| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6597486.1 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 3.2e-115 | 93.12 | Show/hide |
Query: MPRYRSRSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
M RYRSRSRSYSPRRRSRSPPR+RKRYDD+DDSR+RYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLR+ FERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Subjt: MPRYRSRSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPARSRSISQSRFP
RFSEDAIEAKQQLN TVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRN GARGE+YSPARSRSISQS FP
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPARSRSISQSRFP
Query: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSRSRSY
HDKRDYS SPRPKENGRSSREVNIA SGSR PR+ SRS SGSRSRS+
Subjt: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSRSRSY
|
|
| KAG7028947.1 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 4.0e-118 | 94.74 | Show/hide |
Query: MPRYRSRSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
M RYRSRSRSYSPRRRSRSPPR+RKRYDD+DDSR+RYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Subjt: MPRYRSRSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPARSRSISQSRFP
RFSEDAIEAKQQLN TVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGE+YSPARSRSISQS FP
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPARSRSISQSRFP
Query: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSRSRSY
HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIA SGSR PR+ SRS SGSRSRS+
Subjt: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSRSRSY
|
|
| XP_022939180.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucurbita moschata] | 2.9e-116 | 93.93 | Show/hide |
Query: MPRYRSRSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
M RYRSRSRSYSPRRRSRSPPR+RKRYDD+DDSR+RYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Subjt: MPRYRSRSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPARSRSISQSRFP
RFSEDAIEAKQQLN TVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTS SSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRN GARGE+YSPARSRSISQS FP
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPARSRSISQSRFP
Query: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSRSRSY
HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIA SGSR PR+ SRS SGSRSRS+
Subjt: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSRSRSY
|
|
| XP_022973749.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucurbita maxima] | 4.7e-127 | 100 | Show/hide |
Query: MPRYRSRSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
MPRYRSRSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Subjt: MPRYRSRSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPARSRSISQSRFP
RFSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPARSRSISQSRFP
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPARSRSISQSRFP
Query: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSRSRSY
HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSRSRSY
Subjt: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSRSRSY
|
|
| XP_023539925.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 4.0e-118 | 95.55 | Show/hide |
Query: MPRYRSRSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
M RYRSRSRSYSPRRRSRSPPR+RKRYDD D SR+RYHESRSYRDRRSPA SGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Subjt: MPRYRSRSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPARSRSISQSRFP
RFSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRN GARGE+YSPARSRSISQSRFP
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPARSRSISQSRFP
Query: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSRSRSY
HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIA SGSRSPR+ SRSPSGSRSRSY
Subjt: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSRSRSY
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5D3CXM8 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 2.3e-103 | 85.89 | Show/hide |
Query: MPRYRSRSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
M RYRSRSRSYSPRRRSR+PPR RKRYD DD R+RY ESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLR PFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Subjt: MPRYRSRSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPARSRSISQSRFP
RF+EDA EAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMR TSRSSGRSYRRRSP RSPRRR RSYSRSPSPARHDSR+ GAR E+ SPARSRSIS SR P
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPARSRSISQSRFP
Query: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSRSRSYR
D++DYS+SP PK+NGRS REV+ ARS SRSP+ SRSPSGSRSRSYR
Subjt: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSRSRSYR
|
|
| A0A6J1C7W4 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 7.6e-107 | 88.66 | Show/hide |
Query: MPRYRSRSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
M RYRSRSRSYSPRRRSRSPPR RKRYD DD R+RYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Subjt: MPRYRSRSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPARSRSISQSRFP
RF+EDA EAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMR TSRSSGRSYRRRSP RSPRRR RSYSRSPSPARHDSRN GAR E+ SPARSRSIS+SR P
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPARSRSISQSRFP
Query: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSRSRSY
HD+RDYS+SP PKENGRS REV+I RS SRS R+ SRSPSGSRS+SY
Subjt: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSRSRSY
|
|
| A0A6J1FLY4 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 1.4e-116 | 93.93 | Show/hide |
Query: MPRYRSRSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
M RYRSRSRSYSPRRRSRSPPR+RKRYDD+DDSR+RYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Subjt: MPRYRSRSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPARSRSISQSRFP
RFSEDAIEAKQQLN TVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTS SSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRN GARGE+YSPARSRSISQS FP
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPARSRSISQSRFP
Query: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSRSRSY
HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIA SGSR PR+ SRS SGSRSRS+
Subjt: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSRSRSY
|
|
| A0A6J1IFJ5 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 2.3e-127 | 100 | Show/hide |
Query: MPRYRSRSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
MPRYRSRSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Subjt: MPRYRSRSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPARSRSISQSRFP
RFSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPARSRSISQSRFP
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPARSRSISQSRFP
Query: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSRSRSY
HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSRSRSY
Subjt: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSRSRSY
|
|
| A0A6J1IQ05 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 8.7e-103 | 86.23 | Show/hide |
Query: MPRYRSRSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
M RYRSRSRSYSPRRRSR+PPR RKRYD DD R+RY ESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLR PFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Subjt: MPRYRSRSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPARSRSISQSRFP
RF+EDA EAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMR TSRSSGRS RRRSP RSPRRR SYSRSPSPARHDSR+ GAR E+ SPARSRSIS+S P
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPARSRSISQSRFP
Query: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSRSRSY
D+RDYS+SP PKENGRS R V+IARS SRSPR+ASRSPSGSRSRSY
Subjt: HDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSRSRSY
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| Q1PDV2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 1.2e-59 | 61.54 | Show/hide |
Query: MPRYRSRSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
M R RSRSRSYSPR R RSPPRERK YDD NR E S RD S PSGLL+RNLPLDARP DLR FERFGP+KD+YLP+NYYTGEPRGFGFVK+
Subjt: MPRYRSRSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGR--SYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEH-YSP-ARSRSISQ
R++EDA EA +++NH VIGGREI IVFAEENRKTPQEMR+T+ +SGR Y+R S RSPRRR RS+SRS SP R +SR+ R + YSP RSRSIS+
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGR--SYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEH-YSP-ARSRSISQ
Query: SRFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSR
S P ++R+Y N RS RE + S SRS S SR
Subjt: SRFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSR
|
|
| Q8L3X8 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30 | 1.9e-30 | 41.44 | Show/hide |
Query: PRYRSRSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFR
P Y R Y R RS PP R+ Y RR + LLVRN+PLD RPE+LR PFERFGPV+DVY+P++YY+G+PRGF FV+F
Subjt: PRYRSRSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFR
Query: FSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGR---SYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPARSRSISQSR
+ DA EA++ +N GREI +V A E+RK P+EMR +R+ R R RS GRS R+RS SRS SP R R YSPA R R
Subjt: FSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGR---SYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPARSRSISQSR
Query: FPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGS---------------RSPRSASRSPSGSRSRS
D+ +S P G ++ + R+G R R+ SRSPSGSRSRS
Subjt: FPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGS---------------RSPRSASRSPSGSRSRS
|
|
| Q8WXF0 Serine/arginine-rich splicing factor 12 | 5.8e-19 | 37.44 | Show/hide |
Query: PAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSR---SS
P + L +RN+ RPEDLR F R+GP+ DVY+P ++YT PRGF +V+F DA +A LN + GR+I I FA+ +RKTP +M+S R S
Subjt: PAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSR---SS
Query: GRSYRRRSPGRSPRR-------RNRSYSRSPSPARHD--SRNHGARGEHYSPARSRSISQSRFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSAS
R RSP + R RNR S S +RH S + P RS S QSR P +R++ R + R +I +S S SP+
Subjt: GRSYRRRSPGRSPRR-------RNRSYSRSPSPARHD--SRNHGARGEHYSPARSRSISQSRFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSAS
Query: RSPSGSRSRSY
++ SG++SRS+
Subjt: RSPSGSRSRSY
|
|
| Q9LHP2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A | 7.5e-35 | 47.35 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDA
R RSY+P SPPR R + R R+ SR S P+ LLVRNL D R EDLR PFE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGF++F DA
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDA
Query: IEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPAR---SRSIS-QSRFPHD
EAK Q++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR+ R GRS R + RSP R YSRSP P R +RG + PA+ SRS+S Q R
Subjt: IEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPAR---SRSIS-QSRFPHD
Query: KRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSRSRSY
+R YS+SP + S +S SRSPR RS S ++RSY
Subjt: KRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSRSRSY
|
|
| Q9SEU4 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 | 6.0e-32 | 45.85 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDA
R RSY+P SPPR R + R R Y R P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGFV+F DA
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDA
Query: IEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGR-SYRRRSPGR-------SPRRRNRSYSR-----SPSPARHDSRNHGARGEHYSPARSRS
+AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR+ R GR RRR+P R P RR RS SR SP P RH R+ R E Y R
Subjt: IEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGR-SYRRRSPGR-------SPRRRNRSYSR-----SPSPARHDSRNHGARGEHYSPARSRS
Query: ISQSRFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSRSRS
S SR P +S P S + RS SRSPR SRSPS R+RS
Subjt: ISQSRFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSRSRS
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 4.2e-33 | 45.85 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDA
R RSY+P SPPR R + R R Y R P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGFV+F DA
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDA
Query: IEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGR-SYRRRSPGR-------SPRRRNRSYSR-----SPSPARHDSRNHGARGEHYSPARSRS
+AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR+ R GR RRR+P R P RR RS SR SP P RH R+ R E Y R
Subjt: IEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGR-SYRRRSPGR-------SPRRRNRSYSR-----SPSPARHDSRNHGARGEHYSPARSRS
Query: ISQSRFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSRSRS
S SR P +S P S + RS SRSPR SRSPS R+RS
Subjt: ISQSRFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSRSRS
|
|
| AT1G55310.2 SC35-like splicing factor 33 | 8.0e-32 | 44.78 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDA
R RSY+P SPPR R + R R Y R P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGFV+F DA
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDA
Query: IEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPA----RSRSISQSRFPHD
+AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR+ R GR RR R R YSRS SP R+ G++YSP RSIS +D
Subjt: IEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPA----RSRSISQSRFPHD
Query: -KRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRS
+R YS+S P +G R + R SRS
Subjt: -KRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRS
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 5.3e-36 | 47.35 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDA
R RSY+P SPPR R + R R+ SR S P+ LLVRNL D R EDLR PFE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGF++F DA
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFSEDA
Query: IEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPAR---SRSIS-QSRFPHD
EAK Q++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR+ R GRS R + RSP R YSRSP P R +RG + PA+ SRS+S Q R
Subjt: IEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPAR---SRSIS-QSRFPHD
Query: KRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSRSRSY
+R YS+SP + S +S SRSPR RS S ++RSY
Subjt: KRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSRSRSY
|
|
| AT3G55460.1 SC35-like splicing factor 30 | 1.4e-31 | 41.44 | Show/hide |
Query: PRYRSRSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFR
P Y R Y R RS PP R+ Y RR + LLVRN+PLD RPE+LR PFERFGPV+DVY+P++YY+G+PRGF FV+F
Subjt: PRYRSRSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFR
Query: FSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGR---SYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPARSRSISQSR
+ DA EA++ +N GREI +V A E+RK P+EMR +R+ R R RS GRS R+RS SRS SP R R YSPA R R
Subjt: FSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGR---SYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEHYSPARSRSISQSR
Query: FPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGS---------------RSPRSASRSPSGSRSRS
D+ +S P G ++ + R+G R R+ SRSPSGSRSRS
Subjt: FPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGS---------------RSPRSASRSPSGSRSRS
|
|
| AT5G18810.1 SC35-like splicing factor 28 | 8.2e-61 | 61.54 | Show/hide |
Query: MPRYRSRSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
M R RSRSRSYSPR R RSPPRERK YDD NR E S RD S PSGLL+RNLPLDARP DLR FERFGP+KD+YLP+NYYTGEPRGFGFVK+
Subjt: MPRYRSRSRSYSPRRRSRSPPRERKRYDDNDDSRNRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKF
Query: RFSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGR--SYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEH-YSP-ARSRSISQ
R++EDA EA +++NH VIGGREI IVFAEENRKTPQEMR+T+ +SGR Y+R S RSPRRR RS+SRS SP R +SR+ R + YSP RSRSIS+
Subjt: RFSEDAIEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRSTSRSSGR--SYRRRSPGRSPRRRNRSYSRSPSPARHDSRNHGARGEH-YSP-ARSRSISQ
Query: SRFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSR
S P ++R+Y N RS RE + S SRS S SR
Subjt: SRFPHDKRDYSQSPRPKENGRSSREVNIARSGSRSPRSASRSPSGSR
|
|
