; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh02G009040 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh02G009040
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
Descriptiontranscription factor TCP14-like
Genome locationCma_Chr02:5387201..5387710
RNA-Seq ExpressionCmaCh02G009040
SyntenyCmaCh02G009040
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR005333 - Transcription factor, TCP
IPR017887 - Transcription factor TCP subgroup


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6605560.1 Transcription factor TCP15, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.2e-8496.45Show/hide
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KAG7035479.1 Transcription factor TCP15, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.2e-8496.45Show/hide
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XP_022958512.1 transcription factor TCP14-like [Cucurbita moschata]3.7e-8295.86Show/hide
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XP_022996075.1 transcription factor TCP14-like [Cucurbita maxima]7.8e-88100Show/hide
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XP_023533029.1 transcription factor TCP7-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.5e-8395.86Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KDC7 TCP domain-containing protein5.8e-6577.78Show/hide
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        MRVK+ TSNSPR  P      ASESK IPSKA KDRHAKV GRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIA+TGK+IASA  +L 
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        GC KP DPSSS T +TT   F+     GNNYAFP V+E +PLPNYEFDLVSDFDMELFAHHI TLQEVAENSE+E EDDD
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A0A1S3CNQ2 transcription factor TCP72.2e-6477.78Show/hide
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        MRVKK TSNSPR  P      ASESK IPSKA KDRHAKV GRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIA+TGK+IASA  +L 
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        GC KP DPSSS   +TT   F+     GNNYAFPTV+E +PLPNYEFDLVSDFDMELFAHHI TLQEVAENSE+E ED D
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A0A5A7T0X8 Transcription factor TCP72.2e-6477.78Show/hide
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        MRVKK TSNSPR  P      ASESK IPSKA KDRHAKV GRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIA+TGK+IASA  +L 
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        GC KP DPSSS   +TT   F+     GNNYAFPTV+E +PLPNYEFDLVSDFDMELFAHHI TLQEVAENSE+E ED D
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A0A6J1H216 transcription factor TCP14-like1.8e-8295.86Show/hide
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        DPSSS TTTTTAKT DGNNYAFPTVDEQVPLPNYEFDLVSDF+MELFA HINTLQEV ENSEREAEDDD
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A0A6J1K5P6 transcription factor TCP14-like3.8e-88100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q53PH2 Transcription factor PCF32.1e-1976.79Show/hide
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        KDRH KV+GR RRIR+P LCAARVFQLTRELG+KTDG+T+EWLL++AEP+I+A TG
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Q93Z00 Transcription factor TCP141.6e-1948.28Show/hide
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        A++  P+   + KDRH KV GR RRIR+P LCAARVFQLTRELG+K+DG+T+EWLL++AEPS+IA TG   I +    L+    +  SS +  +   + A
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Query:  KTFDGNNYAFPTVDEQ
         TF  NN   P + +Q
Subjt:  KTFDGNNYAFPTVDEQ

Q9C9L2 Transcription factor TCP151.1e-2064.79Show/hide
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        PN+   KP P + + KDRH KV+GR RRIR+P +CAARVFQLTRELG+K+DG+T+EWLL++AEP++IA TG
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Q9FMX2 Transcription factor TCP72.7e-1971.43Show/hide
Query:  KDRHAKVQGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAA
        KDRH+KV GR RRIR+P +CAARVFQLTRELG+K+DGQT+EWLL++AEPSIIA TG     A+
Subjt:  KDRHAKVQGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAA

Q9FTA2 Transcription factor TCP213.6e-1958.43Show/hide
Query:  VKKATSNSPRGVPNASESKPIPSKALKDRHAKVQGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAA
        + + TSN  +G  NA +  P      KDRH+KV GR RRIR+P +CAARVFQLTRELG+K+DGQT+EWLL++AEPSIIA TG     A+
Subjt:  VKKATSNSPRGVPNASESKPIPSKALKDRHAKVQGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G58100.1 TCP family transcription factor4.3e-2071.19Show/hide
Query:  KALKDRHAKVQGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITG
        ++ KDRH KV GR RRIR+P LCAARVFQLTRELG+K+DG+T+EWLL++AEP+I+A TG
Subjt:  KALKDRHAKVQGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITG

AT1G69690.1 TCP family transcription factor7.9e-2264.79Show/hide
Query:  PNASESKPIPSK-ALKDRHAKVQGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITG
        PN+   KP P + + KDRH KV+GR RRIR+P +CAARVFQLTRELG+K+DG+T+EWLL++AEP++IA TG
Subjt:  PNASESKPIPSK-ALKDRHAKVQGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITG

AT3G47620.1 TEOSINTE BRANCHED, cycloidea and PCF (TCP) 141.1e-2048.28Show/hide
Query:  ASESKPIPSKALKDRHAKVQGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGK-DIASAAPELHGCKPTDPSSSTTTT---TTA
        A++  P+   + KDRH KV GR RRIR+P LCAARVFQLTRELG+K+DG+T+EWLL++AEPS+IA TG   I +    L+    +  SS +  +   + A
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Query:  KTFDGNNYAFPTVDEQ
         TF  NN   P + +Q
Subjt:  KTFDGNNYAFPTVDEQ

AT5G08330.1 TCP family transcription factor2.5e-2058.43Show/hide
Query:  VKKATSNSPRGVPNASESKPIPSKALKDRHAKVQGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAA
        + + TSN  +G  NA +  P      KDRH+KV GR RRIR+P +CAARVFQLTRELG+K+DGQT+EWLL++AEPSIIA TG     A+
Subjt:  VKKATSNSPRGVPNASESKPIPSKALKDRHAKVQGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAA

AT5G23280.1 TCP family transcription factor1.9e-2071.43Show/hide
Query:  KDRHAKVQGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAA
        KDRH+KV GR RRIR+P +CAARVFQLTRELG+K+DGQT+EWLL++AEPSIIA TG     A+
Subjt:  KDRHAKVQGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGAGTCAAGAAGGCTACATCTAACTCCCCAAGAGGTGTACCAAATGCCTCAGAGTCTAAGCCCATCCCTTCCAAAGCTCTGAAAGATCGCCATGCCAAGGTT
CAGGGGCGCGATCGACGTATCCGCCTTCCTCCATTGTGTGCAGCTCGGGTCTTTCAGCTAACTCGCGAGCTTGGAAATAAAACAGATGGGCAGACTGTAGAGTGG
CTGTTGAAGAAGGCTGAGCCATCAATTATAGCTATAACTGGTAAAGACATTGCCTCTGCTGCTCCAGAGTTACATGGCTGCAAGCCTACTGATCCATCTTCATCT
ACTACTACTACTACTACAGCAAAAACTTTTGATGGAAACAACTATGCATTCCCAACTGTTGATGAGCAGGTACCATTGCCAAATTATGAATTTGACTTGGTCTCG
GATTTTGATATGGAACTTTTTGCTCATCATATCAACACGCTTCAAGAAGTAGCAGAAAACTCCGAGAGAGAAGCCGAGGACGACGACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGAGTCAAGAAGGCTACATCTAACTCCCCAAGAGGTGTACCAAATGCCTCAGAGTCTAAGCCCATCCCTTCCAAAGCTCTGAAAGATCGCCATGCCAAGGTT
CAGGGGCGCGATCGACGTATCCGCCTTCCTCCATTGTGTGCAGCTCGGGTCTTTCAGCTAACTCGCGAGCTTGGAAATAAAACAGATGGGCAGACTGTAGAGTGG
CTGTTGAAGAAGGCTGAGCCATCAATTATAGCTATAACTGGTAAAGACATTGCCTCTGCTGCTCCAGAGTTACATGGCTGCAAGCCTACTGATCCATCTTCATCT
ACTACTACTACTACTACAGCAAAAACTTTTGATGGAAACAACTATGCATTCCCAACTGTTGATGAGCAGGTACCATTGCCAAATTATGAATTTGACTTGGTCTCG
GATTTTGATATGGAACTTTTTGCTCATCATATCAACACGCTTCAAGAAGTAGCAGAAAACTCCGAGAGAGAAGCCGAGGACGACGACTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRVKKATSNSPRGVPNASESKPIPSKALKDRHAKVQGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAAPELHGCKPTDPSSS
TTTTTTAKTFDGNNYAFPTVDEQVPLPNYEFDLVSDFDMELFAHHINTLQEVAENSEREAEDDD