CuGenDBv2

Gene ID	CmaCh06G003760
Organism	Cucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
Description	60S ribosomal protein L12-like
Genome location	Cma_Chr06:1743248..1743748
RNA-Seq Expression	CmaCh06G003760
Synteny	CmaCh06G003760
Gene Ontology terms	GO:0006412 - translation (biological process) GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function) GO:0070180 - large ribosomal subunit rRNA binding (molecular function)
InterPro domains	IPR000911 - Ribosomal protein L11/L12 IPR020783 - Ribosomal protein L11, C-terminal IPR020784 - Ribosomal protein L11, N-terminal IPR020785 - Ribosomal protein L11, conserved site IPR036769 - Ribosomal protein L11, C-terminal domain superfamily IPR036796 - Ribosomal protein L11/L12, N-terminal domain superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAE9587950.1 putative ribosomal protein L11/L12 [Lupinus albus]

9.6e-83

97.59

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAK+WKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSG+VKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGDVEVPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD

XP_022935531.1 60S ribosomal protein L12-1-like [Cucurbita moschata]

1.1e-83

98.8

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGDVE+PQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD

XP_022950157.1 60S ribosomal protein L12-3 [Cucurbita moschata]

2.3e-84

100

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD

XP_038883892.1 60S ribosomal protein L12-1-like [Benincasa hispida]

1.5e-83

98.8

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI DGDVE+PQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD

XP_038900338.1 60S ribosomal protein L12-3 [Benincasa hispida]

4.3e-83

97.59

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD
        HNGNISLDDVIEIA++MRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI DGDVE+PQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A6A5N6A4 Putative ribosomal protein L11/L12

4.7e-83

97.59

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAK+WKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSG+VKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGDVEVPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD

A0A6J1F4X7 60S ribosomal protein L12-1-like

5.5e-84

98.8

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGDVE+PQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD

A0A6J1GE12 60S ribosomal protein L12-3

1.1e-84

100

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD

A0A6J1J2K8 60S ribosomal protein L12-1-like

5.5e-84

98.8

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGDVE+PQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD

A0A6J1KW77 60S ribosomal protein L12-3

1.1e-84

100

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

O50003 60S ribosomal protein L12

5.1e-79

90.36

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETA +WKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD
        H+G+ISLDDVIEIA++M+ RSMAK+L+G+VKEIL TCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI DGDVE+P D
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD

P0CT83 60S ribosomal protein L12-A

1.6e-64

72.29

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDP++V  +F+R  GGEV   S+LAPKIGPLGLSPKK+GEDIAK T K+WKGLRVTVKLT+QNRQA VSVVPSA+ALVIKALKEP RDRKK KN+ 
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD
        H+GN+SLD++IE+AR MR +S+AK+LSG+VKEILGT  SVGCTVDGK+P D+Q+EI++G++E+PQ+
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD

P50883 60S ribosomal protein L12-1

1.4e-79

88.55

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+VDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD
        HNGNIS DDV EIAR+MRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPKD+QQEI DG+VE+P++
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD

Q9FF52 60S ribosomal protein L12-3

6.1e-80

88.55

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+VDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD
        HNGNIS DDVIEIA++MRPRS+AK+LSG+VKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQ+EIN GD+++P +
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD

Q9LFH5 60S ribosomal protein L12-2

3.0e-79

87.95

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+VDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD
        HNGNIS DDV EIAR+MRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI +G++E+P++
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G37190.1 Ribosomal protein L11 family protein

9.6e-81

88.55

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+VDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD
        HNGNIS DDV EIAR+MRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPKD+QQEI DG+VE+P++
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD

AT3G53430.1 Ribosomal protein L11 family protein

2.1e-80

87.95

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+VDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD
        HNGNIS DDV EIAR+MRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI +G++E+P++
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD

AT5G60670.1 Ribosomal protein L11 family protein

4.3e-81

88.55

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+VDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD
        HNGNIS DDVIEIA++MRPRS+AK+LSG+VKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQ+EIN GD+++P +
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCCTCCGAAGTTTGACCCTAGTCAGGTGGTGGATGTTTTCGTTCGCGTCACCGGAGGTGAGGTTGGAGCAGCCAGTTCTCTTGCTCCGAAGATTGGTCCTCTC
GGTCTTTCTCCTAAGAAGATTGGAGAAGACATTGCTAAAGAGACCGCAAAGGAATGGAAAGGTCTTAGAGTTACTGTAAAGCTCACTGTCCAAAATCGTCAGGCG
AAGGTCTCCGTTGTTCCTTCGGCGGCGGCTTTGGTAATTAAGGCGTTGAAGGAGCCGGAGCGTGACCGGAAGAAGACTAAGAATATCAAGCATAATGGCAACATT
TCTCTTGATGATGTGATTGAAATTGCTAGGGTTATGCGGCCTAGATCGATGGCTAAGGACCTCTCTGGCTCCGTCAAGGAGATCCTTGGAACTTGCGTGTCTGTT
GGTTGTACTGTTGATGGCAAGGACCCTAAGGATCTTCAACAGGAGATTAACGATGGCGACGTTGAAGTGCCCCAAGATTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIKHNGNI
SLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEINDGDVEVPQD

CmaCh06G003760 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome