| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6593325.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 5.4e-119 | 97.48 | Show/hide |
Query: ISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPSRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGR
ISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRR THTLLRLSPGRP+RLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEEL RIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGR
Subjt: ISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPSRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGR
Query: SRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVPGTS
SRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVN VDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEK KVLSAKVSRVPGTS
Subjt: SRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVPGTS
Query: KASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
KASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNN LLEGQPIRVNKA
Subjt: KASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
|
|
| KAG7025672.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 2.2e-120 | 97.51 | Show/hide |
Query: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPSRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKY
MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRR THTLLRLSPGRP+RLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEEL RIVEQHGAVEKAEVMYDKY
Subjt: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPSRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKY
Query: SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVP
SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVN VDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEK KVLSAKVSRVP
Subjt: SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVP
Query: GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNN LLEGQPIRVNKA
Subjt: GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
|
|
| XP_022959724.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like [Cucurbita moschata] | 5.8e-121 | 97.93 | Show/hide |
Query: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPSRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKY
MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRP+RLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEEL RIVEQHGAVEKAEVMYDKY
Subjt: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPSRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKY
Query: SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVP
SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVN VDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEK KVLSAKVSRVP
Subjt: SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVP
Query: GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNN LLEGQPIRVNKA
Subjt: GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
|
|
| XP_023004641.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like [Cucurbita maxima] | 5.6e-124 | 100 | Show/hide |
Query: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPSRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKY
MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPSRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKY
Subjt: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPSRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKY
Query: SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVP
SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVP
Subjt: SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVP
Query: GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
Subjt: GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
|
|
| XP_023513630.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 9.3e-119 | 96.27 | Show/hide |
Query: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPSRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKY
MASISAVLSPTNLIHSS KPAEILL SVSFHRRRTHT LRLSPGRP+RLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEEL RIVE+HGAVEKAEVMYDKY
Subjt: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPSRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKY
Query: SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVP
SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVN VDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEK KVLSAKVSRVP
Subjt: SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVP
Query: GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNN LLEGQPIRVNKA
Subjt: GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A6J1GQT6 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like isoform X1 | 3.0e-99 | 79.15 | Show/hide |
Query: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEI-------LLKSVSFHRRRTHTLLRLSPG-------RPSRLF----AALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTR
MASIS++L+P NLIHSS KP EI L+ +SFH R +TLLR+SPG R +RLF AA++ QD SSVA RKLY+GNIPRNV NEELTR
Subjt: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEI-------LLKSVSFHRRRTHTLLRLSPG-------RPSRLF----AALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTR
Query: IVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLK
IVE+HGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+T+VGGRTIKVNITEKP+VN VDMSLL+A+ESQFIDSP+KVYVGNISSTVSTETLK
Subjt: IVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLK
Query: NFFSEKDKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
NFFSEK KVLSAKVSRVPGTSK+SGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNN LLEGQPIRVNKA
Subjt: NFFSEKDKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
|
|
| A0A6J1GSN8 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like isoform X2 | 3.0e-99 | 79.15 | Show/hide |
Query: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEI-------LLKSVSFHRRRTHTLLRLSPG-------RPSRLF----AALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTR
MASIS++L+P NLIHSS KP EI L+ +SFH R +TLLR+SPG R +RLF AA++ QD SSVA RKLY+GNIPRNV NEELTR
Subjt: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEI-------LLKSVSFHRRRTHTLLRLSPG-------RPSRLF----AALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTR
Query: IVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLK
IVE+HGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+T+VGGRTIKVNITEKP+VN VDMSLL+A+ESQFIDSP+KVYVGNISSTVSTETLK
Subjt: IVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLK
Query: NFFSEKDKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
NFFSEK KVLSAKVSRVPGTSK+SGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNN LLEGQPIRVNKA
Subjt: NFFSEKDKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
|
|
| A0A6J1H8X7 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like | 2.8e-121 | 97.93 | Show/hide |
Query: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPSRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKY
MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRP+RLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEEL RIVEQHGAVEKAEVMYDKY
Subjt: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPSRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKY
Query: SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVP
SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVN VDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEK KVLSAKVSRVP
Subjt: SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVP
Query: GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNN LLEGQPIRVNKA
Subjt: GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
|
|
| A0A6J1JXN0 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like | 3.0e-99 | 79.15 | Show/hide |
Query: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEI-------LLKSVSFHRRRTHTLLRLSPG-------RPSRLF----AALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTR
MASIS++L+P NLIHSS KP EI L+ +SFH R +TLLR+SPG R +RLF AA++ QD SSVA RKLY+GNIPRNV NEELTR
Subjt: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEI-------LLKSVSFHRRRTHTLLRLSPG-------RPSRLF----AALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTR
Query: IVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLK
IVE+HGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+T+VGGRTIKVNITEKP+VN VDMSLL+A+ESQFIDSP+KVYVGNISSTVSTETLK
Subjt: IVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLK
Query: NFFSEKDKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
NFFSEK KVLSAKVSRVPGTSK+SGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNN LLEGQPIRVNKA
Subjt: NFFSEKDKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
|
|
| A0A6J1KSN9 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like | 2.7e-124 | 100 | Show/hide |
Query: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPSRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKY
MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPSRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKY
Subjt: MASISAVLSPTNLIHSSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPSRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKY
Query: SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVP
SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVP
Subjt: SGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVP
Query: GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
Subjt: GTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P19684 33 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic | 3.1e-32 | 39.57 | Show/hide |
Query: DSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKP--VVNMVDMSLLE
+S SV +LYVGN+P ++ + +L+ I + G V E++YD+ + RSR FAFVTM +V++A AI + + VGGRT+KVN E P V + +
Subjt: DSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKP--VVNMVDMSLLE
Query: AEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
+ F+DSPHK+YV N+S ++++ L++ F+++ +SAKV + ++ G+GF+TFSS E + +A+ + N V LEG+P+R+N A
Subjt: AEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
|
|
| P28644 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic | 1.3e-27 | 41.9 | Show/hide |
Query: ERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLEAEESQFID
E KL+VGN+P +VD+E+L I + G VE AEV+Y++ + RSR F FVTM TV++A A+E LN D+ GR + VN E +
Subjt: ERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLEAEESQFID
Query: SPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
+VYVGN+ V T L+ FSE KV+SA+V T ++ G+GFVT SSE EV AI++ + L+G+ +RVN A
Subjt: SPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
|
|
| P82277 30S ribosomal protein 2, chloroplastic | 5.0e-67 | 56.32 | Show/hide |
Query: MASISAVLSPTNLIH------SSTKP---AEILLKSVSFHRRRTHTL-LRLSPGRPSRLFAALTAQDSSSVA----------ERKLYVGNIPRNVDNEEL
MA+IS++L L+ SS+KP ++ L++ SF L R+S P A+ +++SS + R+LYVGNIPRN++N+EL
Subjt: MASISAVLSPTNLIH------SSTKP---AEILLKSVSFHRRRTHTL-LRLSPGRPSRLFAALTAQDSSSVA----------ERKLYVGNIPRNVDNEEL
Query: TRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTET
IVE+HGA+E AEVMYDKYSGRSRRF FVTMKTV+DANA IEKLN+T++GGR IKVNITEKP+ M D++ +AE+SQF++SP+KVY+GN++ TV+ E
Subjt: TRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTET
Query: LKNFFSEKDKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
LK+FFSEK KVL AKV R PGTSK++G+GFV+FSSEEEVEAAI + NN +LEGQ IRVNKA
Subjt: LKNFFSEKDKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
|
|
| Q39061 RNA-binding protein CP33, chloroplastic | 1.8e-32 | 38.38 | Show/hide |
Query: SSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKP--VVNMVDMSLLEAE
+S E +LYVGN+P + + EL++I + G V +++YDK + RSR F FVTM ++++A A++ N + +GGRT+KVN E P N V + +
Subjt: SSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKP--VVNMVDMSLLEAE
Query: ESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
++DSPHKVY GN+ ++++ LK+ F ++ VL AKV T ++ G+GF++F S E V++A+++ N V +EG+ +R+N A
Subjt: ESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
|
|
| Q8VYM4 30S ribosomal protein 2, chloroplastic | 3.5e-68 | 68.98 | Show/hide |
Query: AQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLE
A D SS A R++Y+GNIPR V NE+LT++VE+HGAVEK +VMYDKYSGRSRRF F TMK+V+DANA +EKLN V GR IKVNITEKP+ + D+S+L+
Subjt: AQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLE
Query: AEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
+E+S F+DSP+KVYVGN++ TV+ E L+N FSEK KV+SAKVSRVPGTSK++G+GFVTFSSEE+VEAAI + NN LLEGQ IRVNKA
Subjt: AEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G60000.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.0e-31 | 36.73 | Show/hide |
Query: SSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPSRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTV
S+ KP I +S S R + + + A D + KLY GN+P NVD+ L +I++ E EV+Y++ +G+SR FAFVTM V
Subjt: SSTKPAEILLKSVSFHRRRTHTLLRLSPGRPSRLFAALTAQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTV
Query: DDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSS
+D N I+ L+ T+ GR +KVN +KP N +E + ++ HK++VGN+S TV++E+L F E V+ A+V T ++ GYGFV +SS
Subjt: DDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLEAEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSS
Query: EEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
+ E+E A+ S + LEG+ IRVN A
Subjt: EEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
|
|
| AT2G37220.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.8e-28 | 37.5 | Show/hide |
Query: QDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLEA
++ S A+ KL+VGN+P NVD+ +L ++ E G VE EV+YDK +GRSR F FVTM +V + AA ++ N ++ GR ++VN P S
Subjt: QDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLEA
Query: EESQF--------------IDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
S F S ++VYVGN+S V L++ FSE+ KV+ A+V + ++ G+GFVT+ S +EV+ AI S + L+G+ IRV++A
Subjt: EESQF--------------IDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
|
|
| AT3G52150.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.5e-69 | 68.98 | Show/hide |
Query: AQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLE
A D SS A R++Y+GNIPR V NE+LT++VE+HGAVEK +VMYDKYSGRSRRF F TMK+V+DANA +EKLN V GR IKVNITEKP+ + D+S+L+
Subjt: AQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLE
Query: AEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
+E+S F+DSP+KVYVGN++ TV+ E L+N FSEK KV+SAKVSRVPGTSK++G+GFVTFSSEE+VEAAI + NN LLEGQ IRVNKA
Subjt: AEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
|
|
| AT3G52150.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.5e-69 | 68.98 | Show/hide |
Query: AQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLE
A D SS A R++Y+GNIPR V NE+LT++VE+HGAVEK +VMYDKYSGRSRRF F TMK+V+DANA +EKLN V GR IKVNITEKP+ + D+S+L+
Subjt: AQDSSSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKPVVNMVDMSLLE
Query: AEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
+E+S F+DSP+KVYVGN++ TV+ E L+N FSEK KV+SAKVSRVPGTSK++G+GFVTFSSEE+VEAAI + NN LLEGQ IRVNKA
Subjt: AEESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
|
|
| AT3G52380.1 chloroplast RNA-binding protein 33 | 1.3e-33 | 38.38 | Show/hide |
Query: SSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKP--VVNMVDMSLLEAE
+S E +LYVGN+P + + EL++I + G V +++YDK + RSR F FVTM ++++A A++ N + +GGRT+KVN E P N V + +
Subjt: SSVAERKLYVGNIPRNVDNEELTRIVEQHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETDVGGRTIKVNITEKP--VVNMVDMSLLEAE
Query: ESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
++DSPHKVY GN+ ++++ LK+ F ++ VL AKV T ++ G+GF++F S E V++A+++ N V +EG+ +R+N A
Subjt: ESQFIDSPHKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKDKVLSAKVSRVPGTSKASGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNVLLEGQPIRVNKA
|
|
