; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh04G013490 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh04G013490
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionZinc finger, HIT-type domain
Genome locationCma_Chr04:6873429..6875964
RNA-Seq ExpressionCmaCh04G013490
SyntenyCmaCh04G013490
Gene Ontology termsGO:0000398 - mRNA splicing, via spliceosome (biological process)
GO:0005681 - spliceosomal complex (cellular component)
GO:0004386 - helicase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR007009 - Shq1 protein domain
IPR007529 - Zinc finger, HIT-type
IPR039646 - Zinc finger HIT domain-containing protein 2


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7031944.1 Zinc finger HIT domain-containing protein 2 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.2e-22098.04Show/hide
Query:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTICHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLDED
        MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRT+CHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEME L+ED
Subjt:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTICHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLDED

Query:  DSTLSEETIEKVLAGGQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRAPDTP
        DSTLSEETIEKVLAG QLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPR PDTP
Subjt:  DSTLSEETIEKVLAGGQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRAPDTP

Query:  LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL
        LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL
Subjt:  LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL

Query:  LSLGDPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFEHHKMSTKMDSKAKSSD
        LSLG PALVCLLCDLQRLIQAGERDLKS KRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFE+HKMSTKMDSKAKSSD
Subjt:  LSLGDPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFEHHKMSTKMDSKAKSSD

Query:  KVLIEEIK
        KVLIEEIK
Subjt:  KVLIEEIK

XP_022957527.1 zinc finger HIT domain-containing protein 2 isoform X2 [Cucurbita moschata]7.1e-22098.04Show/hide
Query:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTICHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLDED
        MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTICHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEME LDED
Subjt:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTICHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLDED

Query:  DSTLSEETIEKVLAGGQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRAPDTP
        DSTLSEETIEKVLAG QLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPR P+TP
Subjt:  DSTLSEETIEKVLAGGQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRAPDTP

Query:  LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL
        LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL
Subjt:  LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL

Query:  LSLGDPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFEHHKMSTKMDSKAKSSD
        LSLG PALVCLLCDLQRLIQAGERDLKS KRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFE+HKMSTKMDSKAK SD
Subjt:  LSLGDPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFEHHKMSTKMDSKAKSSD

Query:  KVLIEEIK
        KVLIEEIK
Subjt:  KVLIEEIK

XP_022990596.1 zinc finger HIT domain-containing protein 2 isoform X1 [Cucurbita maxima]6.2e-22499.27Show/hide
Query:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTICHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLDED
        MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTICHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLDED
Subjt:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTICHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLDED

Query:  DSTLSEETIEKVLA---GGQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRAP
        DSTLSEETIEKVLA   GGQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRAP
Subjt:  DSTLSEETIEKVLA---GGQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRAP

Query:  DTPLPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDV
        DTPLPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDV
Subjt:  DTPLPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDV

Query:  AILLSLGDPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFEHHKMSTKMDSKAK
        AILLSLGDPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFEHHKMSTKMDSKAK
Subjt:  AILLSLGDPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFEHHKMSTKMDSKAK

Query:  SSDKVLIEEIK
        SSDKVLIEEIK
Subjt:  SSDKVLIEEIK

XP_022990668.1 zinc finger HIT domain-containing protein 2 isoform X2 [Cucurbita maxima]1.5e-225100Show/hide
Query:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTICHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLDED
        MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTICHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLDED
Subjt:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTICHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLDED

Query:  DSTLSEETIEKVLAGGQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRAPDTP
        DSTLSEETIEKVLAGGQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRAPDTP
Subjt:  DSTLSEETIEKVLAGGQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRAPDTP

Query:  LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL
        LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL
Subjt:  LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL

Query:  LSLGDPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFEHHKMSTKMDSKAKSSD
        LSLGDPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFEHHKMSTKMDSKAKSSD
Subjt:  LSLGDPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFEHHKMSTKMDSKAKSSD

Query:  KVLIEEIK
        KVLIEEIK
Subjt:  KVLIEEIK

XP_023514271.1 zinc finger HIT domain-containing protein 2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.4e-22098.04Show/hide
Query:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTICHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLDED
        MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRT+CHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDD TKRKTLDILKRFHSEEEMEDLDED
Subjt:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTICHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLDED

Query:  DSTLSEETIEKVLAGGQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRAPDTP
        DSTLSEETIEKVLAGGQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGT LVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRAPDTP
Subjt:  DSTLSEETIEKVLAGGQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRAPDTP

Query:  LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL
        LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLS+IDDVAIL
Subjt:  LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL

Query:  LSLGDPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFEHHKMSTKMDSKAKSSD
        LSLG PALVCLLCDLQRLIQAGERDLKS KRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFE+HKMSTKMDSKAK SD
Subjt:  LSLGDPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFEHHKMSTKMDSKAKSSD

Query:  KVLIEEIK
        KVLIEEIK
Subjt:  KVLIEEIK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KV24 HIT-type domain-containing protein7.7e-20490.69Show/hide
Query:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTICHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLD-E
        MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTICHVCHKQFSQY+CPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDS KRKTLDILKRFH+EEEMEDLD E
Subjt:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTICHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLD-E

Query:  DDSTLSEETIEKVLAGGQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRAPDT
        DDSTLSEET EKVLAG QLSFDDLS EEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWW KPSARTISLSKEGTPLVQLHA ++ T SLTS  E  QSS IP+APDT
Subjt:  DDSTLSEETIEKVLAGGQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRAPDT

Query:  PLPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAI
        PLP LSKLS+A+PSPLLAVHL+DIIYSYCFTLRLYNGDWQSDA GSALVVLS+SSVLGQ+G+PETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDV+ 
Subjt:  PLPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAI

Query:  LLSLGDPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFEHHKMSTKMDSKAKSS
        LLSLG PALVCLLCDLQRLIQAGERDLKS KRR+KS+WSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSE WSTLENIVKMEKSSIMEFE+HKMSTKMDSK KS 
Subjt:  LLSLGDPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFEHHKMSTKMDSKAKSS

Query:  DKVLIEEI
        DKVLI+EI
Subjt:  DKVLIEEI

A0A6J1GZD0 zinc finger HIT domain-containing protein 2 isoform X23.4e-22098.04Show/hide
Query:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTICHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLDED
        MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTICHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEME LDED
Subjt:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTICHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLDED

Query:  DSTLSEETIEKVLAGGQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRAPDTP
        DSTLSEETIEKVLAG QLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPR P+TP
Subjt:  DSTLSEETIEKVLAGGQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRAPDTP

Query:  LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL
        LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL
Subjt:  LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL

Query:  LSLGDPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFEHHKMSTKMDSKAKSSD
        LSLG PALVCLLCDLQRLIQAGERDLKS KRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFE+HKMSTKMDSKAK SD
Subjt:  LSLGDPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFEHHKMSTKMDSKAKSSD

Query:  KVLIEEIK
        KVLIEEIK
Subjt:  KVLIEEIK

A0A6J1GZG3 zinc finger HIT domain-containing protein 2 isoform X11.4e-21897.32Show/hide
Query:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTICHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLDED
        MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTICHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEME LDED
Subjt:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTICHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLDED

Query:  DSTLSEETIEKVL---AGGQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRAP
        DSTLSEETIEKVL   AG QLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPR P
Subjt:  DSTLSEETIEKVL---AGGQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRAP

Query:  DTPLPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDV
        +TPLPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDV
Subjt:  DTPLPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDV

Query:  AILLSLGDPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFEHHKMSTKMDSKAK
        AILLSLG PALVCLLCDLQRLIQAGERDLKS KRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFE+HKMSTKMDSKAK
Subjt:  AILLSLGDPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFEHHKMSTKMDSKAK

Query:  SSDKVLIEEIK
         SDKVLIEEIK
Subjt:  SSDKVLIEEIK

A0A6J1JND7 zinc finger HIT domain-containing protein 2 isoform X13.0e-22499.27Show/hide
Query:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTICHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLDED
        MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTICHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLDED
Subjt:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTICHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLDED

Query:  DSTLSEETIEKVLA---GGQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRAP
        DSTLSEETIEKVLA   GGQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRAP
Subjt:  DSTLSEETIEKVLA---GGQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRAP

Query:  DTPLPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDV
        DTPLPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDV
Subjt:  DTPLPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDV

Query:  AILLSLGDPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFEHHKMSTKMDSKAK
        AILLSLGDPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFEHHKMSTKMDSKAK
Subjt:  AILLSLGDPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFEHHKMSTKMDSKAK

Query:  SSDKVLIEEIK
        SSDKVLIEEIK
Subjt:  SSDKVLIEEIK

A0A6J1JTY4 zinc finger HIT domain-containing protein 2 isoform X27.1e-226100Show/hide
Query:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTICHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLDED
        MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTICHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLDED
Subjt:  MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTICHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLDED

Query:  DSTLSEETIEKVLAGGQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRAPDTP
        DSTLSEETIEKVLAGGQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRAPDTP
Subjt:  DSTLSEETIEKVLAGGQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRAPDTP

Query:  LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL
        LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL
Subjt:  LPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAIL

Query:  LSLGDPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFEHHKMSTKMDSKAKSSD
        LSLGDPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFEHHKMSTKMDSKAKSSD
Subjt:  LSLGDPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFEHHKMSTKMDSKAKSSD

Query:  KVLIEEIK
        KVLIEEIK
Subjt:  KVLIEEIK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2TBW5 Zinc finger HIT domain-containing protein 23.3e-1827.48Show/hide
Query:  CHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLDEDDSTLSEETIEKVLAGGQLSFDD
        C     Q ++YTCPRCN  YCSL+CY++H + C E F R+ V+ ELR      S   +    L+R   + E ED +  D+ L        L+G    ++ 
Subjt:  CHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLDEDDSTLSEETIEKVLAGGQLSFDD

Query:  LSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSK------------EGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRAPDTPLPLLSKLSSA
        L+  EK  F R ++ GE  +++ PW  WW    A    L +            E +P        +   +    V  +     P A  T +P L+ LS  
Subjt:  LSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSK------------EGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRAPDTPLPLLSKLSSA

Query:  KPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQS---GQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAILLSLGDPA
        + SPL+   L +++++Y  TL LY+G  ++        +L VS  LG        E  L+A +  LE    P     G L    ++ +   ILL  G PA
Subjt:  KPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQS---GQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAILLSLGDPA

Query:  LVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHE
                  L   G+     G+ RK++   +   +L  A +K  F++ W +E
Subjt:  LVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHE

Q9QY66 Zinc finger HIT domain-containing protein 21.2e-1728.61Show/hide
Query:  SQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLDEDDSTLSEETIEKVLAGGQLSFDDLSAEEKKR
        ++YTCPRCN+ YCSL+CY++H   C E F R+ V   LR+LR   ++  +    L+R   + E ED + +++ L        L+G    ++ L+  EK  
Subjt:  SQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLDEDDSTLSEETIEKVLAGGQLSFDDLSAEEKKR

Query:  FLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQ---STISLTSGVEA--------NQSSEIPRAPDTPLPLLSKLSSAKPSPLLAVH
        F R ++ GE  +++ PW  WW         L +      +  AE +   +  +L SG +A        +  +  P A    +P L+ LS +  SPL+   
Subjt:  FLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQ---STISLTSGVEA--------NQSSEIPRAPDTPLPLLSKLSSAKPSPLLAVH

Query:  LVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGS--ALVVLSVSSVLGQS---GQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAILLSLGDPALVCLLCD
        L +++++Y  TL LY+G    DA+ S     +L VS  LG     G  E  L+A +  LE     A  H  G       + +VA +L LG+  +      
Subjt:  LVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGS--ALVVLSVSSVLGQS---GQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAILLSLGDPALVCLLCD

Query:  LQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHE
        L  L   G      G+ RK++       +L  A +K  F++ W +E
Subjt:  LQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHE

Q9UHR6 Zinc finger HIT domain-containing protein 23.1e-1626.8Show/hide
Query:  CHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLDEDDSTLSEETIEKVLAGGQLSFDD
        C     Q ++YTCPRCN+ YCSL+CY++H   C E+F R+ V+ ELR      S   +    L+R   + E ED +  ++ LS       L+G    ++ 
Subjt:  CHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLDEDDSTLSEETIEKVLAGGQLSFDD

Query:  LSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSK----EGTPLVQLHAEQQST----ISLTSGVEANQSSEI---------PRAPDTPLPLLS
        L+  EK  F R ++ GE  +++ PW  WW    A    L +     G+   +L      T    +   S  E   +  +         P  P T +P + 
Subjt:  LSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSK----EGTPLVQLHAEQQST----ISLTSGVEANQSSEI---------PRAPDTPLPLLS

Query:  KLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQS---GQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAILLS
         LS    SPL+   L +++++Y  TL LY+G   +        +L VS  LG        E  L+A +  LE    P     G L    ++ +   ILL 
Subjt:  KLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQS---GQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAILLS

Query:  LGDP----ALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHE
         G        +  L DL + +         G+ RK++   +    L  A +K  F++ W +E
Subjt:  LGDP----ALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G63830.1 HIT-type Zinc finger family protein6.8e-12055.64Show/hide
Query:  RTSVDSSSSVNLPL-----RTICHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMED----
        +T + S SS + PL     R ICHVC+KQFSQYTCPRCN RYCSL CYKSHS +CTESFMR+NV +EL+Q+R+DD TKRK L+ILKRFH EEE +D    
Subjt:  RTSVDSSSSVNLPL-----RTICHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMED----

Query:  --LDEDDSTLSEETIEKVLAGGQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIP
           D++  +L EE I+K++ G ++S DDLS EE+K F RA+ASGELSKMI+PW+ WW   SARTI+L   GT LVQ   +++ T  +         SEIP
Subjt:  --LDEDDSTLSEETIEKVLAGGQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIP

Query:  RAPDTPLPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHV-GGLQLGLSL
        R PDTPL  LSKL+S  PSPLL +HL+DI YSYCFTLR+YNG+WQSD++G+A +VL+VSSVLG +GQPET+ E LS CLEQTCS AY+++ GGL+ GL+L
Subjt:  RAPDTPLPLLSKLSSAKPSPLLAVHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHV-GGLQLGLSL

Query:  IDDVAILLSLGDPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFEHHKMSTKMD
        +DDV   LSLG  A+VCLL DLQRLI    +++KS   R      D+  KLK A+RK+F++MCWV+EQ SE W  LE  V+ EK+S++E   ++   +M 
Subjt:  IDDVAILLSLGDPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGKRRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFEHHKMSTKMD

Query:  SK--AKSSDKVLIEEIK
         K   +    V+IEEI+
Subjt:  SK--AKSSDKVLIEEIK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGAGGAGATACGAACCTCTGTTGATTCGTCTTCTTCCGTCAATCTTCCTTTGCGGACCATCTGTCATGTGTGCCACAAGCAATTTTCACAGTATACGTGTCCTCG
TTGTAATTCTCGGTACTGTTCTCTGCAATGTTACAAGTCTCATAGTAATCGTTGTACCGAGTCCTTTATGCGAGAAAATGTTGTTGAGGAGCTGCGGCAATTGCGGACGG
ATGATAGTACTAAACGTAAAACGCTTGACATTTTGAAAAGATTTCATTCGGAAGAGGAAATGGAAGACTTGGATGAGGATGATTCAACTTTATCCGAGGAAACTATTGAA
AAAGTTCTTGCAGGTGGCCAACTCAGTTTTGATGATCTGTCTGCGGAGGAGAAGAAACGTTTCTTAAGAGCTATGGCATCAGGAGAGTTGAGCAAGATGATTGAACCTTG
GGAAGCTTGGTGGACGAAACCTTCTGCTAGAACCATATCTCTGAGCAAAGAAGGAACACCACTTGTTCAACTCCATGCTGAGCAGCAATCGACAATTTCACTAACAAGTG
GAGTAGAAGCGAACCAATCAAGTGAAATTCCTCGAGCACCCGATACCCCATTACCTCTGCTTAGCAAGCTTAGTTCTGCGAAGCCATCACCTCTGTTGGCTGTTCATCTG
GTTGATATCATCTATAGTTACTGTTTCACACTTCGCTTGTATAATGGAGACTGGCAGTCAGATGCTATAGGATCAGCTCTGGTTGTTTTGAGTGTCTCCTCTGTCTTGGG
CCAAAGTGGTCAACCAGAAACAGTTCTAGAAGCCCTATCATCTTGCTTGGAACAAACCTGCTCCCCCGCTTACCGACACGTGGGGGGCTTGCAGCTTGGATTGAGTCTTA
TCGACGATGTTGCAATCCTGCTTTCTCTGGGCGATCCTGCTTTAGTGTGCTTGCTTTGCGACTTGCAGAGGCTTATTCAAGCTGGGGAAAGAGATTTGAAATCAGGAAAG
AGGAGAAAAAAATCTAGATGGTCAGACATTGGCACTAAGCTTAAACACGCTGACAGGAAGATCTTTTTCATCATGTGCTGGGTTCACGAGCAGCCAAGTGAAGCTTGGTC
AACTTTGGAGAATATTGTGAAAATGGAGAAGAGTTCAATAATGGAGTTTGAGCATCATAAAATGTCTACAAAAATGGATAGTAAGGCCAAAAGCAGCGATAAAGTTTTGA
TAGAGGAGATAAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAGAAAATGATTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAACCCCAAGGTTTATGCTACTACCGAACATTCCAGTCTTAGGGTAATCGCCATTCCTTCATCTTCTCCTCGTTTCCGTA
GCTCACCTTCTGATTACTCGCCGAATCCGTTGAAGCTTTTTTTCTTCTTCTTCTTCTGGATATGGAGGAGGAGATACGAACCTCTGTTGATTCGTCTTCTTCCGTCAATC
TTCCTTTGCGGACCATCTGTCATGTGTGCCACAAGCAATTTTCACAGTATACGTGTCCTCGTTGTAATTCTCGGTACTGTTCTCTGCAATGTTACAAGTCTCATAGTAAT
CGTTGTACCGAGTCCTTTATGCGAGAAAATGTTGTTGAGGAGCTGCGGCAATTGCGGACGGATGATAGTACTAAACGTAAAACGCTTGACATTTTGAAAAGATTTCATTC
GGAAGAGGAAATGGAAGACTTGGATGAGGATGATTCAACTTTATCCGAGGAAACTATTGAAAAAGTTCTTGCAGGTGGCCAACTCAGTTTTGATGATCTGTCTGCGGAGG
AGAAGAAACGTTTCTTAAGAGCTATGGCATCAGGAGAGTTGAGCAAGATGATTGAACCTTGGGAAGCTTGGTGGACGAAACCTTCTGCTAGAACCATATCTCTGAGCAAA
GAAGGAACACCACTTGTTCAACTCCATGCTGAGCAGCAATCGACAATTTCACTAACAAGTGGAGTAGAAGCGAACCAATCAAGTGAAATTCCTCGAGCACCCGATACCCC
ATTACCTCTGCTTAGCAAGCTTAGTTCTGCGAAGCCATCACCTCTGTTGGCTGTTCATCTGGTTGATATCATCTATAGTTACTGTTTCACACTTCGCTTGTATAATGGAG
ACTGGCAGTCAGATGCTATAGGATCAGCTCTGGTTGTTTTGAGTGTCTCCTCTGTCTTGGGCCAAAGTGGTCAACCAGAAACAGTTCTAGAAGCCCTATCATCTTGCTTG
GAACAAACCTGCTCCCCCGCTTACCGACACGTGGGGGGCTTGCAGCTTGGATTGAGTCTTATCGACGATGTTGCAATCCTGCTTTCTCTGGGCGATCCTGCTTTAGTGTG
CTTGCTTTGCGACTTGCAGAGGCTTATTCAAGCTGGGGAAAGAGATTTGAAATCAGGAAAGAGGAGAAAAAAATCTAGATGGTCAGACATTGGCACTAAGCTTAAACACG
CTGACAGGAAGATCTTTTTCATCATGTGCTGGGTTCACGAGCAGCCAAGTGAAGCTTGGTCAACTTTGGAGAATATTGTGAAAATGGAGAAGAGTTCAATAATGGAGTTT
GAGCATCATAAAATGTCTACAAAAATGGATAGTAAGGCCAAAAGCAGCGATAAAGTTTTGATAGAGGAGATAAAATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEEEIRTSVDSSSSVNLPLRTICHVCHKQFSQYTCPRCNSRYCSLQCYKSHSNRCTESFMRENVVEELRQLRTDDSTKRKTLDILKRFHSEEEMEDLDEDDSTLSEETIE
KVLAGGQLSFDDLSAEEKKRFLRAMASGELSKMIEPWEAWWTKPSARTISLSKEGTPLVQLHAEQQSTISLTSGVEANQSSEIPRAPDTPLPLLSKLSSAKPSPLLAVHL
VDIIYSYCFTLRLYNGDWQSDAIGSALVVLSVSSVLGQSGQPETVLEALSSCLEQTCSPAYRHVGGLQLGLSLIDDVAILLSLGDPALVCLLCDLQRLIQAGERDLKSGK
RRKKSRWSDIGTKLKHADRKIFFIMCWVHEQPSEAWSTLENIVKMEKSSIMEFEHHKMSTKMDSKAKSSDKVLIEEIK