CuGenDBv2

Gene ID	CmaCh04G014670
Organism	Cucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
Description	FAS1 domain-containing protein
Genome location	Cma_Chr04:7478102..7479082
RNA-Seq Expression	CmaCh04G014670
Synteny	CmaCh04G014670
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	IPR000782 - FAS1 domain IPR036378 - FAS1 domain superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6601254.1 putative fasciclin-like arabinogalactan protein 20, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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KAG7032046.1 putative fasciclin-like arabinogalactan protein 20, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

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96.63

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XP_022957384.1 putative fasciclin-like arabinogalactan protein 20 [Cucurbita moschata]

1.8e-170

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XP_022983481.1 putative fasciclin-like arabinogalactan protein 20 [Cucurbita maxima]

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XP_023514866.1 putative fasciclin-like arabinogalactan protein 20 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

3.5e-169

96.32

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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KUM5 FAS1 domain-containing protein

1.5e-125

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A0A1S3BFP5 putative fasciclin-like arabinogalactan protein 20

1.9e-125

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        KIPTML  +SLTVT+ QSDS +SLN VK+S+SP YDDG LVV+GIEKFF+L FQ      SP+ KFRC  L  +NPFGEAI+ LRSNGYSSMALFLESQI
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        +GF+NGQ SMMT+FAPSD+AL TRVD FTDYPSLYFRQILPCRI WNDLV+LE GTELSTYSEGY +++ KSSG L+INGVAVFYPNMYLNEWLV+HGLL
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Query:  DVFSAAERISAEESDSEI
        DVF  AER S  ESDSE+
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A0A6J1DAK1 putative fasciclin-like arabinogalactan protein 20

2.9e-129

80.79

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        TKIPTML GRSLTVT SS+SDSE+SLN VKI++SP YDDGSL+VFG+EKFF+L  QVPPLT SP  A+FRCGP   +NPFGEAIKTL+SNGYSSMALFLE
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        SQI GFNNGQSMMT+FAPSD+ALATRVDNFT+YPSLYFRQILPCRILWNDLVN+E+GTEL+TYSEGY + I KSSG L INGV +FYPNMY+NEWL +HG
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Query:  LL
        LL
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A0A6J1H1S8 putative fasciclin-like arabinogalactan protein 20

8.9e-171

96.32

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A0A6J1J2F0 putative fasciclin-like arabinogalactan protein 20

4.9e-177

100

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SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q9FGW0 Putative fasciclin-like arabinogalactan protein 20

4.1e-40

33.33

Show/hide

Query:  MASPLLVS-LILFSLFSISSPLPSVT-VLNAAEILSDNGFVSMALTLELIAESL-LSQTNSMTIFTPSDTAFVQSGQPSLSLLQFHFSPLYSSPESLKSL
        MAS LL +  ++F +  I     S+T V +A E+LSD+G++SM LTL+L  + L L     +T+F PSD +F + GQPSL  +++  SP     E+L++L
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Query:  VLGTKIPTMLAGRSLTVT-SSQSDSEVSLNGVKISNSPLYDDGSLVVFGIEKFF----------NLIFQVPPLT----------------PSPSAKF---
          G KIPT+ +  SLTVT SS+   + S+N V + +SP++DDG +V++G ++FF          +    +P  T                PSP+      
Subjt:  VLGTKIPTMLAGRSLTVT-SSQSDSEVSLNGVKISNSPLYDDGSLVVFGIEKFF----------NLIFQVPPLT----------------PSPSAKF---

Query:  -----RCGPLMFKNPFGEAIKTLRSNGYSSMALFLESQIIGFNNG-QSMMTIFAPSDDALATRVDNFTDYPSLYFRQILPCRILWNDLVNL-EEGTELST
             R  P+   N F  A + L S G+  +A FL  Q+    +G  + +T+FAP D+A+      F+DY +++   ++   +LW DL    +EG+ L T
Subjt:  -----RCGPLMFKNPFGEAIKTLRSNGYSSMALFLESQIIGFNNG-QSMMTIFAPSDDALATRVDNFTDYPSLYFRQILPCRILWNDLVNL-EEGTELST

Query:  YSEGYELYIAKSSGRLRINGVAVFYPNMYLNEWLVIHGLLDVFSAAER
          +GYE+ I+ S   L +NGV + YP++Y+N+W+ +HG   +    E+
Subjt:  YSEGYELYIAKSSGRLRINGVAVFYPNMYLNEWLVIHGLLDVFSAAER

