; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmaCh08G011880 (gene) of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1 genome

Gene IDCmaCh08G011880
OrganismCucurbita maxima Rimu (Cucurbita maxima (Rimu) v1.1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCma_Chr08:7308911..7309501
RNA-Seq ExpressionCmaCh08G011880
SyntenyCmaCh08G011880
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6575030.1 hypothetical protein SDJN03_25669, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.3e-8286.73Show/hide
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KAG6593932.1 hypothetical protein SDJN03_13408, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.4e-9495.92Show/hide
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XP_022930480.1 uncharacterized protein LOC111436920 [Cucurbita moschata]9.0e-9696.94Show/hide
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XP_023000029.1 uncharacterized protein LOC111494337 [Cucurbita maxima]3.9e-99100Show/hide
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XP_023514741.1 uncharacterized protein LOC111778959 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.9e-9697.96Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KCP9 Uncharacterized protein9.1e-7883Show/hide
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A0A1S3C7J3 uncharacterized protein LOC1034979042.4e-7883.5Show/hide
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A0A5A7SWA1 Uncharacterized protein2.4e-7883.5Show/hide
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A0A6J1EX01 uncharacterized protein LOC1114369204.3e-9696.94Show/hide
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A0A6J1KIS0 uncharacterized protein LOC1114943371.9e-99100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G25250.1 unknown protein5.9e-0529.79Show/hide
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        P + K+ ++N+   S S   S       +      +V IL+RGE +++K   E    +++        ++G  P  +   IRI + +      A  YAG 
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          S SP PS +PLP+F   K V+      AT DL ++LRLD
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AT3G21570.1 unknown protein1.2e-1334.17Show/hide
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        MGTEI+RPQ+CL  R+                 DS    +NSR N        +P+QR+RF              S++ +T T ++V       R+GES 
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        D  +  +  K                                P +   D+YAGS+ F++SP+PSSLPLPSFSKKK  S +V    DDSA++DLRRLLRL
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AT4G02040.1 unknown protein3.5e-0530.14Show/hide
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        +Y+S+++R           + R   N S     ++ S     S     +LVME V IL+RGE+L              T+   LK   D +L+V  T R+
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        GP PE+++KQI  + ++         +AG+  S+SP PS +P+P F
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AT4G32020.1 unknown protein1.8e-0930.58Show/hide
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        MG  +L PQDCLK           P     R++ +  N+ +      S+S+R S+     P    R   +   P  + +      K+ +N++ +  V IL
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        +RGE          + KE  +LVV       T R+GP P ++  QIR+   +      A  YAG     SP PS +PLP+F  KK         AT DL 
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Query:  RLLRLD
        R+LRLD
Subjt:  RLLRLD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGACTGAGATTCTACGACCTCAGGATTGTTTGAAAGGAAGGATCGGAGTTCCGCTGGTGGCCTTTTGTCGTCGCCGGAGTTCTTATGGAAACTCTGATTCG
AATGTTTGTAACTATAATTCTAGATCCAACCGGAAATCAGCGGCTAGGTCGGAGCGGCCGGAGCAGCGGAAACGGTTTGTTTCGAATCAATCGGAGCCGTCGGTC
TCGAAGAGATTGAGTTCCGAGGATTCGAAGACCAGGACGAATAGTTTGGTGATGGAAAATGTTACGATCTTGAGGCGTGGTGAATCGCTCGATTTGAAGACGAAG
GGCGAAGCTCTGAAGAAGGAAGCTGATAATCTGGTCGTGTGTGGGACCGAGAGGTTGGGGCCGGCGCCGGAAATGGTACTGAAGCAGATCCGGATTGTCGACGTT
AGGTATCCGATTATTGGGAAAGCCGATGTTTACGCCGGATCAGCGTTTTCGATGTCTCCATCTCCTAGTTCTCTTCCATTACCGTCGTTCTCGAAGAAGAAACAG
GTATCCACCATCGTTGATGACTCGGCCACAAGAGATCTGAGGCGTTTGCTTCGTCTCGACGCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGGACTGAGATTCTACGACCTCAGGATTGTTTGAAAGGAAGGATCGGAGTTCCGCTGGTGGCCTTTTGTCGTCGCCGGAGTTCTTATGGAAACTCTGATTCG
AATGTTTGTAACTATAATTCTAGATCCAACCGGAAATCAGCGGCTAGGTCGGAGCGGCCGGAGCAGCGGAAACGGTTTGTTTCGAATCAATCGGAGCCGTCGGTC
TCGAAGAGATTGAGTTCCGAGGATTCGAAGACCAGGACGAATAGTTTGGTGATGGAAAATGTTACGATCTTGAGGCGTGGTGAATCGCTCGATTTGAAGACGAAG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGTEILRPQDCLKGRIGVPLVAFCRRRSSYGNSDSNVCNYNSRSNRKSAARSERPEQRKRFVSNQSEPSVSKRLSSEDSKTRTNSLVMENVTILRRGESLDLKTK
GEALKKEADNLVVCGTERLGPAPEMVLKQIRIVDVRYPIIGKADVYAGSAFSMSPSPSSLPLPSFSKKKQVSTIVDDSATRDLRRLLRLDA