; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh04G016470 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh04G016470
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
Descriptionhistone-lysine N-methyltransferase SETD1A
Genome locationCma_Chr04:8315425..8315976
RNA-Seq ExpressionCmaCh04G016470
SyntenyCmaCh04G016470
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6601423.1 hypothetical protein SDJN03_06656, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.4e-8091.8Show/hide
Query:  MASKRQRDEAQMEEMSEGEEIKRQKSYNQILSLLEEEEEEAVEDLSSIISSLQQEISSSSSSSSSFFSSSSSPCSTKWHPISKQNNTQKAEMEEEAATAE
        MASKRQRDEAQMEEMSEGEE+KRQKSY+QILSLLEEEEEEAVEDLSSIISSLQQEIS          SSSSSPCSTKWHPISKQNNTQKAEMEE AA+AE
Subjt:  MASKRQRDEAQMEEMSEGEEIKRQKSYNQILSLLEEEEEEAVEDLSSIISSLQQEISSSSSSSSSFFSSSSSPCSTKWHPISKQNNTQKAEMEEEAATAE

Query:  CGSVEDYASCCCCSSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDELGIPNSEFVVGEGVDGVALCDALWELEDEAANYYTLFHSQLFM
        CGSV+DYASCCCCSSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDELGIPNSEFVVGEGVDGVALCDALWELEDEAANYYTLFHSQLFM
Subjt:  CGSVEDYASCCCCSSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDELGIPNSEFVVGEGVDGVALCDALWELEDEAANYYTLFHSQLFM

KAG7032206.1 hypothetical protein SDJN02_06249, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.3e-8092.9Show/hide
Query:  MASKRQRDEAQMEEMSEGEEIKRQKSYNQILSLLEEEEEEAVEDLSSIISSLQQEISSSSSSSSSFFSSSSSPCSTKWHPISKQNNTQKAEMEEEAATAE
        MASKRQRDEAQMEEMSEGEE+KRQKSY+QILSLLEEEEEEAVEDLSSIISSLQQEISSSS       SSSSSPCSTKWHPISKQ NTQKAEMEE AA+AE
Subjt:  MASKRQRDEAQMEEMSEGEEIKRQKSYNQILSLLEEEEEEAVEDLSSIISSLQQEISSSSSSSSSFFSSSSSPCSTKWHPISKQNNTQKAEMEEEAATAE

Query:  CGSVEDYASCCCCSSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDELGIPNSEFVVGEGVDGVALCDALWELEDEAANYYTLFHSQLFM
        CGSVEDYASCCCCSSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDELGIPNSEF+VGEGVDGVALCDALWELEDEAANYYTLFHSQLFM
Subjt:  CGSVEDYASCCCCSSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDELGIPNSEFVVGEGVDGVALCDALWELEDEAANYYTLFHSQLFM

XP_022957279.1 uncharacterized protein LOC111458717 [Cucurbita moschata]4.9e-8092.9Show/hide
Query:  MASKRQRDEAQMEEMSEGEEIKRQKSYNQILSLLEEEEEEAVEDLSSIISSLQQEISSSSSSSSSFFSSSSSPCSTKWHPISKQNNTQKAEMEEEAATAE
        MASKRQRDEAQMEEMSEGEE+KRQKSY+QILSLLEEEEEEAVEDLSSIISSLQQEISSSSSS     SSSSSPCSTKWHPISKQNNTQKAEMEE AA+AE
Subjt:  MASKRQRDEAQMEEMSEGEEIKRQKSYNQILSLLEEEEEEAVEDLSSIISSLQQEISSSSSSSSSFFSSSSSPCSTKWHPISKQNNTQKAEMEEEAATAE

Query:  CGSVEDYASCCCCSSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDELGIPNSEFVVGEGVDGVALCDALWELEDEAANYYTLFHSQLFM
        CGSV+DYASCCC SSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDELGIPNSEFVVGEG+DGVALCDALWELEDEAANYYTLFHSQLF+
Subjt:  CGSVEDYASCCCCSSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDELGIPNSEFVVGEGVDGVALCDALWELEDEAANYYTLFHSQLFM

XP_022987613.1 uncharacterized protein LOC111485117 [Cucurbita maxima]1.7e-88100Show/hide
Query:  MASKRQRDEAQMEEMSEGEEIKRQKSYNQILSLLEEEEEEAVEDLSSIISSLQQEISSSSSSSSSFFSSSSSPCSTKWHPISKQNNTQKAEMEEEAATAE
        MASKRQRDEAQMEEMSEGEEIKRQKSYNQILSLLEEEEEEAVEDLSSIISSLQQEISSSSSSSSSFFSSSSSPCSTKWHPISKQNNTQKAEMEEEAATAE
Subjt:  MASKRQRDEAQMEEMSEGEEIKRQKSYNQILSLLEEEEEEAVEDLSSIISSLQQEISSSSSSSSSFFSSSSSPCSTKWHPISKQNNTQKAEMEEEAATAE

Query:  CGSVEDYASCCCCSSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDELGIPNSEFVVGEGVDGVALCDALWELEDEAANYYTLFHSQLFM
        CGSVEDYASCCCCSSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDELGIPNSEFVVGEGVDGVALCDALWELEDEAANYYTLFHSQLFM
Subjt:  CGSVEDYASCCCCSSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDELGIPNSEFVVGEGVDGVALCDALWELEDEAANYYTLFHSQLFM

XP_023551025.1 uncharacterized protein LOC111808979 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.4e-7992.35Show/hide
Query:  MASKRQRDEAQMEEMSEGEEIKRQKSYNQILSLLEEEEEEAVEDLSSIISSLQQEISSSSSSSSSFFSSSSSPCSTKWHPISKQNNTQKAEMEEEAATAE
        MASKRQRDEAQMEEMSEGEE+KRQKSY+QILSLLEEEEEEAVEDLSSIISSLQ+EISSSSSSS    SSSSSPCSTKWHPISKQNNTQ+AEMEE AA+AE
Subjt:  MASKRQRDEAQMEEMSEGEEIKRQKSYNQILSLLEEEEEEAVEDLSSIISSLQQEISSSSSSSSSFFSSSSSPCSTKWHPISKQNNTQKAEMEEEAATAE

Query:  CGSVEDYASCCCCSSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDELGIPNSEFVVGEGVDGVALCDALWELEDEAANYYTLFHSQLFM
        CGSVEDY SCCC SSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDELGIPNSEF+V EGVDGVALCDALWELEDEAANYYTLFHSQLFM
Subjt:  CGSVEDYASCCCCSSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDELGIPNSEFVVGEGVDGVALCDALWELEDEAANYYTLFHSQLFM

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BFM2 histone-lysine N-methyltransferase SETD1A6.2e-3656.68Show/hide
Query:  MASKRQRDEAQMEEMSEGEEIKRQKSYNQILSLL---EEEEEEAVEDLSSIISSLQQEISSSSSSSSSFFSSSSSPCSTKWHPISKQNNTQKAEMEEEAA
        MASKRQR +A+ E++ EGEE+KRQKSYNQILSLL   EE+EEE ++DLSSII++LQQEISS     +    +  +      H +S        +    ++
Subjt:  MASKRQRDEAQMEEMSEGEEIKRQKSYNQILSLL---EEEEEEAVEDLSSIISSLQQEISSSSSSSSSFFSSSSSPCSTKWHPISKQNNTQKAEMEEEAA

Query:  TAECGSVEDYASCCCCSSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDELGIPNSEFVVGE-GVDGVALCDALWELEDEAANYYTLFHSQLFM
        ++   S    A+   C  +    EE GERE+VMRHLLEASDDELGIPN EF VG+ GVDGVALCDALWELEDEAANYYTLF SQLFM
Subjt:  TAECGSVEDYASCCCCSSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDELGIPNSEFVVGE-GVDGVALCDALWELEDEAANYYTLFHSQLFM

A0A5D3D3N5 Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A6.2e-3656.68Show/hide
Query:  MASKRQRDEAQMEEMSEGEEIKRQKSYNQILSLL---EEEEEEAVEDLSSIISSLQQEISSSSSSSSSFFSSSSSPCSTKWHPISKQNNTQKAEMEEEAA
        MASKRQR +A+ E++ EGEE+KRQKSYNQILSLL   EE+EEE ++DLSSII++LQQEISS     +    +  +      H +S        +    ++
Subjt:  MASKRQRDEAQMEEMSEGEEIKRQKSYNQILSLL---EEEEEEAVEDLSSIISSLQQEISSSSSSSSSFFSSSSSPCSTKWHPISKQNNTQKAEMEEEAA

Query:  TAECGSVEDYASCCCCSSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDELGIPNSEFVVGE-GVDGVALCDALWELEDEAANYYTLFHSQLFM
        ++   S    A+   C  +    EE GERE+VMRHLLEASDDELGIPN EF VG+ GVDGVALCDALWELEDEAANYYTLF SQLFM
Subjt:  TAECGSVEDYASCCCCSSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDELGIPNSEFVVGE-GVDGVALCDALWELEDEAANYYTLFHSQLFM

A0A6J1DB83 histone-lysine N-methyltransferase SETD1A3.4e-3457.14Show/hide
Query:  MASKRQRDEAQM-EEMSEGEEIKRQKSYNQILSLLEEEEEEAVEDLSSIISSLQQEISSSSSSSSSFFSSSSSPCSTKWHPISKQNNTQKAEMEEEAATA
        +ASKRQR++AQ+ E+MSEGE++KRQKSYNQI+SLLEEEEEEA+EDLSSII++LQQEI  S                        QN+ Q A         
Subjt:  MASKRQRDEAQM-EEMSEGEEIKRQKSYNQILSLLEEEEEEAVEDLSSIISSLQQEISSSSSSSSSFFSSSSSPCSTKWHPISKQNNTQKAEMEEEAATA

Query:  ECGSVEDYASCCCCSSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDE----LGIPNSEFVVGEGVDGV-ALCDALWELEDEAANYYTLFHSQLFM
           S    +SC   +S S  E+E  ERERVMRHLLEASDDE    LGIPN EF+V E   GV +LCDALWELEDEAANYYTLF SQLFM
Subjt:  ECGSVEDYASCCCCSSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDE----LGIPNSEFVVGEGVDGV-ALCDALWELEDEAANYYTLFHSQLFM

A0A6J1H1H5 uncharacterized protein LOC1114587172.4e-8092.9Show/hide
Query:  MASKRQRDEAQMEEMSEGEEIKRQKSYNQILSLLEEEEEEAVEDLSSIISSLQQEISSSSSSSSSFFSSSSSPCSTKWHPISKQNNTQKAEMEEEAATAE
        MASKRQRDEAQMEEMSEGEE+KRQKSY+QILSLLEEEEEEAVEDLSSIISSLQQEISSSSSS     SSSSSPCSTKWHPISKQNNTQKAEMEE AA+AE
Subjt:  MASKRQRDEAQMEEMSEGEEIKRQKSYNQILSLLEEEEEEAVEDLSSIISSLQQEISSSSSSSSSFFSSSSSPCSTKWHPISKQNNTQKAEMEEEAATAE

Query:  CGSVEDYASCCCCSSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDELGIPNSEFVVGEGVDGVALCDALWELEDEAANYYTLFHSQLFM
        CGSV+DYASCCC SSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDELGIPNSEFVVGEG+DGVALCDALWELEDEAANYYTLFHSQLF+
Subjt:  CGSVEDYASCCCCSSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDELGIPNSEFVVGEGVDGVALCDALWELEDEAANYYTLFHSQLFM

A0A6J1JJY7 uncharacterized protein LOC1114851178.2e-89100Show/hide
Query:  MASKRQRDEAQMEEMSEGEEIKRQKSYNQILSLLEEEEEEAVEDLSSIISSLQQEISSSSSSSSSFFSSSSSPCSTKWHPISKQNNTQKAEMEEEAATAE
        MASKRQRDEAQMEEMSEGEEIKRQKSYNQILSLLEEEEEEAVEDLSSIISSLQQEISSSSSSSSSFFSSSSSPCSTKWHPISKQNNTQKAEMEEEAATAE
Subjt:  MASKRQRDEAQMEEMSEGEEIKRQKSYNQILSLLEEEEEEAVEDLSSIISSLQQEISSSSSSSSSFFSSSSSPCSTKWHPISKQNNTQKAEMEEEAATAE

Query:  CGSVEDYASCCCCSSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDELGIPNSEFVVGEGVDGVALCDALWELEDEAANYYTLFHSQLFM
        CGSVEDYASCCCCSSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDELGIPNSEFVVGEGVDGVALCDALWELEDEAANYYTLFHSQLFM
Subjt:  CGSVEDYASCCCCSSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDELGIPNSEFVVGEGVDGVALCDALWELEDEAANYYTLFHSQLFM

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G26920.1 unknown protein5.7e-1840.39Show/hide
Query:  KRQRDEAQMEEMSEGEEIKRQK--------SYNQILSLLEEEEEEAV--EDLSSIISSLQQEISSSSSSSSSFFSSSSSPCSTKWHPISKQNNTQKAEME
        KR R++   E + E E  KRQK        SYNQIL LL + +E+     DL+S I++LQQEISS                                  +
Subjt:  KRQRDEAQMEEMSEGEEIKRQK--------SYNQILSLLEEEEEEAV--EDLSSIISSLQQEISSSSSSSSSFFSSSSSPCSTKWHPISKQNNTQKAEME

