; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh07G010210 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh07G010210
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
Descriptioncopper ion transmembrane transporters
Genome locationCma_Chr07:5308928..5310178
RNA-Seq ExpressionCmaCh07G010210
SyntenyCmaCh07G010210
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6595352.1 putative DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.0e-19387.5Show/hide
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KAG7027360.1 putative DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.4e-21795.43Show/hide
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XP_022966589.1 uncharacterized protein LOC111466226 [Cucurbita maxima]2.5e-228100Show/hide
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XP_023517591.1 uncharacterized protein LOC111781310 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-21394.23Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BKN8 uncharacterized protein LOC1034906411.0e-12663.9Show/hide
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A0A5A7TP38 Putative DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 331.0e-12663.9Show/hide
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A0A6J1DBJ9 uncharacterized protein LOC1110194835.7e-13064.98Show/hide
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        E D +T RRSSNR LR GSVSE + +S   D YP ++  PSSSNG KGKTY+G+FRNR  GRNL+SSK                                
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A0A6J1F003 uncharacterized protein LOC1114381632.8e-21795.43Show/hide
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A0A6J1HU81 uncharacterized protein LOC1114662261.2e-228100Show/hide
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Query:  EQDGSYRFKPMKTRSN
        EQDGSYRFKPMKTRSN
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80792 Putative DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 337.0e-1645Show/hide
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        MGGGPRT+PGG++KWQWKRM  KKA++     L +E+Q+YE R R E++A +       E   K       +   E +K LADRF + G  DLW + DGP
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Q6K7R9 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 481.0e-1139.81Show/hide
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        MGGGPRT+PGG+SKWQ KRM  K A+   +  L  E+Q+Y  R R+E++A+            + P   +   D+          ++ LADRF  PG  D
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Query:  LWTEKDGP
        LW E DGP
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Q9C8S9 Probable DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 485.3e-1645Show/hide
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        MGGGPRT+PGG++KWQWKRM  KKA++     L +E+Q+YE R R E++A +       E   K+      +   E +K LADRF + G  D W E DGP
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G63250.1 DEA(D/H)-box RNA helicase family protein3.8e-1745Show/hide
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        MGGGPRT+PGG++KWQWKRM  KKA++     L +E+Q+YE R R E++A +       E   K+      +   E +K LADRF + G  D W E DGP
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AT2G07750.1 DEA(D/H)-box RNA helicase family protein4.9e-1745Show/hide
