; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh02G016190 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh02G016190
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionGlycine rich superfamily member
Genome locationCma_Chr02:9194607..9199117
RNA-Seq ExpressionCmaCh02G016190
SyntenyCmaCh02G016190
Gene Ontology termsGO:0110165 - cellular anatomical structure (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
AKA71833.1 hypothetical protein CSCA_4708 [Clostridium scatologenes]2.3e-0854.26Show/hide
Query:  VYGPTIASGLGLVYGPTIATGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIATGL
        V GPT A+G+  V GPT ATG+  + GPT A+G+  V GPT A+G+  V GPT ATG   V GPT A+G+  V GPT ATG   V GPT ATG+
Subjt:  VYGPTIASGLGLVYGPTIATGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIATGL

KAE8595352.1 hypothetical protein XENTR_v10015706 [Xenopus tropicalis]1.6e-0942.24Show/hide
Query:  GHVYGPTIASGLGLVYGPTIATGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIATGLGLSS
        G   G  +A+G GL  G  +A G GL  G  +A+G GL  G  +A+G GL  G  +ATGSGL  G  +A+G GL  G  +ATGSGL  G  +ATG GL++
Subjt:  GHVYGPTIASGLGLVYGPTIATGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIATGLGLSS

Query:  DNPPPLPGFLANSSSV
         +   +   LA  S +
Subjt:  DNPPPLPGFLANSSSV

WP_060934597.1 hypothetical protein [Smaragdicoccus niigatensis]1.2e-0945Show/hide
Query:  GHVYGPTIASGLGLVYGPTIATGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIATGLGLSS
        G   G  +A+G GL  G  +ATG GL  G  +A+G GL  G  +A+G GL  G  +ATG+GL  G  +A+G GL  G  +ATG+GL  G  +ATG GL++
Subjt:  GHVYGPTIASGLGLVYGPTIATGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIATGLGLSS

WP_108849523.1 collagen-like protein [Clostridium drakei]1.7e-0855.32Show/hide
Query:  VYGPTIASGLGLVYGPTIATGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIATGL
        V GPT A+G+  V GPT ATG+  V GPT A+G+  V GPT A+G+  V GPT ATG   V GPT A+G+  V GPT ATG   V GPT ATG+
Subjt:  VYGPTIASGLGLVYGPTIATGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIATGL

WP_151573173.1 collagen-like protein [Bacillus mesophilum]7.7e-0958.06Show/hide
Query:  VYGPTIASGLGLVYGPTIATGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIATG
        V GPT A+G   V GPT ATGL  V GPT A+G   V GPT A+G   V GPT ATG+  V GPT A+GL  V GPT ATG+  V GPT ATG
Subjt:  VYGPTIASGLGLVYGPTIATGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIATG

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A2U8DXZ6 Uncharacterized protein8.3e-0955.32Show/hide
Query:  VYGPTIASGLGLVYGPTIATGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIATGL
        V GPT A+G+  V GPT ATG+  V GPT A+G+  V GPT A+G+  V GPT ATG   V GPT A+G+  V GPT ATG   V GPT ATG+
Subjt:  VYGPTIASGLGLVYGPTIATGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIATGL

A0A3P9JB11 Uncharacterized protein4.9e-0942.73Show/hide
Query:  GLGFWAYHCYRIGHVYGPTIASGLGLVYGPTIATGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVY
        GLG   + C   G V GP +    GLV  P +  G GLV GP +  G GLV  P +  G GLV  P +  G GLV GP +    GLV GP +  G GLV 
Subjt:  GLGFWAYHCYRIGHVYGPTIASGLGLVYGPTIATGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVY

Query:  GPTIATGLGL
        GP +    GL
Subjt:  GPTIATGLGL

A0A671VQR5 Uncharacterized protein1.7e-0932Show/hide
Query:  GHVYGPTIASGLGLVYGPTIATGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIATGLGLSS
        G   GP + SG  +  GP + +G G+  GP +  G G+  GP + SG G+  GP + +G G+  GP + SG G+  GP + +G G+  GP + +G  ++S
Subjt:  GHVYGPTIASGLGLVYGPTIATGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIATGLGLSS

Query:  -----DNPPPLPGFLANSSSVTQLP
               P   PG + +   +T  P
Subjt:  -----DNPPPLPGFLANSSSVTQLP

A0A7N6F9T3 Uncharacterized protein3.4e-1044.63Show/hide
Query:  GLGFWAYHCYRIGHVYGPTIAS----GLGLVYGPTIATGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIAS----GLGLVYGPTI
        GLG  +     +G V+GP + S    GLGLV+GP    GLGLV+GP + S  G   GP    GLGLV+GP    G G V+GP + S    GLGLV+GP +
Subjt:  GLGFWAYHCYRIGHVYGPTIAS----GLGLVYGPTIATGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIAS----GLGLVYGPTI

Query:  AT----GSGLVYGPTIATGLG
        A+    G G V+ P    GLG
Subjt:  AT----GSGLVYGPTIATGLG

A0A7V7RN09 Collagen-like protein3.7e-0958.06Show/hide
Query:  VYGPTIASGLGLVYGPTIATGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIATG
        V GPT A+G   V GPT ATGL  V GPT A+G   V GPT A+G   V GPT ATG+  V GPT A+GL  V GPT ATG+  V GPT ATG
Subjt:  VYGPTIASGLGLVYGPTIATGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIATG

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5ISE2 mRNA decay activator protein ZFP36L31.6e-0430.53Show/hide
Query:  GPTIASGLGLVYGPTIATGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIATGLGLS
        G  +A G  +  G  +ATG  L  G  +A G  +  G  +A G  +  G  +ATG+ L +G  +A+G  L  G  +A G+ +  G  +A G  ++
Subjt:  GPTIASGLGLVYGPTIATGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIATGLGLS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGCCTACCATTGCTACCGGATTGGGCATGTTTATGGGCCTACCATTGCTACCGGATTGGGCTTGGTTTATGGGCCTACCATTGCTACCGGATTGGGCTTGGTTTTTG
GGCCTACCATTGCTACCGGATTGGGCATGTTTATGGGCCTACCATTGCTTCCGGATTGGGCTTGGTTTATGGGCCTACCATTGCTACTGGATTGGGATTGGTTTATGGGC
CTACCATTGCTTCCGGATTGGGATTGGTTTATGGGCCTACCATTGCTTCCGGATTGGGCTTGGTTTATGGGCCTACCATTGCTACCGGATCGGGCTTGGTTTATGGGCCT
ACCATTGCTTCCGGATTGGGCTTGGTTTATGGGCCTACCATTGCTACGGGATCGGGCTTGGTTTATGGGCCTACCATTGCTACCGGGTTGGGCTTGAGCTCTGATAACCC
ACCGCCATTGCCAGGGTTCCTCGCCAACTCCTCAAGTGTCACGCAACTCCCCGTCCAATTATGCCCTCTTAGGATCTTAATCTTCACGTGCTCCGGTAATATCAACTTAT
GCCGACCTTCCCCTTCTCTTTTCGCCTTCACTATCGAATACCCTGTTGAATGCGATCTCGAGAATTTCTTCCTACTCTCTTCCTTCTCCATCTCCTCTGTTTCAATCCTC
TGTTTTCCCTTGTTCGAACAAGACCCCTCATCATCATCGGCATCGGAATCGGCATTGGCATCGTTGTCCTCATCAATATCAATACTAATAGCATCTTCAATTGACTCACG
GCGGGAAGTTCGTGGTGGATCAGAGGTCTTATCAGCAGAATTCCTCCGCGAATCGGAGTCGAGATTTCTCCTGCAAACAGGGCAGATTGTCACTGCGAAATTCCTTGATT
TTGGAATATGGGAAAGTGGGAAAGGAGTTGATGAGAAGAGGGTCGAGGCCAGTAGGGGCGGCAGGGGAATCGGTGGAAGGGTGGAGAAGGTTGCCGGAGGTGGAGCGGCG
GAGGTTGCGGGAATGGAGGAAGGAGTCCACAACGCAGCGGCAGCAGTAGATGGAGAAGAAACCGACGAAGAGGAAGGCAACGAGGATGAGTGTGAGGACAATGGTGACAG
GAGGACTGCCGTGATCTTGTGCGGGGAAAGGAATGCGAGTCAAATCGGTGGACATTGGCCGGAAAAGGACCTGAAGGAGAGGAATGTCCGGAAGAAGAACAAGAAAAGGA
AATGGGATTTAAGAAGGAAACTCACATTGTGTTTGATCCATTTCCTGATCCGCCACCACTGTAGCCACCAGGACCCAGGCTTATTGCCACACTCTCTCGATTCTTCGACT
GCTCGTCGTGAAGAAATGTACAACCATCCCCATATGGACACCCCTCCTCGGTGTAAAACTTCTTGCAATGTCGTCCTTTATATGACCTCTGCGACTCGGAACCAAAATTT
GATGTCCCAAGTGAAGGTTCCAGCGCGGAATTTGCAGCAGAGTTTGGTCTTGAAGAACATTTTACCTATCGCTTTTGATCGATTCGAGGACGTAACATCCTGGGAGCTTC
TTGATTTCTTATTTGGGGGTTCGCTGCCGGACCGGCTTTGGGATTGCCTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGCCTACCATTGCTACCGGATTGGGCATGTTTATGGGCCTACCATTGCTACCGGATTGGGCTTGGTTTATGGGCCTACCATTGCTACCGGATTGGGCTTGGTTTTTG
GGCCTACCATTGCTACCGGATTGGGCATGTTTATGGGCCTACCATTGCTTCCGGATTGGGCTTGGTTTATGGGCCTACCATTGCTACTGGATTGGGATTGGTTTATGGGC
CTACCATTGCTTCCGGATTGGGATTGGTTTATGGGCCTACCATTGCTTCCGGATTGGGCTTGGTTTATGGGCCTACCATTGCTACCGGATCGGGCTTGGTTTATGGGCCT
ACCATTGCTTCCGGATTGGGCTTGGTTTATGGGCCTACCATTGCTACGGGATCGGGCTTGGTTTATGGGCCTACCATTGCTACCGGGTTGGGCTTGAGCTCTGATAACCC
ACCGCCATTGCCAGGGTTCCTCGCCAACTCCTCAAGTGTCACGCAACTCCCCGTCCAATTATGCCCTCTTAGGATCTTAATCTTCACGTGCTCCGGTAATATCAACTTAT
GCCGACCTTCCCCTTCTCTTTTCGCCTTCACTATCGAATACCCTGTTGAATGCGATCTCGAGAATTTCTTCCTACTCTCTTCCTTCTCCATCTCCTCTGTTTCAATCCTC
TGTTTTCCCTTGTTCGAACAAGACCCCTCATCATCATCGGCATCGGAATCGGCATTGGCATCGTTGTCCTCATCAATATCAATACTAATAGCATCTTCAATTGACTCACG
GCGGGAAGTTCGTGGTGGATCAGAGGTCTTATCAGCAGAATTCCTCCGCGAATCGGAGTCGAGATTTCTCCTGCAAACAGGGCAGATTGTCACTGCGAAATTCCTTGATT
TTGGAATATGGGAAAGTGGGAAAGGAGTTGATGAGAAGAGGGTCGAGGCCAGTAGGGGCGGCAGGGGAATCGGTGGAAGGGTGGAGAAGGTTGCCGGAGGTGGAGCGGCG
GAGGTTGCGGGAATGGAGGAAGGAGTCCACAACGCAGCGGCAGCAGTAGATGGAGAAGAAACCGACGAAGAGGAAGGCAACGAGGATGAGTGTGAGGACAATGGTGACAG
GAGGACTGCCGTGATCTTGTGCGGGGAAAGGAATGCGAGTCAAATCGGTGGACATTGGCCGGAAAAGGACCTGAAGGAGAGGAATGTCCGGAAGAAGAACAAGAAAAGGA
AATGGGATTTAAGAAGGAAACTCACATTGTGTTTGATCCATTTCCTGATCCGCCACCACTGTAGCCACCAGGACCCAGGCTTATTGCCACACTCTCTCGATTCTTCGACT
GCTCGTCGTGAAGAAATGTACAACCATCCCCATATGGACACCCCTCCTCGGTGTAAAACTTCTTGCAATGTCGTCCTTTATATGACCTCTGCGACTCGGAACCAAAATTT
GATGTCCCAAGTGAAGGTTCCAGCGCGGAATTTGCAGCAGAGTTTGGTCTTGAAGAACATTTTACCTATCGCTTTTGATCGATTCGAGGACGTAACATCCTGGGAGCTTC
TTGATTTCTTATTTGGGGGTTCGCTGCCGGACCGGCTTTGGGATTGCCTTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGLPLLPDWACLWAYHCYRIGLGLWAYHCYRIGLGFWAYHCYRIGHVYGPTIASGLGLVYGPTIATGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGP
TIASGLGLVYGPTIATGSGLVYGPTIATGLGLSSDNPPPLPGFLANSSSVTQLPVQLCPLRILIFTCSGNINLCRPSPSLFAFTIEYPVECDLENFFLLSSFSISSVSIL
CFPLFEQDPSSSSASESALASLSSSISILIASSIDSRREVRGGSEVLSAEFLRESESRFLLQTGQIVTAKFLDFGIWESGKGVDEKRVEASRGGRGIGGRVEKVAGGGAA
EVAGMEEGVHNAAAAVDGEETDEEEGNEDECEDNGDRRTAVILCGERNASQIGGHWPEKDLKERNVRKKNKKRKWDLRRKLTLCLIHFLIRHHCSHQDPGLLPHSLDSST
ARREEMYNHPHMDTPPRCKTSCNVVLYMTSATRNQNLMSQVKVPARNLQQSLVLKNILPIAFDRFEDVTSWELLDFLFGGSLPDRLWDCL