; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh02G016060 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh02G016060
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
Descriptiontranscriptional regulator SUPERMAN-like
Genome locationCma_Chr02:9146091..9146813
RNA-Seq ExpressionCmaCh02G016060
SyntenyCmaCh02G016060
Gene Ontology termsGO:0007155 - cell adhesion (biological process)
GO:0019062 - virion attachment to host cell (biological process)
InterPro domainsIPR008982 - Adenovirus pIV-like, attachment domain
IPR013087 - Zinc finger C2H2-type
IPR036236 - Zinc finger C2H2 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6606245.1 Zinc finger protein 10, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.1e-11894.26Show/hide
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KAG7036187.1 Zinc finger protein 10, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.4e-12095.49Show/hide
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XP_022931230.1 zinc finger protein 10-like [Cucurbita moschata]6.4e-12095.08Show/hide
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XP_022995519.1 transcriptional regulator SUPERMAN-like [Cucurbita maxima]4.4e-129100Show/hide
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XP_023533595.1 zinc finger protein 10-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-11793.9Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LF36 C2H2-type domain-containing protein1.0e-6764.04Show/hide
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A0A1S3CRJ1 transcriptional regulator SUPERMAN-like9.5e-6963.3Show/hide
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A0A5D3E693 Transcriptional regulator SUPERMAN-like9.5e-6963.3Show/hide
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         HQAPS++  P   SS+SSS+     SNSFIIP  DFNGGG LC+LY FPNP +               I SPSSLFSM HHSFN +  STS   AFP+ 
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A0A6J1EYW0 zinc finger protein 10-like3.1e-12095.08Show/hide
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A0A6J1K623 transcriptional regulator SUPERMAN-like2.1e-129100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80942 Zinc finger protein 103.5e-2067.11Show/hide
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Q38895 Transcriptional regulator SUPERMAN7.1e-1337.02Show/hide
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        +D   ++G +WPPRSYTC+FC+REFRSAQALGGHMNVHRRDRA  RL Q+PS++  P     + + S S++ ++    P H         L P  +P Y 
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             SL   S H+  N                  F    +   +RN    +      L +E     S Q++DLELRLG A
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Q9LHS9 Probable transcriptional regulator RABBIT EARS1.9e-1352.81Show/hide
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        L PM T    D    W   E RAF  AE+     G  WPPRSY+C+FC REF+SAQALGGHMNVHRRDRARL Q    ++ P S+  ++
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Q9SLB8 Zinc finger protein 115.8e-1561.97Show/hide
Query:  WPPRSYTCTFCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPSNAIKP------------FSSSSSSSSSSSSL
        WPP++YTC+FCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA+L Q PS   +P            FSSSSSSS++++ L
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Q9SR34 Transcriptional regulator TAC16.4e-0652.54Show/hide
Query:  RSYTCTFCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPSNAIKPFSSSSSSSSSSSSLTSN
        RSY C+FC R F +AQALGGHMN+HRRDRA+L Q      K    + S +S   SL  N
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G37740.1 zinc-finger protein 102.5e-2167.11Show/hide
Query:  PDVVDDDDSWEVRAFAEDTADVMGTTWPPRSYTCTFCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPSNAIKPFSSSS
        P   + + SWE  AFAED  D  G+ WPPRSYTC+FCRREF+SAQALGGHMNVHRRDRARL QA    + P SSSS
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AT2G42410.1 zinc finger protein 114.1e-1661.97Show/hide
Query:  WPPRSYTCTFCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPSNAIKP------------FSSSSSSSSSSSSL
        WPP++YTC+FCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA+L Q PS   +P            FSSSSSSS++++ L
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AT3G23130.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein5.0e-1437.02Show/hide
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        +D   ++G +WPPRSYTC+FC+REFRSAQALGGHMNVHRRDRA  RL Q+PS++  P     + + S S++ ++    P H         L P  +P Y 
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Query:  IRSPSSLFSMSHHSFNN------------------FMPSTSAFPIRNHRAGASSFPQSLSDEQAMESSNQEVDLELRLGQA
             SL   S H+  N                  F    +   +RN    +      L +E     S Q++DLELRLG A
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AT4G17810.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein8.3e-2541.84Show/hide
Query:  SPMQTPDVVDDDDSWEVRAFAEDT-ADVMGTTWPPRSYTCTFCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA--RLHQAPSNAIKPFSSSSSS--SSSSSSLTSNSF
        +P +  ++ DDD+SWEV+AF +DT  ++ GTTWPPRSYTC FCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA  R HQ  + A    S       +S +  L + + 
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Query:  IIPAHDFNGGGLCVLYPFPNPYNIRSPSSLFSMSHHSFNNFMPSTSAFPIRNH--RAGASSFPQSLSDEQAMES-------SNQEVDLELRLGQAP
        II +   N  GL   Y   NP  I   S    ++ +   +F PS   F + N            S  D++++ S       S  E+DLELRLG  P
Subjt:  IIPAHDFNGGGLCVLYPFPNPYNIRSPSSLFSMSHHSFNNFMPSTSAFPIRNH--RAGASSFPQSLSDEQAMES-------SNQEVDLELRLGQAP

AT5G06070.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein1.3e-1452.81Show/hide
Query:  LSPMQTPDVVDDDDSW---EVRAF--AEDTADVMGTTWPPRSYTCTFCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPSNAIKPFSSSSSS
        L PM T    D    W   E RAF  AE+     G  WPPRSY+C+FC REF+SAQALGGHMNVHRRDRARL Q    ++ P S+  ++
Subjt:  LSPMQTPDVVDDDDSW---EVRAF--AEDTADVMGTTWPPRSYTCTFCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPSNAIKPFSSSSSS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGCTCACCTTGACCTTCTCTTTCAATACTCTTCTTCTTCATTTCTTCCTCTTTCTCAAATTACTCGACACGGGCTGACTCCGAACAGTTTAAGCCCTATGCAAAC
GCCGGACGTTGTCGACGACGATGACTCGTGGGAAGTCAGGGCTTTCGCTGAGGACACCGCTGATGTCATGGGAACTACTTGGCCTCCTAGGTCTTACACTTGCACTTTTT
GTAGAAGAGAGTTCAGGTCTGCTCAAGCCCTAGGTGGTCATATGAATGTTCACCGTCGCGATCGTGCTCGGCTCCATCAAGCCCCGTCGAACGCAATCAAACCCTTTTCC
TCCTCCTCCTCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTGACCTCAAATTCTTTCATCATCCCGGCTCATGATTTTAATGGTGGAGGGTTGTGTGTTCTCTACCCATTCCCAAA
CCCTTACAACATTCGCTCACCCTCTTCTCTTTTCTCTATGTCCCATCATTCCTTCAACAACTTCATGCCCTCTACCTCGGCCTTTCCGATTCGTAATCACCGTGCCGGAG
CGAGTAGTTTCCCTCAATCCTTGAGTGATGAACAAGCCATGGAAAGTAGCAACCAAGAGGTTGATCTAGAGCTCAGGCTTGGACAAGCTCCTTCAACTCAAACTCTCATG
GAAAAGGGACACAAAATCTCTAATTTTGAAGCTGCGTGTCTGAGGAAGAGATCATCAGATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGCTCACCTTGACCTTCTCTTTCAATACTCTTCTTCTTCATTTCTTCCTCTTTCTCAAATTACTCGACACGGGCTGACTCCGAACAGTTTAAGCCCTATGCAAAC
GCCGGACGTTGTCGACGACGATGACTCGTGGGAAGTCAGGGCTTTCGCTGAGGACACCGCTGATGTCATGGGAACTACTTGGCCTCCTAGGTCTTACACTTGCACTTTTT
GTAGAAGAGAGTTCAGGTCTGCTCAAGCCCTAGGTGGTCATATGAATGTTCACCGTCGCGATCGTGCTCGGCTCCATCAAGCCCCGTCGAACGCAATCAAACCCTTTTCC
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GAAAAGGGACACAAAATCTCTAATTTTGAAGCTGCGTGTCTGAGGAAGAGATCATCAGATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAHLDLLFQYSSSSFLPLSQITRHGLTPNSLSPMQTPDVVDDDDSWEVRAFAEDTADVMGTTWPPRSYTCTFCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPSNAIKPFS
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