; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh04G017030 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh04G017030
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionlisH domain-containing protein C1711.05 isoform X4
Genome locationCma_Chr04:8556720..8558448
RNA-Seq ExpressionCmaCh04G017030
SyntenyCmaCh04G017030
Gene Ontology termsGO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6601476.1 hypothetical protein SDJN03_06709, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.2e-15093.79Show/hide
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KAG7032255.1 hypothetical protein SDJN02_06299, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.3e-14690.94Show/hide
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XP_022956763.1 uncharacterized protein LOC111458373 [Cucurbita moschata]2.3e-14690.94Show/hide
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XP_022978412.1 uncharacterized protein LOC111478406 [Cucurbita maxima]5.8e-166100Show/hide
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XP_023530940.1 uncharacterized protein LOC111793332 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.8e-15288.29Show/hide
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        G                        KSDELLVFNS PAVITSRETEMKSVEYEEEPKVADTTEYNIED+EGLVAEDLSGRNVLPPALSS+SSSRSRHSER
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        SQCSSNSFAFPILADE AQD SVLADDKIEGAP
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4DW25 uncharacterized protein LOC103489558 isoform X21.7e-10265.94Show/hide
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        PILADEEAQ  S+  D K +G P
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A0A1S4DW26 uncharacterized protein LOC103489558 isoform X12.4e-9666.56Show/hide
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        PI
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A0A5A7STD6 Uncharacterized protein2.4e-9666.56Show/hide
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Query:  PI
        PI
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A0A6J1GYP0 uncharacterized protein LOC1114583731.1e-14690.94Show/hide
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A0A6J1IL15 uncharacterized protein LOC1114784062.8e-166100Show/hide
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        ADDKIEGAP
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G74220.1 unknown protein2.9e-0631.47Show/hide
Query:  SEKSSGSQGPTSASQVSDITHESGGNVMSPTQSPPLQTMDR--------VGGYEPYDPLRIPSAVFQRSRSTTPLEWSIASNESLFSIHGGDDSFSGDNL
        S  SS S     A    D  H    N  +  QSPP Q M+R                P RIPS VF R+ ST P EWS  SNESLFSIH G++SF+G   
Subjt:  SEKSSGSQGPTSASQVSDITHESGGNVMSPTQSPPLQTMDR--------VGGYEPYDPLRIPSAVFQRSRSTTPLEWSIASNESLFSIHGGDDSFSGDNL

Query:  SMLSDLGKSDELLVFNSAPAVITS--------------------RETEMKSVEYEEEPKVADTTEYNIEDREGLVAEDLSGRNVLPPALSSSSSSRSRHS
            D  KS E L F   P+ ITS                       E+K+   +   K A+T +     +E       S R V+    ++++++++   
Subjt:  SMLSDLGKSDELLVFNSAPAVITS--------------------RETEMKSVEYEEEPKVADTTEYNIEDREGLVAEDLSGRNVLPPALSSSSSSRSRHS

Query:  ERS------QCSSNSFAFPIL--ADEEAQDGS
        +RS        S  SFAFP++  AD+    GS
Subjt:  ERS------QCSSNSFAFPIL--ADEEAQDGS

AT2G03630.1 unknown protein4.8e-1734.58Show/hide
Query:  DENVNRPEGGTICLGNPDHDVYQLQFKDDESDVSSLCSAKSEKSSGSQGPTSASQVS---DITHESGGNVMSPTQ--SPPLQTMDRVGGYEPYDPLRIPS
        D++VN+   G++   N D +   +  ++ E+ + +  S     SS S   +S+S +S   D+  E     ++  +  SPP+Q MDR    + YDP RIPS
Subjt:  DENVNRPEGGTICLGNPDHDVYQLQFKDDESDVSSLCSAKSEKSSGSQGPTSASQVS---DITHESGGNVMSPTQ--SPPLQTMDRVGGYEPYDPLRIPS

Query:  AVFQRSRSTTPLEWSIASNESLFSIHGGDDSFS--GDNLSMLSDLGKSDELLVFNSA---PAVITSRE----TEMKSVEYEEEPKVADTTEYNIEDREGL
        +VF+RS+S  P EWS  SNESLFSIH G++SF+  G +L    +L KS ELL ++     P V  S       E K VE ++E KV    E +    +  
Subjt:  AVFQRSRSTTPLEWSIASNESLFSIHGGDDSFS--GDNLSMLSDLGKSDELLVFNSA---PAVITSRE----TEMKSVEYEEEPKVADTTEYNIEDREGL

Query:  VAEDLSGRNVLPPALSSSSSSRSRHSERSQCSSNSFAFPI
          +  S      PA+S  + + S  S RS  S++SF+FP+
Subjt:  VAEDLSGRNVLPPALSSSSSSRSRHSERSQCSSNSFAFPI

AT2G03630.2 unknown protein1.0e-1436.81Show/hide
Query:  DENVNRPEGGTICLGNPDHDVYQLQFKDDESDVSSLCSAKSEKSSGSQGPTSASQVS---DITHESGGNVMSPTQ--SPPLQTMDRVGGYEPYDPLRIPS
        D++VN+   G++   N D +   +  ++ E+ + +  S     SS S   +S+S +S   D+  E     ++  +  SPP+Q MDR    + YDP RIPS
Subjt:  DENVNRPEGGTICLGNPDHDVYQLQFKDDESDVSSLCSAKSEKSSGSQGPTSASQVS---DITHESGGNVMSPTQ--SPPLQTMDRVGGYEPYDPLRIPS

Query:  AVFQRSRSTTPLEWSIASNESLFSIHGGDDSFS--GDNLSMLSDLGKSDELLVFNSAPAVITSRETEMKSVEYEEEPKVADT
        +VF+RS+S  P EWS  SNESLFSIH G++SF+  G +L    +L KS ELL ++    +     +E K V   EEPKV ++
Subjt:  AVFQRSRSTTPLEWSIASNESLFSIHGGDDSFS--GDNLSMLSDLGKSDELLVFNSAPAVITSRETEMKSVEYEEEPKVADT

AT3G02125.1 unknown protein1.2e-0732.97Show/hide
Query:  YDPLRIPSAVFQRSRSTTPLEWSIASNESLFSIHGGDDSFSGDNLSMLSDLGKSDE----LLVFNSA---PAVITSRETEMKSVEYEEEPKVADTTEYNI
        YDP RIPS+VF  S+     EWS+ASNESLFSIH  D +FS      L+++ + +E    +   NS    P V    E E +++  E+EP   + +  +I
Subjt:  YDPLRIPSAVFQRSRSTTPLEWSIASNESLFSIHGGDDSFSGDNLSMLSDLGKSDE----LLVFNSA---PAVITSRETEMKSVEYEEEPKVADTTEYNI

Query:  EDREG--------------------LVAEDLSGRNVLPP----------ALSSSSSSRSRHSERSQCSSNSFAFPILADEEA
        ED E                     + AE L  + V+            ++ S S S S  S+ S  S  SFAFP+L  E+A
Subjt:  EDREG--------------------LVAEDLSGRNVLPP----------ALSSSSSSRSRHSERSQCSSNSFAFPILADEEA

AT5G39200.1 unknown protein9.1e-0836.54Show/hide
Query:  YDPLRIPSAVFQRSRSTTPLEWSIASNESLFSIHGGDDSFSGDNLSMLSDLGKSDELLVFNSAPAVITSRETEMKSVEYEEEPKVADTTEYNIE------
        Y+P RIP +VF  S  T   EWSI SNESLFSIH GD SF        S + KS EL  F    +   S      +++ +  P  A T E NI       
Subjt:  YDPLRIPSAVFQRSRSTTPLEWSIASNESLFSIHGGDDSFSGDNLSMLSDLGKSDELLVFNSAPAVITSRETEMKSVEYEEEPKVADTTEYNIE------

Query:  ---DREGLV-AEDLSGRNVLPPALSSSSSSRSRHSERSQCSSNSFAFPILADEEAQ
           +R+GL        R  +P      S ++S HSE S  S+ SFAFP L + + +
Subjt:  ---DREGLV-AEDLSGRNVLPPALSSSSSSRSRHSERSQCSSNSFAFPILADEEAQ


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAGCGACGGGTAGATGTGAAACAAGCTCACATTCAACAAAACAGCCAGATATTATAGGTTTAGGCAGTACACATTCTGAAGATACTGCTGGGGAAGGATTTTCACT
TTCCCCAACAGGGCAGCTGGCGTATGGGTCTTCATCATGTATAAACTTGATGGAATTGTCAGATCTCGTTCAAGTGGACGAAAATGTTAACCGACCCGAAGGAGGCACAA
TTTGCTTGGGAAATCCTGATCACGATGTTTACCAGCTTCAATTTAAAGATGATGAGAGCGATGTTTCCAGCCTTTGTTCTGCCAAATCAGAGAAGAGTAGCGGTTCTCAA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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