; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh05G006880 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh05G006880
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionOSBP(Oxysterol binding protein)-related protein 4B, putative
Genome locationCma_Chr05:3589058..3589615
RNA-Seq ExpressionCmaCh05G006880
SyntenyCmaCh05G006880
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6598869.1 hypothetical protein SDJN03_08647, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.6e-8194.22Show/hide
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KAG7029810.1 hypothetical protein SDJN02_08153, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.3e-9094.65Show/hide
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XP_022929606.1 uncharacterized protein LOC111436141 [Cucurbita moschata]1.4e-9095.14Show/hide
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XP_022997465.1 uncharacterized protein LOC111492375 [Cucurbita maxima]2.0e-97100Show/hide
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XP_023546389.1 uncharacterized protein LOC111805512 [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.1e-9094.05Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7UK88 Putative OSBP(Oxysterol binding protein)-related protein 4B2.4e-6472.63Show/hide
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A0A5D3BQA0 Putative OSBP(Oxysterol binding protein)-related protein 4B6.4e-6573.16Show/hide
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A0A6J1DGF8 uncharacterized protein LOC1110208301.2e-6070.81Show/hide
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        G             KLET SF+SSD EFMASPRDS+SS SSSSSSS PSSL+ESL VR+MGRVS GRP       +I+R LACYH
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A0A6J1ENL5 uncharacterized protein LOC1114361416.8e-9195.14Show/hide
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A0A6J1K9Q8 uncharacterized protein LOC1114923759.8e-98100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G40475.1 unknown protein6.2e-0435.81Show/hide
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        + SK+I + SS +  SSR  YY GA+  VPF WET+PGTPK     +   LPPL+PPP+  S            +      KL   R +K++R       
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          T+   +    +FS+ S+            SSSSSS SSSSP S +E
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AT4G25845.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: OSBP(oxysterol binding protein)-related protein 4B (TAIR:AT4G25850.2)2.5e-1350Show/hide
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        MK       SSI  +S   YY     EGVPF+WE QPGTP +  P++++PPLSPPPA+LSLGLP P   IE+PK    PT +KLR W+ +   R
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AT4G25850.2 OSBP(oxysterol binding protein)-related protein 4B2.5e-1350Show/hide
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AT5G01790.1 unknown protein6.6e-0654.9Show/hide
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        S  C S R  YY GAA  VPF+WE+ PGTPK P  +   LPPL+PPP+  S
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATGGAAACTTTCATTGGGATATGAAGAGCAAAGTGATAGCAAGAACATCTTCAATAGGTTGTTCTTCTCGCAGCACTTATTACTGTGGAGCAGCTGAAGGAGTCCC
TTTCAAATGGGAAACACAGCCAGGAACCCCCAAAGATCCACCCCCTCAAGACTTGCTTCCACCCCTCAGCCCTCCACCAGCAGTTCTCAGCCTCGGGTTACCGCTACCGT
GCATTGAGAAACCAAAAACCCGACCCCGACCCACGATGAAGCTTAGGTTCTGGAGGAGGGTCAAGAAGAGTAGGGATGATGGGAGAGCTGCTCAAGCAACAACTATAGAC
TATAGCAATGGTAAGTTGGAAACATTTTCATTTCTCAGCTCTGACTGTGAGTTCATGGCTTCTCCTCGAGATTCAATGTCGTCGTCGTCGTCGTCGTCTTCTTCTTCATC
TCCGTCGTCTCTCATCGAGTCGTTAACTGTACGACATATGGGGAGGGTGTCACTTGGAAGACCTTCTAGTTGCGGTACTGCTGGAAAAATTCATAGAATTCTGGCTTGTT
ACCATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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ACCATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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YSNGKLETFSFLSSDCEFMASPRDSMSSSSSSSSSSSPSSLIESLTVRHMGRVSLGRPSSCGTAGKIHRILACYH