CuGenDBv2

Gene ID	CmaCh05G010940
Organism	Cucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
Description	TPR_REGION domain-containing protein
Genome location	Cma_Chr05:8629225..8633483
RNA-Seq Expression	CmaCh05G010940
Synteny	CmaCh05G010940
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0005515 - protein binding (molecular function) GO:0016740 - transferase activity (molecular function)
InterPro domains	IPR011990 - Tetratricopeptide-like helical domain superfamily IPR019734 - Tetratricopeptide repeat

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG7030139.1 hypothetical protein SDJN02_08486, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

1.1e-144

95.93

Show/hide

Query:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSTKPLENLHSPSSLPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVAAIRRGMLLFREGDVSGS
        MAAISSLKPSISMSRSFH+SFTAPSLPNS KPLENLHSPSS PMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAV AIRRGMLLFREGDVSGS
Subjt:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSTKPLENLHSPSSLPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVAAIRRGMLLFREGDVSGS

Query:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLD-----RFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRPVMREAYNMFKDGGH
        LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLD     RFEEGAEQFRLDVAQNP+DTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRPVMREAYNMFKDGGH
Subjt:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLD-----RFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRPVMREAYNMFKDGGH

Query:  PEKLVAAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
        PE LVAAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
Subjt:  PEKLVAAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS

XP_022946000.1 uncharacterized protein LOC111450218 isoform X1 [Cucurbita moschata]

9.8e-146

97.74

Show/hide

Query:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSTKPLENLHSPSSLPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVAAIRRGMLLFREGDVSGS
        MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNS KPLENLHSPSS PMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAV AIRRGMLLFREGDVSGS
Subjt:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSTKPLENLHSPSSLPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVAAIRRGMLLFREGDVSGS

Query:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRPVMREAYNMFKDGGHPEKLV
        LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNP+DTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPR VMREAYNMFKDGGHPE LV
Subjt:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRPVMREAYNMFKDGGHPEKLV

Query:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
        AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
Subjt:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS

XP_022999589.1 uncharacterized protein LOC111493913 isoform X3 [Cucurbita maxima]

3.2e-149

100

Show/hide

Query:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSTKPLENLHSPSSLPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVAAIRRGMLLFREGDVSGS
        MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSTKPLENLHSPSSLPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVAAIRRGMLLFREGDVSGS
Subjt:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSTKPLENLHSPSSLPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVAAIRRGMLLFREGDVSGS

Query:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRPVMREAYNMFKDGGHPEKLV
        LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRPVMREAYNMFKDGGHPEKLV
Subjt:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRPVMREAYNMFKDGGHPEKLV

Query:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
        AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
Subjt:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS

XP_023545315.1 uncharacterized protein LOC111804759 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

1.5e-146

97.36

Show/hide

Query:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSTKPLENLHSPSSLPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVAAIRRGMLLFREGDVSGS
        MAAIS+LKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSTKPLENLHSP+S PM+IKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAV AIRRGMLLFREGDVSGS
Subjt:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSTKPLENLHSPSSLPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVAAIRRGMLLFREGDVSGS

Query:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRPVMREAYNMFKDGGHPEKLV
        LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRF+EGAEQFRLDVAQNP+DTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRPVMREAYNMFKDGGHPEKLV
Subjt:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRPVMREAYNMFKDGGHPEKLV

Query:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
        AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
Subjt:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS

XP_038889663.1 uncharacterized protein LOC120079523 [Benincasa hispida]

7.5e-138

92.83

Show/hide

Query:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSTKPLENLHSPSSLPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVAAIRRGMLLFREGDVSGS
        MAAISSLK SIS+S S HI F APS PNSTK LE  HSPSSLPMRI LNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVAAIRRGMLLFR+GDV GS
Subjt:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSTKPLENLHSPSSLPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVAAIRRGMLLFREGDVSGS

Query:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRPVMREAYNMFKDGGHPEKLV
        LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNP+DTEESIWCF+CEAQLYGVDEARRRFLEVGRD RPVMREAYNMFKDGGHPEKL+
Subjt:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRPVMREAYNMFKDGGHPEKLV

Query:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
        AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAAL +VHCLCRNWS
Subjt:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LGH0 TPR_REGION domain-containing protein

2.2e-135

91.7

Show/hide

Query:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSTKPLENLHSPSSLPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVAAIRRGMLLFREGDVSGS
        MA  SSLK SIS+S S H SFTAPS  NSTK +E  HSPSSLPMRI LNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVAAIRRGMLLFR+GDV GS
Subjt:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSTKPLENLHSPSSLPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVAAIRRGMLLFREGDVSGS

Query:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRPVMREAYNMFKDGGHPEKLV
        LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNP+DTEESIWCF+CEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRPVMREAYNMFKDGGHPEKLV
Subjt:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRPVMREAYNMFKDGGHPEKLV

Query:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
        AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKK+DAAKQ IVAACQS Y QRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
Subjt:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS

A0A5A7TX07 TPR_REGION domain-containing protein

2.3e-132

89.81

Show/hide

Query:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSTKPLENLHSPSSLPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVAAIRRGMLLFREGDVSGS
        MA  S LK SIS+S S H SFTAPS  NS+K +EN HSP+SLP+RI LNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVAAIRRGMLLFR+GDV  S
Subjt:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSTKPLENLHSPSSLPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVAAIRRGMLLFREGDVSGS

Query:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRPVMREAYNMFKDGGHPEKLV
        LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNP+DTEESIWCF+CEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRPVMREAYNMFK+GGHPEKLV
Subjt:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRPVMREAYNMFKDGGHPEKLV

Query:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
        AAFSSGR NEYFYASLYAGLYHEAEKK+DAAKQHIVAACQS YGQRSDDYMAALAKVHCL RNWS
Subjt:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS

A0A5D3BC02 TPR_REGION domain-containing protein

4.2e-134

90.57

Show/hide

Query:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSTKPLENLHSPSSLPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVAAIRRGMLLFREGDVSGS
        MA  S LK SIS+S S H SFTAPS  NS+K +EN HSP+SLP+RI LNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVAAIRRGMLLFR+GDV GS
Subjt:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSTKPLENLHSPSSLPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVAAIRRGMLLFREGDVSGS

Query:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRPVMREAYNMFKDGGHPEKLV
        LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNP+DTEESIWCF+CEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRPVMREAYNMFK+GGHPEKLV
Subjt:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRPVMREAYNMFKDGGHPEKLV

Query:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
        AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKK+DAAKQHIVAACQS YGQRSDDYMAALAKVHCL RNWS
Subjt:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS

A0A6J1G2K4 uncharacterized protein LOC111450218 isoform X1

4.7e-146

97.74

Show/hide

Query:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSTKPLENLHSPSSLPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVAAIRRGMLLFREGDVSGS
        MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNS KPLENLHSPSS PMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAV AIRRGMLLFREGDVSGS
Subjt:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSTKPLENLHSPSSLPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVAAIRRGMLLFREGDVSGS

Query:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRPVMREAYNMFKDGGHPEKLV
        LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNP+DTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPR VMREAYNMFKDGGHPE LV
Subjt:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRPVMREAYNMFKDGGHPEKLV

Query:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
        AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
Subjt:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS

A0A6J1KHI1 uncharacterized protein LOC111493913 isoform X3

1.6e-149

100

Show/hide

Query:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSTKPLENLHSPSSLPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVAAIRRGMLLFREGDVSGS
        MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSTKPLENLHSPSSLPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVAAIRRGMLLFREGDVSGS
Subjt:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSTKPLENLHSPSSLPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVAAIRRGMLLFREGDVSGS

Query:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRPVMREAYNMFKDGGHPEKLV
        LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRPVMREAYNMFKDGGHPEKLV
Subjt:  LAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRPVMREAYNMFKDGGHPEKLV

Query:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
        AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
Subjt:  AAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q1C3L9 Lipoprotein NlpI

3.0e-04

Show/hide

Query:  GMLLFREGDVSGSLAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQL
        G+ L + G+   +   FD  +ELDP        RG++LYY  RF    +  +     +P+D   S+W ++ E ++
Subjt:  GMLLFREGDVSGSLAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQL

Q1CM50 Lipoprotein NlpI

3.0e-04

Show/hide

Query:  GMLLFREGDVSGSLAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQL
        G+ L + G+   +   FD  +ELDP        RG++LYY  RF    +  +     +P+D   S+W ++ E ++
Subjt:  GMLLFREGDVSGSLAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQL

Q7CKI5 Lipoprotein NlpI

3.0e-04

Show/hide

Query:  GMLLFREGDVSGSLAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQL
        G+ L + G+   +   FD  +ELDP        RG++LYY  RF    +  +     +P+D   S+W ++ E ++
Subjt:  GMLLFREGDVSGSLAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQL

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G05625.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein

3.9e-100

68.16

Show/hide

Query:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSTKPLENLHSPSSLPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGG--NNPRDAVAAIRRGMLLFREGDVS
        M+    + P I  SR+    FTA S   +  P  + H              PP +LSRRLF+PSVS IWDA+TGG  +NPR+A+AA+RRGM LFR+GDV+
Subjt:  MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSTKPLENLHSPSSLPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGG--NNPRDAVAAIRRGMLLFREGDVS

Query:  GSLAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRPVMREAYNMFKDGGHPEK
        GS+AEFD+AI LDPRQKAYLWQRGLSLYY+DRFEEGAEQFR+DVAQNP+DTEESIWCF+CEA+L+GVD AR +FLEVGRD RPVMREAYN+FK+GG PEK
Subjt:  GSLAEFDKAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRPVMREAYNMFKDGGHPEK

Query:  LVAAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS
        LV  FSSG+ +EYFYASLYAGLY+EAE K + AK H+ AAC SPYGQRSDDYMA+LAKVHCLCRNWS
Subjt:  LVAAFSSGRENEYFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCTGCAATTTCCAGTCTCAAGCCCTCCATATCCATGTCCCGTTCGTTTCACATATCTTTCACCGCGCCTTCTTTACCAAATTCAACTAAACCCCTCGAAAAT
CTCCACTCTCCGAGCTCGCTTCCGATGAGAATCAAGCTCAATCACGTTCCTCCATTATCATTATCTAGAAGATTGTTTGTTCCTTCCGTCTCTGGAATTTGGGAC
GCCCTAACAGGGGGAAACAACCCTCGCGACGCTGTTGCTGCTATTCGACGCGGAATGCTTCTCTTCAGAGAGGGCGATGTTTCAGGATCTTTAGCAGAATTCGAT
AAGGCAATTGAATTGGATCCTCGTCAAAAGGCATATCTTTGGCAAAGAGGGCTTTCCCTTTACTACCTTGATAGATTTGAAGAGGGAGCCGAGCAGTTCCGACTA
GATGTCGCACAAAATCCGAGCGACACAGAGGAATCTATTTGGTGCTTTGTTTGTGAAGCTCAATTGTATGGAGTTGATGAAGCAAGAAGGCGATTTCTTGAGGTA
GGTAGAGATCCACGACCAGTCATGAGGGAAGCTTATAATATGTTTAAAGATGGTGGCCATCCTGAGAAACTTGTTGCTGCCTTCTCAAGTGGCCGTGAGAATGAA
TACTTTTATGCTTCTCTATATGCTGGGCTTTATCACGAAGCAGAGAAAAAACTGGATGCTGCCAAACAGCATATAGTTGCAGCTTGCCAGTCTCCATATGGACAG
AGGTCTGATGATTACATGGCCGCTCTTGCCAAAGTTCACTGCCTCTGTCGAAACTGGAGTTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

ATCGTCTCCAAATTCTCACAAGTACTCCCCTGCTGAGCACAATCTTCTTCAGCTTCATCGCGTTCTTCATCAATGGCTGCAATTTCCAGTCTCAAGCCCTCCATA
TCCATGTCCCGTTCGTTTCACATATCTTTCACCGCGCCTTCTTTACCAAATTCAACTAAACCCCTCGAAAATCTCCACTCTCCGAGCTCGCTTCCGATGAGAATC
AAGCTCAATCACGTTCCTCCATTATCATTATCTAGAAGATTGTTTGTTCCTTCCGTCTCTGGAATTTGGGACGCCCTAACAGGGGGAAACAACCCTCGCGACGCT
GTTGCTGCTATTCGACGCGGAATGCTTCTCTTCAGAGAGGGCGATGTTTCAGGATCTTTAGCAGAATTCGATAAGGCAATTGAATTGGATCCTCGTCAAAAGGCA
TATCTTTGGCAAAGAGGGCTTTCCCTTTACTACCTTGATAGATTTGAAGAGGGAGCCGAGCAGTTCCGACTAGATGTCGCACAAAATCCGAGCGACACAGAGGAA
TCTATTTGGTGCTTTGTTTGTGAAGCTCAATTGTATGGAGTTGATGAAGCAAGAAGGCGATTTCTTGAGGTAGGTAGAGATCCACGACCAGTCATGAGGGAAGCT
TATAATATGTTTAAAGATGGTGGCCATCCTGAGAAACTTGTTGCTGCCTTCTCAAGTGGCCGTGAGAATGAATACTTTTATGCTTCTCTATATGCTGGGCTTTAT
CACGAAGCAGAGAAAAAACTGGATGCTGCCAAACAGCATATAGTTGCAGCTTGCCAGTCTCCATATGGACAGAGGTCTGATGATTACATGGCCGCTCTTGCCAAA
GTTCACTGCCTCTGTCGAAACTGGAGTTGAAGTTGGTACAACTTTCAGCTAATTGCTTCGATGCCATATTCTACAATTTCTCTGTTTTCCTTCCTATGTTCACTC
TAGCTTTTTAGATCGGAATTCAAATTTGAACGATATCATATTAGGGTGCCTAAACCAAATTGGTTCGGATCGTAATCTATCCATTTCAAGTGGGTTGAAAAAAAA
AAAGTGCCTTTTCAAATCAATTCTAAACGTATTTTTTTAATTATAAACTTTTGGTCTTTTTTTCGTTGAATCCAACCTAGGAGTGGGGAGGATTCAAGCCTTGGA
TCTCTTAGTCAAG

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAAISSLKPSISMSRSFHISFTAPSLPNSTKPLENLHSPSSLPMRIKLNHVPPLSLSRRLFVPSVSGIWDALTGGNNPRDAVAAIRRGMLLFREGDVSGSLAEFD
KAIELDPRQKAYLWQRGLSLYYLDRFEEGAEQFRLDVAQNPSDTEESIWCFVCEAQLYGVDEARRRFLEVGRDPRPVMREAYNMFKDGGHPEKLVAAFSSGRENE
YFYASLYAGLYHEAEKKLDAAKQHIVAACQSPYGQRSDDYMAALAKVHCLCRNWS

CmaCh05G010940 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome