; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh04G027700 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh04G027700
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionBacterial Ig-like domain-containing protein
Genome locationCma_Chr04:18618076..18619908
RNA-Seq ExpressionCmaCh04G027700
SyntenyCmaCh04G027700
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6602504.1 RNA-binding KH domain-containing protein RCF3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.8e-2061.34Show/hide
Query:  MPTELTDGTLGGRTTESTDGTLGGGTTKSTDGTPNDTLGGGTTESTDG--------MPDDTLGGGTTESTDGTLGGGITESTDGTLGGGTTELSDSTFGE
        MPTELTDGTLGG TTE  D TLGGGTT+     P+DTLGGGTTE TDG        +PDDT GGGTTE  D TLGGG TE  D TLGGGTTEL + T G 
Subjt:  MPTELTDGTLGGRTTESTDGTLGGGTTKSTDGTPNDTLGGGTTESTDG--------MPDDTLGGGTTESTDGTLGGGITESTDGTLGGGTTELSDSTFGE

Query:  GTIELLDGSLDNQ-RSFPK
        G  EL D +L  + +S P+
Subjt:  GTIELLDGSLDNQ-RSFPK

WP_179107606.1 bacterial Ig-like domain-containing protein [Lactococcus lactis]3.6e-0853.27Show/hide
Query:  TELTDGTLGGRTTESTDGTLGGGTTKSTDGT-------PNDTLGGG-TTESTDGMPDDTLGGGTTESTDGTLGGGITESTDGTLGGGTTELSDSTFGEGT
        T  TDGT GG TT  TDGT GG TT  TDGT       P D  GGG TT  TDG    T GG TT  TDGT GG  T  TDGT GG TT  +D T G  T
Subjt:  TELTDGTLGGRTTESTDGTLGGGTTKSTDGT-------PNDTLGGG-TTESTDGMPDDTLGGGTTESTDGTLGGGITESTDGTLGGGTTELSDSTFGEGT

Query:  IELLDGS
            DG+
Subjt:  IELLDGS

WP_196229675.1 bacterial Ig-like domain-containing protein, partial [Lactococcus lactis]3.6e-0853.27Show/hide
Query:  TELTDGTLGGRTTESTDGTLGGGTTKSTDGT-------PNDTLGGG-TTESTDGMPDDTLGGGTTESTDGTLGGGITESTDGTLGGGTTELSDSTFGEGT
        T  TDGT GG TT  TDGT GG TT  TDGT       P D  GGG TT  TDG    T GG TT  TDGT GG  T  TDGT GG TT  +D T G  T
Subjt:  TELTDGTLGGRTTESTDGTLGGGTTKSTDGT-------PNDTLGGG-TTESTDGMPDDTLGGGTTESTDGTLGGGITESTDGTLGGGTTELSDSTFGEGT

Query:  IELLDGS
            DG+
Subjt:  IELLDGS

WP_198512929.1 bacterial Ig-like domain-containing protein [Lactococcus lactis]3.6e-0853.27Show/hide
Query:  TELTDGTLGGRTTESTDGTLGGGTTKSTDGT-------PNDTLGGG-TTESTDGMPDDTLGGGTTESTDGTLGGGITESTDGTLGGGTTELSDSTFGEGT
        T  TDGT GG TT  TDGT GG TT  TDGT       P D  GGG TT  TDG    T GG TT  TDGT GG  T  TDGT GG TT  +D T G  T
Subjt:  TELTDGTLGGRTTESTDGTLGGGTTKSTDGT-------PNDTLGGG-TTESTDGMPDDTLGGGTTESTDGTLGGGITESTDGTLGGGTTELSDSTFGEGT

Query:  IELLDGS
            DG+
Subjt:  IELLDGS

WP_211751831.1 bacterial Ig-like domain-containing protein [Lactococcus lactis]3.6e-0853.27Show/hide
Query:  TELTDGTLGGRTTESTDGTLGGGTTKSTDGT-------PNDTLGGG-TTESTDGMPDDTLGGGTTESTDGTLGGGITESTDGTLGGGTTELSDSTFGEGT
        T  TDGT GG TT  TDGT GG TT  TDGT       P D  GGG TT  TDG    T GG TT  TDGT GG  T  TDGT GG TT  +D T G  T
Subjt:  TELTDGTLGGRTTESTDGTLGGGTTKSTDGT-------PNDTLGGG-TTESTDGMPDDTLGGGTTESTDGTLGGGITESTDGTLGGGTTELSDSTFGEGT

