CuGenDBv2

Gene ID	CmaCh07G010410
Organism	Cucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
Description	Tubulin beta chain
Genome location	Cma_Chr07:5424880..5427103
RNA-Seq Expression	CmaCh07G010410
Synteny	CmaCh07G010410
Gene Ontology terms	GO:0000278 - mitotic cell cycle (biological process) GO:0000226 - microtubule cytoskeleton organization (biological process) GO:0005737 - cytoplasm (cellular component) GO:0005874 - microtubule (cellular component) GO:0005525 - GTP binding (molecular function) GO:0005200 - structural constituent of cytoskeleton (molecular function) GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
InterPro domains	IPR037103 - Tubulin/FtsZ-like, C-terminal domain IPR036525 - Tubulin/FtsZ, GTPase domain superfamily IPR023123 - Tubulin, C-terminal IPR018316 - Tubulin/FtsZ, 2-layer sandwich domain IPR017975 - Tubulin, conserved site IPR013838 - Beta tubulin, autoregulation binding site IPR008280 - Tubulin/FtsZ, C-terminal IPR003008 - Tubulin/FtsZ, GTPase domain IPR002453 - Beta tubulin IPR000217 - Tubulin

Homology

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AT5G23860.2 tubulin beta 8

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        VLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYR+LTVPELTQQMWD+KNMM
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        EGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATADEE   E+EEE E
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Sequences

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GGCACTATGGACAGTATCAGATCTGGACTTTATGGCCAGATCTTCAGGCCGGATAACTTTGTTTTTGGTCAATCTGGTGCTGGAAACAACTGGGCGAAAGGACAT
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TGCTTCCGTACTCTCAAGCTCACCACTCCAAGCTTTGGTGATTTGAATCATTTGATCTCTGCAACAATGTCTGGTGTGACTTGCTGTTTGAGATTCCCTGGACAA
CTCAACTCAGATCTCAGAAAGCTCGCTGTTAATCTCATTCCCTTCCCTCGTCTCCACTTTTTCATGGTGGGTTTTGCTCCTCTTACATCTCGTGGTTCTCAGCAG
TACAGAGCACTGACTGTGCCCGAGCTTACTCAACAAATGTGGGATGCCAAGAACATGATGTGTGCGGCCGACCCACGACACGGTCGCTACTTAACTGCCTCTGCT
ATGTTCAGAGGCAAGATGAGCACAAAGGAGGTCGATGAGCAAATGCTCAACGTACAGAACAAGAACTCCTCTTACTTCGTGGAGTGGATTCCAAACAATGTCAAA
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mRNA sequence

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TTTCTTCGATTTCTTCTGCAAAAAATGAGAGAGATCCTTCACGTTCAGGGTGGGCAATGTGGCAACCAGATCGGTGCCAAGTTTTGGGAGGTGGTTTGCGCCGAG
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GCTGTTCTTATGGATCTCGAGCCCGGCACTATGGACAGTATCAGATCTGGACTTTATGGCCAGATCTTCAGGCCGGATAACTTTGTTTTTGGTCAATCTGGTGCT
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TTTCAGGTCTGCCATTCTCTAGGAGGAGGAACTGGATCTGGAATGGGAACACTTCTGATTTCGAAGATCAGAGAAGAATACCCCGACAGGATGATGCTTACTTTC
TCTGTCTTTCCATCTCCCAAGGTCTCTGATACTGTCGTTGAGCCTTACAATGCAACTCTCTCAGTTCATCAACTGGTTGAGAATGCAGATGAGTGCATGGTTCTT
GACAACGAAGCTCTTTACGATATCTGCTTCCGTACTCTCAAGCTCACCACTCCAAGCTTTGGTGATTTGAATCATTTGATCTCTGCAACAATGTCTGGTGTGACT
TGCTGTTTGAGATTCCCTGGACAACTCAACTCAGATCTCAGAAAGCTCGCTGTTAATCTCATTCCCTTCCCTCGTCTCCACTTTTTCATGGTGGGTTTTGCTCCT
CTTACATCTCGTGGTTCTCAGCAGTACAGAGCACTGACTGTGCCCGAGCTTACTCAACAAATGTGGGATGCCAAGAACATGATGTGTGCGGCCGACCCACGACAC
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TTCCGACGTGTGAGCGAACAGTTCACTGCCATGTTTAGGAGGAAAGCTTTCTTGCATTGGTACACCGGTGAAGGTATGGACGAGATGGAGTTCACCGAGGCCGAA
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TTTCTGTTGTCTTTTATTATGTGCTTAACTTTTGGAACTGATTGTGTCTTCACTCTGTTCAAATTTTAACCTACTACCTAATATGAATTTTTGTTCAATTCCCAT
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ATTATTGATTAAGCAAGTAAAAATATAACAAGGGTATTGCTACCA

Protein sequence

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CFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTASA
MFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
EYQQYQDATADEEYYEEEEEEPEDV

CmaCh07G010410 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome