; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh04G021640 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh04G021640
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionDefensin-like protein 1
Genome locationCma_Chr04:15168965..15171333
RNA-Seq ExpressionCmaCh04G021640
SyntenyCmaCh04G021640
Gene Ontology termsGO:0031640 - killing of cells of other organism (biological process)
GO:0050832 - defense response to fungus (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR003614 - Knottin, scorpion toxin-like
IPR008176 - Defensin, plant
IPR036574 - Knottin, scorpion toxin-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6601912.1 hypothetical protein SDJN03_07145, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.6e-3598.67Show/hide
Query:  MKFFSAAILLLLLLL-GTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV
        MKFFSAAILLLLLLL GTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV
Subjt:  MKFFSAAILLLLLLL-GTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV

XP_022922106.1 defensin J1-2-like [Cucurbita moschata]7.4e-3597.33Show/hide
Query:  MKFFSAAILLLLLLL-GTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV
        MKFFSAAILLLLLLL G+GMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV
Subjt:  MKFFSAAILLLLLLL-GTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV

XP_022953671.1 defensin J1-2-like [Cucurbita moschata]2.2e-3496Show/hide
Query:  MKFFSAAILLLLLLL-GTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV
        MKFFSAAILLLLLLL GTGMAPMGTEARTCESPS HF+GLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV
Subjt:  MKFFSAAILLLLLLL-GTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV

XP_022990903.1 defensin J1-2-like [Cucurbita maxima]1.0e-36100Show/hide
Query:  MKFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV
        MKFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV
Subjt:  MKFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV

XP_023517597.1 defensin J1-2-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.4e-3595.95Show/hide
Query:  MKFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV
        MKFFSAAILLLLLLLGTGMAPM TEARTCESPS HF+GLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV
Subjt:  MKFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1E380 defensin J1-2-like3.6e-3597.33Show/hide
Query:  MKFFSAAILLLLLLL-GTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV
        MKFFSAAILLLLLLL G+GMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV
Subjt:  MKFFSAAILLLLLLL-GTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV

A0A6J1GNQ3 defensin J1-2-like1.0e-3496Show/hide
Query:  MKFFSAAILLLLLLL-GTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV
        MKFFSAAILLLLLLL GTGMAPMGTEARTCESPS HF+GLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV
Subjt:  MKFFSAAILLLLLLL-GTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV

A0A6J1JK66 defensin J1-2-like1.0e-3494.59Show/hide
Query:  MKFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV
        MKFFSAAILLLLLLL TGMAPM TEARTCESPS HF+GLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV
Subjt:  MKFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV

A0A6J1JUM8 defensin J1-2-like5.0e-37100Show/hide
Query:  MKFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV
        MKFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV
Subjt:  MKFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV

V5LEQ8 Defensin-like protein 11.8e-3494.59Show/hide
Query:  MKFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV
        MKFFSAAILLLLLLL TGM PM T+ARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV
Subjt:  MKFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A3FPF2 Defensin-like protein5.0e-1857.53Show/hide
Query:  MKFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHC
        M+ FS+ +L+LLL+  T M P   EARTCES S  FKG C S  NC  VC+TEGF  G C+G RRRCFC K C
Subjt:  MKFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHC

O65740 Defensin J1-23.4e-2265.28Show/hide
Query:  KFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHC
        K  +   L+++L+  TGM     EARTCES S  FKGLCFSK+NCG VC TEGF+GGHCRGFRRRCFCT+HC
Subjt:  KFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHC

Q39182 Defensin-like protein 26.3e-2157.53Show/hide
Query:  MKFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHC
        M+  SA +++ ++ + TGM P+  EARTCES S  FKG C S +NC +VC  EGF GG+CRGFRRRCFCT+HC
Subjt:  MKFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHC

Q41914 Defensin-like protein 44.5e-1956.16Show/hide
Query:  MKFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHC
        M+  SA + L+++ + TGM P+  EARTC S S+ FKG C S  NC +VC  EGF GG CRGFRRRCFCT++C
Subjt:  MKFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHC

Q9ZUL7 Defensin-like protein 12.2e-2160.27Show/hide
Query:  MKFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHC
        ++F SAA+LL ++ + TGM P+  EARTCES S  FKG C S +NC +VC  EGF GG CRGFRRRC+CT+HC
Subjt:  MKFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHC

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G61070.1 low-molecular-weight cysteine-rich 662.8e-1653.62Show/hide
Query:  SAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHC
        ++A+LLL ++L T M  +  EARTCE+ S  F G C S +NC +VC  EGF  G CRGFRRRC CT+ C
Subjt:  SAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHC

AT2G02100.1 low-molecular-weight cysteine-rich 694.5e-2257.53Show/hide
Query:  MKFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHC
        M+  SA +++ ++ + TGM P+  EARTCES S  FKG C S +NC +VC  EGF GG+CRGFRRRCFCT+HC
Subjt:  MKFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHC

AT2G02120.1 Scorpion toxin-like knottin superfamily protein3.2e-2056.16Show/hide
Query:  MKFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHC
        M+  SA + L+++ + TGM P+  EARTC S S+ FKG C S  NC +VC  EGF GG CRGFRRRCFCT++C
Subjt:  MKFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHC

AT2G02130.1 low-molecular-weight cysteine-rich 681.5e-2260.27Show/hide
Query:  MKFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHC
        ++F SAA+LL ++ + TGM P+  EARTCES S  FKG C S +NC +VC  EGF GG CRGFRRRC+CT+HC
Subjt:  MKFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHC

AT5G63660.1 Scorpion toxin-like knottin superfamily protein2.8e-1652.78Show/hide
Query:  KFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHC
        KFF+A  LLL+L   +    +G E RTC+S S HFK +C S +NC  VC+ EGF GG C GF RRC+CT+ C
Subjt:  KFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGTTCTTTTCAGCTGCAATTCTGCTGCTCCTGCTGCTTCTCGGCACTGGGATGGCGCCAATGGGTACAGAGGCAAGGACATGCGAGTCTCCGAGCCGCCAC
TTCAAGGGGTTGTGCTTCAGTAAGAACAACTGCGGCCATGTCTGCAAAACAGAGGGCTTCCATGGTGGGCATTGCAGAGGCTTCCGCCGCCGCTGCTTCTGCACA
AAGCACTGCGTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTGAGATTAAAACTTTAGCTTAAAGCAGATATGAACATATAAAAAGTTTCATTTTCTTAAAAGCATTAAAGTTTTGTTTTTTAGGCTGTTTTTGTAGCAATGAT
TACACCCTGTATGTGAAAAAGGGTGTAGATGGGAATATGGTGGGGACTAAGGGAATTGAAAGACAGCTCAAAAAACCCAAATCATATGGATCATGAAGGAATGGA
GATCTGAAGCTTCCACAACACTTAGTGCTCTATGACTCACTCAATCTTCACTTTCAATCTCCTTTTCTGGATCATTCTTATGCCAATTTAAGTGCCAAAGTGGTC
TCCCAATCTTTATATAAACCGCTTTCCACATTCACTCACTCAACACAAAATCCTCTGTTTCTCTCTGTGAATATGAAGTTCTTTTCAGCTGCAATTCTGCTGCTC
CTGCTGCTTCTCGGCACTGGGATGGCGCCAATGGGTACAGAGGCAAGGACATGCGAGTCTCCGAGCCGCCACTTCAAGGGGTTGTGCTTCAGTAAGAACAACTGC
GGCCATGTCTGCAAAACAGAGGGCTTCCATGGTGGGCATTGCAGAGGCTTCCGCCGCCGCTGCTTCTGCACAAAGCACTGCGTTTGAGTGGTCTTTGTTGTTTCA
AATCAGCTGTCTATCAGTTGAAGTGGACACTGATGAGAGCGTGATAATAGAATAAAAGTGGCCATCTTTTGGGTATTGTCGTGTTGTGTAAGGGCTTTGTTTCAT
TTGCTTTGGTTATGATTTGGATTAATGTAATGTTATTCATATAATGGTGTCTTTCATGGCTTCGTTTTGGCTCACTTAAGCTATTCTTTGACACTCTCAGCTTCA
TTGTACCTTTTAACCTCCCTGTCTTCCCATACATTGATATCAAGCTAGAGTAAGCAACTACACATTTGTCAAACCCCTTCTCCTCCATTTCTGCTTTCGAGTACA
GCCCGACATGGCAGTAGGCGTTGATCGCTGAGGTGTAACAGCTAAGCCTACCGTGATCCATTCCCATGGGAGCCAACGTTCTCTCTGGCACACCACCTGTTGTCT
GCTTTTAATACTCATTGTAATAACTCAAGCCCCGCTAGCAGATATTGTCACTTTTAGGCTTTTCCTTTCAAGTTTCCCTTTGTTTTTAAAACACGTCCGCTTAAG
AAATTTTTCGTTCTTCTCTTCGGCCAACGTGGAATCTCACACTCCACCCATTTGCCTCTTTGGAGCCGAACGTCCTCATTGCCACACCACTCGGTATCTGGCTCT
ACCATTTGTAATAAAATATTGTTCTCTTTGGGCTTTCACTTGTTCGACTTCCCACCCGATCAGCTTCTCGTAAACCCTAACCCCTTCTCCGGGCGTAGCCATTGA
CAATTCCACAGAAAATGCAGTCAGACACTCCAATTTTAAAGCCCTTCATCACTTCCACAATCTCAAGTGCCTTCTGTAATGACCCTTGTTGAATATACATCAATA
TGAGCTTTAGAAACATTGCAGGATCTCTCAAAAACTTCTTGGCTTTTGCCTCATTGTAAAGATCTTCAGCCAGTTGAACTTCCTAAATGCTTGCATAAGTGCATA
TCAAAGACGACTAAATGGTATAATCCTCTTCAATCCCTTTCTTCCTCATATCTCTAAAGAACTCAAGCGACTCGAACACTCGCCCTAATTTCGCTAATGATTCGC
AAAGAATCCCATCAATTTTTACCGAAAAGGGCGTAAAATTCACAATCTTACTCTCAACTACTAACCAATCTAGAACAAGTATCAATATCAGGGCAAACACCATAA
TCATCAAAATCTCAAGAAACTAACAAAATAAAATCCCATTTCTTCAATCGCACTAAGTACCTGATTAGATGCCTCAATGCCGATTTCACGTAATACTCGTAGATC
TAATCCTTCAGGGAGTTTAAAATCTTGAAGAAGAGTCCAAACCGATCTCGGTTAGGGCAATGGGGGATTGTTCAGGGATCGGGGAAAGGCTACCGGAGGAATTTA
GATGAAGAGATCGAAGATCGAGAAAAAGAGAGCGAGATTAGTGGCTGGGATGATGGGATTACCTGATAGAGCTTACTGGAGGCGGTGACCAGTCAGTAGAGCCGG
TAATGGCCATCGGAGATAAAAGTCCGAAGGCAGGGGAGGAGGATCAGAATGCTATGTATGCATACCATTTCCTTAACGACGTTGGTTAACATCTTGCCAGCCACT
GAATTTGTGCCACGTAGGAAGTTTCTGGACACATAGGCCTTGAGGGATTTTCCACGTCAGCATAATGTAATACGGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKFFSAAILLLLLLLGTGMAPMGTEARTCESPSRHFKGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV