; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh02G016080 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh02G016080
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionAuxin responsive SAUR protein
Genome locationCma_Chr02:9153683..9154045
RNA-Seq ExpressionCmaCh02G016080
SyntenyCmaCh02G016080
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6606247.1 hypothetical protein SDJN03_03564, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.6e-5391.74Show/hide
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XP_022931160.1 uncharacterized protein LOC111437423 [Cucurbita moschata]1.2e-5392.56Show/hide
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XP_022995520.1 uncharacterized protein LOC111491030 [Cucurbita maxima]2.4e-59100Show/hide
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XP_023534111.1 uncharacterized protein LOC111795770 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.5e-5391.67Show/hide
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XP_038888374.1 uncharacterized protein LOC120078224 [Benincasa hispida]3.3e-3263.43Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LK59 Uncharacterized protein3.5e-3261.87Show/hide
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A0A1S3CQ48 uncharacterized protein LOC1035035367.9e-3261.76Show/hide
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A0A5D3E5S1 Auxin responsive SAUR protein7.9e-3261.76Show/hide
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A0A6J1EYP5 uncharacterized protein LOC1114374235.6e-5492.56Show/hide
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A0A6J1K475 uncharacterized protein LOC1114910301.2e-59100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G17345.1 SAUR-like auxin-responsive protein family8.1e-0532.89Show/hide
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        + K E L  V VG+ R  +++   V+    F+ L+++  RF E+    R ++  + V  + +LFEHLLW++ N SS
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AT2G35290.1 unknown protein2.6e-1944.72Show/hide
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        MGCL+     VMK RR  +A   R  YR L  +  + ++RVVVG+E+ EF+V+P+VLEE PFRVL+   +   K    R+   +    VD+ILFEHLLWL
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Query:  IYNDSSSLLTLNLDEILHFYSQE
        + ND+S+   L++ EI+ FY+Q+
Subjt:  IYNDSSSLLTLNLDEILHFYSQE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTTGTTTGGTCCTCCTCCCTTGCTACGTCATGAAGACACGACGCCGGAGAACCGCCCCTCGCCTCCCCTATCGCCGCCTCGACAAATCGGAGAGCCTGGTAAGGGT
GGTGGTGGGAGAGGAGAGGACAGAATTCCTGGTAGACCCATTTGTGTTAGAAGAAAACCCATTTCGGGTTCTGATGGAAAAGGGAAGATTCGAAGAAAAGGAGGGAAAAA
GAAGAAGCGAAGAACACATAATATTTGTCGATGTTGATGCTATTTTGTTCGAGCACTTGCTTTGGCTCATCTACAACGATTCTTCTTCTTTGCTTACCCTCAATCTTGAC
GAAATTCTTCACTTTTATTCTCAAGAGTTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGTTGTTTGGTCCTCCTCCCTTGCTACGTCATGAAGACACGACGCCGGAGAACCGCCCCTCGCCTCCCCTATCGCCGCCTCGACAAATCGGAGAGCCTGGTAAGGGT
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GAAATTCTTCACTTTTATTCTCAAGAGTTTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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