; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh04G030080 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh04G030080
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionTrinucleotide repeat-containing gene 18 protein-like protein
Genome locationCma_Chr04:19666441..19667031
RNA-Seq ExpressionCmaCh04G030080
SyntenyCmaCh04G030080
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6602714.1 hypothetical protein SDJN03_07947, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.4e-9696.95Show/hide
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KAG7033401.1 hypothetical protein SDJN02_07457, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.6e-9897.45Show/hide
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XP_022953683.1 uncharacterized protein LOC111456137 [Cucurbita moschata]4.0e-9696.95Show/hide
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XP_022991024.1 uncharacterized protein LOC111487739 [Cucurbita maxima]9.3e-101100Show/hide
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XP_023528120.1 uncharacterized protein LOC111791129 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.1e-9695.98Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B2H5 uncharacterized protein LOC1034854232.6e-7279Show/hide
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A0A5D3C8I6 Trinucleotide repeat-containing gene 18 protein-like protein2.6e-7279Show/hide
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A0A6J1DE38 uncharacterized protein LOC1110202118.5e-6878.35Show/hide
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A0A6J1GNZ5 uncharacterized protein LOC1114561371.9e-9696.95Show/hide
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A0A6J1JTM6 uncharacterized protein LOC1114877394.5e-101100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G22680.1 unknown protein9.2e-1440.1Show/hide
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          +K+    + RDPF  A VECSK   A T  E          G + K + +S S   G LN YSSC+R C VSESIVY P +  +S+D L+  + G
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AT1G71970.1 unknown protein3.5e-2141.79Show/hide
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        L
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTTCAATCTTCTCGCCGGACTCGTTCTTTCTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTCGCGGTTCTTACTATTTTCCCGATGACTCTCCGCT
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CCTCTCCTCTGACCTTTCTCCTCCCCTTGCCTCCCATTTCCACCGCTCTGCCGTCCTCCAAGCGCTTCGGATTTCACGACTGGAGGAAATCAAACCGCCAAAATTCGCAG
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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