| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6593527.1 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 8.3e-179 | 93.64 | Show/hide |
Query: MAEEKNLNADNNAYH-GDGAIQMYDQQDKFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTRHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
MAEEKN NAD+NAYH GDGA+QMYDQQD+FELGSELEGGNADSTGGEVKHST HYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETF+ YFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
Subjt: MAEEKNLNADNNAYH-GDGAIQMYDQQDKFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTRHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
Query: PRGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADMNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFEN
PRGFGFVTFCDPSVADMVL KDHVIDGRTVEVKRTVPRAD N+KLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDY+TKRSRGFGFITFEN
Subjt: PRGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADMNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFEN
Query: EDSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKCAGLYDDKMGRPFRGYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYSYGFGYGGPMYM
ED+VESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDS+SNNTAAPPSSGYG+YKC GLYDDKMGRPF YDVYAPFG YGGNYANFYGAY+YGFGYGGPMY+
Subjt: EDSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKCAGLYDDKMGRPFRGYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYSYGFGYGGPMYM
Query: NGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
NGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
Subjt: NGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
|
|
| KAG7025871.1 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 2.3e-176 | 90.35 | Show/hide |
Query: MAEEKNLNADNNAYH-GDGAIQMYDQQDKFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTRHYDSSSSG------------KLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIA
MAEEKN NAD+NAYH GDGA+QMYDQQD+FELGSELEGGNADSTGGEVKHST HYDSSSSG KLFVGGVSWETTEETF+ YFSKYGEIA
Subjt: MAEEKNLNADNNAYH-GDGAIQMYDQQDKFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTRHYDSSSSG------------KLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIA
Query: DSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADMNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTK
DSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVL KDHVIDGRTVEVKRTVPRAD N+KLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDY+TK
Subjt: DSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADMNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTK
Query: RSRGFGFITFENEDSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKCAGLYDDKMGRPFRGYDVYAPFGGYGGNYANFYGAY
RSRGFGFITFENED+VESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDS+SNNTAAPPSSGYG+YKC GLYDDKMGRPF YDVYAPFGGYGGNYANFYGAY
Subjt: RSRGFGFITFENEDSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKCAGLYDDKMGRPFRGYDVYAPFGGYGGNYANFYGAY
Query: SYGFGYGGPMYMNGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
+YGFGYGGPMY+NGI RYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
Subjt: SYGFGYGGPMYMNGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
|
|
| XP_022964368.1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1 [Cucurbita moschata] | 2.6e-180 | 94.24 | Show/hide |
Query: MAEEKNLNADNNAYH-GDGAIQMYDQQDKFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTRHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
MAEEKN NAD+NAYH GDGA+QMYDQQD+FELGSELEGGNADSTGGEVKHST HYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETF+ YFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
Subjt: MAEEKNLNADNNAYH-GDGAIQMYDQQDKFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTRHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
Query: PRGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADMNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFEN
PRGFGFVTFCDPSVADMVL KDHVIDGRTVEVKRTVPRAD NDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDY+TKRSRGFGFITFEN
Subjt: PRGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADMNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFEN
Query: EDSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKCAGLYDDKMGRPFRGYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYSYGFGYGGPMYM
ED+VESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDS+SNNTAAPPSSGYG+YKC GLYDDKMGRPF YDVYAPFGGYGGNYANFYGAY+YGFGYGGPMY+
Subjt: EDSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKCAGLYDDKMGRPFRGYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYSYGFGYGGPMYM
Query: NGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
NGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
Subjt: NGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
|
|
| XP_023000106.1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like [Cucurbita maxima] | 8.6e-192 | 100 | Show/hide |
Query: MAEEKNLNADNNAYHGDGAIQMYDQQDKFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTRHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRP
MAEEKNLNADNNAYHGDGAIQMYDQQDKFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTRHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRP
Subjt: MAEEKNLNADNNAYHGDGAIQMYDQQDKFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTRHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRP
Query: RGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADMNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFENE
RGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADMNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFENE
Subjt: RGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADMNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFENE
Query: DSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKCAGLYDDKMGRPFRGYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYSYGFGYGGPMYMN
DSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKCAGLYDDKMGRPFRGYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYSYGFGYGGPMYMN
Subjt: DSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKCAGLYDDKMGRPFRGYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYSYGFGYGGPMYMN
Query: GIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
GIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
Subjt: GIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
|
|
| XP_023514818.1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 1.3e-179 | 93.94 | Show/hide |
Query: MAEEKNLNADNNAYH-GDGAIQMYDQQDKFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTRHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
MAEEKN NAD+NAYH GDGA+QMYDQQD+FELGSELEGGNADSTGGEVKHST HYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETF+ YFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
Subjt: MAEEKNLNADNNAYH-GDGAIQMYDQQDKFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTRHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
Query: PRGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADMNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFEN
PRGFGFVTFCDPSVADMVL KDHVIDGRTVEVKRTVPRAD NDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDY+TKRSRGFGFITFEN
Subjt: PRGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADMNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFEN
Query: EDSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKCAGLYDDKMGRPFRGYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYSYGFGYGGPMYM
ED+VESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDS+SNNTAAPPSSGYG+YKC GLYDDKMGRPF YDVYAPFGGYGGNYANFYGAY+YGFGYGGPMY+
Subjt: EDSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKCAGLYDDKMGRPFRGYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYSYGFGYGGPMYM
Query: NGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
NGIGRYGMTGYGVP CYGCTMAERYHPYWY
Subjt: NGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0K9M1 Uncharacterized protein | 6.3e-132 | 70.76 | Show/hide |
Query: MAEEKNLNADNNAYHGDGAIQMYDQQDKFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTRHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRP
MA E++ N D NA +G+ QMYDQQ +F++G+ELE N DST E+K+ST YDSSSSGKLFVGGV+WETTE+TF YFSKYGEIADSVIM+DKHTGRP
Subjt: MAEEKNLNADNNAYHGDGAIQMYDQQDKFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTRHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRP
Query: RGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADMNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFENE
RGFGFVTFCDP++ADMVL DH+IDGR VEVKRTVPRADMNDK+VSRTKKIFVGGIPP LTE+ FK YFSSFG I EHQIMIDYKTKRSRGFGFITFENE
Subjt: RGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADMNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFENE
Query: DSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKCAGLYDDKMGRPFRGYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYSYGFGYGGPMYMN
DSVE+IF+G+ HELGGKQVEIKKA+P+RV+YD NSN + +SGY +Y+C GLYDD +G F YD+YAP+GG+G NYA+FYGAY+YGFGYG MYMN
Subjt: DSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKCAGLYDDKMGRPFRGYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYSYGFGYGGPMYMN
Query: GIGRYGMTGYGVP------NCY-------GCTMAERYHPYWY
GRYGM GYG P N Y G +M ER+HPYWY
Subjt: GIGRYGMTGYGVP------NCY-------GCTMAERYHPYWY
|
|
| A0A5A7UU27 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein a1 | 2.2e-129 | 69.28 | Show/hide |
Query: MAEEKNLNADNNAYHGDGA---IQMYDQQDKFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTRHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHT
MAEE++ N D N HG+ +Q +QQ++F++ +ELE N DST E+K+ST YDSSSSGKLFVGGV+WETTE+TF+ YFSKYGEIADSVIM+DKHT
Subjt: MAEEKNLNADNNAYHGDGA---IQMYDQQDKFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTRHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHT
Query: GRPRGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADMNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITF
GRPRGFGFVTFCDP++ADMVL DH+IDGR VEVKRTVPRADMNDK+VSRTKKIFVGGIPP LTE FK YFSSFG I EHQIMIDYKTKRSRGFGFITF
Subjt: GRPRGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADMNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITF
Query: ENEDSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKCAGLYDDKMGRPFRGYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYSYGFGYGGPM
ENEDSV++IF+G+ HELGGKQVEIKKA+P++V+YD NSN + SSGY +Y+C GLYDD +G F YD+YAP+GG+GGNYA+FYGAY+YGFGYG M
Subjt: ENEDSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKCAGLYDDKMGRPFRGYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYSYGFGYGGPM
Query: YMNGIGRYGMTGYGVP------NCY-------GCTMAERYHPYWY
YMN GRYGM GYG P N Y G +M ER+HPYWY
Subjt: YMNGIGRYGMTGYGVP------NCY-------GCTMAERYHPYWY
|
|
| A0A5D3BYF2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein a1 | 2.2e-129 | 69.28 | Show/hide |
Query: MAEEKNLNADNNAYHGDGA---IQMYDQQDKFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTRHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHT
MAEE++ N D N HG+ +Q +QQ++F++ +ELE N DST E+K+ST YDSSSSGKLFVGGV+WETTE+TF+ YFSKYGEIADSVIM+DKHT
Subjt: MAEEKNLNADNNAYHGDGA---IQMYDQQDKFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTRHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHT
Query: GRPRGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADMNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITF
GRPRGFGFVTFCDP++ADMVL DH+IDGR VEVKRTVPRADMNDK+VSRTKKIFVGGIPP LTE FK YFSSFG I EHQIMIDYKTKRSRGFGFITF
Subjt: GRPRGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADMNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITF
Query: ENEDSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKCAGLYDDKMGRPFRGYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYSYGFGYGGPM
ENEDSV++IF+G+ HELGGKQVEIKKA+P++V+YD NSN + SSGY +Y+C GLYDD +G F YD+YAP+GG+GGNYA+FYGAY+YGFGYG M
Subjt: ENEDSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKCAGLYDDKMGRPFRGYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYSYGFGYGGPM
Query: YMNGIGRYGMTGYGVP------NCY-------GCTMAERYHPYWY
YMN GRYGM GYG P N Y G +M ER+HPYWY
Subjt: YMNGIGRYGMTGYGVP------NCY-------GCTMAERYHPYWY
|
|
| A0A6J1HKL5 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1 | 1.3e-180 | 94.24 | Show/hide |
Query: MAEEKNLNADNNAYH-GDGAIQMYDQQDKFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTRHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
MAEEKN NAD+NAYH GDGA+QMYDQQD+FELGSELEGGNADSTGGEVKHST HYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETF+ YFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
Subjt: MAEEKNLNADNNAYH-GDGAIQMYDQQDKFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTRHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGR
Query: PRGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADMNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFEN
PRGFGFVTFCDPSVADMVL KDHVIDGRTVEVKRTVPRAD NDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDY+TKRSRGFGFITFEN
Subjt: PRGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADMNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFEN
Query: EDSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKCAGLYDDKMGRPFRGYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYSYGFGYGGPMYM
ED+VESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDS+SNNTAAPPSSGYG+YKC GLYDDKMGRPF YDVYAPFGGYGGNYANFYGAY+YGFGYGGPMY+
Subjt: EDSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKCAGLYDDKMGRPFRGYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYSYGFGYGGPMYM
Query: NGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
NGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
Subjt: NGIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
|
|
| A0A6J1KEY7 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like | 4.2e-192 | 100 | Show/hide |
Query: MAEEKNLNADNNAYHGDGAIQMYDQQDKFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTRHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRP
MAEEKNLNADNNAYHGDGAIQMYDQQDKFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTRHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRP
Subjt: MAEEKNLNADNNAYHGDGAIQMYDQQDKFELGSELEGGNADSTGGEVKHSTRHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRP
Query: RGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADMNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFENE
RGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADMNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFENE
Subjt: RGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADMNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFENE
Query: DSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKCAGLYDDKMGRPFRGYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYSYGFGYGGPMYMN
DSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKCAGLYDDKMGRPFRGYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYSYGFGYGGPMYMN
Subjt: DSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKCAGLYDDKMGRPFRGYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYSYGFGYGGPMYMN
Query: GIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
GIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
Subjt: GIGRYGMTGYGVPNCYGCTMAERYHPYWY
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O94432 Uncharacterized RNA-binding protein C660.15 | 3.9e-38 | 37.86 | Show/hide |
Query: SELEGGNADSTGGEVKHSTRHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVK
S L G A + + T + + GK+F+GG++WETT+++ YF ++GE+ D +M D TGR RGFGF+TF +P + V+ K+H +DG+ ++ K
Subjt: SELEGGNADSTGGEVKHSTRHYDSSSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVK
Query: RTVPRADMNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFENEDSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSY
R +PR + +T K+FVGG+P TE+ F+ +F+ FG + + +M+D T R RGFGF+T+ENE +VE+ + + GK VE+K+A P+
Subjt: RTVPRADMNDKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFENEDSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSY
Query: DSNSNN
DS+ +
Subjt: DSNSNN
|
|
| P48809 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 27C | 1.0e-38 | 40 | Show/hide |
Query: DSSSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLIK-DHVIDGRTVEVKRTVPRADMNDKLVSRTKKIFV
+ GKLFVGG+SWETT+E + YF ++G+I D V+M + +GR RGFGFVTF DP+ + VL H +DGRT++ K PR K K+F+
Subjt: DSSSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLIK-DHVIDGRTVEVKRTVPRADMNDKLVSRTKKIFV
Query: GGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFENEDSVESIFAGNEKH-ELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKC
GG+P +TE + +F+ +G +TE IM D + K+SRGFGF++FE E SVE + NE++ L GKQVEIKKA PR S NSNN+ + G +C
Subjt: GGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFENEDSVESIFAGNEKH-ELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKC
Query: AGL------------YDDKMGRPFRGYDVYAP--FGGYGGNYANFYGAYSYGFGYGGPMYMNGIG
+ + +MG P + AP GY G + YG+G GP G G
Subjt: AGL------------YDDKMGRPFRGYDVYAP--FGGYGGNYANFYGAYSYGFGYGGPMYMNGIG
|
|
| Q8W034 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1 | 4.6e-47 | 40.27 | Show/hide |
Query: SSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADM---------------N
S GKLFVGG+SWET E+ +F+ YGE++ +++M DK TGRPRGFGFV F DPSV D VL + H ID R V+VKR + R +
Subjt: SSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADM---------------N
Query: DKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFENEDSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAA
++TKKIFVGG+PP LT++ F+ YF +G +T+ IM D T R RGFGF++F++ED+V+S+ H+L GKQVE+K+A+P+ + +
Subjt: DKLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFENEDSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAA
Query: PPSSGY-GVYKCAGLYDDKM-------------GRPFRGYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYSYGFGYGGPMYMNGIGRYG---MTGYGVPNCYG
S GY G YD +M G P G GYG Y N YG YGG Y G YG GYG N G
Subjt: PPSSGY-GVYKCAGLYDDKM-------------GRPFRGYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYSYGFGYGGPMYMNGIGRYG---MTGYGVPNCYG
|
|
| Q98SJ2 DAZ-associated protein 1 | 3.0e-38 | 40.08 | Show/hide |
Query: GKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLI-KDHVIDGRTVEVKRTVPRADMNDKL--------------
GKLFVGG+ W TT+ET YFS+YGE+ D VIM DK T + RGFGFV F DP+ VL + H +DGR ++ K PR ++
Subjt: GKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLI-KDHVIDGRTVEVKRTVPRADMNDKL--------------
Query: VSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFENEDSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPS
SR+ KIFVGGIP E K YF+ FG +TE ++ D + +R RGFGFITFE+E SV+ H++ GK+VE+K+A PR DS S P S
Subjt: VSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFENEDSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPS
Query: SGYGVYKCAGLYDDKMGRPFRGYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYSYGFGYGGP
+ +G + G+P + + Y+P G + G Y G GGP
Subjt: SGYGVYKCAGLYDDKMGRPFRGYDVYAPFGGYGGNYANFYGAYSYGFGYGGP
|
|
| Q9VVE5 RNA-binding protein Musashi homolog Rbp6 | 1.9e-40 | 43.11 | Show/hide |
Query: GKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLIK-DHVIDGRTVEVKRTVPRADMNDKLVSRTKKIFVGGIPP
GK+F+GG+SW+T+ E+ YF +YG+I+++++M D T R RGFGFVTF DP+ D VL + H +DG+ V+ K PR + K+V+RTKKIFVGG+
Subjt: GKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLIK-DHVIDGRTVEVKRTVPRADMNDKLVSRTKKIFVGGIPP
Query: ALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFENEDSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKCAGLYDD
T + K YF FG I + +M D +T R RGFGF+TF++ED V+ + HE+ K VE KKA P+ V +N T A S Y GL
Subjt: ALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFENEDSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKCAGLYDD
Query: KMGRPFRGYDVYAPFGGYGGNYANF
G P Y YA GY G Y +F
Subjt: KMGRPFRGYDVYAPFGGYGGNYANF
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G17640.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.5e-72 | 49.1 | Show/hide |
Query: NNAYHGDGAIQMYDQQDKFEL---GSELEGGNADSTGG-EVKHSTRHYDSSSS----GKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRG
+++YH + Q D FE+ GG A TGG ++KHS H SSSS GKLFVGGVSWETT ETF YF K+GE+ DSVIM D+ TG PRG
Subjt: NNAYHGDGAIQMYDQQDKFEL---GSELEGGNADSTGG-EVKHSTRHYDSSSS----GKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRG
Query: FGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADMND--KLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFENE
FGFVTF D +VA+ VL +DHVID R V++KRT+PR D + K VS+T+KIFVGG+PP L ED K YF +G I EHQIM D+ T RSRGFGF+TF+ E
Subjt: FGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADMND--KLVSRTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFENE
Query: DSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKCAGLYDDK---MGRPFRGYDVYAPFGGYGG----------NYANFY---
DSV+ +F+ + HELG KQVEIK+A P+R D++ + Y +G YD + G+ Y +Y+ +GGYGG N A FY
Subjt: DSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKCAGLYDDK---MGRPFRGYDVYAPFGGYGG----------NYANFY---
Query: GAYSYGFGYGGPMYMNGIGRYGM----TGYGV
G Y YG+GYGG M+ G G G +GYGV
Subjt: GAYSYGFGYGGPMYMNGIGRYGM----TGYGV
|
|
| AT3G13224.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.0e-53 | 43.3 | Show/hide |
Query: DSSSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPR-ADMNDKLVSRTKKIFV
D +S GK+F+GG+ +TT F +F KYGEI DSVIM D+HTG+PRGFGF+TF DPSV D V+ HVI+G+ VE+KRT+P+ A N +TKKIFV
Subjt: DSSSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPR-ADMNDKLVSRTKKIFV
Query: GGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFENEDSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKCA
GGIP +TED K +F+ +G + EHQ++ D++T RSRGFGF+ F++E+ V+ + + ++ QVEIKKA P++ + +PPS YG +
Subjt: GGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFENEDSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKCA
Query: GLYDD---KMGRPFRGYD-----VYAPFGGYGGNYANFYGAYSYGFGYGGPMYMNGIGRYG
+D G P+ G+D P +GG + + G Y YG G GP + G YG
Subjt: GLYDD---KMGRPFRGYD-----VYAPFGGYGGNYANFYGAYSYGFGYGGPMYMNGIGRYG
|
|
| AT4G26650.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 9.2e-51 | 47.17 | Show/hide |
Query: SSSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADMN--------DKLVS-
+S GKLF+GG+SW+T EE YF KYG++ ++VIM D+ TGR RGFGF+ F DPSVA+ V++ H+IDGRTVE K+ VPR D L+S
Subjt: SSSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADMN--------DKLVS-
Query: ---------RTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFENEDSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSN
RTKKIFVGG+P ++TE FK YF FGTI + +M D+ T+R RGFGFITF++E+SV+ + HEL GK VE+K+A+P+ +S + +
Subjt: ---------RTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFENEDSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSN
Query: NTAAPPSSGYGV
+ + YGV
Subjt: NTAAPPSSGYGV
|
|
| AT4G26650.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 9.2e-51 | 47.17 | Show/hide |
Query: SSSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADMN--------DKLVS-
+S GKLF+GG+SW+T EE YF KYG++ ++VIM D+ TGR RGFGF+ F DPSVA+ V++ H+IDGRTVE K+ VPR D L+S
Subjt: SSSSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADMN--------DKLVS-
Query: ---------RTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFENEDSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSN
RTKKIFVGG+P ++TE FK YF FGTI + +M D+ T+R RGFGFITF++E+SV+ + HEL GK VE+K+A+P+ +S + +
Subjt: ---------RTKKIFVGGIPPALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFENEDSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSN
Query: NTAAPPSSGYGV
+ + YGV
Subjt: NTAAPPSSGYGV
|
|
| AT5G40490.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.2e-55 | 47.21 | Show/hide |
Query: SSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADMNDKLVSRTKKIFVGGIP
S+GK+FVGG++ ETT F +F KYGEI DSVIM D+ TG+PRGFGFVT+ D SV D V+ +H+I G+ VE+KRT+PR M+ +TKKIFVGGIP
Subjt: SSGKLFVGGVSWETTEETFTYYFSKYGEIADSVIMMDKHTGRPRGFGFVTFCDPSVADMVLIKDHVIDGRTVEVKRTVPRADMNDKLVSRTKKIFVGGIP
Query: PALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFENEDSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKC--AGL
++ +D FK +F FG + EHQIM D+ T RSRGFGF+T+E+ED V+ + A + EL G QVEIKKA P++ N+ PS +G + G
Subjt: PALTEDAFKVYFSSFGTITEHQIMIDYKTKRSRGFGFITFENEDSVESIFAGNEKHELGGKQVEIKKAIPRRVSYDSNSNNTAAPPSSGYGVYKC--AGL
Query: YDDKMGRPFRG-----YDVYAPFGGYGGNYANFYGAYSYGF-GYGGPMYMNGIGRY-GMTGYGVPNCYG
Y D G G Y GGYGG + YG Y F GYGG Y G+G Y G G YG
Subjt: YDDKMGRPFRG-----YDVYAPFGGYGGNYANFYGAYSYGF-GYGGPMYMNGIGRY-GMTGYGVPNCYG
|
|