Query:  IELLDGS
            DG+
Subjt:  IELLDGS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A199YPR9 GRAM_POS_ANCHORING domain-containing protein9.8e-0458.11Show/hide
Query:  TELTDGTLGGRTTESTDGTLGGGTTKSTDGTPNDTLGGGTTESTDGMPDDTLGGGTTESTDGTLGGGITESTDG
        T  TDGT GG TT  TDGT GG TT  TDGT     GG TT  TDG    T GG TT  TDGT GG  T  TDG
Subjt:  TELTDGTLGGRTTESTDGTLGGGTTKSTDGTPNDTLGGGTTESTDGMPDDTLGGGTTESTDGTLGGGITESTDG

A0A558BZH0 Uncharacterized protein3.4e-0450.54Show/hide
Query:  TELTDGTLGGRTTESTDGTLGGGTTKSTDGTPN-DTLGGGTTESTDGMPDDTLGGGTTESTDGTLGGGITESTDGTLGGGTTELSDSTFGEGT
        T  T GT  G TT +T GT  GGTT +T GT + DT  GGTT +T G    T  GGTT +T GT  GG T +T GT  GGTT    +T G GT
Subjt:  TELTDGTLGGRTTESTDGTLGGGTTKSTDGTPN-DTLGGGTTESTDGMPDDTLGGGTTESTDGTLGGGITESTDGTLGGGTTELSDSTFGEGT

A0A7H8ZDN0 Bacterial Ig-like domain-containing protein1.7e-0853.27Show/hide
Query:  TELTDGTLGGRTTESTDGTLGGGTTKSTDGT-------PNDTLGGG-TTESTDGMPDDTLGGGTTESTDGTLGGGITESTDGTLGGGTTELSDSTFGEGT
        T  TDGT GG TT  TDGT GG TT  TDGT       P D  GGG TT  TDG    T GG TT  TDGT GG  T  TDGT GG TT  +D T G  T
Subjt:  TELTDGTLGGRTTESTDGTLGGGTTKSTDGT-------PNDTLGGG-TTESTDGMPDDTLGGGTTESTDGTLGGGITESTDGTLGGGTTELSDSTFGEGT

Query:  IELLDGS
            DG+
Subjt:  IELLDGS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCAACTGAGTTGACAGATGGAACTTTGGGAGGACGGACTACTGAGTCGACCGATGGTACTTTAGGTGGAGGAACTACGAAGTCGACAGATGGTACGCCAAATGATAC
TTTGGGTGGAGGAACTACGGAGTCGACAGATGGTATGCCAGATGATACTTTGGGTGGAGGAACTACGGAGTCGACAGATGGAACTTTGGGTGGAGGAATTACGGAGTCGA
CAGATGGTACTTTGGGTGGAGGAACAACAGAGTTGTCAGATAGTACTTTTGGTGAAGGAACAATAGAGTTGCTAGATGGAAGTCTCGACAATCAACGATCGTTTCCCAAA
AATTATCGATTTCGAACAGTCGGTGTTCGCCTCACATTGCTACCCTTCTTCTTCATTGTTCCTCAATCTACAGTTTTGCGATACTTCTGCGATGCGGTTGTATTCATTGT
CCTGCTATATCTATCTGCGTCTGATTGTGCTGTCGAGTTGAGATCTAAACTCGTTTTCTGTTCTTATTTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCCAACTGAGTTGACAGATGGAACTTTGGGAGGACGGACTACTGAGTCGACCGATGGTACTTTAGGTGGAGGAACTACGAAGTCGACAGATGGTACGCCAAATGATAC
TTTGGGTGGAGGAACTACGGAGTCGACAGATGGTATGCCAGATGATACTTTGGGTGGAGGAACTACGGAGTCGACAGATGGAACTTTGGGTGGAGGAATTACGGAGTCGA
CAGATGGTACTTTGGGTGGAGGAACAACAGAGTTGTCAGATAGTACTTTTGGTGAAGGAACAATAGAGTTGCTAGATGGAAGTCTCGACAATCAACGATCGTTTCCCAAA
AATTATCGATTTCGAACAGTCGGTGTTCGCCTCACATTGCTACCCTTCTTCTTCATTGTTCCTCAATCTACAGTTTTGCGATACTTCTGCGATGCGGTTGTATTCATTGT
CCTGCTATATCTATCTGCGTCTGATTGTGCTGTCGAGTTGAGATCTAAACTCGTTTTCTGTTCTTATTTCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPTELTDGTLGGRTTESTDGTLGGGTTKSTDGTPNDTLGGGTTESTDGMPDDTLGGGTTESTDGTLGGGITESTDGTLGGGTTELSDSTFGEGTIELLDGSLDNQRSFPK
NYRFRTVGVRLTLLPFFFIVPQSTVLRYFCDAVVFIVLLYLSASDCAVELRSKLVFCSYF