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        MGGGPRT+PGG++KWQWKRM  KKA++     L +E+Q+YE R R E++A +       E   K       +   E +K LADRF + G  DLW + DGP
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AT2G37920.1 copper ion transmembrane transporters4.9e-6578.06Show/hide
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        T  + +T+IRMGGGPRT+PGGVSKWQWKRMQAKK KQLLKARLCRERQIYEMRKRAELKAAV+ELERPWE + K PNLFSV ADEQVKVLADRFQ+PGGF
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Query:  DLWTEKDGPQLFETVDELPSARFFPKGVVHSVKPYRSITGSEGSSSLDSEDGNEI
        DLWT++DGPQLFE+VD+LPSARFFPKGVVHSVKPY  ++    SS +D  D +E+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCAATTTTCCCAATCTCACTCGCAATTTCAAACCCTCCTCGACCACCGCCGTTATTCTCTTTCTCTCAGTCCATAACTGGTTCAAACCGCCTTTTGTACTTT
CCCAATGGGATACGGACCGCTACGAAGATCACGACGCTTATTCGAATGGGTGGAGGTCCAAGAACTTATCCAGGCGGAGTGTCGAAGTGGCAGTGGAAGCGGATG
CAGGCTAAGAAAGCTAAGCAGTTGCTCAAGGCCCGGTTGTGTCGCGAACGCCAGATATATGAGATGCGTAAGCGGGCTGAACTTAAGGCGGCTGTGTCCGAGCTG
GAGAGGCCGTGGGAGGTTGTGGAGAAGGCTCCCAATTTGTTCTCTGTTGGCGCCGATGAGCAGGTGAAGGTCTTGGCGGATAGGTTTCAGAGGCCCGGTGGATTC
GATTTGTGGACGGAAAAAGATGGGCCTCAATTGTTTGAGACGGTTGATGAACTGCCTTCCGCAAGGTTTTTCCCGAAAGGGGTGGTTCACAGTGTAAAGCCGTAC
AGAAGTATAACAGGGTCGGAGGGTTCTTCGAGTTTGGATTCCGAAGATGGAAATGAAATTGGAACTAGTTTTCAAGAAGACGATTTAAAGACTCCCCGGAGGTCT
TCTAACCGGAAATTAAGAATTGGGTCAGTGAGTGAAGAAAAAGCTAATTCAAATTACTCTGATTATTATCCGAGGAGTTCCTCGGTTCCATCAAGTAGTAATGGT
CAAAAAGGAAAGACATACGAGGGTAAATTCAGGAATCGGGAAAAGGGAAGAAACCTCCAGTCTTCTAAGAGATCTTCGAGCTTGGGCTCAGAAGCTGGAAATGGA
ATTGAAACTAGATTTCAAGTAGATGATTTTAAGACTTACCGGAGGTCTTCTAACCGGAAATTGAGAAGTGGGTCAGTGAGTGAAGGAGAAGCTAATTCAGATTAC
TCGGATACAGAGGATTATTATCTGAAGAGTTCCATGGTACCATCAAGTAGTAACAATGGTCGTAAATTCGGGAGTCGGGAAAATGGAAGAAACCTCGAGTCTTCT
AAGAGGGAGTTGAATTCAGGACAAATTGGATTGGATAGAAGACAAAGGGTTCCTAGTCCTCAGATGCATAATGGTAATAGACAGTATGGAAAAGGCAAGGATTCG
AGGCGATCCAAGGGTTCATATTCTGAAGTTTATGACATGAGTTTGGAGCAGGATGGGAGTTACAGATTCAAACCGATGAAAACTCGGTCGAACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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GAGAGGCCGTGGGAGGTTGTGGAGAAGGCTCCCAATTTGTTCTCTGTTGGCGCCGATGAGCAGGTGAAGGTCTTGGCGGATAGGTTTCAGAGGCCCGGTGGATTC
GATTTGTGGACGGAAAAAGATGGGCCTCAATTGTTTGAGACGGTTGATGAACTGCCTTCCGCAAGGTTTTTCCCGAAAGGGGTGGTTCACAGTGTAAAGCCGTAC
AGAAGTATAACAGGGTCGGAGGGTTCTTCGAGTTTGGATTCCGAAGATGGAAATGAAATTGGAACTAGTTTTCAAGAAGACGATTTAAAGACTCCCCGGAGGTCT
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CAAAAAGGAAAGACATACGAGGGTAAATTCAGGAATCGGGAAAAGGGAAGAAACCTCCAGTCTTCTAAGAGATCTTCGAGCTTGGGCTCAGAAGCTGGAAATGGA
ATTGAAACTAGATTTCAAGTAGATGATTTTAAGACTTACCGGAGGTCTTCTAACCGGAAATTGAGAAGTGGGTCAGTGAGTGAAGGAGAAGCTAATTCAGATTAC
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AAGAGGGAGTTGAATTCAGGACAAATTGGATTGGATAGAAGACAAAGGGTTCCTAGTCCTCAGATGCATAATGGTAATAGACAGTATGGAAAAGGCAAGGATTCG
AGGCGATCCAAGGGTTCATATTCTGAAGTTTATGACATGAGTTTGGAGCAGGATGGGAGTTACAGATTCAAACCGATGAAAACTCGGTCGAACTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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ERPWEVVEKAPNLFSVGADEQVKVLADRFQRPGGFDLWTEKDGPQLFETVDELPSARFFPKGVVHSVKPYRSITGSEGSSSLDSEDGNEIGTSFQEDDLKTPRRS
SNRKLRIGSVSEEKANSNYSDYYPRSSSVPSSSNGQKGKTYEGKFRNREKGRNLQSSKRSSSLGSEAGNGIETRFQVDDFKTYRRSSNRKLRSGSVSEGEANSDY
SDTEDYYLKSSMVPSSSNNGRKFGSRENGRNLESSKRELNSGQIGLDRRQRVPSPQMHNGNRQYGKGKDSRRSKGSYSEVYDMSLEQDGSYRFKPMKTRSN