; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh05G010960 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh05G010960
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionF-box protein PP2-B15-like
Genome locationCma_Chr05:8639034..8640300
RNA-Seq ExpressionCmaCh05G010960
SyntenyCmaCh05G010960
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001810 - F-box domain
IPR025886 - Phloem protein 2-like
IPR036047 - F-box-like domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6599205.1 F-box protein PP2-B15, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.5e-15996.25Show/hide
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XP_023545312.1 F-box protein PP2-B15-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.1e-15795.22Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1DQK9 F-box protein VBF-like1.3e-11269.46Show/hide
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A0A6J1G450 F-box protein PP2-B15-like2.3e-15794.88Show/hide
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A0A6J1G464 F-box protein PP2-B15-like3.3e-15694.88Show/hide
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A0A6J1KDI1 F-box protein PP2-B15-like1.5e-16198.98Show/hide
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A0A6J1KF36 F-box protein PP2-B15-like9.5e-164100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80494 F-box protein PP2-B154.5e-6243.06Show/hide
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Q3E6P4 F-box protein At2g022406.8e-5040.69Show/hide
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        G S   VLPEDCIS I+S T+P DA   + VS TF SA  SD VW +FLP  Y  +++ S +       SK+E +F LC +P+LI+ GKKSF LE+ SGK
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         C  LS++EL ITW S P  W W S P+SRF ++AEL    W EI G+T    LSP T Y AY+V K  ++  GL  +P +V + L              
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           Q + K    F G R  R  +          ++  +    +R+DGW E ELGEFF  E  + +  S +E K    KSGL++Q I+ RP
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Q9C7J9 F-box protein PP2-B134.0e-5844.21Show/hide
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        R+++IT+S      SW +   SRF+E AEL  +  +EI G+ +T  LSPNT YGAYL++K++   YGLDL+PA+  V+  +  Q+++ + +L   ++   
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        +M+ LFYGNR ER + +    +G D      R+ + RDDGW EIELGEF T  GEDDE + MS  E KG+QLK G+V+  I++RP
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Q9C7K0 F-box protein VBF4.0e-5844.41Show/hide
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        +M+ LFYGNR ER + +    +G D      R+ + RDDGW EIELGEF T  GEDDE + M+  E KG+QLK G+++  I++RPK
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Q9FLU7 Putative F-box protein PP2-B129.2e-4741.05Show/hide
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        LPE+CI+ ++S T+P DA ++S VS   RSAA+S+  W RFLP +Y        I   L   S ++ F R C SP+LI+ G+ SF +E+ SGK C+ LSA
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Query:  RELAITWSSDPLCWSWKSDPQSRFAEVAELRASSWVEIHGRTRTGRLSPNTLYGAYLVVKISEKG-YGLDLMPAQVCVQLGDALQSSQGSVWLRRKEQSN
        R+L I W   P  W W S P SRF EVA L    W EI G+  T  LS  T Y AYLV K  E G +G + +P +V      + +S++  V         
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Query:  LKMESLFYGNRRERAIKLLASDLGEDFDSNGIRDLRERDDGWSEIELGEFFTGEDDEHLTMSFLETKGFQLKSGLVVQAIQIRPK
               Y NRR              F  +G ++ RE  DGW EIELGE++ G DDE + MS LET+    K G++VQ I+IRPK
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09155.1 phloem protein 2-B153.2e-6343.06Show/hide
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        +LPE C++ ILS TTP D    + VSS FR A +SD VW +FLP +Y  +++ S     +   SK+E +  LC  ILID G+K F++E+ SGKI Y LS+
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        R+L+ITWS     WSW     SRF+E  +L  + W+EI G+ +TG LSPNT YGAYL++K++ + YGLDL+PA+  +++G+  +    S +L   +    
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Query:  KMESLFYGNRRERAIKLLASDLGEDFDSNGIRDLRERDDGWSEIELGEFFT----GEDDEHLTMSFLETKGFQLKSGLVVQAIQIRPK
        +ME +FYG R +R           +   +  R+   RDDGW EIELGEF T    G+DD+ + MS  E KG+QLK G+ +  I++RPK
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AT1G56240.1 phloem protein 2-B132.8e-5944.21Show/hide
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        +LPE C++ IL+ T+P DA   S VSS FR A +SD VW +FLP +Y  +++ S     +   SK+E +  LC  +LID  +K F++ +FSGKI Y LSA
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Query:  RELAITWSSDPLCWSWKSDPQSRFAEVAELRASSWVEIHGRTRTGRLSPNTLYGAYLVVKISEKGYGLDLMPAQVCVQLGDALQSSQGSVWLRRKEQSNL
        R+++IT+S      SW +   SRF+E AEL  +  +EI G+ +T  LSPNT YGAYL++K++   YGLDL+PA+  V+  +  Q+++ + +L   ++   
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Query:  KMESLFYGNRRERAIKLLASDLGEDFDSNGIRDLRERDDGWSEIELGEFFT--GEDDEHLTMSFLETKGFQLKSGLVVQAIQIRP
        +M+ LFYGNR ER + +    +G D      R+ + RDDGW EIELGEF T  GEDDE + MS  E KG+QLK G+V+  I++RP
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AT1G56250.1 phloem protein 2-B142.8e-5944.41Show/hide
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        +LPE CI+ IL+ T+P DA   S VSS FR A +SD VW +FLP +Y  +++ S       + SK+E +  LC  +LID  +K F++ +FSGKI Y LSA
Subjt:  VLPEDCISAILSLTTPTDAGKLSLVSSTFRSAAESDVVWSRFLPRNYAEIMAVSDIAGELPLCSKREAFFRLCSPILIDGGKKSFELERFSGKICYTLSA

Query:  RELAITWSSDPLCWSWKSDPQSRFAEVAELRASSWVEIHGRTRTGRLSPNTLYGAYLVVKISEKGYGLDLMPAQVCVQLGDALQSSQGSVWLRRKEQSNL
        R+++IT S     WSW +   SRF+E AEL  +  +EI G+ +T  LS NT YGAYL+VK+++  YGLDL+PA+  ++  +  Q S+ + +L   ++   
Subjt:  RELAITWSSDPLCWSWKSDPQSRFAEVAELRASSWVEIHGRTRTGRLSPNTLYGAYLVVKISEKGYGLDLMPAQVCVQLGDALQSSQGSVWLRRKEQSNL

Query:  KMESLFYGNRRERAIKLLASDLGEDFDSNGIRDLRERDDGWSEIELGEFFT--GEDDEHLTMSFLETKGFQLKSGLVVQAIQIRPK
        +M+ LFYGNR ER + +    +G D      R+ + RDDGW EIELGEF T  GEDDE + M+  E KG+QLK G+++  I++RPK
Subjt:  KMESLFYGNRRERAIKLLASDLGEDFDSNGIRDLRERDDGWSEIELGEFFT--GEDDEHLTMSFLETKGFQLKSGLVVQAIQIRPK

AT2G02240.1 F-box family protein4.8e-5140.69Show/hide
Query:  GISSIGVLPEDCISAILSLTTPTDAGKLSLVSSTFRSAAESDVVWSRFLPRNYAEIMAVSDIAGELPLCSKREAFFRLC-SPILIDGGKKSFELERFSGK
        G S   VLPEDCIS I+S T+P DA   + VS TF SA  SD VW +FLP  Y  +++ S +       SK+E +F LC +P+LI+ GKKSF LE+ SGK
Subjt:  GISSIGVLPEDCISAILSLTTPTDAGKLSLVSSTFRSAAESDVVWSRFLPRNYAEIMAVSDIAGELPLCSKREAFFRLC-SPILIDGGKKSFELERFSGK

Query:  ICYTLSARELAITWSSDPLCWSWKSDPQSRFAEVAELRASSWVEIHGRTRTGRLSPNTLYGAYLVVKISEKGYGLDLMPAQVCVQLGDALQSSQGSVWLR
         C  LS++EL ITW S P  W W S P+SRF ++AEL    W EI G+T    LSP T Y AY+V K  ++  GL  +P +V + L              
Subjt:  ICYTLSARELAITWSSDPLCWSWKSDPQSRFAEVAELRASSWVEIHGRTRTGRLSPNTLYGAYLVVKISEKGYGLDLMPAQVCVQLGDALQSSQGSVWLR

Query:  RKEQSNLKMESLFYGNRRERAIKLLASDLGEDFDSNGIRDLRERDDGWSEIELGEFFTGEDDEHLTMSFLETKGFQLKSGLVVQAIQIRP
           Q + K    F G R  R  +          ++  +    +R+DGW E ELGEFF  E  + +  S +E K    KSGL++Q I+ RP
Subjt:  RKEQSNLKMESLFYGNRRERAIKLLASDLGEDFDSNGIRDLRERDDGWSEIELGEFFTGEDDEHLTMSFLETKGFQLKSGLVVQAIQIRP

AT5G24560.1 phloem protein 2-B126.5e-4841.05Show/hide
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        LPE+CI+ ++S T+P DA ++S VS   RSAA+S+  W RFLP +Y        I   L   S ++ F R C SP+LI+ G+ SF +E+ SGK C+ LSA
Subjt:  LPEDCISAILSLTTPTDAGKLSLVSSTFRSAAESDVVWSRFLPRNYAEIMAVSDIAGELPLCSKREAFFRLC-SPILIDGGKKSFELERFSGKICYTLSA

Query:  RELAITWSSDPLCWSWKSDPQSRFAEVAELRASSWVEIHGRTRTGRLSPNTLYGAYLVVKISEKG-YGLDLMPAQVCVQLGDALQSSQGSVWLRRKEQSN
        R+L I W   P  W W S P SRF EVA L    W EI G+  T  LS  T Y AYLV K  E G +G + +P +V      + +S++  V         
Subjt:  RELAITWSSDPLCWSWKSDPQSRFAEVAELRASSWVEIHGRTRTGRLSPNTLYGAYLVVKISEKG-YGLDLMPAQVCVQLGDALQSSQGSVWLRRKEQSN

Query:  LKMESLFYGNRRERAIKLLASDLGEDFDSNGIRDLRERDDGWSEIELGEFFTGEDDEHLTMSFLETKGFQLKSGLVVQAIQIRPK
               Y NRR              F  +G ++ RE  DGW EIELGE++ G DDE + MS LET+    K G++VQ I+IRPK
Subjt:  LKMESLFYGNRRERAIKLLASDLGEDFDSNGIRDLRERDDGWSEIELGEFFTGEDDEHLTMSFLETKGFQLKSGLVVQAIQIRPK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCGGAATTTCCAGCATCGGAGTGTTGCCGGAGGACTGTATTTCGGCGATTCTGTCACTCACGACTCCCACCGACGCCGGGAAATTGTCCCTCGTCTCGTCGACGTT
CCGATCAGCAGCCGAATCCGACGTCGTTTGGAGCAGATTTTTGCCTAGAAACTACGCCGAAATCATGGCCGTTTCTGATATCGCCGGCGAATTGCCACTCTGTTCGAAGA
GAGAAGCTTTCTTCCGACTCTGTTCTCCGATCCTTATCGACGGCGGTAAAAAGAGCTTTGAGTTGGAGAGATTTTCCGGGAAGATCTGTTATACATTGTCAGCAAGAGAG
CTGGCGATCACTTGGAGCTCCGATCCACTCTGTTGGAGCTGGAAATCCGATCCTCAATCAAGATTCGCAGAAGTTGCAGAGCTAAGAGCATCGAGCTGGGTGGAAATCCA
TGGAAGAACAAGAACAGGACGGCTGTCTCCGAACACATTGTACGGAGCTTATCTTGTGGTGAAGATTTCAGAGAAAGGGTATGGGTTAGATTTGATGCCAGCCCAAGTTT
GTGTTCAATTGGGGGATGCGTTGCAGAGCTCCCAAGGCTCTGTTTGGCTGCGCCGCAAGGAACAGAGCAACCTCAAAATGGAGTCTCTGTTTTATGGGAATCGGAGGGAG
AGAGCCATAAAGCTATTGGCTTCTGATTTGGGAGAGGATTTTGATAGCAACGGAATTAGGGATCTCCGAGAGAGAGACGATGGGTGGTCGGAGATTGAATTGGGAGAGTT
CTTCACCGGAGAAGACGATGAACACCTCACCATGAGCTTCTTGGAGACCAAAGGCTTTCAGCTCAAATCTGGACTTGTTGTTCAAGCTATTCAAATTCGGCCTAAACATT
AG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ACTAAAGATAAGATTGGATCAAAAAAATGGCCGGAATTTCCAGCATCGGAGTGTTGCCGGAGGACTGTATTTCGGCGATTCTGTCACTCACGACTCCCACCGACGCCGGG
AAATTGTCCCTCGTCTCGTCGACGTTCCGATCAGCAGCCGAATCCGACGTCGTTTGGAGCAGATTTTTGCCTAGAAACTACGCCGAAATCATGGCCGTTTCTGATATCGC
CGGCGAATTGCCACTCTGTTCGAAGAGAGAAGCTTTCTTCCGACTCTGTTCTCCGATCCTTATCGACGGCGGTAAAAAGAGCTTTGAGTTGGAGAGATTTTCCGGGAAGA
TCTGTTATACATTGTCAGCAAGAGAGCTGGCGATCACTTGGAGCTCCGATCCACTCTGTTGGAGCTGGAAATCCGATCCTCAATCAAGATTCGCAGAAGTTGCAGAGCTA
AGAGCATCGAGCTGGGTGGAAATCCATGGAAGAACAAGAACAGGACGGCTGTCTCCGAACACATTGTACGGAGCTTATCTTGTGGTGAAGATTTCAGAGAAAGGGTATGG
GTTAGATTTGATGCCAGCCCAAGTTTGTGTTCAATTGGGGGATGCGTTGCAGAGCTCCCAAGGCTCTGTTTGGCTGCGCCGCAAGGAACAGAGCAACCTCAAAATGGAGT
CTCTGTTTTATGGGAATCGGAGGGAGAGAGCCATAAAGCTATTGGCTTCTGATTTGGGAGAGGATTTTGATAGCAACGGAATTAGGGATCTCCGAGAGAGAGACGATGGG
TGGTCGGAGATTGAATTGGGAGAGTTCTTCACCGGAGAAGACGATGAACACCTCACCATGAGCTTCTTGGAGACCAAAGGCTTTCAGCTCAAATCTGGACTTGTTGTTCA
AGCTATTCAAATTCGGCCTAAACATTAGCCAACACGCTCAATCCAAGCATACCATAGTTCCATGGATACACACTAGTTAATTGATTCTTTTGTTTGTTAAGAATTTAAGA
TGTCTTACGTGAGGCAACTAAAGTCTTAATCAAGTGGAATTCGGTTTGAAATCGACATCATATGTTCATTTATTTAAAAAAATATATATTAAATATATATTAAAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAGISSIGVLPEDCISAILSLTTPTDAGKLSLVSSTFRSAAESDVVWSRFLPRNYAEIMAVSDIAGELPLCSKREAFFRLCSPILIDGGKKSFELERFSGKICYTLSARE
LAITWSSDPLCWSWKSDPQSRFAEVAELRASSWVEIHGRTRTGRLSPNTLYGAYLVVKISEKGYGLDLMPAQVCVQLGDALQSSQGSVWLRRKEQSNLKMESLFYGNRRE
RAIKLLASDLGEDFDSNGIRDLRERDDGWSEIELGEFFTGEDDEHLTMSFLETKGFQLKSGLVVQAIQIRPKH