Q9FL53 Fasciclin-like arabinogalactan protein 21

1.3e-09

25.57

Show/hide

Query:  FSISSPLPSVTVLNAAEILSDNGFVSMALTLELIAESLLSQTNSMTIFTPSDTAFVQSGQPS----LSLLQFHFSPLYSSPESLKSLVLGTKIPTMLAGR
        FS SSP  S   LNA+  L  + F ++A  L +  E  LS + + T+F   D +F  +          LL +H  PL  S + L     GT +PT+L  +
Subjt:  FSISSPLPSVTVLNAAEILSDNGFVSMALTLELIAESLLSQTNSMTIFTPSDTAFVQSGQPS----LSLLQFHFSPLYSSPESLKSLVLGTKIPTMLAGR

Query:  SLTV-TSSQSDSEVSLNGVKISNSPLYDDGSLVVFGIEKFFNLI------FQVPPLTPSPSAKFRCG--PLMFKNPFGEAIKTLRSNGYSSMALFLES--
        S+ + T +Q      +N V+I++  ++   SLV+ G+   F+ +          PL  S +         +     +   ++ L SNG+   A+ L S  
Subjt:  SLTV-TSSQSDSEVSLNGVKISNSPLYDDGSLVVFGIEKFFNLI------FQVPPLTPSPSAKFRCG--PLMFKNPFGEAIKTLRSNGYSSMALFLES--

Query:  -QIIGFNNGQSMMTIFAPSDDALATRVDNFTDYPSLY---FRQILPCRILWNDLVNLEEGTELSTYSEGYELYIAK-----SSGRLRINGVAVFYPNMYL
         +I+  +N    +T    +  A    V   +  P LY      IL  R+ + D  ++ +   + T     +L I +     S G   I+GV +  P+M+ 
Subjt:  -QIIGFNNGQSMMTIFAPSDDALATRVDNFTDYPSLY---FRQILPCRILWNDLVNLEEGTELSTYSEGYELYIAK-----SSGRLRINGVAVFYPNMYL

Query:  NEWLVIHGL
        +   VIHG+
Subjt:  NEWLVIHGL

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G06920.1 FASCICLIN-like arabinogalactan protein 21 precursor

9.2e-11

25.57

Show/hide

Query:  FSISSPLPSVTVLNAAEILSDNGFVSMALTLELIAESLLSQTNSMTIFTPSDTAFVQSGQPS----LSLLQFHFSPLYSSPESLKSLVLGTKIPTMLAGR
        FS SSP  S   LNA+  L  + F ++A  L +  E  LS + + T+F   D +F  +          LL +H  PL  S + L     GT +PT+L  +
Subjt:  FSISSPLPSVTVLNAAEILSDNGFVSMALTLELIAESLLSQTNSMTIFTPSDTAFVQSGQPS----LSLLQFHFSPLYSSPESLKSLVLGTKIPTMLAGR

Query:  SLTV-TSSQSDSEVSLNGVKISNSPLYDDGSLVVFGIEKFFNLI------FQVPPLTPSPSAKFRCG--PLMFKNPFGEAIKTLRSNGYSSMALFLES--
        S+ + T +Q      +N V+I++  ++   SLV+ G+   F+ +          PL  S +         +     +   ++ L SNG+   A+ L S  
Subjt:  SLTV-TSSQSDSEVSLNGVKISNSPLYDDGSLVVFGIEKFFNLI------FQVPPLTPSPSAKFRCG--PLMFKNPFGEAIKTLRSNGYSSMALFLES--

Query:  -QIIGFNNGQSMMTIFAPSDDALATRVDNFTDYPSLY---FRQILPCRILWNDLVNLEEGTELSTYSEGYELYIAK-----SSGRLRINGVAVFYPNMYL
         +I+  +N    +T    +  A    V   +  P LY      IL  R+ + D  ++ +   + T     +L I +     S G   I+GV +  P+M+ 
Subjt:  -QIIGFNNGQSMMTIFAPSDDALATRVDNFTDYPSLY---FRQILPCRILWNDLVNLEEGTELSTYSEGYELYIAK-----SSGRLRINGVAVFYPNMYL

Query:  NEWLVIHGL
        +   VIHG+
Subjt:  NEWLVIHGL

AT5G40940.1 putative fasciclin-like arabinogalactan protein 20

2.9e-41

33.33

Show/hide

Query:  MASPLLVS-LILFSLFSISSPLPSVT-VLNAAEILSDNGFVSMALTLELIAESL-LSQTNSMTIFTPSDTAFVQSGQPSLSLLQFHFSPLYSSPESLKSL
        MAS LL +  ++F +  I     S+T V +A E+LSD+G++SM LTL+L  + L L     +T+F PSD +F + GQPSL  +++  SP     E+L++L
Subjt:  MASPLLVS-LILFSLFSISSPLPSVT-VLNAAEILSDNGFVSMALTLELIAESL-LSQTNSMTIFTPSDTAFVQSGQPSLSLLQFHFSPLYSSPESLKSL

Query:  VLGTKIPTMLAGRSLTVT-SSQSDSEVSLNGVKISNSPLYDDGSLVVFGIEKFF----------NLIFQVPPLT----------------PSPSAKF---
          G KIPT+ +  SLTVT SS+   + S+N V + +SP++DDG +V++G ++FF          +    +P  T                PSP+      
Subjt:  VLGTKIPTMLAGRSLTVT-SSQSDSEVSLNGVKISNSPLYDDGSLVVFGIEKFF----------NLIFQVPPLT----------------PSPSAKF---

Query:  -----RCGPLMFKNPFGEAIKTLRSNGYSSMALFLESQIIGFNNG-QSMMTIFAPSDDALATRVDNFTDYPSLYFRQILPCRILWNDLVNL-EEGTELST
             R  P+   N F  A + L S G+  +A FL  Q+    +G  + +T+FAP D+A+      F+DY +++   ++   +LW DL    +EG+ L T
Subjt:  -----RCGPLMFKNPFGEAIKTLRSNGYSSMALFLESQIIGFNNG-QSMMTIFAPSDDALATRVDNFTDYPSLYFRQILPCRILWNDLVNL-EEGTELST

Query:  YSEGYELYIAKSSGRLRINGVAVFYPNMYLNEWLVIHGLLDVFSAAER
          +GYE+ I+ S   L +NGV + YP++Y+N+W+ +HG   +    E+
Subjt:  YSEGYELYIAKSSGRLRINGVAVFYPNMYLNEWLVIHGLLDVFSAAER

Sequences

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CDS sequence

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ATGGCTTCCCCACTCCTCGTCTCTCTCATCCTTTTTTCTCTCTTCTCTATCTCTTCCCCTTTACCCTCTGTAACTGTTCTCAACGCTGCCGAAATCTTGTCCGAC
AATGGCTTTGTCTCAATGGCTCTTACGCTTGAACTCATAGCCGAATCTTTGCTCTCACAGACAAATTCAATGACGATCTTCACACCTTCAGACACTGCTTTTGTT
CAATCGGGTCAGCCTTCTCTCTCTCTCCTTCAATTCCACTTCTCGCCGCTCTACTCATCTCCTGAAAGCCTCAAATCGCTTGTGTTGGGCACCAAGATTCCTACG
ATGTTGGCTGGTCGATCGCTTACGGTAACCTCCTCCCAATCTGATTCTGAAGTTTCATTAAACGGAGTAAAGATTAGTAACTCGCCGTTGTACGATGACGGCTCG
CTTGTTGTTTTCGGTATCGAGAAGTTTTTTAACCTGATATTCCAAGTTCCACCACTTACTCCGAGTCCGAGTGCGAAATTTCGGTGTGGTCCATTGATGTTTAAG
AATCCGTTTGGTGAAGCGATAAAAACTCTACGGTCTAATGGATATTCTTCGATGGCGTTATTTCTTGAATCTCAGATTATAGGGTTTAATAATGGTCAATCCATG
ATGACCATCTTTGCTCCTTCCGATGATGCATTGGCTACTCGTGTTGATAACTTTACTGATTATCCGTCTCTATATTTTCGTCAGATTTTACCGTGCAGGATCTTG
TGGAATGATTTAGTGAATCTCGAGGAAGGCACAGAGTTATCTACATATTCGGAGGGATACGAACTTTATATCGCAAAATCAAGCGGCAGGTTGAGAATCAATGGA
GTTGCAGTCTTCTACCCTAACATGTATTTGAACGAGTGGCTAGTGATCCATGGCCTTCTTGATGTTTTTTCTGCGGCAGAGAGAATCTCAGCAGAGGAATCAGAT
TCAGAAATCCATGGGATGGCAATGTATCACTGGTAA

mRNA sequence

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MASPLLVSLILFSLFSISSPLPSVTVLNAAEILSDNGFVSMALTLELIAESLLSQTNSMTIFTPSDTAFVQSGQPSLSLLQFHFSPLYSSPESLKSLVLGTKIPT
MLAGRSLTVTSSQSDSEVSLNGVKISNSPLYDDGSLVVFGIEKFFNLIFQVPPLTPSPSAKFRCGPLMFKNPFGEAIKTLRSNGYSSMALFLESQIIGFNNGQSM
MTIFAPSDDALATRVDNFTDYPSLYFRQILPCRILWNDLVNLEEGTELSTYSEGYELYIAKSSGRLRINGVAVFYPNMYLNEWLVIHGLLDVFSAAERISAEESD
SEIHGMAMYHW

CmaCh04G014670 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome