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A0A6J1EV39 uncharacterized protein LOC1114383193.0e-4165.1Show/hide
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        MSLVDPS GR  +W V F LFL +LSGG CLL+Y+ LPETE+TAWLPVAGLSLVCLPWFFW LTF YR+ISRACGFRVSL +  + +    ++ N +NN+
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          ESP+ DA  QA +EDGN   QR+SN SSNNS +SRESE P AI+MGS
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A0A6J1G7P7 uncharacterized protein LOC1114515883.7e-6895.21Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G30770.1 Putative membrane lipoprotein6.4e-2041.51Show/hide
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        M + DP  G+  I ++T  LFLS+  GGGCL+ Y  LP      WL   G+  VCLPWFFW LTF YRI+SR  GFR+ +G   N + A       D + 
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        P    ESP  D         G      +GNQ  ++ ++SSN++  S ESE PLAI+M S
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTTTGGTCGATCCATCAGTTGGACGTGTATTAATATGGATCGTTACTTTCATTCTCTTCCTCTCTGTTCTCAGCGGCGGCGGATGCCTTTTGATGTATGTTACCCT
ACCTGAGACCGAAAACACCGCGTGGCTACCGGTCGCAGGCTTATCATTGGTCTGCCTCCCTTGGTTCTTTTGGTTCTTAACTTTCTTGTATAGAATCATCTCACGTGCAT
GTGGTTTTAGAGTCTCCCTTGGCTTAGTTGTGAACGAAGATGCAGCGGCAACAAATAACGAAAATGCCGATAATAATACTCCTAATGAATCCCCTCAAAGTGATGCAGGG
TGTCAGGCTTATAAGGAGGACGGCAATCAAAGGCAAAGCAATTCATCATCGAACAACTCCAGAGTGTCTCGTGAAAGTGAAAAGCCATTAGCCATAACAATGGGGTCGTA
A
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCTTTGGTCGATCCATCAGTTGGACGTGTATTAATATGGATCGTTACTTTCATTCTCTTCCTCTCTGTTCTCAGCGGCGGCGGATGCCTTTTGATGTATGTTACCCT
ACCTGAGACCGAAAACACCGCGTGGCTACCGGTCGCAGGCTTATCATTGGTCTGCCTCCCTTGGTTCTTTTGGTTCTTAACTTTCTTGTATAGAATCATCTCACGTGCAT
GTGGTTTTAGAGTCTCCCTTGGCTTAGTTGTGAACGAAGATGCAGCGGCAACAAATAACGAAAATGCCGATAATAATACTCCTAATGAATCCCCTCAAAGTGATGCAGGG
TGTCAGGCTTATAAGGAGGACGGCAATCAAAGGCAAAGCAATTCATCATCGAACAACTCCAGAGTGTCTCGTGAAAGTGAAAAGCCATTAGCCATAACAATGGGGTCGTA
A
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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CQAYKEDGNQRQSNSSSNNSRVSRESEKPLAITMGS