; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh02G007600 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh02G007600
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
Description50S ribosomal protein L4
Genome locationCma_Chr02:4579662..4581594
RNA-Seq ExpressionCmaCh02G007600
SyntenyCmaCh02G007600
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR002136 - Ribosomal protein L4/L1e
IPR013005 - 50S ribosomal protein uL4
IPR023574 - Ribosomal protein L4 domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022948154.1 50S ribosomal protein L4, chloroplastic-like isoform X1 [Cucurbita moschata]5.2e-14898.29Show/hide
Query:  MAASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTAST
        MAAST PSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTAST
Subjt:  MAASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTAST

Query:  LTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPK
        LTRAEV GGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPK
Subjt:  LTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPK

Query:  EKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIED-EEEEEEELEGEEGLETGEDLDAAE
        EKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIED EEEEEEELEGEEGL+ GEDLDAAE
Subjt:  EKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIED-EEEEEEELEGEEGLETGEDLDAAE

XP_022948155.1 50S ribosomal protein L4, chloroplastic-like isoform X2 [Cucurbita moschata]6.5e-14398.93Show/hide
Query:  MAASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTAST
        MAAST PSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTAST
Subjt:  MAASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTAST

Query:  LTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPK
        LTRAEV GGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPK
Subjt:  LTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPK

Query:  EKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIED-EEEEEEELEGEE
        EKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIED EEEEEEELEGEE
Subjt:  EKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIED-EEEEEEELEGEE

XP_023007555.1 50S ribosomal protein L4, chloroplastic-like isoform X1 [Cucurbita maxima]1.3e-151100Show/hide
Query:  MAASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTAST
        MAASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTAST
Subjt:  MAASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTAST

Query:  LTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPK
        LTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPK
Subjt:  LTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPK

Query:  EKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIEDEEEEEEELEGEEGLETGEDLDAAE
        EKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIEDEEEEEEELEGEEGLETGEDLDAAE
Subjt:  EKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIEDEEEEEEELEGEEGLETGEDLDAAE

XP_023007557.1 50S ribosomal protein L4, chloroplastic-like isoform X2 [Cucurbita maxima]1.4e-145100Show/hide
Query:  MAASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTAST
        MAASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTAST
Subjt:  MAASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTAST

Query:  LTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPK
        LTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPK
Subjt:  LTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPK

Query:  EKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIEDEEEEEEELEGEE
        EKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIEDEEEEEEELEGEE
Subjt:  EKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIEDEEEEEEELEGEE

XP_023532270.1 50S ribosomal protein L4, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.8e-14898.63Show/hide
Query:  MAASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTAST
        MAASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTAST
Subjt:  MAASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTAST

Query:  LTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPK
        LTRAEV GGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPK
Subjt:  LTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPK

Query:  EKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIED-EEEEEEELEGEEGLETGEDLDAAE
        EKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIED EEEEEEELEGEEGLE GE+LDAAE
Subjt:  EKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIED-EEEEEEELEGEEGLETGEDLDAAE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1D3V7 50S ribosomal protein L4, chloroplastic2.3e-14192.88Show/hide
Query:  MAASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTAST
        MA STTPSSLSFF+SS+FLSSANQNSKLFC+WKPNS KPQ+KPLSISSQLATLPVLSF GEKVGET LDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTAST
Subjt:  MAASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTAST

Query:  LTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPK
        LTRAEV GGG+KPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPK
Subjt:  LTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPK

Query:  EKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIEDEEEEEEE----LEGEEGLETGEDLDAAE
        EKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDIL+SDK+VLTPAAVDYLNERYGINYE GIED+EEEEEE     EGEEGLE GED DAAE
Subjt:  EKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIEDEEEEEEE----LEGEEGLETGEDLDAAE

A0A6J1G8Y3 50S ribosomal protein L4, chloroplastic-like isoform X23.2e-14398.93Show/hide
Query:  MAASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTAST
        MAAST PSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTAST
Subjt:  MAASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTAST

Query:  LTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPK
        LTRAEV GGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPK
Subjt:  LTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPK

Query:  EKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIED-EEEEEEELEGEE
        EKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIED EEEEEEELEGEE
Subjt:  EKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIED-EEEEEEELEGEE

A0A6J1G917 50S ribosomal protein L4, chloroplastic-like isoform X12.5e-14898.29Show/hide
Query:  MAASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTAST
        MAAST PSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTAST
Subjt:  MAASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTAST

Query:  LTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPK
        LTRAEV GGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPK
Subjt:  LTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPK

Query:  EKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIED-EEEEEEELEGEEGLETGEDLDAAE
        EKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIED EEEEEEELEGEEGL+ GEDLDAAE
Subjt:  EKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIED-EEEEEEELEGEEGLETGEDLDAAE

A0A6J1KZ16 50S ribosomal protein L4, chloroplastic-like isoform X26.8e-146100Show/hide
Query:  MAASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTAST
        MAASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTAST
Subjt:  MAASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTAST

Query:  LTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPK
        LTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPK
Subjt:  LTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPK

Query:  EKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIEDEEEEEEELEGEE
        EKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIEDEEEEEEELEGEE
Subjt:  EKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIEDEEEEEEELEGEE

A0A6J1L3A5 50S ribosomal protein L4, chloroplastic-like isoform X16.3e-152100Show/hide
Query:  MAASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTAST
        MAASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTAST
Subjt:  MAASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTAST

Query:  LTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPK
        LTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPK
Subjt:  LTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPK

Query:  EKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIEDEEEEEEELEGEEGLETGEDLDAAE
        EKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIEDEEEEEEELEGEEGLETGEDLDAAE
Subjt:  EKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIEDEEEEEEELEGEEGLETGEDLDAAE

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B0JI02 50S ribosomal protein L44.8e-5652.45Show/hide
Query:  VLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTASTLTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKE
        V ++ GE+ G   L+LK+A PETA+ ++HR +++     R+G AS+ TR+EVRGGGRKP++QK TG+AR GS+R+PL  GGGV+FGPKPRD+ +K+NRKE
Subjt:  VLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTASTLTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKE

Query:  KRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPKEKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLN
        KRLA+ TA+ S A N IVVE F ++F +PKTKE  AAL RWG  P+EK L ++TE+ +NV LS RNI  LK++   +LN++D++ +D+++ T AA+  + 
Subjt:  KRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPKEKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLN

Query:  ERYG
        E YG
Subjt:  ERYG

O49937 50S ribosomal protein L4, chloroplastic4.2e-9266.09Show/hide
Query:  MAASTTPS-SLSFFSSSIFLS-SANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTA
        MA ST+ S SLSFFSSS+F S S N +SK       +S    S  LSI S+L  LP+L+F+GEKVGET L+LK+APPE ARAVVHR +IT  QNKRRGTA
Subjt:  MAASTTPS-SLSFFSSSIFLS-SANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTA

Query:  STLTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGID
        STLTRAEVRGGGRKPY QKKTG+ARRGS  +PLRPGGGV+FGPKPRDW+IK+N+KE+RLA+STA+ASA  N+ VVE+F + FEKPKTK+FIAA++RWG+D
Subjt:  STLTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGID

Query:  PKEKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIEDEEEEEEELEGEE---GLETG
        P EKSLF + ++ +NV  S RNI TLKLLTPR+LNLFD+LN++KLV T   + YLN+RYG++  E  EDEEEEEEE EGEE   G+E G
Subjt:  PKEKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIEDEEEEEEELEGEE---GLETG

O50061 50S ribosomal protein L4, chloroplastic3.4e-10270.11Show/hide
Query:  AASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTASTL
        +++T P+SLSFFSSS+FLSS++Q  K + +         SKPLS+SSQLATLP+LSF GEKVGET LDLK+AP +TARAVVHRAI+TD  NKRRGTASTL
Subjt:  AASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTASTL

Query:  TRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAV---NTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGID
        TR EVRGGG KPY QKKTG ARRGS RTPLRPGGGVVFGP+P+DWSIKINRKEK+LAISTA++SAA      IVVE+FG+KFEKPKTK+F+AA++RWG+D
Subjt:  TRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAV---NTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGID

Query:  PKEKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIEDEEEEEEELEGEE
        PKEK++FLM +V +NV  SSRNIGTL++LTPRTLNLFDILN+DKLVLTPAAV++LN RYG+   + +E+E+++E+E EG E
Subjt:  PKEKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIEDEEEEEEELEGEE

O80361 50S ribosomal protein L4, chloroplastic6.9e-9567.86Show/hide
Query:  SSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTASTLTRAEVR
        +SLSFFSSSIFLS+ N  S     ++       +   +I S++AT+P+LSF G +VG T L+LKSAP +TARAVVHR + TD +N+RRGTASTLTR+EVR
Subjt:  SSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTASTLTRAEVR

Query:  GGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPKEKSLFLM
        GGG KPY QKKTG+ARRGS RTPLRPGGGVVFGPKP+DWS+KIN+KEKRLAISTA++SA+ NTIVVE+F DKFEKPKTKEFI  ++RWG+DPKEKSLFLM
Subjt:  GGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPKEKSLFLM

Query:  TEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYG--INYEEGIEDEEEEEEELEGEEGLETGE
        T+VSDNV LSSRNIGTLK+LTPRTLNLFDIL+S+KLVLT +AVD+LNERYG    +E+  ED++E+ +  E EE  E+ E
Subjt:  TEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYG--INYEEGIEDEEEEEEELEGEEGLETGE

Q8DMN0 50S ribosomal protein L41.3e-5654.41Show/hide
Query:  VLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTASTLTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKE
        V  + G   GE  LDL +A PETA  +VHRA++    N R+GT ST TRAEVRGGGRKP++QK TG+AR GS+R+PL  GGGV+FGPKPRD+S K+NRKE
Subjt:  VLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTASTLTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKE

Query:  KRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPKEKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLN
        +RLA+ TA+ S   + IVV+DF D   +PKTKE + AL+RWGI+P++K L L  ++++ V LS+RN+ TLKLL    LN+FD+L +D++V T  A+  + 
Subjt:  KRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPKEKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLN

Query:  ERYG
        E YG
Subjt:  ERYG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G07320.1 ribosomal protein L42.4e-10370.11Show/hide
Query:  AASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTASTL
        +++T P+SLSFFSSS+FLSS++Q  K + +         SKPLS+SSQLATLP+LSF GEKVGET LDLK+AP +TARAVVHRAI+TD  NKRRGTASTL
Subjt:  AASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTASTL

Query:  TRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAV---NTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGID
        TR EVRGGG KPY QKKTG ARRGS RTPLRPGGGVVFGP+P+DWSIKINRKEK+LAISTA++SAA      IVVE+FG+KFEKPKTK+F+AA++RWG+D
Subjt:  TRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAV---NTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGID

Query:  PKEKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIEDEEEEEEELEGEE
        PKEK++FLM +V +NV  SSRNIGTL++LTPRTLNLFDILN+DKLVLTPAAV++LN RYG+   + +E+E+++E+E EG E
Subjt:  PKEKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIEDEEEEEEELEGEE

AT1G07320.2 ribosomal protein L45.4e-10371.01Show/hide
Query:  AASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTASTL
        +++T P+SLSFFSSS+FLSS++Q  K + +         SKPLS+SSQLATLP+LSF GEKVGET LDLK+AP +TARAVVHRAI+TD  NKRRGTASTL
Subjt:  AASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTASTL

Query:  TRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAV---NTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGID
        TR EVRGGG KPY QKKTG ARRGS RTPLRPGGGVVFGP+P+DWSIKINRKEK+LAISTA++SAA      IVVE+FG+KFEKPKTK+F+AA++RWG+D
Subjt:  TRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAV---NTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGID

Query:  PKEKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIEDEEEEEEE
        PKEK++FLM +V +NV  SSRNIGTL++LTPRTLNLFDILN+DKLVLTPAAV++LN RYG++  E  +D+E+E EE
Subjt:  PKEKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIEDEEEEEEE

AT1G07320.3 ribosomal protein L42.4e-10370.25Show/hide
Query:  AASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTASTL
        +++T P+SLSFFSSS+FLSS++Q  K + +         SKPLS+SSQLATLP+LSF GEKVGET LDLK+AP +TARAVVHRAI+TD  NKRRGTASTL
Subjt:  AASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTASTL

Query:  TRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAV---NTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGID
        TR EVRGGG KPY QKKTG ARRGS RTPLRPGGGVVFGP+P+DWSIKINRKEK+LAISTA++SAA      IVVE+FG+KFEKPKTK+F+AA++RWG+D
Subjt:  TRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAV---NTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGID

Query:  PKEKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIEDEEEEEEELEG
        PKEK++FLM +V +NV  SSRNIGTL++LTPRTLNLFDILN+DKLVLTPAAV++LN RYG+   + +E+E+++E+E EG
Subjt:  PKEKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIEDEEEEEEELEG

AT1G07320.4 ribosomal protein L42.4e-10370.25Show/hide
Query:  AASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTASTL
        +++T P+SLSFFSSS+FLSS++Q  K + +         SKPLS+SSQLATLP+LSF GEKVGET LDLK+AP +TARAVVHRAI+TD  NKRRGTASTL
Subjt:  AASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTASTL

Query:  TRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAV---NTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGID
        TR EVRGGG KPY QKKTG ARRGS RTPLRPGGGVVFGP+P+DWSIKINRKEK+LAISTA++SAA      IVVE+FG+KFEKPKTK+F+AA++RWG+D
Subjt:  TRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAV---NTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGID

Query:  PKEKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIEDEEEEEEELEG
        PKEK++FLM +V +NV  SSRNIGTL++LTPRTLNLFDILN+DKLVLTPAAV++LN RYG+   + +E+E+++E+E EG
Subjt:  PKEKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIEDEEEEEEELEG

AT2G20060.1 Ribosomal protein L4/L1 family2.8e-1930.58Show/hide
Query:  LPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTASTLTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINR
        +PV +F  E+ G  VL          + ++H  +      +++GT ST T +EV G GRKP+ QK TG+AR G++R P   GG V+ GPKPR  +IK+N+
Subjt:  LPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTASTLTRAEVRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINR

Query:  KEKRLAISTAVASAAV--NTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPKEKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAV
        + +RL +  A+ + A     +V +D G      KTK  +    +   + K+  +     + + ++L+++N+  + ++    LN++ IL  D L+++  AV
Subjt:  KEKRLAISTAVASAAV--NTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPKEKSLFLMTEVSDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAV

Query:  DYLNER
        + + ER
Subjt:  DYLNER


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCCTCCACCACGCCATCGTCGCTCTCTTTCTTCTCTTCATCGATCTTCCTTTCATCGGCCAACCAAAATTCTAAGCTCTTTTGCAATTGGAAACCCAAT
TCCTTTAAACCCCAATCCAAGCCCTTATCGATCTCCTCCCAGCTCGCTACTCTTCCAGTCCTCTCCTTCACCGGAGAAAAAGTAGGCGAGACCGTCCTTGACCTC
AAGTCCGCTCCACCGGAAACCGCTCGCGCCGTCGTTCATCGAGCCATTATTACTGATCAACAGAACAAGCGCCGTGGGACCGCCTCGACTCTTACTAGAGCTGAG
GTTAGAGGAGGCGGCAGAAAACCATACCAGCAAAAGAAAACTGGGAAGGCCCGTCGTGGTTCGATGCGTACTCCTCTCCGGCCTGGCGGAGGTGTGGTTTTCGGG
CCGAAACCTAGGGATTGGTCCATTAAAATCAACAGAAAGGAGAAGAGACTGGCGATTTCGACGGCGGTGGCTAGTGCGGCGGTAAATACGATAGTGGTGGAAGAT
TTTGGTGACAAATTCGAGAAGCCGAAAACTAAGGAGTTCATTGCTGCGCTAAAGAGATGGGGAATCGATCCTAAGGAGAAATCCTTGTTCTTAATGACGGAGGTT
TCTGATAATGTGCGACTATCCAGCCGCAATATCGGAACACTGAAGTTGTTGACGCCGAGAACACTGAATTTGTTCGATATTTTGAATTCTGATAAGTTGGTTTTG
ACGCCGGCGGCGGTGGATTATCTGAATGAGAGATATGGAATCAATTACGAAGAAGGAATTGAAGACGAGGAGGAAGAAGAAGAAGAATTAGAAGGCGAAGAAGGG
CTGGAGACCGGTGAGGATTTGGATGCAGCGGAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTCCTATTTGCCATTGATATCAGCGGGAGTGGATAACGAAGCCATCTGTAGAACCCAGAGAGCACCTCAAAGCTTCTTCAACCTCACCTACAATGGCGGCCTCCA
CCACGCCATCGTCGCTCTCTTTCTTCTCTTCATCGATCTTCCTTTCATCGGCCAACCAAAATTCTAAGCTCTTTTGCAATTGGAAACCCAATTCCTTTAAACCCC
AATCCAAGCCCTTATCGATCTCCTCCCAGCTCGCTACTCTTCCAGTCCTCTCCTTCACCGGAGAAAAAGTAGGCGAGACCGTCCTTGACCTCAAGTCCGCTCCAC
CGGAAACCGCTCGCGCCGTCGTTCATCGAGCCATTATTACTGATCAACAGAACAAGCGCCGTGGGACCGCCTCGACTCTTACTAGAGCTGAGGTTAGAGGAGGCG
GCAGAAAACCATACCAGCAAAAGAAAACTGGGAAGGCCCGTCGTGGTTCGATGCGTACTCCTCTCCGGCCTGGCGGAGGTGTGGTTTTCGGGCCGAAACCTAGGG
ATTGGTCCATTAAAATCAACAGAAAGGAGAAGAGACTGGCGATTTCGACGGCGGTGGCTAGTGCGGCGGTAAATACGATAGTGGTGGAAGATTTTGGTGACAAAT
TCGAGAAGCCGAAAACTAAGGAGTTCATTGCTGCGCTAAAGAGATGGGGAATCGATCCTAAGGAGAAATCCTTGTTCTTAATGACGGAGGTTTCTGATAATGTGC
GACTATCCAGCCGCAATATCGGAACACTGAAGTTGTTGACGCCGAGAACACTGAATTTGTTCGATATTTTGAATTCTGATAAGTTGGTTTTGACGCCGGCGGCGG
TGGATTATCTGAATGAGAGATATGGAATCAATTACGAAGAAGGAATTGAAGACGAGGAGGAAGAAGAAGAAGAATTAGAAGGCGAAGAAGGGCTGGAGACCGGTG
AGGATTTGGATGCAGCGGAATGATTCTGCCATGTACGAATCGGCGAAAGCTTCGGCATGTTAGCTTGCAGGCTTGAATGTATTCTTTTTTTGGTTCTTGTTCACA
CTCAAAGGTATCTCCTTCTTCTCTTTCCCTCCAATATCCTTGTGTATTGTCAGTAGTTGGTCTCTTCAAGAACAATCTTTGATTGTTTAGGAACTTGCATTCTGT
TATGTCTTCACTGTACTTTCTTCCTAAGTTAGGAGCTTCCATTAGAACTTTACATCTCCTATGGCAGCTCCGTCGTCGATAACTTGTGAAAATGCTTAAAGAGAT
AGAGAACAAAGTTCTTGAAAGATCATCTAGACTTGTGGAGTAAATCTAGAGTTGAATTGAATGGTTCTTCTGATCTTAAAATGTTCTTCAACTAACCTGATCGCT
GTGGAAATATGATTGTGGGGTGCCCTTTCAGCAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAASTTPSSLSFFSSSIFLSSANQNSKLFCNWKPNSFKPQSKPLSISSQLATLPVLSFTGEKVGETVLDLKSAPPETARAVVHRAIITDQQNKRRGTASTLTRAE
VRGGGRKPYQQKKTGKARRGSMRTPLRPGGGVVFGPKPRDWSIKINRKEKRLAISTAVASAAVNTIVVEDFGDKFEKPKTKEFIAALKRWGIDPKEKSLFLMTEV
SDNVRLSSRNIGTLKLLTPRTLNLFDILNSDKLVLTPAAVDYLNERYGINYEEGIEDEEEEEEELEGEEGLETGEDLDAAE