Query:  EEAATAECGSVEDYASCCCCSSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDELGIPNSEF------------VVGEG-VDGVALCDALWELEDEAANYYTLFHSQ
        + A  +E  +VED  S   C SS   E E   +E+VM+HLLEASDDELGIPN++F            V G+  +DG    DA WELEDEAANYYTL  S+
Subjt:  EEAATAECGSVEDYASCCCCSSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDELGIPNSEF------------VVGEG-VDGVALCDALWELEDEAANYYTLFHSQ

Query:  LFM
        LFM
Subjt:  LFM

AT1G69760.1 unknown protein2.1e-2040.89Show/hide
Query:  KRQRDEAQMEEMSEGEEIKRQK------SYNQILSLLEEEEEEAVEDLSSIISSLQQEISSSSSSSSSFFS--SSSSPCSTKWHPISKQNNTQKAEMEEE
        KRQRDE + E +   EE KRQK      SYNQ+L+LL++E E    D++S+I++LQQEIS+   +++ F    S SS CS                    
Subjt:  KRQRDEAQMEEMSEGEEIKRQK------SYNQILSLLEEEEEEAVEDLSSIISSLQQEISSSSSSSSSFFS--SSSSPCSTKWHPISKQNNTQKAEMEEE

Query:  AATAECGSVEDYASCCCCSSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDELGIPNSEF-----------VVGEGVDGVALCD----ALWELEDEAANYYTLFHSQ
        ++++ C S ED              E  G++E+VM+HLLEA+DDELGIPN+EF              + V+G +L D     LWELEDEAANYYTL  S+
Subjt:  AATAECGSVEDYASCCCCSSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDELGIPNSEF-----------VVGEGVDGVALCD----ALWELEDEAANYYTLFHSQ

Query:  LFM
        LFM
Subjt:  LFM


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCATCCAAACGACAAAGGGATGAGGCCCAAATGGAGGAGATGAGCGAGGGGGAAGAGATAAAACGGCAAAAATCATACAACCAAATCCTATCCCTTTTGGAGGAAGA
GGAAGAGGAAGCTGTTGAGGATTTGTCATCGATCATCAGCTCACTCCAGCAAGAAATATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTTTTTTCTTCTTCTTCTTCTCCAT
GTTCCACAAAATGGCATCCAATTTCAAAACAGAACAACACCCAGAAGGCGGAGATGGAGGAGGAGGCGGCAACCGCAGAGTGTGGATCAGTAGAAGATTATGCTTCTTGT
TGTTGTTGTTCTTCTTCGTCTGTGAACGAGGAAGAGGGTGGTGAAAGAGAGAGAGTGATGAGACACCTTCTGGAAGCTTCGGATGATGAGCTTGGGATCCCAAACAGTGA
GTTCGTGGTGGGTGAAGGAGTGGATGGAGTGGCGTTGTGTGATGCGTTGTGGGAGTTGGAAGATGAGGCTGCCAATTACTACACCTTGTTTCACTCCCAGCTTTTTATGT
AG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCATCCAAACGACAAAGGGATGAGGCCCAAATGGAGGAGATGAGCGAGGGGGAAGAGATAAAACGGCAAAAATCATACAACCAAATCCTATCCCTTTTGGAGGAAGA
GGAAGAGGAAGCTGTTGAGGATTTGTCATCGATCATCAGCTCACTCCAGCAAGAAATATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTTTTTTCTTCTTCTTCTTCTCCAT
GTTCCACAAAATGGCATCCAATTTCAAAACAGAACAACACCCAGAAGGCGGAGATGGAGGAGGAGGCGGCAACCGCAGAGTGTGGATCAGTAGAAGATTATGCTTCTTGT
TGTTGTTGTTCTTCTTCGTCTGTGAACGAGGAAGAGGGTGGTGAAAGAGAGAGAGTGATGAGACACCTTCTGGAAGCTTCGGATGATGAGCTTGGGATCCCAAACAGTGA
GTTCGTGGTGGGTGAAGGAGTGGATGGAGTGGCGTTGTGTGATGCGTTGTGGGAGTTGGAAGATGAGGCTGCCAATTACTACACCTTGTTTCACTCCCAGCTTTTTATGT
AG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASKRQRDEAQMEEMSEGEEIKRQKSYNQILSLLEEEEEEAVEDLSSIISSLQQEISSSSSSSSSFFSSSSSPCSTKWHPISKQNNTQKAEMEEEAATAECGSVEDYASC
CCCSSSSVNEEEGGERERVMRHLLEASDDELGIPNSEFVVGEGVDGVALCDALWELEDEAANYYTLFHSQLFM